Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XBJ3

Protein Details
Accession A0A0J0XBJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-197SEAPKKGKATKKKAAPKKAAPKKAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-157PPAKKAKRAPTAGKSVAR
175-203APKKGKATKKKAAPKKAAPKKAAAKKKGQ
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.833, cyto 12.5, nucl 12, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027093  EAF_fam  
IPR019194  Tscrpt_elong_fac_Eaf_N  
Gene Ontology GO:0032783  C:super elongation complex  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09816  EAF  
Amino Acid Sequences MSTADPLIALPDGTFPLKFADSARDALRGKKRPHDDVVALKYAFKPASVAADTPGVLEPAPSGVTGGRVLSFDLSSGQSQVFDVREESSKPRECVLVWNEDQQTFTLHALPSTLHLTQNRTLSAQRVNGAFPAAEPSAPPPAKKAKRAPTAGKSVARKQVPSAADLDPVLPSSEAPKKGKATKKKAAPKKAAPKKAAAKKKGQAPVSSPAQGKIKSVEIIEDSDDDLDEFADMLGDAMEAAESEEEDEVEEEDDDELGGAQYAGYAAADAEGDEEWI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.15
7 0.2
8 0.21
9 0.25
10 0.26
11 0.29
12 0.3
13 0.37
14 0.46
15 0.48
16 0.51
17 0.57
18 0.63
19 0.63
20 0.68
21 0.67
22 0.62
23 0.63
24 0.63
25 0.59
26 0.51
27 0.46
28 0.41
29 0.38
30 0.32
31 0.23
32 0.18
33 0.13
34 0.19
35 0.19
36 0.18
37 0.16
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.11
43 0.09
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.07
60 0.08
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.11
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.18
75 0.24
76 0.28
77 0.28
78 0.29
79 0.28
80 0.27
81 0.32
82 0.31
83 0.31
84 0.27
85 0.32
86 0.32
87 0.31
88 0.31
89 0.24
90 0.22
91 0.16
92 0.16
93 0.13
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.14
103 0.17
104 0.2
105 0.22
106 0.21
107 0.2
108 0.19
109 0.2
110 0.22
111 0.2
112 0.19
113 0.17
114 0.17
115 0.16
116 0.16
117 0.13
118 0.09
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.09
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.26
129 0.3
130 0.37
131 0.44
132 0.46
133 0.54
134 0.6
135 0.63
136 0.59
137 0.62
138 0.6
139 0.57
140 0.52
141 0.49
142 0.5
143 0.45
144 0.4
145 0.33
146 0.35
147 0.3
148 0.28
149 0.26
150 0.19
151 0.19
152 0.18
153 0.18
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.07
158 0.06
159 0.09
160 0.15
161 0.2
162 0.21
163 0.25
164 0.3
165 0.38
166 0.47
167 0.53
168 0.57
169 0.61
170 0.68
171 0.75
172 0.8
173 0.82
174 0.82
175 0.81
176 0.83
177 0.85
178 0.84
179 0.76
180 0.75
181 0.75
182 0.76
183 0.76
184 0.7
185 0.69
186 0.66
187 0.72
188 0.71
189 0.64
190 0.58
191 0.52
192 0.54
193 0.49
194 0.49
195 0.4
196 0.37
197 0.38
198 0.36
199 0.33
200 0.28
201 0.26
202 0.23
203 0.22
204 0.21
205 0.17
206 0.18
207 0.18
208 0.16
209 0.14
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05