Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XRP5

Protein Details
Accession A0A0J0XRP5    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-283AGNGNREEKKKPKKKRPAEEEKAEERKEPPKKKKKTAAAKEKEAKEABasic
293-361EKEEREKAEKEKGKKKKKKKDEETAPAAAAAEKPKPKKKKKEDSDKEEEEKKKPAPKKKKKAAAKEDAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-361RAAGNGNREEKKKPKKKRPAEEEKAEERKEPPKKKKKTAAAKEKEAKEAKEREEREAKEKEEREKAEKEKGKKKKKKKDEETAPAAAAAEKPKPKKKKKEDSDKEEEEKKKPAPKKKKKAAAKEDAK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNYHRFARALLKKSRKWEPSLSIQLYQTYWRFENSEINFVYDGPMKPFLLALRAQVIPAALIPFLYDIRPPVSFVDGCLVVEIQDFRKTPEVRSRVVMRPAPETLPLTIDIMLGRRAETWDEAMTLELESRVMAATSAPLYLGTSPLAARNAALSLALTAPANPNVGADGAPRSAQAQGEEEDSEQETLRKLLGIGTGARAFQPNWSVLRVTEKMENYRKDRERDAAQRAAGNGNREEKKKPKKKRPAEEEKAEERKEPPKKKKKTAAAKEKEAKEAKEREEREAKEKEEREKAEKEKGKKKKKKKDEETAPAAAAAEKPKPKKKKKEDSDKEEEEKKKPAPKKKKKAAAKEDAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.44
3 0.51
4 0.6
5 0.63
6 0.71
7 0.78
8 0.74
9 0.71
10 0.72
11 0.68
12 0.68
13 0.73
14 0.69
15 0.63
16 0.57
17 0.53
18 0.45
19 0.44
20 0.36
21 0.3
22 0.27
23 0.26
24 0.27
25 0.26
26 0.34
27 0.32
28 0.37
29 0.32
30 0.34
31 0.32
32 0.3
33 0.3
34 0.26
35 0.24
36 0.2
37 0.23
38 0.2
39 0.2
40 0.22
41 0.2
42 0.18
43 0.18
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.11
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.18
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.09
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.14
78 0.14
79 0.16
80 0.24
81 0.25
82 0.29
83 0.37
84 0.4
85 0.37
86 0.42
87 0.46
88 0.44
89 0.5
90 0.49
91 0.41
92 0.41
93 0.4
94 0.36
95 0.32
96 0.28
97 0.21
98 0.19
99 0.18
100 0.15
101 0.13
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.1
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.08
119 0.08
120 0.06
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.22
206 0.22
207 0.29
208 0.35
209 0.4
210 0.39
211 0.47
212 0.51
213 0.49
214 0.51
215 0.49
216 0.5
217 0.52
218 0.54
219 0.49
220 0.45
221 0.43
222 0.41
223 0.4
224 0.34
225 0.29
226 0.25
227 0.28
228 0.31
229 0.32
230 0.37
231 0.42
232 0.51
233 0.59
234 0.67
235 0.71
236 0.78
237 0.86
238 0.91
239 0.92
240 0.92
241 0.92
242 0.9
243 0.86
244 0.84
245 0.81
246 0.71
247 0.63
248 0.55
249 0.55
250 0.56
251 0.59
252 0.61
253 0.64
254 0.73
255 0.81
256 0.87
257 0.89
258 0.9
259 0.9
260 0.9
261 0.88
262 0.89
263 0.87
264 0.8
265 0.79
266 0.71
267 0.63
268 0.6
269 0.59
270 0.55
271 0.55
272 0.54
273 0.53
274 0.58
275 0.58
276 0.57
277 0.56
278 0.53
279 0.53
280 0.57
281 0.56
282 0.57
283 0.58
284 0.57
285 0.59
286 0.61
287 0.62
288 0.64
289 0.66
290 0.67
291 0.73
292 0.79
293 0.81
294 0.87
295 0.88
296 0.92
297 0.94
298 0.94
299 0.95
300 0.94
301 0.94
302 0.9
303 0.83
304 0.72
305 0.61
306 0.5
307 0.4
308 0.31
309 0.25
310 0.24
311 0.28
312 0.36
313 0.45
314 0.56
315 0.66
316 0.75
317 0.82
318 0.87
319 0.9
320 0.94
321 0.95
322 0.94
323 0.93
324 0.9
325 0.86
326 0.84
327 0.79
328 0.72
329 0.69
330 0.66
331 0.66
332 0.66
333 0.7
334 0.72
335 0.78
336 0.84
337 0.88
338 0.91
339 0.92
340 0.94
341 0.94