Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H1B5K7

Protein Details
Accession A0A0H1B5K7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-122QMLYKLKHPPRESKPKSPAPTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-127KHPPRESKPKSPAPTPAKPKR
Subcellular Location(s) cyto 11, nucl 9, mito 4, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTTLPRDRSSGRQTRGIFENPDPFAQVAHATTQDDDDAIDFEDTYDGLGDRLDEDQDAFNDDTFGGGEGEKESVGKDFDFYGKTAQMTNVLDEEQMLYKLKHPPRESKPKSPAPTPAKPKRTGYELYHDPGYIPEIQAKSTIWGTDVGQKSKAEDSTQPSKPAAPAKKVMSLEEVEAQMRAQSKKPLATEPEQPSAPPPPPQTAPQFPGAIPQATVPLTMPLHDRPAPPPDGMLPSSLQEFPPLDQQRQYAQLGKDALAAQAFQRQQSFPPMEAMLPRPGMPPPPMHHQNRPPPGAAPQRPMRQVQHHHPKSQAPMGPPGQLPATSGMPPNLSPLTEEQRKANLIEDAKRAKRNHKIFLLSKGNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVAATGNVTDPESEASLSEDFYYQVYSQIRGAPRQHPRQPLGHFAQTYLFQTGGRSAGGMGRRQFYTGDNHMQRMQQQVQRAVEAAKLRPKNKQLIIEGSLGKISFSNAKTPKPLLNIKRPDSSDGQKASNLKKSNHTTMSASDRKSILKNIENVYGTLMQMEDHERSMPPPPDESDPGSVERHMEWRQKMQNLNQKLWSDMKVLEPIVPGSSTPHPFIAFLSYPKGKKAIPRIFRQIDQEQRVTILTMIIVHLDSLDVVQRAQLQLGESQPPLAVREEIDLFSHAVMPSLLGYVNEAPINIITGLLGLVIGQTHVQTVAKTRVGLGVLTMLLSRAELVKEGGTVEDELLKSWTELYNTFFDRLEPVFGDIFPGTINSGDDMYVWQFLAAVGIGASPEQQQRLVIAVKERVMETVAQSKTLPADMASQRLGNVNLFMRAIGLDVELLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.48
3 0.52
4 0.5
5 0.57
6 0.57
7 0.6
8 0.63
9 0.59
10 0.54
11 0.5
12 0.53
13 0.47
14 0.45
15 0.41
16 0.35
17 0.3
18 0.26
19 0.22
20 0.16
21 0.16
22 0.17
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.14
28 0.13
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.07
42 0.06
43 0.07
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.13
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.13
56 0.11
57 0.12
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.15
72 0.17
73 0.17
74 0.2
75 0.2
76 0.21
77 0.21
78 0.2
79 0.23
80 0.22
81 0.23
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.16
86 0.17
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.17
92 0.27
93 0.32
94 0.39
95 0.43
96 0.52
97 0.61
98 0.71
99 0.75
100 0.76
101 0.81
102 0.81
103 0.82
104 0.77
105 0.77
106 0.74
107 0.76
108 0.76
109 0.76
110 0.75
111 0.75
112 0.76
113 0.7
114 0.67
115 0.64
116 0.59
117 0.57
118 0.54
119 0.52
120 0.48
121 0.43
122 0.37
123 0.31
124 0.29
125 0.21
126 0.16
127 0.18
128 0.17
129 0.18
130 0.19
131 0.18
132 0.18
133 0.18
134 0.17
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.21
139 0.26
140 0.26
141 0.28
142 0.28
143 0.29
144 0.32
145 0.32
146 0.27
147 0.27
148 0.32
149 0.37
150 0.41
151 0.41
152 0.38
153 0.38
154 0.39
155 0.43
156 0.43
157 0.4
158 0.42
159 0.43
160 0.49
161 0.48
162 0.45
163 0.4
164 0.34
165 0.31
166 0.27
167 0.25
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.14
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.23
176 0.26
177 0.31
178 0.34
179 0.37
180 0.39
181 0.41
182 0.47
183 0.46
184 0.47
185 0.43
186 0.4
187 0.37
188 0.36
189 0.35
190 0.31
191 0.28
192 0.28
193 0.3
194 0.35
195 0.39
196 0.4
197 0.41
198 0.39
199 0.38
200 0.33
201 0.35
202 0.33
203 0.26
204 0.21
205 0.18
206 0.17
207 0.15
208 0.16
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.15
214 0.14
215 0.19
216 0.21
217 0.23
218 0.22
219 0.28
220 0.29
221 0.26
222 0.26
223 0.23
224 0.24
225 0.23
226 0.22
227 0.17
228 0.15
229 0.17
230 0.17
231 0.15
232 0.13
233 0.14
234 0.13
235 0.22
236 0.24
237 0.24
238 0.25
239 0.27
240 0.27
241 0.31
242 0.32
243 0.28
244 0.26
245 0.28
246 0.27
247 0.26
248 0.26
249 0.22
250 0.2
251 0.14
252 0.14
253 0.1
254 0.15
255 0.15
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.17
260 0.24
261 0.26
262 0.2
263 0.22
264 0.21
265 0.2
266 0.22
267 0.23
268 0.19
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.18
274 0.18
275 0.2
276 0.21
277 0.29
278 0.36
279 0.4
280 0.47
281 0.53
282 0.61
283 0.64
284 0.62
285 0.54
286 0.47
287 0.5
288 0.53
289 0.47
290 0.44
291 0.44
292 0.47
293 0.49
294 0.51
295 0.48
296 0.46
297 0.5
298 0.54
299 0.58
300 0.57
301 0.57
302 0.57
303 0.56
304 0.51
305 0.51
306 0.44
307 0.34
308 0.37
309 0.35
310 0.35
311 0.31
312 0.28
313 0.22
314 0.19
315 0.17
316 0.13
317 0.13
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.12
325 0.1
326 0.1
327 0.13
328 0.19
329 0.22
330 0.23
331 0.22
332 0.25
333 0.26
334 0.25
335 0.23
336 0.21
337 0.19
338 0.22
339 0.26
340 0.3
341 0.33
342 0.39
343 0.4
344 0.44
345 0.5
346 0.53
347 0.54
348 0.53
349 0.56
350 0.52
351 0.59
352 0.59
353 0.5
354 0.44
355 0.38
356 0.32
357 0.25
358 0.23
359 0.17
360 0.12
361 0.13
362 0.13
363 0.15
364 0.15
365 0.17
366 0.18
367 0.16
368 0.17
369 0.2
370 0.22
371 0.22
372 0.24
373 0.23
374 0.23
375 0.21
376 0.19
377 0.14
378 0.11
379 0.08
380 0.06
381 0.06
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.06
399 0.09
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.15
404 0.16
405 0.18
406 0.22
407 0.26
408 0.34
409 0.41
410 0.46
411 0.49
412 0.5
413 0.53
414 0.52
415 0.51
416 0.47
417 0.42
418 0.36
419 0.31
420 0.29
421 0.24
422 0.23
423 0.16
424 0.12
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.08
433 0.1
434 0.13
435 0.14
436 0.15
437 0.16
438 0.16
439 0.17
440 0.16
441 0.19
442 0.2
443 0.27
444 0.26
445 0.28
446 0.29
447 0.29
448 0.29
449 0.3
450 0.31
451 0.25
452 0.28
453 0.31
454 0.3
455 0.29
456 0.28
457 0.23
458 0.2
459 0.2
460 0.19
461 0.21
462 0.26
463 0.27
464 0.33
465 0.37
466 0.42
467 0.44
468 0.47
469 0.43
470 0.43
471 0.44
472 0.42
473 0.37
474 0.3
475 0.26
476 0.2
477 0.17
478 0.12
479 0.1
480 0.11
481 0.12
482 0.2
483 0.22
484 0.24
485 0.26
486 0.29
487 0.31
488 0.31
489 0.39
490 0.38
491 0.45
492 0.52
493 0.53
494 0.56
495 0.54
496 0.52
497 0.49
498 0.46
499 0.43
500 0.37
501 0.35
502 0.32
503 0.36
504 0.36
505 0.38
506 0.39
507 0.34
508 0.4
509 0.44
510 0.48
511 0.46
512 0.44
513 0.38
514 0.37
515 0.44
516 0.41
517 0.36
518 0.33
519 0.31
520 0.31
521 0.31
522 0.32
523 0.29
524 0.28
525 0.32
526 0.32
527 0.35
528 0.34
529 0.32
530 0.3
531 0.25
532 0.2
533 0.15
534 0.13
535 0.08
536 0.08
537 0.11
538 0.09
539 0.09
540 0.1
541 0.1
542 0.11
543 0.17
544 0.2
545 0.19
546 0.2
547 0.22
548 0.25
549 0.28
550 0.29
551 0.27
552 0.25
553 0.26
554 0.25
555 0.23
556 0.2
557 0.18
558 0.2
559 0.23
560 0.27
561 0.28
562 0.35
563 0.41
564 0.45
565 0.49
566 0.52
567 0.56
568 0.55
569 0.56
570 0.53
571 0.48
572 0.45
573 0.43
574 0.37
575 0.3
576 0.25
577 0.24
578 0.21
579 0.21
580 0.19
581 0.17
582 0.16
583 0.14
584 0.13
585 0.11
586 0.12
587 0.16
588 0.17
589 0.18
590 0.19
591 0.18
592 0.19
593 0.19
594 0.21
595 0.17
596 0.16
597 0.21
598 0.25
599 0.25
600 0.26
601 0.29
602 0.25
603 0.3
604 0.4
605 0.43
606 0.46
607 0.52
608 0.61
609 0.62
610 0.64
611 0.64
612 0.61
613 0.61
614 0.59
615 0.53
616 0.43
617 0.4
618 0.37
619 0.31
620 0.23
621 0.14
622 0.09
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.04
631 0.04
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.07
636 0.09
637 0.1
638 0.1
639 0.11
640 0.1
641 0.12
642 0.15
643 0.17
644 0.15
645 0.15
646 0.16
647 0.15
648 0.16
649 0.15
650 0.13
651 0.11
652 0.14
653 0.15
654 0.15
655 0.15
656 0.15
657 0.14
658 0.13
659 0.15
660 0.12
661 0.1
662 0.1
663 0.09
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.06
668 0.08
669 0.08
670 0.1
671 0.1
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.11
676 0.09
677 0.07
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.05
682 0.05
683 0.03
684 0.03
685 0.03
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.06
691 0.07
692 0.07
693 0.12
694 0.18
695 0.2
696 0.2
697 0.2
698 0.22
699 0.22
700 0.22
701 0.17
702 0.13
703 0.11
704 0.11
705 0.1
706 0.08
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.07
711 0.07
712 0.08
713 0.09
714 0.09
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.1
720 0.1
721 0.13
722 0.12
723 0.12
724 0.13
725 0.13
726 0.12
727 0.13
728 0.14
729 0.13
730 0.14
731 0.17
732 0.22
733 0.24
734 0.26
735 0.24
736 0.22
737 0.24
738 0.24
739 0.23
740 0.18
741 0.18
742 0.18
743 0.17
744 0.2
745 0.16
746 0.15
747 0.12
748 0.12
749 0.1
750 0.1
751 0.1
752 0.08
753 0.09
754 0.09
755 0.09
756 0.1
757 0.11
758 0.11
759 0.11
760 0.09
761 0.09
762 0.09
763 0.09
764 0.07
765 0.06
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.05
770 0.06
771 0.09
772 0.12
773 0.13
774 0.14
775 0.14
776 0.15
777 0.19
778 0.22
779 0.21
780 0.24
781 0.27
782 0.28
783 0.3
784 0.3
785 0.26
786 0.25
787 0.23
788 0.21
789 0.26
790 0.24
791 0.23
792 0.23
793 0.24
794 0.24
795 0.24
796 0.21
797 0.13
798 0.21
799 0.22
800 0.26
801 0.27
802 0.26
803 0.25
804 0.28
805 0.29
806 0.21
807 0.23
808 0.2
809 0.2
810 0.2
811 0.19
812 0.16
813 0.14
814 0.14
815 0.11
816 0.09