FuNGI

A0A0J0XCF2

Protein Details

Accession

A0A0J0XCF2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
112-137	YSSSSRPAPKKAQKAKKKEPEPAWAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
117-133	RPAPKKAQKAKKKEPEP

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 7, nucl 6.5, cyto 6.5, pero 6, mito 4, cysk 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MSFFGFDTALPDDPRAKGPGFHAHANTDAFNLGGAGVEEDLAVYQWGEGDASLLEGGDELNDETFGDFDDIAADFNFSAAPAPSKPRVASTKSHFGPKAVADPFAMTEDDFYSSSSRPAPKKAQKAKKKEPEPAWARASPANAWGAQRPPQHIPSIDEIEAGMAAARVSDKRASQPKQVFSLEEIERQLVSAPQPQTAAVPVPGHQRNVSQHQQMPMGTPPAHPTPPPQGNYNPQAVLDSMFPDMRQAQQGHAPPPPGMGPSPVPTMPSALRDKTPEQLAAIEARIAAKIESMSKFNNLMGNSDKDFITRIQLSQLATSDPYTSDFYAQVFSALKRQQGPEGPKGPNIVQAAPGMGFGVGGPANRFGKMGNASMQRLATQVRKLVASSSKRQANMSNDALQGALGRVPARRGAQATPRPVLNVGNSKADRHRPMQQLNTSSETRPALTRKQVMFALEELYDQALDIEQLRRDAPPPTDVPRVEAWSQACNAKVEEMWRTLMVMEPLGVSTPHPFISLLNPLKGQRLFPRLLRHLPSNESLTLLTLLVATYPQLDVVARAPPPPVADASLLTKADRLDRARREAETDSFLQYVVPGVDTLINQCGLGLISGLLGICSQRMDIGQVAATRPGVALFTALLSRAQSLLRAPPEHSPTAEEVDHWNKTFAYFLFHMVPHLNGVFPSSVAQKAAFGPGAYLLDPASQLEGVELERREAEAWGFAAALAVNAPEDRQTELVGALRDKILHAVQAARDPHTNRARAELKLRNVNMFLHGLGLDASMIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.27
3	0.25
4	0.26
5	0.3
6	0.38
7	0.39
8	0.43
9	0.42
10	0.41
11	0.43
12	0.42
13	0.38
14	0.28
15	0.24
16	0.17
17	0.15
18	0.12
19	0.08
20	0.06
21	0.06
22	0.06
23	0.05
24	0.06
25	0.05
26	0.05
27	0.05
28	0.05
29	0.05
30	0.05
31	0.04
32	0.05
33	0.05
34	0.06
35	0.05
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.06
40	0.06
41	0.05
42	0.05
43	0.05
44	0.04
45	0.05
46	0.05
47	0.05
48	0.06
49	0.06
50	0.06
51	0.06
52	0.07
53	0.08
54	0.07
55	0.07
56	0.08
57	0.08
58	0.09
59	0.09
60	0.09
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.06
65	0.07
66	0.07
67	0.1
68	0.12
69	0.18
70	0.22
71	0.26
72	0.27
73	0.33
74	0.39
75	0.41
76	0.47
77	0.48
78	0.55
79	0.54
80	0.61
81	0.56
82	0.5
83	0.5
84	0.44
85	0.44
86	0.35
87	0.33
88	0.26
89	0.26
90	0.25
91	0.23
92	0.2
93	0.12
94	0.12
95	0.12
96	0.14
97	0.13
98	0.13
99	0.14
100	0.14
101	0.16
102	0.21
103	0.27
104	0.28
105	0.35
106	0.45
107	0.52
108	0.62
109	0.71
110	0.76
111	0.79
112	0.87
113	0.9
114	0.9
115	0.89
116	0.88
117	0.84
118	0.84
119	0.79
120	0.76
121	0.71
122	0.62
123	0.56
124	0.49
125	0.45
126	0.35
127	0.32
128	0.27
129	0.22
130	0.23
131	0.23
132	0.24
133	0.28
134	0.32
135	0.33
136	0.36
137	0.37
138	0.4
139	0.38
140	0.38
141	0.38
142	0.39
143	0.34
144	0.29
145	0.26
146	0.22
147	0.19
148	0.15
149	0.09
150	0.04
151	0.04
152	0.04
153	0.05
154	0.05
155	0.08
156	0.11
157	0.13
158	0.21
159	0.31
160	0.35
161	0.43
162	0.5
163	0.52
164	0.56
165	0.56
166	0.49
167	0.41
168	0.44
169	0.36
170	0.32
171	0.29
172	0.24
173	0.22
174	0.21
175	0.19
176	0.14
177	0.14
178	0.17
179	0.17
180	0.18
181	0.18
182	0.18
183	0.18
184	0.18
185	0.17
186	0.13
187	0.13
188	0.13
189	0.21
190	0.23
191	0.25
192	0.24
193	0.27
194	0.3
195	0.37
196	0.41
197	0.39
198	0.4
199	0.41
200	0.42
201	0.38
202	0.36
203	0.3
204	0.28
205	0.23
206	0.21
207	0.22
208	0.23
209	0.24
210	0.22
211	0.24
212	0.29
213	0.35
214	0.36
215	0.36
216	0.37
217	0.42
218	0.46
219	0.45
220	0.36
221	0.29
222	0.28
223	0.25
224	0.21
225	0.15
226	0.12
227	0.1
228	0.1
229	0.09
230	0.1
231	0.11
232	0.11
233	0.16
234	0.15
235	0.15
236	0.21
237	0.25
238	0.26
239	0.27
240	0.27
241	0.22
242	0.23
243	0.22
244	0.17
245	0.14
246	0.14
247	0.13
248	0.14
249	0.18
250	0.16
251	0.17
252	0.16
253	0.18
254	0.16
255	0.19
256	0.21
257	0.2
258	0.21
259	0.24
260	0.25
261	0.27
262	0.28
263	0.23
264	0.2
265	0.19
266	0.18
267	0.16
268	0.14
269	0.11
270	0.09
271	0.08
272	0.08
273	0.07
274	0.06
275	0.05
276	0.06
277	0.09
278	0.1
279	0.12
280	0.13
281	0.15
282	0.16
283	0.16
284	0.19
285	0.15
286	0.16
287	0.18
288	0.2
289	0.19
290	0.2
291	0.18
292	0.15
293	0.16
294	0.14
295	0.16
296	0.14
297	0.13
298	0.13
299	0.16
300	0.16
301	0.16
302	0.16
303	0.12
304	0.12
305	0.12
306	0.11
307	0.09
308	0.1
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.11
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.14
320	0.16
321	0.17
322	0.19
323	0.2
324	0.22
325	0.27
326	0.32
327	0.33
328	0.38
329	0.37
330	0.36
331	0.37
332	0.34
333	0.33
334	0.29
335	0.23
336	0.17
337	0.16
338	0.15
339	0.13
340	0.13
341	0.07
342	0.06
343	0.05
344	0.03
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.09
353	0.08
354	0.11
355	0.13
356	0.14
357	0.16
358	0.18
359	0.19
360	0.2
361	0.2
362	0.16
363	0.15
364	0.16
365	0.14
366	0.13
367	0.15
368	0.14
369	0.14
370	0.14
371	0.16
372	0.21
373	0.22
374	0.26
375	0.3
376	0.33
377	0.33
378	0.34
379	0.36
380	0.34
381	0.36
382	0.34
383	0.3
384	0.27
385	0.26
386	0.25
387	0.2
388	0.15
389	0.09
390	0.07
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.09
396	0.1
397	0.12
398	0.13
399	0.15
400	0.24
401	0.29
402	0.32
403	0.31
404	0.3
405	0.29
406	0.28
407	0.26
408	0.2
409	0.21
410	0.19
411	0.24
412	0.24
413	0.25
414	0.28
415	0.33
416	0.33
417	0.3
418	0.37
419	0.37
420	0.42
421	0.47
422	0.48
423	0.46
424	0.46
425	0.47
426	0.4
427	0.33
428	0.32
429	0.25
430	0.21
431	0.2
432	0.21
433	0.21
434	0.25
435	0.31
436	0.29
437	0.31
438	0.31
439	0.29
440	0.27
441	0.23
442	0.2
443	0.13
444	0.12
445	0.1
446	0.09
447	0.07
448	0.06
449	0.05
450	0.03
451	0.04
452	0.05
453	0.07
454	0.07
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.11
459	0.14
460	0.14
461	0.16
462	0.18
463	0.22
464	0.28
465	0.27
466	0.29
467	0.28
468	0.3
469	0.27
470	0.27
471	0.24
472	0.2
473	0.21
474	0.2
475	0.19
476	0.16
477	0.16
478	0.13
479	0.13
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.14
484	0.13
485	0.13
486	0.12
487	0.13
488	0.11
489	0.09
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.05
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.12
503	0.21
504	0.21
505	0.21
506	0.23
507	0.23
508	0.28
509	0.28
510	0.27
511	0.24
512	0.28
513	0.3
514	0.32
515	0.4
516	0.4
517	0.45
518	0.46
519	0.45
520	0.42
521	0.43
522	0.42
523	0.37
524	0.31
525	0.27
526	0.23
527	0.19
528	0.17
529	0.13
530	0.1
531	0.07
532	0.06
533	0.05
534	0.05
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.05
541	0.06
542	0.07
543	0.11
544	0.1
545	0.11
546	0.12
547	0.13
548	0.14
549	0.14
550	0.14
551	0.12
552	0.12
553	0.13
554	0.15
555	0.18
556	0.17
557	0.16
558	0.17
559	0.15
560	0.18
561	0.22
562	0.24
563	0.3
564	0.35
565	0.42
566	0.44
567	0.44
568	0.45
569	0.43
570	0.41
571	0.36
572	0.33
573	0.28
574	0.25
575	0.24
576	0.19
577	0.15
578	0.14
579	0.09
580	0.08
581	0.06
582	0.06
583	0.08
584	0.08
585	0.09
586	0.1
587	0.1
588	0.09
589	0.09
590	0.09
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.04
599	0.04
600	0.04
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.05
605	0.06
606	0.08
607	0.08
608	0.09
609	0.11
610	0.12
611	0.13
612	0.14
613	0.14
614	0.12
615	0.11
616	0.1
617	0.08
618	0.07
619	0.07
620	0.05
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.07
625	0.07
626	0.08
627	0.09
628	0.09
629	0.09
630	0.11
631	0.17
632	0.21
633	0.23
634	0.24
635	0.3
636	0.35
637	0.36
638	0.35
639	0.32
640	0.29
641	0.32
642	0.3
643	0.24
644	0.25
645	0.29
646	0.32
647	0.29
648	0.28
649	0.24
650	0.24
651	0.26
652	0.2
653	0.2
654	0.18
655	0.2
656	0.23
657	0.23
658	0.24
659	0.22
660	0.22
661	0.18
662	0.18
663	0.15
664	0.11
665	0.13
666	0.11
667	0.11
668	0.12
669	0.12
670	0.13
671	0.14
672	0.14
673	0.14
674	0.15
675	0.18
676	0.17
677	0.14
678	0.13
679	0.14
680	0.15
681	0.14
682	0.13
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.1
687	0.1
688	0.08
689	0.08
690	0.08
691	0.08
692	0.09
693	0.14
694	0.14
695	0.14
696	0.14
697	0.15
698	0.16
699	0.16
700	0.15
701	0.12
702	0.13
703	0.11
704	0.11
705	0.1
706	0.1
707	0.08
708	0.08
709	0.06
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.06
714	0.08
715	0.09
716	0.11
717	0.12
718	0.13
719	0.13
720	0.15
721	0.18
722	0.18
723	0.18
724	0.18
725	0.18
726	0.18
727	0.17
728	0.19
729	0.17
730	0.16
731	0.17
732	0.19
733	0.21
734	0.27
735	0.29
736	0.29
737	0.34
738	0.34
739	0.42
740	0.47
741	0.5
742	0.43
743	0.5
744	0.51
745	0.5
746	0.57
747	0.56
748	0.56
749	0.61
750	0.63
751	0.58
752	0.56
753	0.52
754	0.46
755	0.4
756	0.31
757	0.23
758	0.2
759	0.16
760	0.14
761	0.13

A0A0J0XCF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer