Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H1BD01

Protein Details
Accession A0A0H1BD01    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-324ETPPRLKSPSRKKPENNTPHKSHydrophilic
507-527QELPKTKQRKSSPPLKAQPKSHydrophilic
654-674EERANRKRAELRKQLETRNKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-315SRKK
445-455IGGKKKPAKPR
514-526QRKSSPPLKAQPK
538-542GRKKK
658-689NRKRAELRKQLETRNKGVGTGVGGPAKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.333, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSKWSKLQLPSDNPTPPLLYKYLTSNLGCEIFVTDLAYVWSESLTRKEILKNASKYNTSIDPSEDDEQYFVLLQKISDALRGSKDSSLLLASEAGGNELKLSTSTKLPAPLDPLRWTFTLSQQSPNALTKHILLPILKGDVNHETRILSLIGQVKQKDWALSKLFDKIESSGVDLSTVFPGMGGVRLSRKDSVYSQASKLIKGVAPFDEELWNNEYQAKDADYNLGVHIASELSLSSSSIDRHSDGIAPENWWNKLGAGPVDQPHQAARKDKYQEKPTSRIPLSPAEKEEATESDDDEFQTMETPPRLKSPSRKKPENNTPHKSTRSTGKRHIESDGDSTEGSPSPSLGSKNRNHTGNVANHSKQKKSRASNSSTATTSEEDERDDTHPASKRRLKGLGTIYGRQPVRRKNSPVESAESTQSEAQPEAAAKPKPTTKTKESLGTIGGKKKPAKPRQETPIESTASDVSDAPGTSSGPKPTKEGADTNDMAIESENDTDSSISRPAEQELPKTKQRKSSPPLKAQPKSGGIGVIGQIGGRKKKAEHISPIDQPETTKLGTPNNDHDEDGDEMETSPAPRQTAKPKHSGGKLGMIGGRSKPAASTSRKEHSPDQKMPELSPPPRYGTATRPSEQPLAPELGEQVETKQEATEETPEERANRKRAELRKQLETRNKGVGTGVGGPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.48
3 0.4
4 0.36
5 0.32
6 0.27
7 0.25
8 0.28
9 0.31
10 0.33
11 0.32
12 0.29
13 0.3
14 0.3
15 0.28
16 0.23
17 0.19
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.1
22 0.09
23 0.1
24 0.11
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.11
30 0.14
31 0.17
32 0.18
33 0.21
34 0.26
35 0.32
36 0.39
37 0.47
38 0.48
39 0.53
40 0.58
41 0.57
42 0.53
43 0.52
44 0.5
45 0.43
46 0.39
47 0.34
48 0.3
49 0.33
50 0.35
51 0.31
52 0.26
53 0.23
54 0.21
55 0.19
56 0.17
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.14
63 0.13
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.21
68 0.23
69 0.24
70 0.24
71 0.24
72 0.22
73 0.21
74 0.19
75 0.15
76 0.13
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.13
91 0.16
92 0.18
93 0.24
94 0.25
95 0.26
96 0.31
97 0.34
98 0.36
99 0.38
100 0.39
101 0.36
102 0.35
103 0.35
104 0.3
105 0.32
106 0.38
107 0.34
108 0.38
109 0.36
110 0.39
111 0.39
112 0.41
113 0.35
114 0.27
115 0.26
116 0.23
117 0.24
118 0.24
119 0.23
120 0.19
121 0.19
122 0.2
123 0.22
124 0.2
125 0.17
126 0.18
127 0.23
128 0.26
129 0.25
130 0.24
131 0.21
132 0.2
133 0.22
134 0.19
135 0.12
136 0.13
137 0.18
138 0.21
139 0.25
140 0.26
141 0.25
142 0.28
143 0.3
144 0.29
145 0.26
146 0.29
147 0.28
148 0.31
149 0.32
150 0.35
151 0.34
152 0.31
153 0.3
154 0.25
155 0.24
156 0.21
157 0.22
158 0.16
159 0.15
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.1
164 0.1
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.11
173 0.13
174 0.16
175 0.18
176 0.19
177 0.2
178 0.22
179 0.27
180 0.3
181 0.31
182 0.3
183 0.35
184 0.35
185 0.32
186 0.31
187 0.27
188 0.22
189 0.2
190 0.21
191 0.15
192 0.17
193 0.17
194 0.18
195 0.18
196 0.17
197 0.18
198 0.19
199 0.18
200 0.16
201 0.18
202 0.16
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.12
207 0.12
208 0.14
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.14
232 0.13
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.19
237 0.21
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.15
248 0.17
249 0.17
250 0.16
251 0.17
252 0.2
253 0.2
254 0.24
255 0.26
256 0.31
257 0.37
258 0.44
259 0.5
260 0.55
261 0.61
262 0.61
263 0.64
264 0.62
265 0.64
266 0.58
267 0.52
268 0.46
269 0.45
270 0.43
271 0.4
272 0.36
273 0.3
274 0.29
275 0.27
276 0.25
277 0.17
278 0.15
279 0.13
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.11
292 0.11
293 0.15
294 0.18
295 0.2
296 0.3
297 0.39
298 0.48
299 0.56
300 0.64
301 0.67
302 0.74
303 0.82
304 0.83
305 0.82
306 0.78
307 0.76
308 0.74
309 0.71
310 0.63
311 0.53
312 0.53
313 0.51
314 0.5
315 0.52
316 0.54
317 0.54
318 0.53
319 0.54
320 0.45
321 0.39
322 0.36
323 0.27
324 0.19
325 0.16
326 0.14
327 0.13
328 0.11
329 0.1
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.1
335 0.12
336 0.19
337 0.24
338 0.32
339 0.36
340 0.37
341 0.36
342 0.38
343 0.41
344 0.38
345 0.39
346 0.36
347 0.34
348 0.39
349 0.41
350 0.42
351 0.4
352 0.43
353 0.46
354 0.48
355 0.56
356 0.57
357 0.61
358 0.63
359 0.62
360 0.56
361 0.48
362 0.43
363 0.35
364 0.28
365 0.23
366 0.18
367 0.15
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.13
374 0.16
375 0.21
376 0.23
377 0.31
378 0.35
379 0.37
380 0.4
381 0.45
382 0.41
383 0.42
384 0.45
385 0.45
386 0.42
387 0.41
388 0.37
389 0.39
390 0.38
391 0.35
392 0.36
393 0.35
394 0.4
395 0.45
396 0.49
397 0.51
398 0.58
399 0.61
400 0.57
401 0.55
402 0.5
403 0.45
404 0.41
405 0.34
406 0.28
407 0.22
408 0.2
409 0.16
410 0.13
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.14
416 0.15
417 0.15
418 0.18
419 0.23
420 0.28
421 0.34
422 0.39
423 0.39
424 0.45
425 0.47
426 0.5
427 0.47
428 0.43
429 0.4
430 0.39
431 0.37
432 0.38
433 0.37
434 0.36
435 0.39
436 0.45
437 0.53
438 0.56
439 0.62
440 0.63
441 0.69
442 0.72
443 0.77
444 0.73
445 0.68
446 0.65
447 0.56
448 0.48
449 0.41
450 0.32
451 0.23
452 0.21
453 0.15
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.1
461 0.13
462 0.18
463 0.2
464 0.21
465 0.24
466 0.26
467 0.29
468 0.3
469 0.31
470 0.29
471 0.32
472 0.32
473 0.29
474 0.27
475 0.24
476 0.2
477 0.17
478 0.14
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.11
488 0.1
489 0.11
490 0.12
491 0.14
492 0.21
493 0.23
494 0.29
495 0.34
496 0.4
497 0.46
498 0.51
499 0.53
500 0.55
501 0.61
502 0.64
503 0.63
504 0.68
505 0.71
506 0.75
507 0.81
508 0.82
509 0.78
510 0.73
511 0.72
512 0.65
513 0.57
514 0.47
515 0.38
516 0.28
517 0.26
518 0.21
519 0.14
520 0.11
521 0.09
522 0.11
523 0.14
524 0.17
525 0.17
526 0.19
527 0.19
528 0.28
529 0.37
530 0.41
531 0.47
532 0.51
533 0.56
534 0.6
535 0.63
536 0.56
537 0.48
538 0.41
539 0.35
540 0.3
541 0.24
542 0.22
543 0.2
544 0.25
545 0.29
546 0.33
547 0.37
548 0.4
549 0.41
550 0.38
551 0.36
552 0.33
553 0.3
554 0.27
555 0.2
556 0.14
557 0.13
558 0.13
559 0.13
560 0.11
561 0.12
562 0.13
563 0.14
564 0.16
565 0.22
566 0.32
567 0.42
568 0.46
569 0.52
570 0.56
571 0.63
572 0.65
573 0.66
574 0.58
575 0.56
576 0.52
577 0.46
578 0.42
579 0.35
580 0.33
581 0.27
582 0.27
583 0.19
584 0.18
585 0.16
586 0.19
587 0.25
588 0.29
589 0.35
590 0.4
591 0.47
592 0.5
593 0.54
594 0.59
595 0.62
596 0.65
597 0.66
598 0.65
599 0.66
600 0.64
601 0.61
602 0.61
603 0.59
604 0.53
605 0.53
606 0.49
607 0.46
608 0.47
609 0.5
610 0.45
611 0.44
612 0.49
613 0.48
614 0.47
615 0.46
616 0.48
617 0.5
618 0.47
619 0.42
620 0.36
621 0.33
622 0.31
623 0.28
624 0.24
625 0.2
626 0.21
627 0.18
628 0.15
629 0.16
630 0.17
631 0.16
632 0.16
633 0.14
634 0.15
635 0.18
636 0.21
637 0.2
638 0.22
639 0.25
640 0.27
641 0.3
642 0.36
643 0.41
644 0.44
645 0.46
646 0.52
647 0.58
648 0.65
649 0.72
650 0.75
651 0.73
652 0.76
653 0.79
654 0.81
655 0.82
656 0.8
657 0.74
658 0.72
659 0.66
660 0.56
661 0.5
662 0.41
663 0.35
664 0.32
665 0.3
666 0.26
667 0.27
668 0.3
669 0.38