FuNGI

B2WPG2

Protein Details

Accession

B2WPG2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-45	PVAANGQPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQ	Hydrophilic
182-204	PTGTKKPPAFHKKTEQKYRPDDT	Hydrophilic
522-548	EASGNESSRKKHKKKHSEKLADGTRKS	Basic
562-587	SEMTDAGKKRKKDKKEKNRIMIGNTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-42	RRRRPRPQADVLRKPRR
171-171	K
184-191	GTKKPPAF
509-541	GKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHSEKL
568-580	GKKRKKDKKEKNR

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNGNMNGNPPSVAPAAPVAANGQPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQNITKPLVSLSQMNEAKKTVPTAENGARSKEELKQEFINQGAHVFPLIVSRKNLKELRHHVMRLQSKSHVDIQDEKQFAPPIKLHRRDPRAPPSGVGSHYEEEDTREDMEETKERERIELQKEERRKVREENQAKIAPTGTKKPPAFHKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDYENKQTWVGTYESEMSETHVMLSTTNPGNIQTAIQLAPMERWYRFNVKNKVKAGSDDMDKLVTKLESGGPRFFAELERRQAQRVKAEDEAKLWSGVRTRVGGGADDEGRIKRERNDDDMGGFVKREADADDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGEEQDVKEAAEKLKRDQLQAALWDRPDEQLLARKEEEERRLAELTKASEKSTRKQLAKREKQYDYLDSDPENPYITESESDTDSETERQQAKEEAEKKAAEQNGKAVEGGAMASGTSTKANTPSGNHKANDGKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHSEKLADGTRKSTLGSFKGAGSGSDSEMTDAGKKRKKDKKEKNRIMIGNTPSATPGASRAGSPAAGNGSRAASPTTTTTAAPARQALPSAREIYDSLPPQGMNIQNLIAKFKGRVDKTNTQMFIKLVKAVSSFDKAKSWLTPLPAMPSDEHISAYMTGGSAPKTT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.16
3	0.15
4	0.15
5	0.14
6	0.14
7	0.19
8	0.19
9	0.24
10	0.3
11	0.37
12	0.47
13	0.55
14	0.63
15	0.68
16	0.78
17	0.82
18	0.84
19	0.88
20	0.89
21	0.9
22	0.92
23	0.92
24	0.92
25	0.86
26	0.82
27	0.8
28	0.79
29	0.75
30	0.74
31	0.75
32	0.75
33	0.78
34	0.78
35	0.71
36	0.61
37	0.56
38	0.49
39	0.39
40	0.32
41	0.27
42	0.32
43	0.33
44	0.35
45	0.35
46	0.33
47	0.33
48	0.31
49	0.31
50	0.26
51	0.24
52	0.26
53	0.31
54	0.37
55	0.43
56	0.43
57	0.44
58	0.4
59	0.4
60	0.4
61	0.39
62	0.42
63	0.37
64	0.39
65	0.4
66	0.42
67	0.43
68	0.42
69	0.38
70	0.28
71	0.26
72	0.22
73	0.18
74	0.15
75	0.11
76	0.09
77	0.15
78	0.18
79	0.2
80	0.23
81	0.29
82	0.31
83	0.4
84	0.44
85	0.41
86	0.49
87	0.54
88	0.59
89	0.62
90	0.6
91	0.56
92	0.61
93	0.64
94	0.59
95	0.55
96	0.51
97	0.46
98	0.48
99	0.51
100	0.45
101	0.4
102	0.42
103	0.44
104	0.47
105	0.45
106	0.42
107	0.39
108	0.39
109	0.37
110	0.34
111	0.32
112	0.34
113	0.43
114	0.5
115	0.55
116	0.61
117	0.69
118	0.72
119	0.78
120	0.77
121	0.74
122	0.69
123	0.61
124	0.57
125	0.52
126	0.46
127	0.4
128	0.34
129	0.27
130	0.27
131	0.27
132	0.21
133	0.2
134	0.2
135	0.18
136	0.14
137	0.14
138	0.14
139	0.15
140	0.18
141	0.21
142	0.22
143	0.25
144	0.27
145	0.26
146	0.28
147	0.31
148	0.35
149	0.36
150	0.42
151	0.44
152	0.5
153	0.57
154	0.63
155	0.65
156	0.62
157	0.6
158	0.6
159	0.63
160	0.65
161	0.65
162	0.63
163	0.64
164	0.63
165	0.59
166	0.52
167	0.44
168	0.38
169	0.35
170	0.36
171	0.33
172	0.38
173	0.39
174	0.42
175	0.51
176	0.57
177	0.61
178	0.6
179	0.66
180	0.68
181	0.76
182	0.84
183	0.81
184	0.79
185	0.8
186	0.78
187	0.72
188	0.69
189	0.65
190	0.6
191	0.64
192	0.63
193	0.62
194	0.59
195	0.58
196	0.58
197	0.6
198	0.62
199	0.57
200	0.53
201	0.53
202	0.55
203	0.52
204	0.49
205	0.43
206	0.36
207	0.31
208	0.26
209	0.2
210	0.17
211	0.18
212	0.22
213	0.28
214	0.28
215	0.27
216	0.26
217	0.26
218	0.25
219	0.24
220	0.18
221	0.1
222	0.1
223	0.13
224	0.12
225	0.14
226	0.13
227	0.12
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.1
232	0.1
233	0.09
234	0.09
235	0.12
236	0.11
237	0.12
238	0.12
239	0.11
240	0.12
241	0.12
242	0.12
243	0.08
244	0.09
245	0.08
246	0.09
247	0.08
248	0.07
249	0.08
250	0.1
251	0.12
252	0.11
253	0.13
254	0.16
255	0.24
256	0.3
257	0.39
258	0.47
259	0.53
260	0.61
261	0.61
262	0.61
263	0.54
264	0.5
265	0.45
266	0.38
267	0.33
268	0.26
269	0.24
270	0.21
271	0.2
272	0.19
273	0.15
274	0.11
275	0.09
276	0.08
277	0.12
278	0.15
279	0.17
280	0.18
281	0.18
282	0.18
283	0.19
284	0.18
285	0.17
286	0.19
287	0.21
288	0.26
289	0.29
290	0.3
291	0.32
292	0.36
293	0.35
294	0.36
295	0.34
296	0.32
297	0.32
298	0.34
299	0.33
300	0.3
301	0.29
302	0.23
303	0.21
304	0.17
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.12
310	0.12
311	0.13
312	0.14
313	0.13
314	0.11
315	0.12
316	0.11
317	0.1
318	0.11
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.14
324	0.21
325	0.24
326	0.28
327	0.31
328	0.29
329	0.29
330	0.29
331	0.25
332	0.18
333	0.15
334	0.1
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.03
361	0.02
362	0.02
363	0.02
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.08
372	0.08
373	0.1
374	0.13
375	0.14
376	0.16
377	0.23
378	0.24
379	0.24
380	0.25
381	0.25
382	0.24
383	0.27
384	0.28
385	0.23
386	0.21
387	0.21
388	0.2
389	0.17
390	0.16
391	0.12
392	0.1
393	0.15
394	0.17
395	0.2
396	0.19
397	0.2
398	0.23
399	0.28
400	0.3
401	0.26
402	0.26
403	0.25
404	0.26
405	0.26
406	0.24
407	0.21
408	0.21
409	0.24
410	0.23
411	0.21
412	0.26
413	0.28
414	0.31
415	0.39
416	0.44
417	0.44
418	0.49
419	0.58
420	0.63
421	0.71
422	0.76
423	0.74
424	0.68
425	0.69
426	0.67
427	0.61
428	0.55
429	0.47
430	0.39
431	0.32
432	0.32
433	0.27
434	0.24
435	0.2
436	0.15
437	0.14
438	0.13
439	0.13
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.1
444	0.11
445	0.11
446	0.11
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.16
451	0.19
452	0.19
453	0.19
454	0.22
455	0.23
456	0.3
457	0.34
458	0.32
459	0.33
460	0.33
461	0.32
462	0.35
463	0.36
464	0.3
465	0.26
466	0.27
467	0.26
468	0.26
469	0.24
470	0.19
471	0.15
472	0.13
473	0.12
474	0.07
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.05
482	0.06
483	0.09
484	0.11
485	0.13
486	0.16
487	0.25
488	0.32
489	0.37
490	0.37
491	0.39
492	0.44
493	0.47
494	0.54
495	0.51
496	0.52
497	0.56
498	0.66
499	0.67
500	0.68
501	0.72
502	0.7
503	0.74
504	0.7
505	0.68
506	0.6
507	0.56
508	0.48
509	0.4
510	0.38
511	0.31
512	0.26
513	0.24
514	0.25
515	0.27
516	0.38
517	0.48
518	0.5
519	0.57
520	0.68
521	0.74
522	0.83
523	0.9
524	0.91
525	0.9
526	0.87
527	0.87
528	0.86
529	0.83
530	0.73
531	0.64
532	0.55
533	0.45
534	0.4
535	0.34
536	0.29
537	0.23
538	0.26
539	0.24
540	0.23
541	0.25
542	0.25
543	0.21
544	0.2
545	0.18
546	0.16
547	0.16
548	0.16
549	0.13
550	0.14
551	0.14
552	0.16
553	0.2
554	0.28
555	0.32
556	0.37
557	0.47
558	0.56
559	0.67
560	0.73
561	0.79
562	0.81
563	0.87
564	0.93
565	0.92
566	0.93
567	0.87
568	0.81
569	0.78
570	0.7
571	0.66
572	0.55
573	0.45
574	0.36
575	0.32
576	0.26
577	0.18
578	0.16
579	0.14
580	0.14
581	0.13
582	0.14
583	0.16
584	0.16
585	0.16
586	0.15
587	0.16
588	0.16
589	0.16
590	0.16
591	0.16
592	0.16
593	0.17
594	0.17
595	0.12
596	0.14
597	0.16
598	0.18
599	0.18
600	0.17
601	0.2
602	0.23
603	0.24
604	0.24
605	0.25
606	0.23
607	0.22
608	0.25
609	0.25
610	0.24
611	0.26
612	0.28
613	0.26
614	0.26
615	0.25
616	0.25
617	0.3
618	0.29
619	0.26
620	0.25
621	0.24
622	0.23
623	0.28
624	0.29
625	0.23
626	0.22
627	0.22
628	0.22
629	0.23
630	0.25
631	0.2
632	0.19
633	0.19
634	0.24
635	0.31
636	0.33
637	0.41
638	0.47
639	0.55
640	0.59
641	0.67
642	0.63
643	0.56
644	0.55
645	0.49
646	0.44
647	0.36
648	0.35
649	0.26
650	0.26
651	0.25
652	0.24
653	0.27
654	0.3
655	0.31
656	0.28
657	0.31
658	0.31
659	0.33
660	0.33
661	0.35
662	0.32
663	0.34
664	0.37
665	0.35
666	0.4
667	0.39
668	0.39
669	0.34
670	0.36
671	0.35
672	0.3
673	0.29
674	0.23
675	0.22
676	0.2
677	0.2
678	0.15
679	0.11
680	0.12
681	0.13

B2WPG2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer