Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J1BDQ3

Protein Details
Accession A0A0J1BDQ3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
456-476LKLARAVAKREGRQKPRKKDKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
460-476RAVAKREGRQKPRKKDK
Subcellular Location(s) nucl 6mito 6cyto 6extr 6cyto_nucl 6cyto_mito 6mito_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSAITLPSVGRIRCYWALLVPQYGSAPGGGTKLELKFVYLDPVLSTHLGPQSLGVLNHGLIDLIHPSEREQARNDLASAIQSDDLQGSVTRMRFSRLSRIRQMCGAQPNDIPIPPDINAVTEDSDYLIIDLVLNWVADGLLLAFFHAIKDFDPQGNNDPSRRHEGWSNFCGSVGMTDEHIQTLHQSISANVTPPQRTRYPPTRVFQLHSVNHSAQPTSMVFTWPPARPTDKPSEQFDGLYDADEYADLMRGVDMDPSALAAKPGEVRTNCTTRFGAEHSIRTEGVYRHVTSVFIPYDQVIFACFQTTQLYELPTGHEWPPKPQAPAQVPAQAQSQPHPQPQAAPNGPDWRSDYERGYGTPAPPPAPASAPAAPAPISAPAAPAAPASAPPFARGGYAPYEGYRAPVENHAPRGGSTRPLVRPPGDVEKCRGCGTRESPEWRKGENGVKDLCNACGLKLARAVAKREGRQKPRKKDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.29
3 0.27
4 0.34
5 0.33
6 0.35
7 0.28
8 0.27
9 0.25
10 0.24
11 0.21
12 0.14
13 0.12
14 0.1
15 0.11
16 0.09
17 0.1
18 0.14
19 0.15
20 0.19
21 0.17
22 0.18
23 0.2
24 0.2
25 0.24
26 0.2
27 0.2
28 0.16
29 0.18
30 0.19
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.18
35 0.17
36 0.17
37 0.16
38 0.17
39 0.19
40 0.19
41 0.16
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.1
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.1
52 0.09
53 0.11
54 0.2
55 0.22
56 0.25
57 0.26
58 0.31
59 0.34
60 0.35
61 0.34
62 0.27
63 0.24
64 0.22
65 0.2
66 0.16
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.09
75 0.12
76 0.14
77 0.15
78 0.16
79 0.19
80 0.23
81 0.26
82 0.35
83 0.39
84 0.46
85 0.54
86 0.59
87 0.58
88 0.58
89 0.58
90 0.53
91 0.53
92 0.47
93 0.39
94 0.35
95 0.36
96 0.33
97 0.31
98 0.26
99 0.18
100 0.18
101 0.16
102 0.17
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.09
137 0.11
138 0.14
139 0.15
140 0.17
141 0.22
142 0.29
143 0.3
144 0.29
145 0.3
146 0.31
147 0.38
148 0.37
149 0.33
150 0.33
151 0.38
152 0.42
153 0.43
154 0.44
155 0.35
156 0.34
157 0.32
158 0.25
159 0.19
160 0.15
161 0.11
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.18
179 0.2
180 0.21
181 0.25
182 0.25
183 0.28
184 0.34
185 0.4
186 0.45
187 0.5
188 0.51
189 0.55
190 0.53
191 0.52
192 0.5
193 0.49
194 0.43
195 0.38
196 0.4
197 0.32
198 0.33
199 0.31
200 0.25
201 0.17
202 0.17
203 0.14
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.11
209 0.16
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.2
214 0.21
215 0.26
216 0.33
217 0.35
218 0.37
219 0.4
220 0.42
221 0.39
222 0.37
223 0.32
224 0.27
225 0.2
226 0.17
227 0.13
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.05
249 0.08
250 0.09
251 0.13
252 0.13
253 0.18
254 0.22
255 0.27
256 0.27
257 0.28
258 0.27
259 0.23
260 0.25
261 0.21
262 0.25
263 0.22
264 0.25
265 0.23
266 0.24
267 0.24
268 0.22
269 0.24
270 0.17
271 0.19
272 0.2
273 0.19
274 0.19
275 0.19
276 0.19
277 0.16
278 0.2
279 0.16
280 0.13
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.14
300 0.14
301 0.16
302 0.16
303 0.2
304 0.19
305 0.24
306 0.31
307 0.31
308 0.33
309 0.33
310 0.4
311 0.39
312 0.42
313 0.41
314 0.4
315 0.36
316 0.35
317 0.34
318 0.29
319 0.25
320 0.24
321 0.29
322 0.27
323 0.3
324 0.31
325 0.29
326 0.32
327 0.35
328 0.42
329 0.36
330 0.34
331 0.34
332 0.39
333 0.4
334 0.36
335 0.35
336 0.31
337 0.34
338 0.35
339 0.33
340 0.29
341 0.3
342 0.29
343 0.31
344 0.28
345 0.25
346 0.27
347 0.27
348 0.24
349 0.23
350 0.24
351 0.21
352 0.2
353 0.2
354 0.21
355 0.21
356 0.22
357 0.21
358 0.21
359 0.19
360 0.17
361 0.16
362 0.12
363 0.12
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.09
370 0.08
371 0.07
372 0.09
373 0.11
374 0.14
375 0.13
376 0.14
377 0.16
378 0.15
379 0.16
380 0.15
381 0.16
382 0.16
383 0.18
384 0.18
385 0.17
386 0.2
387 0.18
388 0.2
389 0.19
390 0.16
391 0.16
392 0.21
393 0.28
394 0.3
395 0.34
396 0.34
397 0.33
398 0.32
399 0.35
400 0.32
401 0.29
402 0.28
403 0.32
404 0.35
405 0.4
406 0.44
407 0.41
408 0.43
409 0.44
410 0.51
411 0.5
412 0.48
413 0.49
414 0.5
415 0.52
416 0.52
417 0.49
418 0.41
419 0.43
420 0.46
421 0.5
422 0.51
423 0.57
424 0.6
425 0.65
426 0.66
427 0.59
428 0.57
429 0.53
430 0.55
431 0.53
432 0.52
433 0.5
434 0.47
435 0.5
436 0.48
437 0.42
438 0.38
439 0.31
440 0.25
441 0.28
442 0.27
443 0.25
444 0.28
445 0.3
446 0.31
447 0.36
448 0.4
449 0.41
450 0.49
451 0.53
452 0.6
453 0.67
454 0.72
455 0.78
456 0.85