Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M3MDT8

Protein Details
Accession A0A5M3MDT8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-234LSQGSERKTFKKKRRSPKNPSDMKTNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-225RKTFKKKRRSPK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002867  IBR_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR027370  Znf-RING_euk  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
KEGG cput:CONPUDRAFT_84352  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PF13445  zf-RING_UBOX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS50103  ZF_C3H1  
PS50089  ZF_RING_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22585  Rcat_RBR_DEAH12-like  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MPSSSPHTLVKPPLLPKAAQHQAAREVAQPLDGDVVDDEIARICREINQPGTVRRQVATKGDPKLEARIAPALSSAPTASMPSSAPSGKGLALVDRALYTRSPIVPNSVESQEVVQVNLPPPTESIPKSNKGQATKATPQANKDQAIKTPSQATKRETSKTPLRGRKVAEVPQRSIQSRAPSLSPQDVKRQGTEITSQNTAEPTKEALSQGSERKTFKKKRRSPKNPSDMKTNSDIIHVSGLDSCTLPEVPLVDDAQGLHNVKLPSPITRSADTTPAVQSKSSSDVCWLFLKGRCPYNPCERLHVSAPPHVCKDWLFGLCERNPCPRKHEMPDKNVKYPHVCNLWLRRGVCDRQVCYFQHELPAKEQKLPSPDSSIAVKPDPLQVTLFDHTKVKLDSGFEVISIATGFENRWVHVAGIPPDVSCKAIEKLLKSFGQVDQLLGLDPTVTLSKSRYIKVQYSAALEASDAAQKLNGHSLSGAKLIAKIPVNNTTRGNGVLDDTTVHLEWKAPGRMAYVGYSTLKEAIDAVEAADGKVFRNHIISATLYDGLPSVGAFNVLFEGLPHDTKEAELRVYGTAEAMMLERPNYQSLQQAINNIKKMLEDCGELLSFDVIPPPYREGTVKATARFISSREATYAQEHIHERKPQFLGRTLLVARHVQSLEYHVARRTFTQIAGDLSHLRWSWNTGRKQGVTVYNAGEQWSGPVKVKLCAENAKELSVLKVKYERIQKGETVVDDKVPVWDDHFSRPAGVEFIRMLDNEYPLARIIVDRSRRIISVWGPIVSRTVICRRIVGKYRYIQSRRRWEIPLSGRLTSMIASNRVYKLQDDLARDRCRLDAPNRRLVVFGEQILYTATCRLIEKLQASPEQNSSKSATSTCPVCFGDPTDPTSLSCGHVWCRSCLSDYILSSVDSKSFPLSCLGNDATCAECIPLSIAQSLLSAAEFESIAQASFSAFVHARPDEFFYCPTPDCTQVYRASAHDAILQCPSCLARICSACHVEAHDGMTCAERDASEEKLFTEWTDQHDVKRCPSCKVAIERSEGCNHMTCTRCQTHICWVCLATFHKGKGIYDHMRQEHGGIGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.47
3 0.46
4 0.51
5 0.51
6 0.51
7 0.48
8 0.45
9 0.48
10 0.5
11 0.48
12 0.41
13 0.36
14 0.3
15 0.3
16 0.25
17 0.19
18 0.19
19 0.17
20 0.14
21 0.11
22 0.12
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.17
32 0.22
33 0.29
34 0.31
35 0.37
36 0.41
37 0.47
38 0.55
39 0.53
40 0.51
41 0.45
42 0.45
43 0.43
44 0.46
45 0.48
46 0.47
47 0.49
48 0.5
49 0.53
50 0.51
51 0.53
52 0.49
53 0.41
54 0.37
55 0.36
56 0.33
57 0.29
58 0.27
59 0.22
60 0.18
61 0.18
62 0.15
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.17
75 0.16
76 0.18
77 0.17
78 0.15
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.17
88 0.2
89 0.22
90 0.22
91 0.27
92 0.28
93 0.3
94 0.32
95 0.29
96 0.26
97 0.24
98 0.24
99 0.23
100 0.22
101 0.2
102 0.17
103 0.19
104 0.2
105 0.22
106 0.21
107 0.17
108 0.18
109 0.21
110 0.25
111 0.24
112 0.3
113 0.35
114 0.39
115 0.44
116 0.49
117 0.51
118 0.5
119 0.54
120 0.52
121 0.54
122 0.56
123 0.59
124 0.6
125 0.57
126 0.57
127 0.6
128 0.59
129 0.54
130 0.53
131 0.48
132 0.45
133 0.47
134 0.45
135 0.39
136 0.42
137 0.44
138 0.45
139 0.48
140 0.48
141 0.51
142 0.56
143 0.58
144 0.53
145 0.56
146 0.58
147 0.62
148 0.68
149 0.68
150 0.69
151 0.7
152 0.7
153 0.71
154 0.69
155 0.68
156 0.67
157 0.64
158 0.61
159 0.62
160 0.63
161 0.55
162 0.52
163 0.47
164 0.45
165 0.43
166 0.4
167 0.36
168 0.34
169 0.37
170 0.42
171 0.43
172 0.39
173 0.45
174 0.5
175 0.5
176 0.48
177 0.46
178 0.39
179 0.36
180 0.38
181 0.34
182 0.3
183 0.3
184 0.29
185 0.27
186 0.28
187 0.26
188 0.22
189 0.18
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.19
196 0.23
197 0.28
198 0.31
199 0.34
200 0.35
201 0.42
202 0.51
203 0.57
204 0.63
205 0.68
206 0.72
207 0.79
208 0.88
209 0.92
210 0.92
211 0.93
212 0.94
213 0.92
214 0.86
215 0.85
216 0.76
217 0.69
218 0.63
219 0.55
220 0.44
221 0.36
222 0.33
223 0.24
224 0.23
225 0.19
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.11
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.14
245 0.14
246 0.13
247 0.17
248 0.17
249 0.17
250 0.22
251 0.21
252 0.21
253 0.24
254 0.29
255 0.29
256 0.3
257 0.33
258 0.3
259 0.33
260 0.3
261 0.28
262 0.26
263 0.26
264 0.25
265 0.22
266 0.21
267 0.19
268 0.23
269 0.23
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.22
274 0.23
275 0.22
276 0.2
277 0.22
278 0.28
279 0.29
280 0.34
281 0.35
282 0.37
283 0.42
284 0.48
285 0.53
286 0.49
287 0.51
288 0.48
289 0.49
290 0.47
291 0.47
292 0.4
293 0.37
294 0.4
295 0.36
296 0.35
297 0.32
298 0.3
299 0.25
300 0.25
301 0.25
302 0.23
303 0.22
304 0.22
305 0.28
306 0.31
307 0.35
308 0.34
309 0.39
310 0.42
311 0.41
312 0.45
313 0.47
314 0.5
315 0.54
316 0.63
317 0.62
318 0.66
319 0.75
320 0.74
321 0.73
322 0.69
323 0.63
324 0.58
325 0.51
326 0.48
327 0.42
328 0.38
329 0.38
330 0.43
331 0.47
332 0.47
333 0.44
334 0.41
335 0.43
336 0.44
337 0.45
338 0.43
339 0.38
340 0.36
341 0.41
342 0.38
343 0.37
344 0.37
345 0.3
346 0.32
347 0.34
348 0.32
349 0.33
350 0.41
351 0.37
352 0.39
353 0.39
354 0.34
355 0.36
356 0.38
357 0.34
358 0.31
359 0.3
360 0.27
361 0.29
362 0.27
363 0.25
364 0.22
365 0.21
366 0.17
367 0.21
368 0.19
369 0.18
370 0.17
371 0.15
372 0.18
373 0.2
374 0.2
375 0.16
376 0.16
377 0.16
378 0.18
379 0.17
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.16
385 0.15
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.13
402 0.17
403 0.14
404 0.15
405 0.15
406 0.14
407 0.15
408 0.15
409 0.14
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.13
414 0.15
415 0.16
416 0.18
417 0.22
418 0.23
419 0.21
420 0.22
421 0.2
422 0.23
423 0.21
424 0.18
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.11
429 0.09
430 0.04
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.13
438 0.15
439 0.16
440 0.2
441 0.23
442 0.27
443 0.29
444 0.32
445 0.28
446 0.28
447 0.27
448 0.23
449 0.19
450 0.15
451 0.12
452 0.1
453 0.09
454 0.07
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.11
460 0.11
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.07
468 0.09
469 0.09
470 0.12
471 0.12
472 0.13
473 0.14
474 0.22
475 0.24
476 0.25
477 0.25
478 0.23
479 0.22
480 0.22
481 0.2
482 0.12
483 0.11
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.07
488 0.08
489 0.07
490 0.07
491 0.06
492 0.07
493 0.08
494 0.12
495 0.12
496 0.11
497 0.12
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.13
502 0.1
503 0.1
504 0.11
505 0.11
506 0.1
507 0.1
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.08
533 0.08
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.04
539 0.03
540 0.04
541 0.03
542 0.03
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.03
547 0.05
548 0.06
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.1
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.08
559 0.08
560 0.09
561 0.09
562 0.07
563 0.06
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.04
569 0.05
570 0.06
571 0.07
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.12
576 0.14
577 0.17
578 0.17
579 0.21
580 0.25
581 0.29
582 0.29
583 0.26
584 0.24
585 0.21
586 0.2
587 0.18
588 0.14
589 0.11
590 0.1
591 0.11
592 0.11
593 0.1
594 0.1
595 0.08
596 0.06
597 0.06
598 0.07
599 0.06
600 0.07
601 0.08
602 0.1
603 0.1
604 0.11
605 0.12
606 0.14
607 0.18
608 0.25
609 0.26
610 0.25
611 0.27
612 0.26
613 0.27
614 0.25
615 0.21
616 0.18
617 0.17
618 0.17
619 0.17
620 0.18
621 0.17
622 0.18
623 0.19
624 0.15
625 0.17
626 0.19
627 0.21
628 0.24
629 0.29
630 0.28
631 0.31
632 0.33
633 0.32
634 0.33
635 0.34
636 0.32
637 0.26
638 0.3
639 0.24
640 0.23
641 0.23
642 0.21
643 0.17
644 0.18
645 0.18
646 0.14
647 0.14
648 0.16
649 0.18
650 0.18
651 0.18
652 0.17
653 0.19
654 0.19
655 0.2
656 0.21
657 0.18
658 0.17
659 0.17
660 0.16
661 0.17
662 0.17
663 0.17
664 0.14
665 0.13
666 0.16
667 0.14
668 0.13
669 0.12
670 0.15
671 0.22
672 0.29
673 0.32
674 0.34
675 0.39
676 0.39
677 0.41
678 0.41
679 0.38
680 0.32
681 0.31
682 0.28
683 0.25
684 0.24
685 0.23
686 0.19
687 0.13
688 0.13
689 0.13
690 0.12
691 0.12
692 0.14
693 0.15
694 0.18
695 0.2
696 0.21
697 0.22
698 0.27
699 0.28
700 0.32
701 0.32
702 0.3
703 0.28
704 0.26
705 0.25
706 0.23
707 0.21
708 0.16
709 0.2
710 0.2
711 0.25
712 0.34
713 0.36
714 0.35
715 0.38
716 0.37
717 0.36
718 0.37
719 0.32
720 0.27
721 0.23
722 0.19
723 0.17
724 0.17
725 0.14
726 0.14
727 0.13
728 0.11
729 0.14
730 0.16
731 0.19
732 0.21
733 0.2
734 0.19
735 0.19
736 0.18
737 0.17
738 0.15
739 0.13
740 0.1
741 0.12
742 0.12
743 0.11
744 0.13
745 0.12
746 0.13
747 0.12
748 0.12
749 0.12
750 0.11
751 0.11
752 0.09
753 0.08
754 0.1
755 0.16
756 0.22
757 0.23
758 0.26
759 0.27
760 0.27
761 0.28
762 0.29
763 0.24
764 0.26
765 0.27
766 0.25
767 0.24
768 0.24
769 0.24
770 0.2
771 0.19
772 0.15
773 0.19
774 0.22
775 0.23
776 0.26
777 0.27
778 0.35
779 0.43
780 0.43
781 0.45
782 0.46
783 0.53
784 0.59
785 0.63
786 0.63
787 0.64
788 0.71
789 0.71
790 0.69
791 0.66
792 0.59
793 0.62
794 0.61
795 0.6
796 0.53
797 0.46
798 0.41
799 0.38
800 0.36
801 0.26
802 0.23
803 0.16
804 0.15
805 0.16
806 0.2
807 0.21
808 0.22
809 0.23
810 0.2
811 0.2
812 0.24
813 0.27
814 0.29
815 0.34
816 0.41
817 0.44
818 0.44
819 0.42
820 0.37
821 0.36
822 0.36
823 0.4
824 0.42
825 0.44
826 0.53
827 0.53
828 0.52
829 0.5
830 0.45
831 0.41
832 0.33
833 0.27
834 0.2
835 0.18
836 0.18
837 0.18
838 0.17
839 0.11
840 0.1
841 0.09
842 0.09
843 0.1
844 0.12
845 0.13
846 0.17
847 0.2
848 0.22
849 0.26
850 0.3
851 0.32
852 0.33
853 0.37
854 0.37
855 0.36
856 0.34
857 0.33
858 0.3
859 0.29
860 0.27
861 0.24
862 0.23
863 0.25
864 0.23
865 0.25
866 0.24
867 0.23
868 0.23
869 0.23
870 0.26
871 0.25
872 0.28
873 0.26
874 0.26
875 0.25
876 0.26
877 0.24
878 0.2
879 0.2
880 0.19
881 0.19
882 0.24
883 0.26
884 0.26
885 0.28
886 0.28
887 0.28
888 0.28
889 0.29
890 0.29
891 0.28
892 0.29
893 0.25
894 0.25
895 0.23
896 0.22
897 0.19
898 0.14
899 0.15
900 0.15
901 0.14
902 0.14
903 0.16
904 0.17
905 0.15
906 0.2
907 0.21
908 0.18
909 0.18
910 0.19
911 0.17
912 0.16
913 0.16
914 0.11
915 0.09
916 0.09
917 0.11
918 0.1
919 0.1
920 0.11
921 0.11
922 0.11
923 0.11
924 0.11
925 0.09
926 0.08
927 0.06
928 0.06
929 0.07
930 0.06
931 0.06
932 0.07
933 0.07
934 0.07
935 0.07
936 0.07
937 0.06
938 0.07
939 0.07
940 0.1
941 0.1
942 0.1
943 0.15
944 0.16
945 0.17
946 0.17
947 0.22
948 0.21
949 0.23
950 0.25
951 0.23
952 0.27
953 0.27
954 0.3
955 0.28
956 0.3
957 0.31
958 0.32
959 0.34
960 0.34
961 0.36
962 0.34
963 0.32
964 0.34
965 0.31
966 0.29
967 0.29
968 0.26
969 0.25
970 0.28
971 0.28
972 0.21
973 0.22
974 0.21
975 0.18
976 0.2
977 0.21
978 0.21
979 0.24
980 0.28
981 0.33
982 0.35
983 0.34
984 0.32
985 0.33
986 0.3
987 0.28
988 0.27
989 0.22
990 0.2
991 0.2
992 0.21
993 0.18
994 0.16
995 0.15
996 0.12
997 0.14
998 0.15
999 0.2
1000 0.2
1001 0.2
1002 0.2
1003 0.21
1004 0.21
1005 0.19
1006 0.22
1007 0.2
1008 0.24
1009 0.32
1010 0.32
1011 0.37
1012 0.46
1013 0.49
1014 0.51
1015 0.58
1016 0.54
1017 0.51
1018 0.55
1019 0.55
1020 0.53
1021 0.6
1022 0.61
1023 0.57
1024 0.63
1025 0.61
1026 0.61
1027 0.6
1028 0.53
1029 0.46
1030 0.42
1031 0.38
1032 0.39
1033 0.38
1034 0.36
1035 0.4
1036 0.43
1037 0.44
1038 0.43
1039 0.43
1040 0.47
1041 0.52
1042 0.51
1043 0.45
1044 0.42
1045 0.38
1046 0.4
1047 0.4
1048 0.38
1049 0.34
1050 0.33
1051 0.35
1052 0.36
1053 0.36
1054 0.37
1055 0.43
1056 0.42
1057 0.45
1058 0.53
1059 0.51
1060 0.53
1061 0.52
1062 0.47