Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2W5M7

Protein Details
Accession B2W5M7    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
352-377NYNRGRGRKTNGHRDRDNRRRDRSGSBasic
379-407DENDWNKRRDRFKSGKNDRGSRKEEKKEIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-87RRNDRDDRNGRPGRGGRGGRGGRGAH
355-376RGRGRKTNGHRDRDNRRRDRSG
383-406WNKRRDRFKSGKNDRGSRKEEKKE
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
CDD cd08029  LA_like_fungal  
cd12291  RRM1_La  
Amino Acid Sequences MADTAVTGAAAANPAEVKTESSAQVETGAKTESSESNSKTTKTEEGEEKWALNGNSEEKNGRRNDRDDRNGRPGRGGRGGRGGRGAHNNNNNNYRKKPHNREFEKLPESDDPEEIRSQVEFYFSRANLASDHHMFMETEGPKNKPVSIHHVCTFSRMRRFKPYSAVVAALRDSKDLVVVDDGEYSKPGSEAVKRREAITVPVEDGDDEKNPSTEELFYRLKNASSNNMATSVYAKGFGSEEESGQIALEKFFRPYGAVQVRMRREDNGTWKGSVFVEFDSEDSQKQFLALDPKPKFNDNELTAMGKQEYIEMKCAEKGIKPDHLMTEQEKYEARKKQREANGGSRPHNNNNNYNRGRGRKTNGHRDRDNRRRDRSGSVDENDWNKRRDRFKSGKNDRGSRKEEKKEIERDGHGVPIIKDVSDATSNKRKAETDDNEASPKKNKLEIKEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.11
3 0.11
4 0.13
5 0.15
6 0.19
7 0.2
8 0.21
9 0.22
10 0.19
11 0.24
12 0.24
13 0.21
14 0.19
15 0.19
16 0.17
17 0.17
18 0.2
19 0.18
20 0.21
21 0.27
22 0.28
23 0.33
24 0.37
25 0.37
26 0.36
27 0.37
28 0.38
29 0.36
30 0.4
31 0.4
32 0.42
33 0.47
34 0.46
35 0.43
36 0.37
37 0.38
38 0.31
39 0.27
40 0.25
41 0.23
42 0.25
43 0.27
44 0.31
45 0.28
46 0.36
47 0.4
48 0.45
49 0.47
50 0.5
51 0.57
52 0.63
53 0.71
54 0.7
55 0.72
56 0.75
57 0.75
58 0.69
59 0.68
60 0.62
61 0.58
62 0.6
63 0.55
64 0.47
65 0.51
66 0.51
67 0.45
68 0.45
69 0.4
70 0.36
71 0.44
72 0.46
73 0.44
74 0.52
75 0.56
76 0.57
77 0.65
78 0.67
79 0.64
80 0.64
81 0.62
82 0.63
83 0.68
84 0.73
85 0.73
86 0.77
87 0.78
88 0.79
89 0.8
90 0.79
91 0.73
92 0.62
93 0.56
94 0.49
95 0.47
96 0.42
97 0.36
98 0.29
99 0.26
100 0.26
101 0.23
102 0.19
103 0.15
104 0.14
105 0.12
106 0.14
107 0.12
108 0.14
109 0.2
110 0.19
111 0.22
112 0.21
113 0.21
114 0.18
115 0.21
116 0.23
117 0.18
118 0.19
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.2
124 0.17
125 0.19
126 0.21
127 0.22
128 0.25
129 0.26
130 0.26
131 0.23
132 0.25
133 0.3
134 0.33
135 0.37
136 0.37
137 0.41
138 0.39
139 0.41
140 0.44
141 0.4
142 0.44
143 0.43
144 0.44
145 0.5
146 0.56
147 0.54
148 0.55
149 0.53
150 0.48
151 0.45
152 0.44
153 0.33
154 0.29
155 0.27
156 0.22
157 0.18
158 0.14
159 0.13
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.14
177 0.22
178 0.27
179 0.34
180 0.34
181 0.35
182 0.37
183 0.36
184 0.33
185 0.28
186 0.24
187 0.17
188 0.17
189 0.16
190 0.13
191 0.14
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.13
203 0.15
204 0.15
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.17
211 0.18
212 0.19
213 0.17
214 0.17
215 0.16
216 0.14
217 0.15
218 0.12
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.18
243 0.2
244 0.25
245 0.27
246 0.33
247 0.36
248 0.39
249 0.39
250 0.32
251 0.32
252 0.32
253 0.37
254 0.36
255 0.35
256 0.32
257 0.31
258 0.31
259 0.27
260 0.24
261 0.17
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.16
276 0.18
277 0.27
278 0.29
279 0.34
280 0.36
281 0.38
282 0.38
283 0.34
284 0.4
285 0.32
286 0.34
287 0.3
288 0.31
289 0.29
290 0.28
291 0.23
292 0.16
293 0.13
294 0.13
295 0.16
296 0.14
297 0.17
298 0.18
299 0.18
300 0.19
301 0.21
302 0.19
303 0.18
304 0.22
305 0.23
306 0.28
307 0.29
308 0.31
309 0.32
310 0.33
311 0.33
312 0.3
313 0.31
314 0.25
315 0.25
316 0.25
317 0.27
318 0.32
319 0.38
320 0.44
321 0.48
322 0.51
323 0.59
324 0.65
325 0.69
326 0.69
327 0.71
328 0.71
329 0.69
330 0.69
331 0.68
332 0.65
333 0.64
334 0.65
335 0.6
336 0.61
337 0.61
338 0.68
339 0.62
340 0.63
341 0.62
342 0.61
343 0.62
344 0.6
345 0.62
346 0.61
347 0.69
348 0.73
349 0.76
350 0.77
351 0.79
352 0.81
353 0.84
354 0.83
355 0.85
356 0.83
357 0.82
358 0.82
359 0.77
360 0.76
361 0.73
362 0.72
363 0.68
364 0.61
365 0.57
366 0.53
367 0.56
368 0.56
369 0.53
370 0.47
371 0.45
372 0.5
373 0.54
374 0.57
375 0.61
376 0.63
377 0.68
378 0.77
379 0.82
380 0.83
381 0.84
382 0.86
383 0.85
384 0.84
385 0.81
386 0.81
387 0.8
388 0.8
389 0.79
390 0.79
391 0.79
392 0.78
393 0.79
394 0.76
395 0.68
396 0.62
397 0.56
398 0.5
399 0.42
400 0.37
401 0.29
402 0.28
403 0.25
404 0.21
405 0.2
406 0.18
407 0.2
408 0.22
409 0.23
410 0.25
411 0.35
412 0.38
413 0.4
414 0.43
415 0.42
416 0.42
417 0.51
418 0.5
419 0.49
420 0.54
421 0.54
422 0.58
423 0.58
424 0.55
425 0.51
426 0.51
427 0.46
428 0.47
429 0.5
430 0.51