Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2VS58

Protein Details
Accession B2VS58    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-328APSDPPPRPRKPPRPHIPQMSAHydrophilic
397-423TLKSTKRGTYYKKRRRWERVKNVVDETHydrophilic
570-593EGRVEARGHHGKKKRKVETTEIAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
314-319RPRKPP
409-412KRRR
576-585RGHHGKKKRK
Subcellular Location(s) cyto 16, nucl 8, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MICEVLTNLSSNIYLGKFGTFNSNLLIGRPYYLTYELLDKDDGKSKTELRVVPASELHAETLGSEQVPVADASDENAEGNAGFDIVGEDGQVIMRNNRLTIDDASRQALSMAEIEELKKAGAGSGKEIIAKIMASHNAIDEKTSFSLAKYTLRKSKKYLKRFTALPMDVGLLTEYVLEKEAYKIMELREDLLGLINAWANVHSGETNRVLLGEDGVSQIGGGRWLVVDDTGGLVTAALAEKMGILYPEDEEDESDEEPDAAEATKTNGTSITPETRDTDTTMVDADADTTMTSEAPNATDPSSTNGAPSDPPPRPRKPPRPHIPQMSAKTNTLTVLHPNNQPNLSYLKYFGYDYGAPTVSHPLYKHLKSLSWLSLLHPEDDPTYDEPETIPEDVLMTLKSTKRGTYYKKRRRWERVKNVVDETRRGGFDGLIVATAMDAKTVLRELVPLVRGGGRVVVYNHNVEPLVELCDYYSKERRAAYIAREFGPSQKQQQANGKKHDQDDDGDSASEGDNDEEDFPLNPTLLLAPSLQTARARQWQVLPGRTHPMMTSKGGAEGYIFTATRVLPIEGRVEARGHHGKKKRKVETTEIAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.14
4 0.13
5 0.14
6 0.22
7 0.2
8 0.21
9 0.21
10 0.24
11 0.22
12 0.23
13 0.25
14 0.17
15 0.18
16 0.18
17 0.17
18 0.16
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.22
23 0.22
24 0.23
25 0.24
26 0.22
27 0.23
28 0.3
29 0.3
30 0.28
31 0.3
32 0.31
33 0.36
34 0.42
35 0.41
36 0.39
37 0.45
38 0.43
39 0.42
40 0.4
41 0.36
42 0.31
43 0.29
44 0.24
45 0.18
46 0.16
47 0.13
48 0.13
49 0.12
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.08
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.17
86 0.19
87 0.21
88 0.26
89 0.27
90 0.28
91 0.3
92 0.28
93 0.27
94 0.23
95 0.2
96 0.15
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.13
109 0.13
110 0.15
111 0.18
112 0.19
113 0.19
114 0.19
115 0.18
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.16
131 0.14
132 0.12
133 0.16
134 0.16
135 0.23
136 0.25
137 0.31
138 0.38
139 0.45
140 0.49
141 0.53
142 0.62
143 0.64
144 0.7
145 0.74
146 0.72
147 0.71
148 0.7
149 0.69
150 0.68
151 0.59
152 0.49
153 0.4
154 0.33
155 0.27
156 0.24
157 0.18
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.12
171 0.11
172 0.15
173 0.15
174 0.16
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.12
258 0.14
259 0.14
260 0.15
261 0.18
262 0.19
263 0.19
264 0.19
265 0.17
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.09
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.13
296 0.17
297 0.17
298 0.24
299 0.31
300 0.35
301 0.45
302 0.54
303 0.64
304 0.66
305 0.75
306 0.78
307 0.81
308 0.84
309 0.82
310 0.78
311 0.76
312 0.71
313 0.67
314 0.59
315 0.49
316 0.43
317 0.35
318 0.29
319 0.22
320 0.18
321 0.15
322 0.17
323 0.21
324 0.25
325 0.27
326 0.29
327 0.28
328 0.27
329 0.25
330 0.24
331 0.21
332 0.16
333 0.16
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.13
344 0.14
345 0.18
346 0.14
347 0.16
348 0.15
349 0.18
350 0.24
351 0.25
352 0.28
353 0.25
354 0.26
355 0.26
356 0.3
357 0.26
358 0.22
359 0.22
360 0.2
361 0.26
362 0.26
363 0.25
364 0.21
365 0.19
366 0.17
367 0.18
368 0.19
369 0.13
370 0.15
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.14
375 0.15
376 0.13
377 0.12
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.07
384 0.1
385 0.11
386 0.16
387 0.16
388 0.17
389 0.22
390 0.3
391 0.38
392 0.46
393 0.56
394 0.63
395 0.71
396 0.8
397 0.85
398 0.89
399 0.91
400 0.91
401 0.91
402 0.91
403 0.89
404 0.84
405 0.79
406 0.75
407 0.66
408 0.58
409 0.5
410 0.42
411 0.35
412 0.31
413 0.25
414 0.18
415 0.16
416 0.15
417 0.11
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.06
422 0.07
423 0.06
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.05
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.06
432 0.08
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.13
437 0.14
438 0.14
439 0.14
440 0.15
441 0.11
442 0.12
443 0.14
444 0.18
445 0.18
446 0.21
447 0.21
448 0.2
449 0.19
450 0.18
451 0.17
452 0.13
453 0.14
454 0.12
455 0.12
456 0.11
457 0.15
458 0.16
459 0.2
460 0.27
461 0.26
462 0.3
463 0.31
464 0.32
465 0.34
466 0.37
467 0.39
468 0.4
469 0.41
470 0.39
471 0.4
472 0.39
473 0.38
474 0.41
475 0.37
476 0.35
477 0.4
478 0.41
479 0.45
480 0.55
481 0.61
482 0.62
483 0.67
484 0.68
485 0.66
486 0.66
487 0.65
488 0.57
489 0.5
490 0.46
491 0.41
492 0.35
493 0.29
494 0.26
495 0.21
496 0.19
497 0.16
498 0.11
499 0.08
500 0.07
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.09
516 0.12
517 0.13
518 0.14
519 0.16
520 0.18
521 0.23
522 0.31
523 0.33
524 0.33
525 0.37
526 0.43
527 0.48
528 0.53
529 0.51
530 0.46
531 0.51
532 0.49
533 0.45
534 0.38
535 0.36
536 0.33
537 0.32
538 0.31
539 0.25
540 0.27
541 0.26
542 0.25
543 0.2
544 0.17
545 0.17
546 0.17
547 0.16
548 0.13
549 0.15
550 0.15
551 0.16
552 0.17
553 0.16
554 0.14
555 0.16
556 0.19
557 0.2
558 0.22
559 0.21
560 0.2
561 0.19
562 0.27
563 0.35
564 0.37
565 0.44
566 0.51
567 0.6
568 0.69
569 0.79
570 0.81
571 0.81
572 0.84
573 0.84