Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XHV0

Protein Details
Accession A0A0J0XHV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-160RIAAEKTAKNRARRQKRKHRGGEPASKGHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-167AEKTAKNRARRQKRKHRGGEPASKGHEPDGKRS
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MPVEPASPSPEPFERSPSPDFGSRGGASGDGPKVRGRRFTEHDIQKRRLEKLLANPDKEVVLPEGMGLKMGRTPKDTLKNISGSSAAAGSGEFHIYKHSRRREYERVKAMERQTRDLEEQAAFMARQAERDRIAAEKTAKNRARRQKRKHRGGEPASKGHEPDGKRSKFANGGETQEQREEREEHGEVNTVAEVQAAQAAAAAGDSAERRAEVSITVVDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.39
3 0.42
4 0.41
5 0.41
6 0.41
7 0.41
8 0.36
9 0.38
10 0.32
11 0.3
12 0.26
13 0.22
14 0.18
15 0.21
16 0.23
17 0.18
18 0.19
19 0.22
20 0.28
21 0.31
22 0.38
23 0.39
24 0.44
25 0.5
26 0.57
27 0.62
28 0.66
29 0.73
30 0.74
31 0.73
32 0.72
33 0.7
34 0.65
35 0.59
36 0.52
37 0.47
38 0.49
39 0.55
40 0.54
41 0.51
42 0.48
43 0.45
44 0.41
45 0.36
46 0.27
47 0.17
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.08
55 0.07
56 0.1
57 0.13
58 0.14
59 0.16
60 0.19
61 0.25
62 0.35
63 0.37
64 0.39
65 0.4
66 0.41
67 0.38
68 0.37
69 0.3
70 0.2
71 0.18
72 0.13
73 0.09
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.09
82 0.11
83 0.16
84 0.24
85 0.31
86 0.36
87 0.41
88 0.49
89 0.57
90 0.64
91 0.68
92 0.67
93 0.63
94 0.6
95 0.61
96 0.58
97 0.53
98 0.46
99 0.41
100 0.35
101 0.33
102 0.32
103 0.26
104 0.23
105 0.18
106 0.16
107 0.12
108 0.11
109 0.09
110 0.08
111 0.1
112 0.08
113 0.11
114 0.12
115 0.15
116 0.15
117 0.16
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.2
123 0.22
124 0.25
125 0.34
126 0.38
127 0.44
128 0.52
129 0.59
130 0.66
131 0.72
132 0.8
133 0.82
134 0.88
135 0.92
136 0.92
137 0.9
138 0.89
139 0.87
140 0.87
141 0.81
142 0.76
143 0.69
144 0.6
145 0.52
146 0.45
147 0.41
148 0.32
149 0.36
150 0.41
151 0.38
152 0.4
153 0.4
154 0.41
155 0.42
156 0.43
157 0.4
158 0.33
159 0.37
160 0.41
161 0.42
162 0.4
163 0.38
164 0.37
165 0.31
166 0.32
167 0.29
168 0.25
169 0.29
170 0.27
171 0.24
172 0.24
173 0.25
174 0.21
175 0.2
176 0.18
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.03
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.12
201 0.13