Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H1BGB8

Protein Details
Accession A0A0H1BGB8    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-43MAVEKKDKKRKAAIVSAQTTADPPSKKSKKSTSKPAKVQEDVPHydrophilic
114-137KSSEAEKPSKKKSKKAAEVPEPSVHydrophilic
216-240AIPDAKQMKRKLRKMKKNTTEPEEPHydrophilic
439-465DAETTPKKAKKEKEKKDTPVKEAKRTGBasic
467-486VEKKKEGKSAPKKEKTVTDTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-12KDKKRKA
24-51PSKKSKKSTSKPAKVQEDVPKPILKKPK
96-131REKSKKKPVTPSPAAAKSKSSEAEKPSKKKSKKAAE
222-232QMKRKLRKMKK
330-351ANKRFKRTPWNAIERRRMDAGK
444-520PKKAKKEKEKKDTPVKEAKRTGEVEKKKEGKSAPKKEKTVTDTPEKPAKGGKDKASPSAAGKSEKKGGKSKGKKSKA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 9.999, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAVEKKDKKRKAAIVSAQTTADPPSKKSKKSTSKPAKVQEDVPKPILKKPKAAQATNGDLPKSVPVKVTSEPARQIRPRKRAADFLSDDEAEEGDREKSKKKPVTPSPAAAKSKSSEAEKPSKKKSKKAAEVPEPSVPSAVKKAATKADSGKESLSTSKVSKKSKDVTELAEVENEGSEGEEDDDQTAALIQGFESSGDEDVSGDEGFEPGKGVPAIPDAKQMKRKLRKMKKNTTEPEEPGTVYVGRVPHGFYEHEMRAYFSQFGPITQLRLSRNRTTGRSKHFAFIEFASDSVARVVADSMDNYLMFGHILKCKYVPKERVHPELWKGANKRFKRTPWNAIERRRMDAGKTREQWSKKIEQEEVRRAARAEKMKALGYEFEMPALKGVDEVPVAVAEKEEQGAIDGVEKEASTDKQEEPAAIEAPTKDIEKPNVQVADAETTPKKAKKEKEKKDTPVKEAKRTGEVEKKKEGKSAPKKEKTVTDTPEKPAKGGKDKASPSAAGKSEKKGGKSKGKKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.71
4 0.61
5 0.53
6 0.44
7 0.37
8 0.34
9 0.25
10 0.25
11 0.34
12 0.42
13 0.47
14 0.55
15 0.63
16 0.68
17 0.76
18 0.83
19 0.84
20 0.86
21 0.9
22 0.91
23 0.89
24 0.81
25 0.8
26 0.79
27 0.76
28 0.71
29 0.66
30 0.61
31 0.54
32 0.58
33 0.6
34 0.53
35 0.54
36 0.53
37 0.59
38 0.62
39 0.63
40 0.63
41 0.6
42 0.64
43 0.61
44 0.59
45 0.49
46 0.4
47 0.39
48 0.37
49 0.31
50 0.25
51 0.22
52 0.22
53 0.26
54 0.27
55 0.34
56 0.34
57 0.38
58 0.44
59 0.46
60 0.52
61 0.56
62 0.64
63 0.67
64 0.7
65 0.73
66 0.74
67 0.73
68 0.73
69 0.71
70 0.71
71 0.64
72 0.59
73 0.55
74 0.47
75 0.43
76 0.34
77 0.29
78 0.18
79 0.15
80 0.12
81 0.1
82 0.14
83 0.16
84 0.21
85 0.27
86 0.37
87 0.45
88 0.51
89 0.59
90 0.65
91 0.74
92 0.75
93 0.76
94 0.75
95 0.76
96 0.72
97 0.62
98 0.55
99 0.46
100 0.44
101 0.41
102 0.37
103 0.33
104 0.36
105 0.46
106 0.51
107 0.57
108 0.63
109 0.7
110 0.71
111 0.75
112 0.78
113 0.79
114 0.8
115 0.83
116 0.83
117 0.82
118 0.83
119 0.79
120 0.73
121 0.64
122 0.54
123 0.45
124 0.35
125 0.26
126 0.23
127 0.21
128 0.18
129 0.18
130 0.22
131 0.27
132 0.28
133 0.29
134 0.31
135 0.34
136 0.33
137 0.33
138 0.3
139 0.25
140 0.26
141 0.24
142 0.21
143 0.18
144 0.19
145 0.25
146 0.32
147 0.36
148 0.39
149 0.44
150 0.5
151 0.52
152 0.57
153 0.51
154 0.48
155 0.48
156 0.46
157 0.39
158 0.32
159 0.27
160 0.2
161 0.17
162 0.13
163 0.07
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.1
203 0.12
204 0.11
205 0.19
206 0.21
207 0.25
208 0.33
209 0.39
210 0.45
211 0.53
212 0.61
213 0.65
214 0.73
215 0.79
216 0.82
217 0.87
218 0.87
219 0.88
220 0.85
221 0.81
222 0.76
223 0.67
224 0.6
225 0.5
226 0.4
227 0.3
228 0.25
229 0.18
230 0.12
231 0.12
232 0.09
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.15
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.1
249 0.14
250 0.12
251 0.12
252 0.15
253 0.14
254 0.15
255 0.15
256 0.19
257 0.18
258 0.24
259 0.29
260 0.29
261 0.35
262 0.37
263 0.41
264 0.46
265 0.5
266 0.5
267 0.52
268 0.49
269 0.47
270 0.45
271 0.42
272 0.35
273 0.29
274 0.25
275 0.18
276 0.17
277 0.14
278 0.12
279 0.11
280 0.09
281 0.09
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.07
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.14
301 0.18
302 0.24
303 0.31
304 0.37
305 0.39
306 0.49
307 0.54
308 0.59
309 0.57
310 0.56
311 0.51
312 0.51
313 0.48
314 0.45
315 0.43
316 0.43
317 0.5
318 0.48
319 0.53
320 0.52
321 0.56
322 0.6
323 0.64
324 0.67
325 0.67
326 0.75
327 0.75
328 0.76
329 0.79
330 0.71
331 0.67
332 0.61
333 0.52
334 0.45
335 0.46
336 0.44
337 0.44
338 0.45
339 0.47
340 0.5
341 0.52
342 0.54
343 0.51
344 0.52
345 0.48
346 0.49
347 0.5
348 0.51
349 0.58
350 0.61
351 0.61
352 0.54
353 0.5
354 0.46
355 0.43
356 0.42
357 0.4
358 0.35
359 0.33
360 0.35
361 0.35
362 0.36
363 0.33
364 0.28
365 0.24
366 0.25
367 0.2
368 0.19
369 0.17
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.12
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.16
402 0.17
403 0.2
404 0.21
405 0.21
406 0.2
407 0.22
408 0.19
409 0.17
410 0.18
411 0.14
412 0.15
413 0.17
414 0.15
415 0.16
416 0.19
417 0.24
418 0.27
419 0.29
420 0.33
421 0.33
422 0.32
423 0.3
424 0.28
425 0.28
426 0.24
427 0.26
428 0.2
429 0.23
430 0.29
431 0.31
432 0.36
433 0.39
434 0.49
435 0.56
436 0.66
437 0.73
438 0.79
439 0.85
440 0.89
441 0.92
442 0.9
443 0.87
444 0.87
445 0.83
446 0.82
447 0.79
448 0.73
449 0.69
450 0.64
451 0.64
452 0.64
453 0.65
454 0.61
455 0.64
456 0.68
457 0.63
458 0.66
459 0.64
460 0.65
461 0.67
462 0.72
463 0.73
464 0.75
465 0.79
466 0.78
467 0.8
468 0.77
469 0.75
470 0.7
471 0.69
472 0.65
473 0.67
474 0.69
475 0.61
476 0.55
477 0.51
478 0.53
479 0.53
480 0.55
481 0.56
482 0.57
483 0.59
484 0.64
485 0.62
486 0.56
487 0.51
488 0.51
489 0.48
490 0.46
491 0.47
492 0.46
493 0.51
494 0.53
495 0.55
496 0.56
497 0.62
498 0.65
499 0.72
500 0.77