Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XND9

Protein Details
Accession A0A0J0XND9    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-105VTPVVGKRPRGRPRKTATSASHydrophilic
135-159EPAPTPAPRKRGRPPKKVKEVIASDHydrophilic
170-195QEAPTPPPKAKVRRKSVKHEVPTREPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-99KRPRGRPRK
140-153PAPRKRGRPPKKVK
178-185KAKVRRKS
261-279RRRRKSSLGFGENKRKAPR
356-369RPKRKAIIRRKPKP
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9, cyto 7.5, plas 4, pero 2, mito 1, extr 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MSAPTRDVYLAQDFNPASLRVPQLRSILHEHGVRHSSAAKKADLVALFITEIQPRAAIILAQDARVRPSATGIIAVSSTGDEAPVTPVVGKRPRGRPRKTATSASEELKAEDDMSEVPAKRARSRRSTVDVSDAEPAPTPAPRKRGRPPKKVKEVIASDEESDVRMEDIQEAPTPPPKAKVRRKSVKHEVPTREPVPDVPATAPAAVRKPRSSFLPPAPRPEDHTTPQRPRRSSNAEDNSSPFSDYNPFQAGSAEAAEVARRRRKSSLGFGENKRKAPRPSEWTATSQPSASILRKVGPSNENLRSPAPPKIAYADEVAEADAHNAIVERKFGEVTQSYPDDAPITVTTSTKMVERPKRKAIIRRKPKPSGSTLPLSLFSLLIFILSAHYKSISTSNGFCDNNSNTNSVILGRELPIKAAQECMIQRAQWQADHPDETPNITCDVASLPLVPFVPRPTKCVPCPANAQCSRGEVVACDPEYLLKPSLLAPISPLLDGWPLMPPRVFTPKCKPDTARMRQIGQLATQMERFLAKRRGTIECSSASVDLTVGPGVRYGVSEKELLNTFAERRVDSIEREDFDDMFQRAITDLVAHKDLVESIDEYGTSYYTSARSDMSMACHAKLEALHLLDQWKSQLGGTAAVIALIFGLRNRIEAARTEHKQVREYTEMAVRRLQDQEYRHFTDPVQNPTSYMPPAQLRDVILPASLRQGTKQRIWSKVEAKVEENANVLVREREVKGDVWKTWEWSAIGGGRAVEPSSPALAIETGPPAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.26
4 0.21
5 0.24
6 0.3
7 0.29
8 0.33
9 0.36
10 0.38
11 0.39
12 0.42
13 0.44
14 0.42
15 0.41
16 0.42
17 0.39
18 0.41
19 0.42
20 0.38
21 0.33
22 0.34
23 0.34
24 0.37
25 0.4
26 0.34
27 0.33
28 0.34
29 0.38
30 0.32
31 0.29
32 0.22
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.17
37 0.13
38 0.14
39 0.12
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.16
47 0.17
48 0.18
49 0.21
50 0.21
51 0.23
52 0.25
53 0.25
54 0.17
55 0.19
56 0.2
57 0.18
58 0.2
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.11
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.12
75 0.2
76 0.27
77 0.34
78 0.4
79 0.5
80 0.59
81 0.68
82 0.74
83 0.77
84 0.79
85 0.83
86 0.81
87 0.79
88 0.75
89 0.73
90 0.69
91 0.62
92 0.58
93 0.47
94 0.41
95 0.34
96 0.29
97 0.21
98 0.16
99 0.15
100 0.1
101 0.12
102 0.16
103 0.15
104 0.17
105 0.21
106 0.23
107 0.31
108 0.39
109 0.44
110 0.49
111 0.55
112 0.6
113 0.64
114 0.68
115 0.62
116 0.61
117 0.55
118 0.47
119 0.46
120 0.38
121 0.31
122 0.25
123 0.24
124 0.17
125 0.18
126 0.22
127 0.22
128 0.31
129 0.36
130 0.44
131 0.53
132 0.64
133 0.71
134 0.77
135 0.83
136 0.85
137 0.9
138 0.9
139 0.84
140 0.83
141 0.77
142 0.71
143 0.65
144 0.55
145 0.45
146 0.39
147 0.34
148 0.25
149 0.2
150 0.15
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.2
161 0.22
162 0.2
163 0.27
164 0.34
165 0.43
166 0.52
167 0.61
168 0.66
169 0.75
170 0.82
171 0.85
172 0.87
173 0.87
174 0.85
175 0.85
176 0.81
177 0.78
178 0.79
179 0.7
180 0.6
181 0.51
182 0.43
183 0.38
184 0.31
185 0.25
186 0.18
187 0.18
188 0.17
189 0.17
190 0.17
191 0.14
192 0.2
193 0.23
194 0.26
195 0.27
196 0.29
197 0.31
198 0.36
199 0.4
200 0.41
201 0.46
202 0.53
203 0.52
204 0.57
205 0.59
206 0.54
207 0.56
208 0.55
209 0.52
210 0.45
211 0.53
212 0.54
213 0.59
214 0.67
215 0.68
216 0.64
217 0.63
218 0.67
219 0.66
220 0.63
221 0.64
222 0.63
223 0.59
224 0.57
225 0.56
226 0.5
227 0.42
228 0.37
229 0.26
230 0.19
231 0.19
232 0.18
233 0.19
234 0.18
235 0.17
236 0.16
237 0.17
238 0.16
239 0.13
240 0.13
241 0.09
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.1
246 0.15
247 0.21
248 0.23
249 0.26
250 0.29
251 0.35
252 0.39
253 0.47
254 0.51
255 0.53
256 0.59
257 0.63
258 0.7
259 0.69
260 0.68
261 0.62
262 0.59
263 0.54
264 0.52
265 0.54
266 0.5
267 0.51
268 0.52
269 0.51
270 0.5
271 0.5
272 0.46
273 0.39
274 0.32
275 0.26
276 0.23
277 0.23
278 0.19
279 0.18
280 0.15
281 0.17
282 0.19
283 0.2
284 0.22
285 0.21
286 0.24
287 0.28
288 0.31
289 0.3
290 0.3
291 0.3
292 0.28
293 0.29
294 0.3
295 0.26
296 0.23
297 0.22
298 0.23
299 0.23
300 0.22
301 0.2
302 0.16
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.14
327 0.15
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.13
340 0.19
341 0.28
342 0.35
343 0.41
344 0.47
345 0.54
346 0.57
347 0.63
348 0.66
349 0.68
350 0.72
351 0.76
352 0.77
353 0.78
354 0.79
355 0.74
356 0.69
357 0.65
358 0.58
359 0.52
360 0.44
361 0.38
362 0.33
363 0.29
364 0.22
365 0.15
366 0.11
367 0.08
368 0.06
369 0.05
370 0.04
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.13
384 0.18
385 0.19
386 0.18
387 0.2
388 0.21
389 0.23
390 0.23
391 0.22
392 0.17
393 0.17
394 0.17
395 0.13
396 0.12
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.12
409 0.12
410 0.15
411 0.14
412 0.13
413 0.14
414 0.17
415 0.17
416 0.15
417 0.16
418 0.17
419 0.18
420 0.2
421 0.19
422 0.18
423 0.18
424 0.18
425 0.17
426 0.15
427 0.14
428 0.12
429 0.11
430 0.08
431 0.09
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.11
441 0.18
442 0.18
443 0.24
444 0.28
445 0.33
446 0.34
447 0.43
448 0.42
449 0.38
450 0.46
451 0.44
452 0.49
453 0.46
454 0.47
455 0.38
456 0.38
457 0.35
458 0.27
459 0.23
460 0.14
461 0.13
462 0.15
463 0.14
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.13
468 0.15
469 0.14
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.15
474 0.14
475 0.12
476 0.11
477 0.13
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.08
485 0.1
486 0.1
487 0.11
488 0.11
489 0.11
490 0.14
491 0.25
492 0.26
493 0.27
494 0.37
495 0.46
496 0.5
497 0.54
498 0.53
499 0.53
500 0.63
501 0.65
502 0.65
503 0.59
504 0.57
505 0.55
506 0.56
507 0.47
508 0.37
509 0.32
510 0.24
511 0.21
512 0.19
513 0.17
514 0.13
515 0.14
516 0.14
517 0.17
518 0.24
519 0.24
520 0.27
521 0.31
522 0.35
523 0.38
524 0.4
525 0.37
526 0.3
527 0.31
528 0.29
529 0.25
530 0.2
531 0.15
532 0.13
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.08
543 0.09
544 0.11
545 0.13
546 0.12
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.17
551 0.17
552 0.16
553 0.19
554 0.2
555 0.17
556 0.17
557 0.21
558 0.22
559 0.22
560 0.26
561 0.26
562 0.25
563 0.27
564 0.27
565 0.23
566 0.22
567 0.25
568 0.19
569 0.16
570 0.15
571 0.12
572 0.12
573 0.12
574 0.11
575 0.08
576 0.09
577 0.12
578 0.13
579 0.12
580 0.12
581 0.12
582 0.13
583 0.11
584 0.11
585 0.09
586 0.08
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.08
596 0.09
597 0.1
598 0.1
599 0.11
600 0.12
601 0.14
602 0.16
603 0.22
604 0.23
605 0.22
606 0.23
607 0.22
608 0.21
609 0.2
610 0.19
611 0.15
612 0.16
613 0.16
614 0.16
615 0.18
616 0.18
617 0.18
618 0.16
619 0.14
620 0.13
621 0.12
622 0.14
623 0.13
624 0.14
625 0.13
626 0.14
627 0.12
628 0.12
629 0.11
630 0.07
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.04
635 0.07
636 0.07
637 0.08
638 0.11
639 0.12
640 0.13
641 0.17
642 0.25
643 0.31
644 0.34
645 0.41
646 0.44
647 0.47
648 0.5
649 0.5
650 0.49
651 0.45
652 0.44
653 0.4
654 0.41
655 0.41
656 0.38
657 0.38
658 0.32
659 0.3
660 0.32
661 0.31
662 0.3
663 0.32
664 0.39
665 0.43
666 0.48
667 0.47
668 0.46
669 0.44
670 0.47
671 0.49
672 0.48
673 0.45
674 0.38
675 0.37
676 0.39
677 0.42
678 0.34
679 0.28
680 0.25
681 0.26
682 0.29
683 0.3
684 0.3
685 0.28
686 0.28
687 0.29
688 0.25
689 0.21
690 0.19
691 0.17
692 0.2
693 0.21
694 0.19
695 0.22
696 0.3
697 0.35
698 0.41
699 0.5
700 0.52
701 0.56
702 0.62
703 0.67
704 0.65
705 0.67
706 0.68
707 0.62
708 0.57
709 0.55
710 0.52
711 0.45
712 0.39
713 0.33
714 0.27
715 0.24
716 0.23
717 0.18
718 0.17
719 0.2
720 0.19
721 0.22
722 0.22
723 0.24
724 0.31
725 0.36
726 0.36
727 0.37
728 0.38
729 0.38
730 0.38
731 0.39
732 0.31
733 0.26
734 0.29
735 0.25
736 0.24
737 0.22
738 0.21
739 0.17
740 0.18
741 0.17
742 0.13
743 0.12
744 0.13
745 0.13
746 0.13
747 0.12
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.13