Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XIY4

Protein Details
Accession A0A0J0XIY4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
209-228GPPPVPKKSKGKKAGGRDMSBasic
287-309VEAPPPPKKKRTVSAPHRRPVDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-223VPKKSKGKKAG
269-305KRKKEKVEEEEKQPREEEVEAPPPPKKKRTVSAPHRR
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 8, cyto 8, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MGRGQGIDLRAEEEAARRAARSAVGGARFAGSGSRAKHTDLLGEQALRARLHRISHEHGMAFDDEAMRLLAMGAETRMRSLLGSAVRAQQHRVHSTHQHKPPMRASGSKGAKPLWSQKITSDTAAVMAALATANREQNKAHRVARTERNARETEMARAQAAAKEREERESGSAPDTGAGASPAAPPDEPGPSRQRPSEPVFQASPTFGGPPPVPKKSKGKKAGGRDMSAEVQAKITNQTATVNAGRKRYAWEMGGGAFRPQVSSLLSGKRKKEKVEEEEKQPREEEVEAPPPPKKKRTVSAPHRRPVDVAVRGDKRARDDTALTVVDVVFALEREGSGRGMGTADEIVRRQYAKPGGPYGPWQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.2
4 0.18
5 0.19
6 0.2
7 0.21
8 0.19
9 0.2
10 0.23
11 0.24
12 0.24
13 0.24
14 0.23
15 0.21
16 0.19
17 0.16
18 0.12
19 0.16
20 0.18
21 0.23
22 0.23
23 0.25
24 0.29
25 0.28
26 0.31
27 0.27
28 0.3
29 0.27
30 0.26
31 0.25
32 0.25
33 0.28
34 0.23
35 0.22
36 0.21
37 0.22
38 0.25
39 0.3
40 0.33
41 0.36
42 0.42
43 0.45
44 0.41
45 0.38
46 0.37
47 0.32
48 0.25
49 0.2
50 0.14
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.12
69 0.12
70 0.14
71 0.16
72 0.21
73 0.25
74 0.26
75 0.28
76 0.29
77 0.33
78 0.36
79 0.36
80 0.36
81 0.42
82 0.5
83 0.56
84 0.58
85 0.62
86 0.61
87 0.65
88 0.66
89 0.64
90 0.59
91 0.53
92 0.51
93 0.51
94 0.53
95 0.48
96 0.45
97 0.38
98 0.38
99 0.37
100 0.41
101 0.4
102 0.37
103 0.35
104 0.36
105 0.4
106 0.39
107 0.36
108 0.28
109 0.19
110 0.17
111 0.16
112 0.13
113 0.07
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.17
125 0.22
126 0.27
127 0.3
128 0.31
129 0.35
130 0.41
131 0.49
132 0.53
133 0.55
134 0.52
135 0.54
136 0.51
137 0.49
138 0.46
139 0.38
140 0.33
141 0.28
142 0.26
143 0.2
144 0.2
145 0.19
146 0.16
147 0.18
148 0.16
149 0.14
150 0.18
151 0.19
152 0.21
153 0.22
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.2
158 0.17
159 0.17
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.09
164 0.07
165 0.06
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.1
175 0.1
176 0.13
177 0.2
178 0.22
179 0.25
180 0.26
181 0.28
182 0.3
183 0.35
184 0.4
185 0.35
186 0.35
187 0.34
188 0.33
189 0.31
190 0.26
191 0.21
192 0.13
193 0.13
194 0.09
195 0.11
196 0.1
197 0.18
198 0.23
199 0.28
200 0.3
201 0.33
202 0.44
203 0.5
204 0.6
205 0.61
206 0.66
207 0.67
208 0.75
209 0.81
210 0.74
211 0.67
212 0.59
213 0.53
214 0.44
215 0.39
216 0.31
217 0.2
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.14
228 0.17
229 0.21
230 0.23
231 0.26
232 0.26
233 0.26
234 0.29
235 0.29
236 0.29
237 0.23
238 0.22
239 0.21
240 0.22
241 0.23
242 0.19
243 0.16
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.12
251 0.15
252 0.23
253 0.31
254 0.36
255 0.42
256 0.51
257 0.54
258 0.55
259 0.62
260 0.63
261 0.65
262 0.7
263 0.7
264 0.7
265 0.76
266 0.74
267 0.66
268 0.57
269 0.48
270 0.4
271 0.35
272 0.28
273 0.23
274 0.28
275 0.28
276 0.3
277 0.34
278 0.39
279 0.44
280 0.48
281 0.5
282 0.51
283 0.58
284 0.66
285 0.73
286 0.76
287 0.81
288 0.85
289 0.84
290 0.81
291 0.73
292 0.63
293 0.58
294 0.56
295 0.51
296 0.47
297 0.48
298 0.47
299 0.49
300 0.52
301 0.49
302 0.46
303 0.44
304 0.41
305 0.37
306 0.35
307 0.35
308 0.37
309 0.35
310 0.29
311 0.25
312 0.22
313 0.18
314 0.15
315 0.12
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.14
333 0.14
334 0.16
335 0.19
336 0.21
337 0.2
338 0.26
339 0.33
340 0.36
341 0.41
342 0.46
343 0.46