Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XVQ2

Protein Details
Accession A0A0J0XVQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-306DKGKGKGKGKGKGKAKAKELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-306KGKGKGKGKGKGKAKAKEL
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSNNDSPEYLPSSEDEIQRLLQQCAMLQREIDSLREALADVREERDGLSKDLAEARDPHTSLQRENVDLGFGIQAHRERREVRNAHGSLSHTHDALQDEHDELRAKYEALWIQHSELWAKYEALRPKAAAQAQAGWPDSKIKNDLRSPRSPRTPRTPHTPTFPPPPSRSDIAETWRSTKGLTLPAVPRAEDDSSDSDRTVMPTGSTHTRHLSADSLARGFQGSSDQPEASTSTYVARGPSAAPRSPQNRPTPCRFYAGGGCRRGNKCWFSHDSHNLWVNKDKDQNLDKGKGKGKGKGKGKAKAKEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.25
4 0.25
5 0.3
6 0.31
7 0.26
8 0.23
9 0.22
10 0.22
11 0.27
12 0.29
13 0.24
14 0.22
15 0.22
16 0.25
17 0.26
18 0.25
19 0.2
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.15
24 0.12
25 0.13
26 0.15
27 0.14
28 0.15
29 0.16
30 0.15
31 0.16
32 0.21
33 0.21
34 0.2
35 0.21
36 0.19
37 0.2
38 0.25
39 0.25
40 0.21
41 0.21
42 0.23
43 0.26
44 0.27
45 0.27
46 0.3
47 0.31
48 0.3
49 0.36
50 0.35
51 0.3
52 0.31
53 0.3
54 0.23
55 0.2
56 0.19
57 0.12
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.14
62 0.17
63 0.19
64 0.22
65 0.26
66 0.31
67 0.41
68 0.41
69 0.42
70 0.49
71 0.48
72 0.45
73 0.44
74 0.41
75 0.33
76 0.36
77 0.32
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.2
83 0.19
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.14
89 0.12
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.15
95 0.16
96 0.17
97 0.19
98 0.18
99 0.19
100 0.2
101 0.2
102 0.16
103 0.14
104 0.14
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.17
109 0.22
110 0.23
111 0.23
112 0.22
113 0.23
114 0.27
115 0.27
116 0.23
117 0.19
118 0.19
119 0.2
120 0.22
121 0.21
122 0.16
123 0.15
124 0.18
125 0.18
126 0.16
127 0.19
128 0.19
129 0.24
130 0.3
131 0.39
132 0.4
133 0.48
134 0.54
135 0.56
136 0.63
137 0.62
138 0.62
139 0.63
140 0.65
141 0.6
142 0.62
143 0.62
144 0.54
145 0.55
146 0.54
147 0.48
148 0.48
149 0.5
150 0.46
151 0.42
152 0.43
153 0.41
154 0.38
155 0.37
156 0.32
157 0.29
158 0.29
159 0.32
160 0.29
161 0.29
162 0.28
163 0.26
164 0.23
165 0.22
166 0.2
167 0.18
168 0.19
169 0.2
170 0.2
171 0.25
172 0.26
173 0.24
174 0.22
175 0.21
176 0.2
177 0.16
178 0.17
179 0.17
180 0.19
181 0.2
182 0.19
183 0.17
184 0.16
185 0.17
186 0.16
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.13
191 0.18
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.23
196 0.23
197 0.24
198 0.22
199 0.18
200 0.2
201 0.19
202 0.17
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.14
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.15
217 0.15
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.18
227 0.22
228 0.22
229 0.24
230 0.31
231 0.37
232 0.43
233 0.5
234 0.53
235 0.58
236 0.62
237 0.69
238 0.69
239 0.65
240 0.63
241 0.56
242 0.5
243 0.5
244 0.53
245 0.52
246 0.51
247 0.52
248 0.55
249 0.57
250 0.58
251 0.57
252 0.53
253 0.48
254 0.5
255 0.53
256 0.51
257 0.58
258 0.61
259 0.57
260 0.58
261 0.62
262 0.56
263 0.54
264 0.55
265 0.48
266 0.46
267 0.49
268 0.46
269 0.46
270 0.49
271 0.54
272 0.54
273 0.6
274 0.58
275 0.59
276 0.63
277 0.63
278 0.63
279 0.63
280 0.64
281 0.65
282 0.69
283 0.71
284 0.73
285 0.75
286 0.8