Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XD27

Protein Details
Accession A0A0J0XD27    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-272SRDSKKSDKAGEKKKRKPRKKKEAGEDGGEBasic
309-334DESSTEAGKRRNRRKRAPGTGRGGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-196ANKSRAKAAKKKEKAASKKDEKDSKADAKSDKAR
247-266KKSDKAGEKKKRKPRKKKEA
316-335GKRRNRRKRAPGTGRGGGGA
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 13.333, cyto 3, cyto_nucl 2.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MPRGTKAPAPRLKLVIRRLPPTLPEETFWRVVEPFVEGKSLWRRYVKGRAGDAFGVHPQHSRAYVLMNDTESLIAFHAGFDGHIFRNKAGVEYQAVIEYAPIEKTPYKAKVKKDAREGTIDDDPDYLAFLENRGAVEAKASPEITAASQPTSTPLLEALRAAANKSRAKAAKKKEKAASKKDEKDSKADAKSDKARAAALASISEAATKRAPKTAGSGGVVMVAGKGREVFVAPAEVVQEGDSRDSKKSDKAGEKKKRKPRKKKEAGEDGGEHAGTIAAGAGKSASASASAPPAPKKDARIDGGLAVVDESSTEAGKRRNRRKRAPGTGRGGGGAGGGEGRPVTEGSVVEENSGQSRSQKPRAAREQGAATSRDGSAVSAPRGRGRGGLLPSEARIDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.65
4 0.63
5 0.62
6 0.58
7 0.55
8 0.52
9 0.5
10 0.42
11 0.38
12 0.38
13 0.4
14 0.39
15 0.36
16 0.33
17 0.26
18 0.25
19 0.23
20 0.22
21 0.19
22 0.17
23 0.18
24 0.15
25 0.22
26 0.31
27 0.35
28 0.36
29 0.38
30 0.41
31 0.47
32 0.58
33 0.59
34 0.57
35 0.58
36 0.56
37 0.56
38 0.54
39 0.47
40 0.39
41 0.35
42 0.3
43 0.25
44 0.23
45 0.2
46 0.21
47 0.21
48 0.2
49 0.17
50 0.17
51 0.19
52 0.2
53 0.21
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.17
58 0.14
59 0.12
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.15
71 0.16
72 0.16
73 0.19
74 0.19
75 0.2
76 0.18
77 0.19
78 0.16
79 0.17
80 0.17
81 0.14
82 0.14
83 0.12
84 0.11
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.19
93 0.27
94 0.36
95 0.42
96 0.48
97 0.56
98 0.65
99 0.69
100 0.73
101 0.72
102 0.65
103 0.65
104 0.6
105 0.54
106 0.48
107 0.42
108 0.32
109 0.25
110 0.22
111 0.16
112 0.15
113 0.1
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.18
151 0.19
152 0.2
153 0.25
154 0.28
155 0.34
156 0.42
157 0.49
158 0.54
159 0.58
160 0.65
161 0.66
162 0.71
163 0.74
164 0.75
165 0.75
166 0.74
167 0.76
168 0.75
169 0.76
170 0.68
171 0.64
172 0.61
173 0.58
174 0.51
175 0.46
176 0.4
177 0.38
178 0.42
179 0.4
180 0.35
181 0.28
182 0.26
183 0.22
184 0.21
185 0.17
186 0.11
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.12
197 0.14
198 0.15
199 0.15
200 0.19
201 0.21
202 0.21
203 0.2
204 0.2
205 0.17
206 0.16
207 0.15
208 0.11
209 0.08
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.06
228 0.08
229 0.1
230 0.11
231 0.13
232 0.15
233 0.17
234 0.2
235 0.24
236 0.31
237 0.39
238 0.47
239 0.56
240 0.65
241 0.74
242 0.79
243 0.86
244 0.89
245 0.9
246 0.92
247 0.93
248 0.93
249 0.94
250 0.94
251 0.93
252 0.93
253 0.86
254 0.8
255 0.7
256 0.61
257 0.51
258 0.4
259 0.3
260 0.18
261 0.14
262 0.08
263 0.06
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.06
276 0.09
277 0.11
278 0.14
279 0.17
280 0.19
281 0.23
282 0.26
283 0.29
284 0.34
285 0.38
286 0.38
287 0.39
288 0.38
289 0.34
290 0.32
291 0.27
292 0.2
293 0.13
294 0.1
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.09
302 0.16
303 0.25
304 0.35
305 0.46
306 0.56
307 0.66
308 0.76
309 0.84
310 0.88
311 0.92
312 0.92
313 0.91
314 0.89
315 0.83
316 0.73
317 0.62
318 0.51
319 0.4
320 0.29
321 0.19
322 0.11
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.12
334 0.17
335 0.17
336 0.17
337 0.18
338 0.18
339 0.18
340 0.19
341 0.16
342 0.16
343 0.25
344 0.33
345 0.41
346 0.47
347 0.51
348 0.61
349 0.7
350 0.74
351 0.69
352 0.66
353 0.64
354 0.63
355 0.61
356 0.52
357 0.43
358 0.37
359 0.32
360 0.28
361 0.21
362 0.17
363 0.18
364 0.21
365 0.24
366 0.26
367 0.28
368 0.32
369 0.34
370 0.34
371 0.31
372 0.31
373 0.34
374 0.33
375 0.36
376 0.34
377 0.34
378 0.35