FuNGI

A0A5M3MDD0

Protein Details

Accession

A0A5M3MDD0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
970-990	LPIVQPYRKDKKKQIITSLQT	Hydrophilic
1140-1166	SEDGTAIKTTRRRRKPRAAKADADSAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
932-940	KARKGKGAK
1150-1159	RRRRKPRAAK

Subcellular Location(s)

cyto 17, nucl 5, pero 2, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	cput:CONPUDRAFT_110485 -
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MDSPTQDQLSVMDACLHNLYDVPRAKQVFEDLRQSKGGEPLLEPRIYNSFLEAYLELAGRDPDERHQWLEEAWSLFGVMQSREESVQPTASTYATMLLAWVRYSSDPETAPKNAVNPSQLLSHIVDEEIPITSVVADRAITSSDEAASIITLLSKAAVELSLPRIVGELGQAHSAGMHEIEEDAVPQATPVRKRKATTVDGQTFDEEVPFNLDNLRKHLTQVALARRVLPEDVASRQKLLEDSAIDVAIARLQHEAKLLDDLEIGNPRLNKPKLRQWMWEWHTRLTARLTAEVREVVDAERQAGATPAPSNRKPATQIGPFLSLIKPEKLSLLVILEVMRLSGSGGVLDGMKTARALLTVGRAVENEYKAEMCKKNNIAVPQHTRFSGDVNFFSGNGYKALQAGRLAAAKYLEENEEWTSDWTQQLRVRIGGILVDCLMDVATIERQAVDKRTGEKISEQQPAFYHAYEYVRGQKLGVIRINPFVAEHLAKDGMQGTLHPRHLPMLVQPKPWVNAEQGGYIYSKSSAMRYKDSIEQQKYLQHASALGNCELVYAGLDVLGSTPWKVNEKVFDIVLQVWNSGERLGKMPPAVFDVPEPERPANVETDVKAKTVYGQRMRAWTNDKANAHSDRCSVNYKIEVARAFLGDTMYLPHNLDFRGRAYPIPPHLNHLGDDLSRGLLRFAKGKPLGVRGLRWLKIHIANLYGFDKANFDEREEFAMKYLEEIYDSAENPLTGKRWWMKADDPWQCLGACIELKAALDAPEPTAYVSHLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDQQGAAQVNLAVTDRPSDVYTHVAKMVERRLAEDCVKGEKHAELLLGKITRKVVKQTVMTTVYGVTFVGARDQIERQLSDRKDIPEEACWAAAAYLAHITLNCIGDLFSGAKAIQNWLNLCARLISKSIPAERVASALEAPKARKGKGAKALAEGGNGGANNRIKNEQMTSVVWTTPLGLPIVQPYRKDKKKQIITSLQTVFISDPNTPAEVNTMKQASAFPPNFIHSLDATHMMLTALECRKQDITFASVHDSYWTHAASIDDMSAIIRSTFVDLHSSDILGRLRSEFEERYATHKIPVASLSSKSLIKSLQQSGVTIDPASEMARAVENTGLASLFASEGDNTVETVSEDGTAIKTTRRRRKPRAAKADADSAEAEAGAEGDAVAVSPEMSTKFVDMTAMLPPLPKKGDFDVETIKGSLYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.2
3	0.19
4	0.15
5	0.17
6	0.19
7	0.21
8	0.26
9	0.28
10	0.34
11	0.35
12	0.35
13	0.36
14	0.42
15	0.42
16	0.42
17	0.49
18	0.44
19	0.46
20	0.48
21	0.47
22	0.41
23	0.39
24	0.37
25	0.29
26	0.29
27	0.33
28	0.37
29	0.37
30	0.34
31	0.31
32	0.32
33	0.32
34	0.3
35	0.25
36	0.21
37	0.19
38	0.22
39	0.19
40	0.16
41	0.16
42	0.16
43	0.13
44	0.12
45	0.13
46	0.11
47	0.13
48	0.13
49	0.17
50	0.24
51	0.27
52	0.29
53	0.3
54	0.3
55	0.29
56	0.32
57	0.31
58	0.25
59	0.23
60	0.2
61	0.18
62	0.17
63	0.18
64	0.16
65	0.12
66	0.13
67	0.14
68	0.16
69	0.17
70	0.18
71	0.19
72	0.19
73	0.21
74	0.19
75	0.19
76	0.19
77	0.18
78	0.18
79	0.15
80	0.14
81	0.12
82	0.11
83	0.1
84	0.1
85	0.1
86	0.1
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.15
91	0.17
92	0.19
93	0.2
94	0.23
95	0.28
96	0.28
97	0.31
98	0.28
99	0.3
100	0.31
101	0.32
102	0.31
103	0.28
104	0.28
105	0.27
106	0.26
107	0.26
108	0.22
109	0.2
110	0.18
111	0.17
112	0.15
113	0.13
114	0.13
115	0.1
116	0.09
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.07
124	0.07
125	0.08
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.11
130	0.1
131	0.11
132	0.1
133	0.09
134	0.08
135	0.07
136	0.06
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.08
147	0.12
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.13
152	0.14
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.11
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.1
163	0.07
164	0.06
165	0.05
166	0.06
167	0.07
168	0.06
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.06
173	0.06
174	0.11
175	0.16
176	0.24
177	0.32
178	0.4
179	0.45
180	0.47
181	0.55
182	0.6
183	0.61
184	0.62
185	0.64
186	0.62
187	0.59
188	0.59
189	0.52
190	0.44
191	0.37
192	0.29
193	0.19
194	0.13
195	0.15
196	0.14
197	0.13
198	0.16
199	0.19
200	0.2
201	0.25
202	0.29
203	0.24
204	0.26
205	0.3
206	0.27
207	0.29
208	0.35
209	0.38
210	0.39
211	0.39
212	0.39
213	0.36
214	0.36
215	0.31
216	0.24
217	0.18
218	0.16
219	0.21
220	0.25
221	0.25
222	0.24
223	0.24
224	0.25
225	0.23
226	0.22
227	0.19
228	0.14
229	0.16
230	0.16
231	0.16
232	0.14
233	0.13
234	0.11
235	0.1
236	0.09
237	0.07
238	0.09
239	0.09
240	0.11
241	0.13
242	0.14
243	0.13
244	0.16
245	0.16
246	0.13
247	0.14
248	0.13
249	0.13
250	0.16
251	0.16
252	0.15
253	0.17
254	0.19
255	0.27
256	0.31
257	0.35
258	0.38
259	0.48
260	0.55
261	0.59
262	0.63
263	0.6
264	0.67
265	0.64
266	0.67
267	0.6
268	0.52
269	0.53
270	0.47
271	0.44
272	0.36
273	0.35
274	0.28
275	0.31
276	0.29
277	0.25
278	0.26
279	0.25
280	0.22
281	0.18
282	0.17
283	0.12
284	0.14
285	0.13
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.1
292	0.08
293	0.11
294	0.15
295	0.21
296	0.23
297	0.29
298	0.3
299	0.33
300	0.36
301	0.39
302	0.41
303	0.39
304	0.42
305	0.38
306	0.4
307	0.37
308	0.35
309	0.29
310	0.26
311	0.24
312	0.22
313	0.2
314	0.17
315	0.18
316	0.17
317	0.17
318	0.14
319	0.12
320	0.1
321	0.1
322	0.09
323	0.09
324	0.07
325	0.07
326	0.06
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.09
346	0.1
347	0.11
348	0.11
349	0.11
350	0.14
351	0.17
352	0.17
353	0.15
354	0.14
355	0.14
356	0.15
357	0.22
358	0.24
359	0.22
360	0.29
361	0.31
362	0.35
363	0.38
364	0.42
365	0.4
366	0.44
367	0.51
368	0.47
369	0.46
370	0.41
371	0.4
372	0.35
373	0.32
374	0.28
375	0.22
376	0.19
377	0.2
378	0.2
379	0.18
380	0.19
381	0.17
382	0.13
383	0.11
384	0.12
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.11
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.13
393	0.12
394	0.12
395	0.12
396	0.1
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.09
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.12
407	0.12
408	0.15
409	0.14
410	0.17
411	0.19
412	0.23
413	0.22
414	0.22
415	0.21
416	0.19
417	0.18
418	0.15
419	0.13
420	0.09
421	0.08
422	0.07
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.03
427	0.03
428	0.04
429	0.04
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.08
435	0.11
436	0.13
437	0.15
438	0.18
439	0.23
440	0.24
441	0.24
442	0.26
443	0.29
444	0.33
445	0.38
446	0.35
447	0.32
448	0.31
449	0.36
450	0.34
451	0.28
452	0.22
453	0.16
454	0.18
455	0.17
456	0.18
457	0.2
458	0.2
459	0.2
460	0.19
461	0.19
462	0.2
463	0.24
464	0.25
465	0.2
466	0.19
467	0.21
468	0.21
469	0.19
470	0.17
471	0.12
472	0.12
473	0.11
474	0.09
475	0.09
476	0.1
477	0.09
478	0.1
479	0.1
480	0.08
481	0.07
482	0.08
483	0.11
484	0.16
485	0.17
486	0.17
487	0.17
488	0.18
489	0.18
490	0.18
491	0.19
492	0.24
493	0.26
494	0.27
495	0.28
496	0.29
497	0.3
498	0.3
499	0.26
500	0.17
501	0.18
502	0.18
503	0.17
504	0.16
505	0.15
506	0.14
507	0.13
508	0.12
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.11
513	0.15
514	0.17
515	0.2
516	0.22
517	0.24
518	0.28
519	0.35
520	0.4
521	0.38
522	0.37
523	0.36
524	0.37
525	0.36
526	0.32
527	0.25
528	0.17
529	0.16
530	0.15
531	0.17
532	0.16
533	0.15
534	0.14
535	0.13
536	0.13
537	0.11
538	0.09
539	0.06
540	0.04
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.04
547	0.03
548	0.04
549	0.05
550	0.06
551	0.09
552	0.1
553	0.11
554	0.14
555	0.17
556	0.18
557	0.17
558	0.16
559	0.15
560	0.15
561	0.16
562	0.13
563	0.1
564	0.08
565	0.09
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.06
570	0.08
571	0.08
572	0.1
573	0.1
574	0.1
575	0.1
576	0.14
577	0.13
578	0.12
579	0.12
580	0.14
581	0.16
582	0.17
583	0.19
584	0.15
585	0.14
586	0.15
587	0.16
588	0.13
589	0.13
590	0.12
591	0.1
592	0.14
593	0.14
594	0.14
595	0.13
596	0.11
597	0.14
598	0.18
599	0.24
600	0.25
601	0.28
602	0.3
603	0.34
604	0.36
605	0.35
606	0.35
607	0.33
608	0.33
609	0.35
610	0.34
611	0.31
612	0.34
613	0.35
614	0.32
615	0.28
616	0.25
617	0.21
618	0.22
619	0.24
620	0.21
621	0.19
622	0.18
623	0.19
624	0.18
625	0.2
626	0.18
627	0.15
628	0.15
629	0.13
630	0.12
631	0.1
632	0.09
633	0.07
634	0.06
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.08
640	0.09
641	0.09
642	0.1
643	0.09
644	0.1
645	0.12
646	0.13
647	0.13
648	0.13
649	0.17
650	0.21
651	0.26
652	0.25
653	0.26
654	0.28
655	0.28
656	0.27
657	0.24
658	0.21
659	0.14
660	0.15
661	0.11
662	0.09
663	0.08
664	0.08
665	0.07
666	0.08
667	0.09
668	0.13
669	0.13
670	0.2
671	0.21
672	0.24
673	0.25
674	0.27
675	0.31
676	0.28
677	0.28
678	0.28
679	0.33
680	0.33
681	0.31
682	0.29
683	0.28
684	0.3
685	0.31
686	0.25
687	0.21
688	0.18
689	0.2
690	0.19
691	0.16
692	0.13
693	0.11
694	0.11
695	0.09
696	0.15
697	0.13
698	0.14
699	0.16
700	0.16
701	0.21
702	0.22
703	0.21
704	0.16
705	0.17
706	0.15
707	0.13
708	0.13
709	0.08
710	0.07
711	0.08
712	0.09
713	0.09
714	0.1
715	0.1
716	0.09
717	0.09
718	0.09
719	0.1
720	0.1
721	0.08
722	0.13
723	0.16
724	0.19
725	0.21
726	0.24
727	0.26
728	0.32
729	0.41
730	0.44
731	0.42
732	0.39
733	0.38
734	0.35
735	0.32
736	0.25
737	0.18
738	0.11
739	0.09
740	0.08
741	0.08
742	0.08
743	0.08
744	0.08
745	0.06
746	0.07
747	0.07
748	0.08
749	0.08
750	0.08
751	0.08
752	0.07
753	0.07
754	0.08
755	0.09
756	0.09
757	0.1
758	0.12
759	0.13
760	0.14
761	0.14
762	0.15
763	0.14
764	0.17
765	0.17
766	0.15
767	0.15
768	0.14
769	0.13
770	0.12
771	0.12
772	0.08
773	0.06
774	0.06
775	0.06
776	0.06
777	0.06
778	0.06
779	0.05
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.05
785	0.05
786	0.06
787	0.06
788	0.05
789	0.05
790	0.07
791	0.07
792	0.08
793	0.08
794	0.09
795	0.1
796	0.15
797	0.16
798	0.16
799	0.17
800	0.17
801	0.17
802	0.2
803	0.23
804	0.22
805	0.21
806	0.22
807	0.23
808	0.26
809	0.27
810	0.25
811	0.22
812	0.24
813	0.24
814	0.22
815	0.21
816	0.18
817	0.18
818	0.16
819	0.16
820	0.1
821	0.11
822	0.14
823	0.15
824	0.15
825	0.16
826	0.18
827	0.21
828	0.22
829	0.27
830	0.28
831	0.31
832	0.35
833	0.35
834	0.38
835	0.37
836	0.36
837	0.31
838	0.26
839	0.21
840	0.17
841	0.15
842	0.08
843	0.06
844	0.06
845	0.07
846	0.07
847	0.08
848	0.1
849	0.11
850	0.14
851	0.16
852	0.16
853	0.17
854	0.25
855	0.26
856	0.28
857	0.31
858	0.3
859	0.31
860	0.33
861	0.33
862	0.27
863	0.3
864	0.27
865	0.22
866	0.2
867	0.16
868	0.14
869	0.13
870	0.1
871	0.07
872	0.07
873	0.07
874	0.07
875	0.07
876	0.08
877	0.09
878	0.09
879	0.09
880	0.08
881	0.08
882	0.08
883	0.1
884	0.1
885	0.07
886	0.07
887	0.07
888	0.09
889	0.1
890	0.12
891	0.13
892	0.15
893	0.16
894	0.18
895	0.21
896	0.19
897	0.19
898	0.19
899	0.17
900	0.16
901	0.17
902	0.15
903	0.17
904	0.22
905	0.24
906	0.24
907	0.25
908	0.25
909	0.24
910	0.23
911	0.19
912	0.15
913	0.14
914	0.14
915	0.16
916	0.16
917	0.17
918	0.23
919	0.26
920	0.26
921	0.31
922	0.33
923	0.39
924	0.45
925	0.52
926	0.47
927	0.47
928	0.52
929	0.46
930	0.42
931	0.34
932	0.24
933	0.18
934	0.16
935	0.12
936	0.13
937	0.14
938	0.15
939	0.17
940	0.18
941	0.18
942	0.21
943	0.23
944	0.21
945	0.22
946	0.22
947	0.24
948	0.23
949	0.22
950	0.2
951	0.17
952	0.17
953	0.15
954	0.14
955	0.11
956	0.1
957	0.1
958	0.16
959	0.24
960	0.24
961	0.26
962	0.33
963	0.44
964	0.52
965	0.6
966	0.63
967	0.66
968	0.74
969	0.8
970	0.81
971	0.81
972	0.78
973	0.78
974	0.7
975	0.62
976	0.51
977	0.44
978	0.34
979	0.26
980	0.23
981	0.15
982	0.14
983	0.14
984	0.15
985	0.14
986	0.13
987	0.16
988	0.16
989	0.16
990	0.2
991	0.19
992	0.18
993	0.18
994	0.2
995	0.18
996	0.26
997	0.26
998	0.24
999	0.25
1000	0.28
1001	0.28
1002	0.27
1003	0.26
1004	0.17
1005	0.18
1006	0.18
1007	0.18
1008	0.16
1009	0.15
1010	0.14
1011	0.12
1012	0.12
1013	0.1
1014	0.15
1015	0.15
1016	0.18
1017	0.18
1018	0.21
1019	0.23
1020	0.23
1021	0.26
1022	0.22
1023	0.22
1024	0.21
1025	0.22
1026	0.25
1027	0.23
1028	0.23
1029	0.23
1030	0.2
1031	0.19
1032	0.2
1033	0.18
1034	0.13
1035	0.14
1036	0.15
1037	0.14
1038	0.14
1039	0.13
1040	0.09
1041	0.09
1042	0.09
1043	0.08
1044	0.08
1045	0.06
1046	0.06
1047	0.06
1048	0.08
1049	0.09
1050	0.09
1051	0.13
1052	0.13
1053	0.17
1054	0.17
1055	0.17
1056	0.15
1057	0.18
1058	0.19
1059	0.17
1060	0.18
1061	0.15
1062	0.17
1063	0.19
1064	0.24
1065	0.21
1066	0.22
1067	0.28
1068	0.28
1069	0.32
1070	0.36
1071	0.34
1072	0.32
1073	0.35
1074	0.32
1075	0.28
1076	0.29
1077	0.28
1078	0.25
1079	0.26
1080	0.27
1081	0.26
1082	0.27
1083	0.26
1084	0.26
1085	0.23
1086	0.25
1087	0.3
1088	0.32
1089	0.35
1090	0.34
1091	0.34
1092	0.35
1093	0.35
1094	0.31
1095	0.24
1096	0.19
1097	0.13
1098	0.13
1099	0.13
1100	0.11
1101	0.09
1102	0.09
1103	0.11
1104	0.11
1105	0.12
1106	0.12
1107	0.12
1108	0.12
1109	0.12
1110	0.11
1111	0.08
1112	0.08
1113	0.07
1114	0.06
1115	0.06
1116	0.07
1117	0.06
1118	0.07
1119	0.09
1120	0.09
1121	0.09
1122	0.09
1123	0.09
1124	0.08
1125	0.09
1126	0.09
1127	0.07
1128	0.07
1129	0.08
1130	0.09
1131	0.1
1132	0.11
1133	0.16
1134	0.24
1135	0.34
1136	0.44
1137	0.55
1138	0.65
1139	0.74
1140	0.84
1141	0.9
1142	0.94
1143	0.94
1144	0.92
1145	0.89
1146	0.84
1147	0.83
1148	0.72
1149	0.64
1150	0.53
1151	0.42
1152	0.33
1153	0.25
1154	0.19
1155	0.09
1156	0.09
1157	0.06
1158	0.05
1159	0.04
1160	0.04
1161	0.04
1162	0.04
1163	0.04
1164	0.04
1165	0.04
1166	0.04
1167	0.06
1168	0.07
1169	0.09
1170	0.1
1171	0.1
1172	0.11
1173	0.11
1174	0.12
1175	0.11
1176	0.11
1177	0.14
1178	0.15
1179	0.14
1180	0.16
1181	0.17
1182	0.22
1183	0.26
1184	0.25
1185	0.26
1186	0.3
1187	0.38
1188	0.37
1189	0.41
1190	0.43
1191	0.42
1192	0.43
1193	0.4
1194	0.35
1195	0.27

A0A5M3MDD0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer