FuNGI

A0A0J0XZI3

Protein Details

Accession

A0A0J0XZI3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-40	RAAFLKRFRRPKLEMLQRQSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 12, cyto 9.5, cyto_nucl 8, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR035698 RNAP_III_Rpc1_C IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02736 RNAP_III_Rpc1_C cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MLQCICKTCARVLLPPVERAAFLKRFRRPKLEMLQRQSAQKGVLASCKKVTTCPYCFAPNGIVKRSGTLKISHEPYRSNKNAEAKQEWMSNFKSVITEQGAIGTHLNKSVEDMNPLKVLELFRRVTAEDCELLALHPDIGRPEDYLWTYISVPPPSIRPSVASEAGNNEDDLTAKLVEIVNQNRMLISVMEKGQGLSQTISNWDALSQMIALYINSQTPGINTTGSKPIRGFVQRLKGKSGRFRGNLSGKRVDFSGRTVIGPDPNLRIDEVAVPEKIAVKLSYPERVTDYNIEAMRQCVVNGAKLHPGANVIETGRGPYPRRSLQPLKDIERRKEMARNLRVGDIVHRHVRDGDIVLFNRQPSLHKISIMCHRVRVRPWRTFRLNECVCNPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARTEALELMSVKKNLVTPRNGEPIVAAIQDFITASYLLSKRDRLLDRQQFTQIVSYLGDANIPIELPPPTIWKPQRLWTGKQVYNLLMRPNSNSKVLVNLEAKCRTLVEPRKEYNFPLDMAPNDGYLVIRNSEIMCGVFDKNTVGDGKKNSVFGVILRDYGSNEAAMAMTRLAKLSARWLANQGFSLGINDVIPGPVLQQSKDSLVEKAYKECDDNIELAKRGKLQNMPGCDQETTLESTISATLSDTRANVGDICKRELSRANAPLIMATCGSKGSLINVAQMVALVGQQIIAGKRVANGFQDRSLPHFKKKSIDPPAKGFVRNSFFSGLSPAEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMARRLMKSLEDLSAQYDLSVRNSVGTVVQFEYGDDSLDPACLEGDATPVEYVRSWQHAMATAPKDDVKLYPYQVEEIARYIYPELHAGRKKKGVIVPQEWQQVHVKFRENTYNFINDKIAKKMAEQRERRGVPAADSRDAAEEYEDFLISHDPDVQRVLDNSFSVTRSQLLQFLENCRTRYLLAKIEPGSTVGAVGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINAAKIISTPIITVQLEQYRDESVARIVKGRIERTTLGEIASIIEEAWTGAGAFIEVHVDMDAISKLQLEITLDSIKHSLTLAPKLKIRDSDVTINSRKARIKIYINDPSDKDKFTGVYERLKYLKRAIPSVQVKGLPEIDRSVITKDEKDKERLQLLVTGYGLSEVMGMDGVDGINTKTNHVMETAKVLGIEAARQTIYEEIQTTMRSHGMNIDPRHVMLLGDVMTYKGEVLGITRFGVQKMKDSVLMLASFEKTTDHLFDASLFSKVDEIEGVSECIIMGTPAPGCGTSLASIVTPAPFLAKRKPLLFESAYKEGRERLATGMDID

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.49
3	0.49
4	0.42
5	0.39
6	0.35
7	0.37
8	0.35
9	0.39
10	0.46
11	0.52
12	0.61
13	0.67
14	0.74
15	0.72
16	0.74
17	0.78
18	0.8
19	0.81
20	0.79
21	0.81
22	0.76
23	0.75
24	0.67
25	0.59
26	0.49
27	0.41
28	0.37
29	0.3
30	0.36
31	0.34
32	0.36
33	0.37
34	0.4
35	0.38
36	0.39
37	0.45
38	0.44
39	0.45
40	0.48
41	0.48
42	0.49
43	0.49
44	0.47
45	0.45
46	0.44
47	0.46
48	0.44
49	0.44
50	0.39
51	0.43
52	0.44
53	0.41
54	0.36
55	0.35
56	0.36
57	0.39
58	0.45
59	0.48
60	0.48
61	0.5
62	0.54
63	0.6
64	0.6
65	0.57
66	0.58
67	0.6
68	0.63
69	0.64
70	0.62
71	0.55
72	0.55
73	0.56
74	0.5
75	0.46
76	0.42
77	0.37
78	0.33
79	0.3
80	0.28
81	0.22
82	0.26
83	0.24
84	0.23
85	0.2
86	0.22
87	0.22
88	0.21
89	0.22
90	0.18
91	0.15
92	0.17
93	0.18
94	0.14
95	0.17
96	0.2
97	0.2
98	0.25
99	0.26
100	0.26
101	0.28
102	0.28
103	0.26
104	0.24
105	0.25
106	0.24
107	0.29
108	0.27
109	0.26
110	0.29
111	0.29
112	0.28
113	0.29
114	0.28
115	0.22
116	0.2
117	0.2
118	0.18
119	0.17
120	0.17
121	0.14
122	0.11
123	0.1
124	0.11
125	0.12
126	0.14
127	0.15
128	0.14
129	0.15
130	0.18
131	0.19
132	0.2
133	0.19
134	0.19
135	0.19
136	0.22
137	0.25
138	0.22
139	0.22
140	0.22
141	0.25
142	0.27
143	0.28
144	0.25
145	0.23
146	0.28
147	0.32
148	0.34
149	0.32
150	0.29
151	0.31
152	0.33
153	0.31
154	0.25
155	0.2
156	0.16
157	0.16
158	0.15
159	0.13
160	0.1
161	0.09
162	0.11
163	0.11
164	0.14
165	0.2
166	0.23
167	0.26
168	0.27
169	0.27
170	0.25
171	0.25
172	0.23
173	0.17
174	0.16
175	0.15
176	0.15
177	0.17
178	0.17
179	0.17
180	0.17
181	0.18
182	0.17
183	0.14
184	0.14
185	0.14
186	0.16
187	0.17
188	0.15
189	0.14
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.09
194	0.07
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.09
204	0.08
205	0.09
206	0.11
207	0.11
208	0.12
209	0.12
210	0.15
211	0.24
212	0.24
213	0.26
214	0.24
215	0.25
216	0.3
217	0.34
218	0.35
219	0.34
220	0.44
221	0.47
222	0.49
223	0.55
224	0.53
225	0.56
226	0.6
227	0.61
228	0.6
229	0.58
230	0.6
231	0.61
232	0.67
233	0.67
234	0.64
235	0.63
236	0.54
237	0.52
238	0.49
239	0.43
240	0.34
241	0.3
242	0.3
243	0.23
244	0.23
245	0.24
246	0.25
247	0.25
248	0.26
249	0.25
250	0.21
251	0.21
252	0.22
253	0.2
254	0.19
255	0.17
256	0.17
257	0.18
258	0.18
259	0.17
260	0.16
261	0.16
262	0.18
263	0.17
264	0.16
265	0.13
266	0.11
267	0.17
268	0.2
269	0.26
270	0.24
271	0.26
272	0.28
273	0.29
274	0.31
275	0.29
276	0.28
277	0.28
278	0.27
279	0.27
280	0.23
281	0.22
282	0.2
283	0.17
284	0.14
285	0.14
286	0.14
287	0.18
288	0.19
289	0.2
290	0.23
291	0.24
292	0.25
293	0.2
294	0.21
295	0.17
296	0.16
297	0.16
298	0.12
299	0.13
300	0.12
301	0.14
302	0.15
303	0.18
304	0.2
305	0.24
306	0.31
307	0.34
308	0.38
309	0.45
310	0.51
311	0.54
312	0.6
313	0.62
314	0.62
315	0.65
316	0.68
317	0.65
318	0.64
319	0.6
320	0.55
321	0.55
322	0.56
323	0.58
324	0.57
325	0.57
326	0.51
327	0.5
328	0.47
329	0.4
330	0.38
331	0.33
332	0.31
333	0.31
334	0.29
335	0.29
336	0.28
337	0.29
338	0.24
339	0.21
340	0.2
341	0.19
342	0.2
343	0.22
344	0.22
345	0.21
346	0.21
347	0.2
348	0.18
349	0.19
350	0.26
351	0.25
352	0.27
353	0.28
354	0.31
355	0.39
356	0.43
357	0.38
358	0.37
359	0.4
360	0.42
361	0.48
362	0.54
363	0.53
364	0.56
365	0.63
366	0.66
367	0.68
368	0.7
369	0.68
370	0.68
371	0.64
372	0.58
373	0.54
374	0.5
375	0.44
376	0.39
377	0.35
378	0.27
379	0.25
380	0.21
381	0.19
382	0.14
383	0.15
384	0.14
385	0.13
386	0.1
387	0.09
388	0.1
389	0.08
390	0.08
391	0.07
392	0.06
393	0.07
394	0.1
395	0.1
396	0.1
397	0.11
398	0.12
399	0.11
400	0.12
401	0.12
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.12
406	0.15
407	0.15
408	0.14
409	0.15
410	0.18
411	0.22
412	0.28
413	0.28
414	0.28
415	0.34
416	0.4
417	0.39
418	0.35
419	0.3
420	0.26
421	0.23
422	0.2
423	0.14
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.07
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.1
433	0.11
434	0.13
435	0.15
436	0.17
437	0.17
438	0.25
439	0.28
440	0.29
441	0.39
442	0.45
443	0.46
444	0.48
445	0.49
446	0.43
447	0.41
448	0.37
449	0.26
450	0.18
451	0.15
452	0.13
453	0.11
454	0.1
455	0.09
456	0.07
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.04
461	0.05
462	0.05
463	0.07
464	0.07
465	0.12
466	0.14
467	0.23
468	0.25
469	0.3
470	0.33
471	0.38
472	0.48
473	0.48
474	0.49
475	0.51
476	0.57
477	0.54
478	0.55
479	0.5
480	0.42
481	0.42
482	0.39
483	0.34
484	0.27
485	0.24
486	0.24
487	0.28
488	0.28
489	0.25
490	0.24
491	0.21
492	0.23
493	0.24
494	0.26
495	0.24
496	0.24
497	0.27
498	0.28
499	0.28
500	0.23
501	0.23
502	0.2
503	0.25
504	0.32
505	0.35
506	0.41
507	0.43
508	0.48
509	0.49
510	0.48
511	0.44
512	0.37
513	0.3
514	0.24
515	0.23
516	0.18
517	0.2
518	0.19
519	0.14
520	0.12
521	0.11
522	0.1
523	0.09
524	0.09
525	0.07
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.06
533	0.07
534	0.08
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.07
539	0.09
540	0.1
541	0.09
542	0.12
543	0.13
544	0.17
545	0.19
546	0.19
547	0.18
548	0.17
549	0.16
550	0.14
551	0.18
552	0.14
553	0.13
554	0.13
555	0.14
556	0.13
557	0.14
558	0.14
559	0.07
560	0.07
561	0.06
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.04
566	0.05
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.06
571	0.06
572	0.1
573	0.16
574	0.16
575	0.16
576	0.2
577	0.21
578	0.21
579	0.21
580	0.17
581	0.12
582	0.11
583	0.11
584	0.08
585	0.06
586	0.06
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.04
592	0.04
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.1
597	0.11
598	0.13
599	0.15
600	0.15
601	0.12
602	0.13
603	0.18
604	0.18
605	0.19
606	0.2
607	0.19
608	0.19
609	0.18
610	0.19
611	0.15
612	0.15
613	0.15
614	0.14
615	0.15
616	0.15
617	0.15
618	0.16
619	0.16
620	0.19
621	0.2
622	0.24
623	0.27
624	0.31
625	0.32
626	0.3
627	0.3
628	0.26
629	0.24
630	0.18
631	0.15
632	0.13
633	0.11
634	0.1
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.06
640	0.04
641	0.05
642	0.06
643	0.07
644	0.07
645	0.07
646	0.07
647	0.07
648	0.08
649	0.09
650	0.12
651	0.13
652	0.15
653	0.16
654	0.16
655	0.18
656	0.21
657	0.25
658	0.27
659	0.29
660	0.28
661	0.27
662	0.27
663	0.26
664	0.22
665	0.17
666	0.11
667	0.08
668	0.07
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.05
673	0.06
674	0.09
675	0.09
676	0.1
677	0.1
678	0.1
679	0.09
680	0.09
681	0.08
682	0.04
683	0.04
684	0.03
685	0.03
686	0.03
687	0.03
688	0.04
689	0.04
690	0.05
691	0.06
692	0.06
693	0.08
694	0.08
695	0.09
696	0.11
697	0.14
698	0.14
699	0.15
700	0.18
701	0.16
702	0.21
703	0.29
704	0.29
705	0.33
706	0.36
707	0.36
708	0.39
709	0.43
710	0.48
711	0.5
712	0.56
713	0.52
714	0.52
715	0.57
716	0.55
717	0.51
718	0.42
719	0.38
720	0.34
721	0.31
722	0.28
723	0.24
724	0.21
725	0.2
726	0.21
727	0.16
728	0.12
729	0.11
730	0.09
731	0.08
732	0.08
733	0.08
734	0.06
735	0.06
736	0.06
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.06
741	0.05
742	0.05
743	0.04
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.06
748	0.06
749	0.05
750	0.05
751	0.06
752	0.05
753	0.06
754	0.07
755	0.07
756	0.12
757	0.13
758	0.15
759	0.15
760	0.16
761	0.16
762	0.16
763	0.17
764	0.14
765	0.15
766	0.14
767	0.14
768	0.14
769	0.14
770	0.13
771	0.1
772	0.1
773	0.09
774	0.09
775	0.1
776	0.09
777	0.08
778	0.08
779	0.09
780	0.08
781	0.08
782	0.08
783	0.08
784	0.09
785	0.08
786	0.08
787	0.1
788	0.09
789	0.09
790	0.07
791	0.07
792	0.06
793	0.07
794	0.07
795	0.05
796	0.05
797	0.04
798	0.04
799	0.04
800	0.05
801	0.05
802	0.05
803	0.05
804	0.05
805	0.06
806	0.06
807	0.07
808	0.08
809	0.11
810	0.12
811	0.12
812	0.13
813	0.15
814	0.16
815	0.21
816	0.22
817	0.19
818	0.19
819	0.2
820	0.19
821	0.17
822	0.17
823	0.13
824	0.14
825	0.15
826	0.16
827	0.16
828	0.16
829	0.17
830	0.17
831	0.15
832	0.13
833	0.14
834	0.11
835	0.11
836	0.1
837	0.1
838	0.09
839	0.12
840	0.12
841	0.18
842	0.24
843	0.27
844	0.31
845	0.35
846	0.36
847	0.38
848	0.4
849	0.4
850	0.43
851	0.45
852	0.45
853	0.46
854	0.52
855	0.47
856	0.45
857	0.43
858	0.37
859	0.35
860	0.35
861	0.35
862	0.29
863	0.32
864	0.4
865	0.36
866	0.36
867	0.36
868	0.4
869	0.34
870	0.34
871	0.34
872	0.28
873	0.29
874	0.3
875	0.29
876	0.22
877	0.25
878	0.33
879	0.39
880	0.45
881	0.47
882	0.51
883	0.58
884	0.59
885	0.57
886	0.53
887	0.44
888	0.39
889	0.42
890	0.39
891	0.3
892	0.3
893	0.29
894	0.25
895	0.25
896	0.21
897	0.14
898	0.1
899	0.1
900	0.1
901	0.1
902	0.08
903	0.08
904	0.09
905	0.09
906	0.09
907	0.12
908	0.11
909	0.12
910	0.13
911	0.13
912	0.13
913	0.14
914	0.15
915	0.12
916	0.12
917	0.13
918	0.13
919	0.14
920	0.13
921	0.13
922	0.13
923	0.14
924	0.14
925	0.16
926	0.16
927	0.19
928	0.2
929	0.24
930	0.31
931	0.32
932	0.32
933	0.29
934	0.29
935	0.26
936	0.3
937	0.29
938	0.28
939	0.27
940	0.32
941	0.33
942	0.33
943	0.32
944	0.28
945	0.24
946	0.17
947	0.14
948	0.08
949	0.08
950	0.06
951	0.06
952	0.05
953	0.04
954	0.04
955	0.04
956	0.04
957	0.04
958	0.04
959	0.04
960	0.06
961	0.06
962	0.07
963	0.08
964	0.11
965	0.11
966	0.13
967	0.13
968	0.12
969	0.12
970	0.12
971	0.12
972	0.1
973	0.1
974	0.09
975	0.08
976	0.08
977	0.07
978	0.07
979	0.06
980	0.06
981	0.08
982	0.07
983	0.08
984	0.1
985	0.1
986	0.11
987	0.15
988	0.22
989	0.22
990	0.23
991	0.22
992	0.21
993	0.21
994	0.21
995	0.17
996	0.1
997	0.08
998	0.08
999	0.12
1000	0.11
1001	0.12
1002	0.15
1003	0.19
1004	0.2
1005	0.2
1006	0.2
1007	0.18
1008	0.18
1009	0.18
1010	0.15
1011	0.15
1012	0.18
1013	0.18
1014	0.2
1015	0.2
1016	0.24
1017	0.29
1018	0.32
1019	0.3
1020	0.3
1021	0.31
1022	0.33
1023	0.36
1024	0.32
1025	0.26
1026	0.23
1027	0.21
1028	0.17
1029	0.16
1030	0.11
1031	0.06
1032	0.06
1033	0.05
1034	0.05
1035	0.05
1036	0.04
1037	0.03
1038	0.03
1039	0.03
1040	0.04
1041	0.04
1042	0.04
1043	0.05
1044	0.05
1045	0.05
1046	0.05
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.06
1050	0.06
1051	0.06
1052	0.06
1053	0.06
1054	0.06
1055	0.06
1056	0.07
1057	0.07
1058	0.08
1059	0.11
1060	0.14
1061	0.13
1062	0.15
1063	0.15
1064	0.14
1065	0.13
1066	0.13
1067	0.13
1068	0.14
1069	0.24
1070	0.28
1071	0.31
1072	0.35
1073	0.38
1074	0.41
1075	0.41
1076	0.43
1077	0.4
1078	0.4
1079	0.45
1080	0.46
1081	0.5
1082	0.49
1083	0.52
1084	0.49
1085	0.49
1086	0.48
1087	0.43
1088	0.43
1089	0.43
1090	0.48
1091	0.5
1092	0.56
1093	0.59
1094	0.59
1095	0.61
1096	0.58
1097	0.58
1098	0.53
1099	0.46
1100	0.38
1101	0.31
1102	0.28
1103	0.27
1104	0.33
1105	0.3
1106	0.35
1107	0.36
1108	0.39
1109	0.42
1110	0.44
1111	0.44
1112	0.44
1113	0.44
1114	0.39
1115	0.42
1116	0.41
1117	0.46
1118	0.49
1119	0.5
1120	0.47
1121	0.45
1122	0.42
1123	0.4
1124	0.42
1125	0.33
1126	0.29
1127	0.26
1128	0.23
1129	0.22
1130	0.23
1131	0.22
1132	0.22
1133	0.23
1134	0.27
1135	0.32
1136	0.4
1137	0.43
1138	0.48
1139	0.51
1140	0.53
1141	0.55
1142	0.51
1143	0.45
1144	0.42
1145	0.38
1146	0.34
1147	0.29
1148	0.23
1149	0.18
1150	0.17
1151	0.15
1152	0.1
1153	0.08
1154	0.05
1155	0.05
1156	0.05
1157	0.04
1158	0.04
1159	0.05
1160	0.04
1161	0.04
1162	0.05
1163	0.05
1164	0.11
1165	0.12
1166	0.13
1167	0.16
1168	0.17
1169	0.18
1170	0.2
1171	0.21
1172	0.16
1173	0.21
1174	0.21
1175	0.18
1176	0.17
1177	0.17
1178	0.16
1179	0.15
1180	0.16
1181	0.11
1182	0.12
1183	0.11
1184	0.11
1185	0.13
1186	0.13
1187	0.13
1188	0.13
1189	0.14
1190	0.14
1191	0.16
1192	0.17
1193	0.18
1194	0.18
1195	0.2
1196	0.18
1197	0.17
1198	0.22
1199	0.27
1200	0.33
1201	0.35
1202	0.38
1203	0.36
1204	0.36
1205	0.37
1206	0.31
1207	0.24
1208	0.16
1209	0.16
1210	0.12
1211	0.11
1212	0.11
1213	0.1
1214	0.1
1215	0.1
1216	0.09
1217	0.06
1218	0.06
1219	0.05
1220	0.07
1221	0.1
1222	0.11
1223	0.11
1224	0.15
1225	0.16
1226	0.17
1227	0.23
1228	0.22
1229	0.27
1230	0.31
1231	0.32
1232	0.31
1233	0.31
1234	0.31
1235	0.29
1236	0.29
1237	0.22
1238	0.2
1239	0.19
1240	0.17
1241	0.16
1242	0.15
1243	0.13
1244	0.15
1245	0.17
1246	0.16
1247	0.15
1248	0.16
1249	0.17
1250	0.2
1251	0.2
1252	0.19
1253	0.17
1254	0.15
1255	0.15
1256	0.15
1257	0.14
1258	0.11
1259	0.11
1260	0.11
1261	0.13
1262	0.13
1263	0.12
1264	0.12
1265	0.11
1266	0.1
1267	0.09
1268	0.07
1269	0.06
1270	0.07
1271	0.07
1272	0.08
1273	0.09
1274	0.09
1275	0.1
1276	0.11
1277	0.13
1278	0.11
1279	0.12
1280	0.12
1281	0.11
1282	0.12
1283	0.12
1284	0.12
1285	0.1
1286	0.09
1287	0.13
1288	0.16
1289	0.2
1290	0.28
1291	0.34
1292	0.4
1293	0.43
1294	0.48
1295	0.47
1296	0.51
1297	0.52
1298	0.51
1299	0.5
1300	0.54
1301	0.52
1302	0.49
1303	0.48
1304	0.43
1305	0.44
1306	0.39
1307	0.33
1308	0.28
1309	0.28

A0A0J0XZI3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer