Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XKN1

Protein Details
Accession A0A0J0XKN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
415-438GGGRRERGERAPRRPRANQDDLDRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
320-380KHGRAAGKETAARRSGGGRWEEARDLKDRVGTRGEGREFARRIGAREERERERERGGRRSR
403-430GYGRRYGERKEGGGGRRERGERAPRRPR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, plas 8, cyto_nucl 7.5, cyto 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Amino Acid Sequences MDIDGGLPWDADDSGPTAPPPPAPAPDDVDMLDRPLDDFVPRERGGRARSPVPEHVQALMGRMGKGKVYLAEETPGIIHHDAERRIARDPRLTRLALELDRQDPTEWLAAVSAGAGSTIRPNALFVSSELIKHLSTAKVFTWASEFGVGIMGIEWLNDSTLILLFPTPAAALLSLSMLAKAGFDPTDGDDPLEERAAHGFPASLLPRRSPTPEPDRRVADLDAELEGLAEAREAEDGTGGGGGDSGGAGDPDAPVRKGRGAFRASRGSANGAFDLPPLAGQSTPRFAEGVDPHARVTVRYATTDDTKHKRGAGESSWYAKHGRAAGKETAARRSGGGRWEEARDLKDRVGTRGEGREFARRIGAREERERERERGGRRSRVEDLDADLEWMARRREGEDDGRGYGRRYGERKEGGGGRRERGERAPRRPRANQDDLDRELDEMFASRGDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.13
5 0.14
6 0.15
7 0.2
8 0.21
9 0.25
10 0.27
11 0.3
12 0.33
13 0.33
14 0.34
15 0.29
16 0.29
17 0.24
18 0.23
19 0.21
20 0.15
21 0.14
22 0.13
23 0.13
24 0.11
25 0.14
26 0.16
27 0.23
28 0.24
29 0.25
30 0.27
31 0.33
32 0.38
33 0.43
34 0.45
35 0.44
36 0.49
37 0.53
38 0.58
39 0.58
40 0.57
41 0.5
42 0.46
43 0.43
44 0.37
45 0.33
46 0.3
47 0.25
48 0.21
49 0.22
50 0.21
51 0.18
52 0.19
53 0.18
54 0.16
55 0.18
56 0.2
57 0.19
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.15
63 0.14
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.21
68 0.21
69 0.27
70 0.3
71 0.29
72 0.34
73 0.39
74 0.39
75 0.43
76 0.45
77 0.46
78 0.49
79 0.47
80 0.42
81 0.41
82 0.42
83 0.34
84 0.34
85 0.3
86 0.26
87 0.27
88 0.27
89 0.24
90 0.19
91 0.19
92 0.17
93 0.14
94 0.12
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.09
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.13
119 0.13
120 0.16
121 0.13
122 0.13
123 0.15
124 0.14
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.19
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.08
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.08
181 0.06
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.09
189 0.11
190 0.13
191 0.14
192 0.15
193 0.17
194 0.19
195 0.23
196 0.22
197 0.27
198 0.34
199 0.42
200 0.45
201 0.48
202 0.49
203 0.46
204 0.46
205 0.39
206 0.3
207 0.22
208 0.18
209 0.13
210 0.1
211 0.09
212 0.06
213 0.06
214 0.04
215 0.03
216 0.03
217 0.02
218 0.02
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.03
238 0.04
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.11
244 0.15
245 0.17
246 0.23
247 0.27
248 0.29
249 0.34
250 0.4
251 0.38
252 0.37
253 0.35
254 0.31
255 0.28
256 0.26
257 0.21
258 0.15
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.09
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.18
275 0.18
276 0.22
277 0.23
278 0.23
279 0.23
280 0.25
281 0.25
282 0.19
283 0.21
284 0.21
285 0.18
286 0.18
287 0.2
288 0.2
289 0.23
290 0.27
291 0.31
292 0.31
293 0.34
294 0.35
295 0.36
296 0.35
297 0.33
298 0.35
299 0.31
300 0.32
301 0.31
302 0.33
303 0.32
304 0.32
305 0.31
306 0.26
307 0.26
308 0.24
309 0.26
310 0.25
311 0.3
312 0.31
313 0.34
314 0.37
315 0.36
316 0.36
317 0.33
318 0.3
319 0.26
320 0.27
321 0.26
322 0.27
323 0.27
324 0.25
325 0.26
326 0.28
327 0.31
328 0.31
329 0.3
330 0.28
331 0.28
332 0.26
333 0.29
334 0.28
335 0.28
336 0.29
337 0.29
338 0.29
339 0.35
340 0.35
341 0.34
342 0.34
343 0.4
344 0.37
345 0.36
346 0.39
347 0.32
348 0.34
349 0.38
350 0.43
351 0.41
352 0.49
353 0.55
354 0.54
355 0.61
356 0.63
357 0.58
358 0.59
359 0.6
360 0.58
361 0.62
362 0.64
363 0.65
364 0.65
365 0.68
366 0.66
367 0.63
368 0.59
369 0.5
370 0.46
371 0.39
372 0.34
373 0.28
374 0.22
375 0.18
376 0.17
377 0.19
378 0.16
379 0.15
380 0.16
381 0.17
382 0.21
383 0.26
384 0.31
385 0.35
386 0.37
387 0.38
388 0.4
389 0.39
390 0.37
391 0.36
392 0.34
393 0.35
394 0.36
395 0.39
396 0.46
397 0.49
398 0.49
399 0.52
400 0.54
401 0.52
402 0.57
403 0.56
404 0.51
405 0.54
406 0.54
407 0.51
408 0.53
409 0.59
410 0.59
411 0.65
412 0.72
413 0.73
414 0.8
415 0.85
416 0.86
417 0.85
418 0.84
419 0.8
420 0.78
421 0.77
422 0.72
423 0.67
424 0.57
425 0.48
426 0.38
427 0.31
428 0.23
429 0.16
430 0.13