Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M3MSX2

Protein Details
Accession A0A5M3MSX2    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-81RSPARSPPPYRRRSPPPKRPSHAPAPTHydrophilic
238-279GRDSRDWRDRRSPPPRSGRYSPDYRRRRSYSRSPPRGSSPRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-75RDAPRGRSRSRSPARSNGFRSPARSNGFRSPARSPPPYRRRSPPPKRPS
238-276GRDSRDWRDRRSPPPRSGRYSPDYRRRRSYSRSPPRGSS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cput:CONPUDRAFT_81729  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12363  RRM_TRA2  
Amino Acid Sequences YGEPGAAPVDPYSDAYNAPAPAAGEGRDAPRGRSRSRSPARSNGFRSPARSNGFRSPARSPPPYRRRSPPPKRPSHAPAPTPTQVLGVFGLSIRTQERDLDDEFSRFGRVEKVTIVYDQRSDRSRGFGFIKMSAVEEATRCIQELNGVELNGRRIRVDYSVTDRPHAPTPGEYMGHRRSGRDTFPAREGREGRDSYRDSHRDSYRDSYRDRDSHRDRDRERDRDFRRSDRDKDRDPYGRDSRDWRDRRSPPPRSGRYSPDYRRRRSYSRSPPRGSSPRREYDGNAPSAPDAMRVDSTNGPSAGRDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.2
4 0.18
5 0.17
6 0.16
7 0.14
8 0.15
9 0.16
10 0.14
11 0.12
12 0.14
13 0.16
14 0.23
15 0.23
16 0.25
17 0.32
18 0.38
19 0.4
20 0.47
21 0.51
22 0.55
23 0.64
24 0.71
25 0.7
26 0.74
27 0.78
28 0.79
29 0.78
30 0.76
31 0.73
32 0.66
33 0.64
34 0.6
35 0.59
36 0.55
37 0.53
38 0.5
39 0.51
40 0.55
41 0.53
42 0.52
43 0.5
44 0.53
45 0.55
46 0.58
47 0.56
48 0.59
49 0.67
50 0.7
51 0.71
52 0.71
53 0.75
54 0.79
55 0.84
56 0.84
57 0.84
58 0.87
59 0.86
60 0.86
61 0.82
62 0.82
63 0.79
64 0.72
65 0.67
66 0.64
67 0.59
68 0.52
69 0.45
70 0.36
71 0.27
72 0.23
73 0.19
74 0.11
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.11
84 0.13
85 0.15
86 0.16
87 0.19
88 0.19
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.16
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.16
101 0.18
102 0.19
103 0.16
104 0.18
105 0.19
106 0.2
107 0.21
108 0.23
109 0.22
110 0.25
111 0.24
112 0.25
113 0.26
114 0.26
115 0.25
116 0.23
117 0.23
118 0.19
119 0.19
120 0.15
121 0.13
122 0.1
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.09
131 0.1
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.16
138 0.15
139 0.14
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.18
147 0.25
148 0.25
149 0.26
150 0.26
151 0.26
152 0.27
153 0.26
154 0.2
155 0.15
156 0.18
157 0.19
158 0.19
159 0.17
160 0.2
161 0.22
162 0.28
163 0.27
164 0.25
165 0.26
166 0.29
167 0.3
168 0.32
169 0.33
170 0.29
171 0.36
172 0.4
173 0.37
174 0.4
175 0.4
176 0.36
177 0.39
178 0.38
179 0.33
180 0.35
181 0.35
182 0.33
183 0.4
184 0.39
185 0.37
186 0.43
187 0.45
188 0.41
189 0.44
190 0.48
191 0.46
192 0.47
193 0.44
194 0.42
195 0.45
196 0.48
197 0.5
198 0.52
199 0.52
200 0.59
201 0.65
202 0.69
203 0.65
204 0.69
205 0.74
206 0.72
207 0.71
208 0.71
209 0.68
210 0.69
211 0.72
212 0.69
213 0.7
214 0.69
215 0.72
216 0.72
217 0.74
218 0.71
219 0.71
220 0.71
221 0.69
222 0.66
223 0.66
224 0.64
225 0.61
226 0.56
227 0.58
228 0.59
229 0.61
230 0.62
231 0.6
232 0.62
233 0.65
234 0.73
235 0.77
236 0.77
237 0.76
238 0.81
239 0.82
240 0.8
241 0.78
242 0.76
243 0.72
244 0.74
245 0.74
246 0.74
247 0.75
248 0.74
249 0.78
250 0.78
251 0.78
252 0.77
253 0.78
254 0.79
255 0.81
256 0.84
257 0.8
258 0.78
259 0.8
260 0.82
261 0.78
262 0.77
263 0.75
264 0.73
265 0.72
266 0.69
267 0.63
268 0.63
269 0.63
270 0.57
271 0.48
272 0.41
273 0.37
274 0.36
275 0.32
276 0.25
277 0.19
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.22
282 0.24
283 0.27
284 0.29
285 0.28
286 0.25