Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H1BQI6

Protein Details
Accession A0A0H1BQI6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
613-633ITSSLKLARRYKRREHYDDNWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.333, nucl 15, cyto 10.5, mito_nucl 8.665
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005378  Vps35  
IPR042491  Vps35_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030906  C:retromer, cargo-selective complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF03635  Vps35  
Amino Acid Sequences MASPPNVPEEQSRLLEDALGVVRQQAHMMRRCLETPGKLMDALKCGSTLVSELRTPSLGPKQYYELYMAVHDALRHLSVYLKESHPVNHLADLYELVQYAGNIIPRLYLMITVGTVYMGIEDAPVKEIMKDMMEMSRGVQHPIRGLFLRYYLSGQAKDHLPTGTGDGPQGNIQDSISFILTNFVEMNKLWVRLQHQGHSRERELRTQERKELELLVGSNLVRLSQLVDLETYKTIILQPLLEQIVQCRDVLAQEYLLEVMTKVFPDEYHLHTLDLLLSAIARLNPHVDMKKIVIGLMDRLSSYAARDSDNNDTPESKKQAEEEATVRLLEKLRLAKENEGEKPQPETEVSGEDKDATTKEPNKEPDAAENGEQEPSPVANGEDEGGSKSKLPVDIKLYEIFFDQVVNLVRTRNLPIQDTIALLVSLVNLALNIYPERLEYVDQVLEYATKKTLEHADSADLHSSAAQSNLLNLLLAPIRTYISIFTALSLPNYIPLFAAQSYPTRRAVAGEIARGILRNRTIISTSEHLDGVLQILSVLIKEGMQQPVGYPGVQQQRRAGETEETIEEQGWLARIVHFIQGPDNDTQLKLLQETRKAYSEGNERIRYTTPAIITSSLKLARRYKRREHYDDNWQAQSSTLYRFMHQCISNLYQRVNSGCAELSLRLFVLCGQVADQAGFEEFSYEFFAQAFTIYEDSISDSRAQFQAVCILASALHGTRGFGKENYDTLITKAALHGSKLLKKPDQCRAVYLASHLWWAVENQQQEGEDAKDLYRDSKRVLECLQRALRVADACMDTAVSVELFVEILNRYVYYFDQGNETVTIKYLNGLIELIHSNLQTSQNDGVPNSSLDNPKRHFQRTLDYIKSRDYEGVVTEPRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.23
4 0.2
5 0.16
6 0.15
7 0.12
8 0.13
9 0.14
10 0.14
11 0.17
12 0.19
13 0.26
14 0.32
15 0.37
16 0.39
17 0.41
18 0.42
19 0.46
20 0.47
21 0.42
22 0.4
23 0.4
24 0.38
25 0.36
26 0.38
27 0.35
28 0.33
29 0.3
30 0.26
31 0.21
32 0.19
33 0.18
34 0.16
35 0.15
36 0.14
37 0.16
38 0.17
39 0.18
40 0.2
41 0.2
42 0.2
43 0.24
44 0.3
45 0.33
46 0.34
47 0.35
48 0.39
49 0.41
50 0.42
51 0.38
52 0.3
53 0.25
54 0.24
55 0.22
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.14
65 0.15
66 0.18
67 0.22
68 0.22
69 0.25
70 0.26
71 0.29
72 0.29
73 0.31
74 0.3
75 0.28
76 0.27
77 0.25
78 0.24
79 0.22
80 0.19
81 0.16
82 0.14
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.12
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.11
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.2
124 0.19
125 0.22
126 0.23
127 0.22
128 0.26
129 0.27
130 0.29
131 0.23
132 0.25
133 0.23
134 0.23
135 0.23
136 0.2
137 0.2
138 0.22
139 0.24
140 0.24
141 0.24
142 0.26
143 0.26
144 0.27
145 0.27
146 0.22
147 0.19
148 0.17
149 0.21
150 0.2
151 0.18
152 0.18
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.18
157 0.14
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.16
174 0.15
175 0.17
176 0.16
177 0.19
178 0.23
179 0.3
180 0.34
181 0.35
182 0.41
183 0.47
184 0.54
185 0.57
186 0.57
187 0.58
188 0.57
189 0.57
190 0.57
191 0.59
192 0.61
193 0.6
194 0.63
195 0.58
196 0.57
197 0.51
198 0.46
199 0.36
200 0.29
201 0.24
202 0.17
203 0.16
204 0.14
205 0.14
206 0.11
207 0.11
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.12
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.13
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.11
253 0.15
254 0.17
255 0.22
256 0.23
257 0.23
258 0.22
259 0.23
260 0.18
261 0.15
262 0.11
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.17
277 0.19
278 0.18
279 0.17
280 0.14
281 0.13
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.13
294 0.16
295 0.21
296 0.26
297 0.26
298 0.24
299 0.25
300 0.26
301 0.31
302 0.32
303 0.27
304 0.24
305 0.23
306 0.28
307 0.28
308 0.29
309 0.24
310 0.22
311 0.21
312 0.2
313 0.19
314 0.16
315 0.15
316 0.13
317 0.15
318 0.16
319 0.18
320 0.23
321 0.24
322 0.26
323 0.3
324 0.35
325 0.35
326 0.35
327 0.34
328 0.31
329 0.32
330 0.29
331 0.25
332 0.2
333 0.18
334 0.14
335 0.16
336 0.17
337 0.14
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.1
344 0.15
345 0.2
346 0.23
347 0.29
348 0.32
349 0.34
350 0.37
351 0.35
352 0.33
353 0.32
354 0.3
355 0.25
356 0.23
357 0.21
358 0.19
359 0.18
360 0.14
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.12
378 0.13
379 0.15
380 0.19
381 0.2
382 0.22
383 0.23
384 0.22
385 0.18
386 0.18
387 0.15
388 0.1
389 0.09
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.11
398 0.14
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.16
403 0.18
404 0.18
405 0.17
406 0.14
407 0.1
408 0.09
409 0.07
410 0.06
411 0.04
412 0.03
413 0.03
414 0.02
415 0.02
416 0.02
417 0.03
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.14
440 0.14
441 0.15
442 0.15
443 0.17
444 0.17
445 0.18
446 0.17
447 0.12
448 0.11
449 0.1
450 0.09
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.09
484 0.08
485 0.09
486 0.08
487 0.12
488 0.15
489 0.18
490 0.19
491 0.18
492 0.18
493 0.18
494 0.19
495 0.21
496 0.2
497 0.18
498 0.17
499 0.17
500 0.16
501 0.16
502 0.15
503 0.11
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.13
509 0.13
510 0.16
511 0.16
512 0.17
513 0.17
514 0.17
515 0.15
516 0.14
517 0.13
518 0.1
519 0.08
520 0.05
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.03
527 0.03
528 0.05
529 0.08
530 0.09
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.14
535 0.15
536 0.13
537 0.1
538 0.15
539 0.24
540 0.26
541 0.28
542 0.27
543 0.31
544 0.32
545 0.34
546 0.29
547 0.22
548 0.22
549 0.22
550 0.2
551 0.17
552 0.16
553 0.14
554 0.12
555 0.1
556 0.09
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.06
561 0.08
562 0.08
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.13
567 0.14
568 0.16
569 0.15
570 0.16
571 0.14
572 0.13
573 0.14
574 0.13
575 0.12
576 0.11
577 0.16
578 0.19
579 0.24
580 0.27
581 0.29
582 0.29
583 0.3
584 0.29
585 0.3
586 0.34
587 0.37
588 0.41
589 0.42
590 0.4
591 0.42
592 0.43
593 0.39
594 0.34
595 0.3
596 0.23
597 0.21
598 0.21
599 0.21
600 0.2
601 0.19
602 0.2
603 0.2
604 0.22
605 0.26
606 0.33
607 0.41
608 0.5
609 0.57
610 0.64
611 0.7
612 0.78
613 0.8
614 0.81
615 0.78
616 0.79
617 0.79
618 0.74
619 0.66
620 0.56
621 0.47
622 0.39
623 0.35
624 0.26
625 0.19
626 0.2
627 0.19
628 0.2
629 0.22
630 0.24
631 0.29
632 0.28
633 0.26
634 0.26
635 0.3
636 0.33
637 0.32
638 0.31
639 0.26
640 0.27
641 0.27
642 0.24
643 0.2
644 0.16
645 0.14
646 0.14
647 0.14
648 0.13
649 0.12
650 0.11
651 0.1
652 0.09
653 0.09
654 0.08
655 0.09
656 0.09
657 0.08
658 0.08
659 0.1
660 0.1
661 0.1
662 0.09
663 0.07
664 0.07
665 0.08
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.07
670 0.11
671 0.11
672 0.11
673 0.11
674 0.11
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.07
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.11
684 0.11
685 0.11
686 0.13
687 0.13
688 0.16
689 0.16
690 0.17
691 0.14
692 0.14
693 0.18
694 0.16
695 0.16
696 0.13
697 0.12
698 0.11
699 0.11
700 0.13
701 0.07
702 0.09
703 0.09
704 0.1
705 0.14
706 0.17
707 0.19
708 0.18
709 0.22
710 0.22
711 0.23
712 0.25
713 0.23
714 0.21
715 0.2
716 0.23
717 0.2
718 0.18
719 0.18
720 0.2
721 0.19
722 0.19
723 0.24
724 0.25
725 0.32
726 0.37
727 0.43
728 0.44
729 0.5
730 0.57
731 0.61
732 0.63
733 0.57
734 0.56
735 0.54
736 0.51
737 0.45
738 0.41
739 0.35
740 0.27
741 0.27
742 0.23
743 0.18
744 0.14
745 0.15
746 0.17
747 0.18
748 0.19
749 0.19
750 0.21
751 0.21
752 0.21
753 0.22
754 0.19
755 0.16
756 0.16
757 0.15
758 0.15
759 0.15
760 0.21
761 0.24
762 0.25
763 0.26
764 0.33
765 0.35
766 0.37
767 0.42
768 0.45
769 0.43
770 0.51
771 0.52
772 0.46
773 0.46
774 0.42
775 0.41
776 0.32
777 0.3
778 0.25
779 0.21
780 0.19
781 0.18
782 0.16
783 0.12
784 0.12
785 0.11
786 0.07
787 0.05
788 0.05
789 0.05
790 0.05
791 0.05
792 0.06
793 0.06
794 0.08
795 0.08
796 0.08
797 0.09
798 0.1
799 0.11
800 0.14
801 0.15
802 0.14
803 0.19
804 0.19
805 0.21
806 0.21
807 0.22
808 0.18
809 0.17
810 0.18
811 0.13
812 0.14
813 0.14
814 0.12
815 0.11
816 0.11
817 0.1
818 0.13
819 0.14
820 0.14
821 0.14
822 0.14
823 0.14
824 0.17
825 0.22
826 0.19
827 0.22
828 0.23
829 0.24
830 0.27
831 0.26
832 0.25
833 0.22
834 0.22
835 0.22
836 0.24
837 0.29
838 0.32
839 0.41
840 0.42
841 0.49
842 0.56
843 0.59
844 0.6
845 0.56
846 0.61
847 0.62
848 0.68
849 0.68
850 0.66
851 0.63
852 0.63
853 0.6
854 0.52
855 0.45
856 0.38
857 0.3
858 0.28
859 0.32