Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XTM1

Protein Details
Accession A0A0J0XTM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-69PEEAHKRGKRFVRRMNNAAHVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-59AARRDAKSAPEEAHKRGKRFV
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13.5, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036867  R3H_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd02325  R3H  
Amino Acid Sequences MTDVDSPAPLRLPAILQNPGNKALRQVEAFNAQQRERAAARRDAKSAPEEAHKRGKRFVRRMNNAAHVDNPHAVLPKRGDMMPTVPLHYHPLRPSFPSDALERSTHIPSVSAARADPLGASSAHGAFTTSLKGTRAMLRRRGRRAETIVPVLENAVRAWLGGEYDKPPGGDWAPIDPTVVDYSDAATGEGQSGPSRLPRQHQVTDVPELPIVNGKVSAVLELSRSPAHLSWTVPDSFDRLVVHLVARYYELISWSEDQRTATGQVVRLTHIVRPNIVKPKPPPASHALLTPETSDVSGVSGSDTEHLSAESDASDAATEVAHSDTESVIGDDDTRHAGDVSAASQSLSERWADDASDGGAHAHESLTERLGALGLHRTESHGSSAYASSEGGWTDGGVDSIVFHPEERWPESPVAGTASLPQLKGGAPQRLGGNGPLDKPSFFEYLFGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.29
3 0.31
4 0.37
5 0.4
6 0.44
7 0.45
8 0.39
9 0.39
10 0.38
11 0.39
12 0.36
13 0.35
14 0.33
15 0.36
16 0.39
17 0.41
18 0.41
19 0.37
20 0.38
21 0.37
22 0.37
23 0.34
24 0.39
25 0.38
26 0.42
27 0.49
28 0.5
29 0.53
30 0.5
31 0.51
32 0.48
33 0.45
34 0.39
35 0.42
36 0.42
37 0.44
38 0.52
39 0.54
40 0.53
41 0.58
42 0.63
43 0.65
44 0.7
45 0.75
46 0.75
47 0.78
48 0.82
49 0.81
50 0.81
51 0.74
52 0.65
53 0.58
54 0.49
55 0.44
56 0.38
57 0.32
58 0.25
59 0.25
60 0.24
61 0.25
62 0.25
63 0.26
64 0.27
65 0.26
66 0.25
67 0.23
68 0.25
69 0.27
70 0.26
71 0.24
72 0.22
73 0.22
74 0.28
75 0.28
76 0.31
77 0.28
78 0.33
79 0.33
80 0.36
81 0.39
82 0.38
83 0.37
84 0.35
85 0.33
86 0.3
87 0.3
88 0.28
89 0.26
90 0.24
91 0.24
92 0.22
93 0.2
94 0.17
95 0.15
96 0.19
97 0.19
98 0.16
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.14
121 0.2
122 0.28
123 0.33
124 0.42
125 0.5
126 0.58
127 0.65
128 0.71
129 0.68
130 0.67
131 0.67
132 0.64
133 0.6
134 0.56
135 0.48
136 0.4
137 0.36
138 0.29
139 0.23
140 0.16
141 0.11
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.08
150 0.09
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.08
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.1
182 0.13
183 0.14
184 0.18
185 0.25
186 0.31
187 0.33
188 0.35
189 0.36
190 0.36
191 0.38
192 0.35
193 0.28
194 0.22
195 0.19
196 0.17
197 0.15
198 0.12
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.12
225 0.11
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.17
252 0.18
253 0.18
254 0.19
255 0.18
256 0.19
257 0.21
258 0.2
259 0.19
260 0.21
261 0.26
262 0.33
263 0.34
264 0.37
265 0.35
266 0.45
267 0.5
268 0.48
269 0.46
270 0.43
271 0.46
272 0.41
273 0.41
274 0.35
275 0.29
276 0.29
277 0.25
278 0.2
279 0.15
280 0.14
281 0.11
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.09
360 0.14
361 0.13
362 0.15
363 0.15
364 0.17
365 0.19
366 0.21
367 0.22
368 0.18
369 0.18
370 0.18
371 0.19
372 0.18
373 0.16
374 0.14
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.1
392 0.15
393 0.2
394 0.24
395 0.25
396 0.27
397 0.28
398 0.29
399 0.29
400 0.26
401 0.24
402 0.19
403 0.18
404 0.17
405 0.23
406 0.24
407 0.23
408 0.22
409 0.19
410 0.19
411 0.26
412 0.3
413 0.31
414 0.3
415 0.33
416 0.35
417 0.36
418 0.37
419 0.33
420 0.32
421 0.28
422 0.29
423 0.3
424 0.3
425 0.28
426 0.28
427 0.3
428 0.27
429 0.23