Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J1B9W9

Protein Details
Accession A0A0J1B9W9    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSDTQPKRKSGRTPEQQAARDHydrophilic
474-501GGGDERRDKRDKRGKKWESTGRPRPGAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-28RDARKAAKK
85-112EMRAAKKRAKLGQAPVEKKADYEKKAKK
324-343AREKRAKEALTKGKRGSAKA
401-424KRAGGKRNRDDARPGPAKFQRRER
479-500RRDKRDKRGKKWESTGRPRPGA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDTQPKRKSGRTPEQQAARDARKAAKKAAAEAAAAESAAAAKTQDDAASDAEEGGGDKRKRPVYDEEEMLEVDLKAGAPLSKAEMRAAKKRAKLGQAPVEKKADYEKKAKKLAEAEDDDEDGEAEAEGTGEARTRKKDKAAAPKEEKSEFSVWIGNMSFRTQPEALKSWIQTGITESGGEDDCITRVYLPKKAARGEFSENKGFAYVDFKTEEQMLLAIGLSERPLDGRRLLIKAGNDHKANPNARTPKTIPSGPGTASVGKQKHAESSTLFIGNLPFDTTEEELRDLIETNCADLIAEQEEAEAEAADEEDEEMDEEAREAAREKRAKEALTKGKRGSAKAGLIKTRVAQFEDTGRCKGFAFWDFKSPVYARAALMNKKNHFLRGHKLTLQYASQEATKRAGGKRNRDDARPGPAKFQRRERAPRYFENGDGEHASAPVPTSAPAHTDFKSEAAAQARIAAMVSGEGGGESGGGDERRDKRDKRGKKWESTGRPRPGAALMMAKREKVGIVESAGSKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.83
3 0.79
4 0.76
5 0.74
6 0.68
7 0.62
8 0.58
9 0.57
10 0.56
11 0.57
12 0.56
13 0.54
14 0.5
15 0.51
16 0.53
17 0.47
18 0.39
19 0.36
20 0.32
21 0.25
22 0.22
23 0.17
24 0.1
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.05
29 0.05
30 0.06
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.1
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.11
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.18
44 0.18
45 0.22
46 0.3
47 0.36
48 0.38
49 0.42
50 0.49
51 0.48
52 0.53
53 0.53
54 0.47
55 0.42
56 0.41
57 0.36
58 0.27
59 0.19
60 0.13
61 0.1
62 0.08
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.12
69 0.15
70 0.16
71 0.2
72 0.26
73 0.3
74 0.38
75 0.45
76 0.48
77 0.5
78 0.57
79 0.6
80 0.61
81 0.63
82 0.64
83 0.66
84 0.69
85 0.68
86 0.65
87 0.62
88 0.53
89 0.47
90 0.48
91 0.46
92 0.41
93 0.48
94 0.52
95 0.56
96 0.64
97 0.64
98 0.6
99 0.58
100 0.59
101 0.58
102 0.53
103 0.47
104 0.41
105 0.41
106 0.35
107 0.28
108 0.22
109 0.13
110 0.09
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.07
119 0.1
120 0.13
121 0.2
122 0.24
123 0.28
124 0.34
125 0.42
126 0.48
127 0.56
128 0.62
129 0.66
130 0.7
131 0.71
132 0.7
133 0.65
134 0.57
135 0.51
136 0.44
137 0.34
138 0.28
139 0.26
140 0.21
141 0.21
142 0.2
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.13
148 0.18
149 0.16
150 0.17
151 0.21
152 0.23
153 0.24
154 0.25
155 0.26
156 0.23
157 0.25
158 0.23
159 0.19
160 0.18
161 0.18
162 0.14
163 0.14
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.09
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.06
174 0.11
175 0.14
176 0.18
177 0.22
178 0.26
179 0.3
180 0.34
181 0.36
182 0.34
183 0.37
184 0.39
185 0.41
186 0.42
187 0.42
188 0.37
189 0.35
190 0.32
191 0.27
192 0.2
193 0.17
194 0.13
195 0.11
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.09
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.11
217 0.13
218 0.15
219 0.15
220 0.17
221 0.17
222 0.22
223 0.26
224 0.28
225 0.26
226 0.27
227 0.31
228 0.35
229 0.36
230 0.32
231 0.35
232 0.37
233 0.37
234 0.41
235 0.39
236 0.38
237 0.4
238 0.39
239 0.33
240 0.29
241 0.3
242 0.25
243 0.24
244 0.19
245 0.17
246 0.16
247 0.2
248 0.18
249 0.17
250 0.19
251 0.18
252 0.2
253 0.2
254 0.2
255 0.15
256 0.17
257 0.18
258 0.16
259 0.16
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.07
265 0.05
266 0.05
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.09
311 0.17
312 0.21
313 0.22
314 0.29
315 0.33
316 0.34
317 0.37
318 0.44
319 0.47
320 0.51
321 0.55
322 0.49
323 0.51
324 0.53
325 0.49
326 0.45
327 0.4
328 0.38
329 0.39
330 0.42
331 0.39
332 0.37
333 0.37
334 0.34
335 0.33
336 0.28
337 0.24
338 0.21
339 0.19
340 0.25
341 0.31
342 0.31
343 0.29
344 0.28
345 0.27
346 0.26
347 0.26
348 0.23
349 0.22
350 0.25
351 0.24
352 0.31
353 0.31
354 0.31
355 0.35
356 0.31
357 0.29
358 0.27
359 0.27
360 0.2
361 0.26
362 0.31
363 0.32
364 0.38
365 0.43
366 0.41
367 0.46
368 0.47
369 0.46
370 0.45
371 0.45
372 0.47
373 0.47
374 0.51
375 0.49
376 0.5
377 0.46
378 0.44
379 0.41
380 0.33
381 0.26
382 0.22
383 0.21
384 0.21
385 0.2
386 0.2
387 0.21
388 0.25
389 0.28
390 0.36
391 0.4
392 0.48
393 0.56
394 0.64
395 0.65
396 0.63
397 0.66
398 0.62
399 0.65
400 0.62
401 0.54
402 0.52
403 0.56
404 0.62
405 0.61
406 0.66
407 0.65
408 0.67
409 0.77
410 0.76
411 0.79
412 0.76
413 0.77
414 0.75
415 0.69
416 0.61
417 0.57
418 0.5
419 0.42
420 0.37
421 0.31
422 0.23
423 0.2
424 0.18
425 0.12
426 0.12
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.13
433 0.16
434 0.19
435 0.19
436 0.21
437 0.21
438 0.21
439 0.23
440 0.2
441 0.21
442 0.21
443 0.22
444 0.19
445 0.2
446 0.19
447 0.17
448 0.16
449 0.12
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.06
462 0.07
463 0.08
464 0.16
465 0.22
466 0.3
467 0.38
468 0.41
469 0.5
470 0.6
471 0.7
472 0.73
473 0.79
474 0.81
475 0.83
476 0.91
477 0.9
478 0.91
479 0.91
480 0.91
481 0.89
482 0.83
483 0.73
484 0.65
485 0.57
486 0.49
487 0.41
488 0.4
489 0.33
490 0.38
491 0.4
492 0.37
493 0.35
494 0.33
495 0.31
496 0.23
497 0.24
498 0.17
499 0.18
500 0.21
501 0.22
502 0.23
503 0.23