FuNGI

B2VRT0

Protein Details

Accession

B2VRT0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-50	SPSLIRSPGKRARRQIPSRTPSGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1202-1224	RPTAARGGRGRGKPGLGRPMIPK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034397 Prp24_RRM1 IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR031766 RRM_occluded IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF16842 RRM_occluded
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12296 RRM1_Prp24 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MDINSLLSPSDSPAGTPTPQPAPSAPSPSLIRSPGKRARRQIPSRTPSGLSQQVMSSSSPQPHSAIQQRVPSPGYAQIANGARTMHTTINTAQQAASPRDARMTPPNATYRQASTPGMDTLADLASMQQQQAARQSSVVHQRPVTLQHLGQNLSGESVASIMTEASPRPRNFVTRSLDQQHIDWLNQLDQTLLENPFDYYSHVSLVTTLHQGLQTHLASFDADPNSYELVQPLRDAYKTMSDKYPLGELLWHYRLNDEKTLARNVEERMGVLELHKQATQDEPYSAKLWAAYGEYVSYLVACSWEQIPPEEWPEEERLIGRELFQPQLLLDVLQQGAERVKYNLQESNLVWDRYLQVLEEDLERGGFSQEKAMRVAAIYNERLGQPHATWANTLSRYASFNSRYSKGPSDQVMEEAVQKNTHIKQQYANREEYEFKVLQAFQAGDQAAEYNAVTRYLKWEKRTMGVYSFHLVNALYERATLRFPVDASIWEDHVEFLIWQDNRSVDLLNVLERATRHCPWSGSLWSHRILTLEAENKPFEDLELVKHTATGSGLLEHTDLDELIKVQLAWCGYLRRRAFDDPRATEDDVDVAEVGIRSALEFVREVGMKKHGREWTDPKYRLERTHMKFWLQRGDIDQARRIQESVVQYQEDSYDFWYRCYIFEMLLWAPNSTRTKQNAGQELRPPTQATAVLERAMKRLQTIDEPELLIDMYVSHCEQHESALKVRSAAIERRRAERIVSVRREKERASAAASAPPQDTPESQVAEGSSKRKREDGDDEMTLKKSKHVDSESTSAVANGQERITSEAPSEARSTEPKRDREHTSIIVKKLPAGTTQTRIRQFFTDAGTVKNLTLKEEKDSLTAIVEFESPEEAKYALTKEAKGFEGHPISIELGQSTTVYVTNYPAHADEAWLRKLYSPFGEIVGIRFPSLKFDAHRRFCYVQFASNSEAIAATQLDGTDVEGMKLISKISDPNAKKKRDGATAEGREVYIWHLNFKTKEREVKEVFAKFGRIERTKLPIIKSTGNNRGFCYVVYEAKESADAAVAEMHGKELWGLKLMVEIATDRPATKPKIQSTLENPEISAPREATPGESDPVTDANIKPASFLDRSIAILNLPDTVPDARIKPLVEQYDFKRIKLEPQHGGAIIEFTTVEGAGKAQFALSGKDFEGRKLRIGTVHDLNKQKGEWKPSNSFMQPRINRPTAARGGRGRGKPGLGRPMIPKGAVKTNGEVKSNADFRAQFLKAPAKDSAKEDDKMEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.22
4	0.25
5	0.28
6	0.29
7	0.31
8	0.3
9	0.33
10	0.36
11	0.41
12	0.37
13	0.37
14	0.38
15	0.39
16	0.43
17	0.41
18	0.43
19	0.41
20	0.5
21	0.54
22	0.62
23	0.67
24	0.71
25	0.76
26	0.8
27	0.85
28	0.86
29	0.88
30	0.84
31	0.81
32	0.76
33	0.69
34	0.62
35	0.6
36	0.56
37	0.46
38	0.41
39	0.36
40	0.33
41	0.32
42	0.3
43	0.27
44	0.24
45	0.28
46	0.29
47	0.3
48	0.3
49	0.31
50	0.38
51	0.42
52	0.45
53	0.45
54	0.51
55	0.51
56	0.53
57	0.52
58	0.45
59	0.39
60	0.36
61	0.34
62	0.26
63	0.25
64	0.27
65	0.29
66	0.29
67	0.28
68	0.22
69	0.2
70	0.22
71	0.24
72	0.2
73	0.18
74	0.2
75	0.2
76	0.28
77	0.29
78	0.27
79	0.24
80	0.25
81	0.3
82	0.3
83	0.35
84	0.28
85	0.27
86	0.31
87	0.32
88	0.33
89	0.36
90	0.38
91	0.35
92	0.4
93	0.46
94	0.44
95	0.47
96	0.45
97	0.41
98	0.4
99	0.41
100	0.36
101	0.31
102	0.31
103	0.29
104	0.27
105	0.22
106	0.18
107	0.15
108	0.14
109	0.11
110	0.08
111	0.08
112	0.12
113	0.13
114	0.12
115	0.14
116	0.15
117	0.17
118	0.24
119	0.28
120	0.24
121	0.24
122	0.26
123	0.3
124	0.39
125	0.42
126	0.4
127	0.36
128	0.38
129	0.4
130	0.44
131	0.41
132	0.34
133	0.3
134	0.32
135	0.35
136	0.34
137	0.32
138	0.29
139	0.25
140	0.22
141	0.2
142	0.14
143	0.09
144	0.08
145	0.07
146	0.05
147	0.05
148	0.04
149	0.05
150	0.07
151	0.08
152	0.15
153	0.24
154	0.24
155	0.29
156	0.32
157	0.38
158	0.41
159	0.49
160	0.48
161	0.47
162	0.54
163	0.54
164	0.57
165	0.52
166	0.48
167	0.47
168	0.42
169	0.35
170	0.31
171	0.27
172	0.24
173	0.24
174	0.23
175	0.15
176	0.13
177	0.15
178	0.16
179	0.15
180	0.14
181	0.13
182	0.14
183	0.15
184	0.15
185	0.15
186	0.15
187	0.14
188	0.15
189	0.15
190	0.14
191	0.14
192	0.15
193	0.15
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.15
198	0.15
199	0.16
200	0.21
201	0.19
202	0.17
203	0.17
204	0.16
205	0.15
206	0.15
207	0.19
208	0.14
209	0.14
210	0.14
211	0.16
212	0.17
213	0.16
214	0.16
215	0.12
216	0.13
217	0.14
218	0.13
219	0.14
220	0.15
221	0.15
222	0.16
223	0.17
224	0.24
225	0.26
226	0.29
227	0.31
228	0.31
229	0.32
230	0.32
231	0.32
232	0.23
233	0.21
234	0.2
235	0.19
236	0.23
237	0.26
238	0.25
239	0.23
240	0.25
241	0.3
242	0.31
243	0.32
244	0.28
245	0.28
246	0.31
247	0.36
248	0.34
249	0.31
250	0.31
251	0.29
252	0.3
253	0.26
254	0.22
255	0.19
256	0.19
257	0.17
258	0.15
259	0.18
260	0.16
261	0.17
262	0.18
263	0.16
264	0.17
265	0.21
266	0.23
267	0.19
268	0.19
269	0.19
270	0.21
271	0.22
272	0.22
273	0.18
274	0.15
275	0.13
276	0.12
277	0.12
278	0.1
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.07
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.05
289	0.07
290	0.08
291	0.1
292	0.1
293	0.12
294	0.14
295	0.15
296	0.19
297	0.18
298	0.17
299	0.18
300	0.21
301	0.2
302	0.18
303	0.17
304	0.15
305	0.17
306	0.17
307	0.16
308	0.17
309	0.19
310	0.19
311	0.19
312	0.17
313	0.15
314	0.16
315	0.15
316	0.1
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.1
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.14
328	0.16
329	0.19
330	0.22
331	0.22
332	0.25
333	0.24
334	0.31
335	0.32
336	0.3
337	0.27
338	0.24
339	0.24
340	0.22
341	0.22
342	0.13
343	0.09
344	0.1
345	0.11
346	0.1
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.14
356	0.17
357	0.18
358	0.19
359	0.19
360	0.18
361	0.17
362	0.18
363	0.15
364	0.17
365	0.16
366	0.15
367	0.16
368	0.16
369	0.17
370	0.17
371	0.16
372	0.11
373	0.17
374	0.18
375	0.17
376	0.17
377	0.19
378	0.23
379	0.22
380	0.22
381	0.17
382	0.17
383	0.18
384	0.2
385	0.23
386	0.21
387	0.25
388	0.29
389	0.3
390	0.31
391	0.34
392	0.37
393	0.34
394	0.35
395	0.33
396	0.32
397	0.3
398	0.29
399	0.25
400	0.21
401	0.23
402	0.21
403	0.19
404	0.15
405	0.15
406	0.19
407	0.19
408	0.24
409	0.22
410	0.21
411	0.27
412	0.36
413	0.46
414	0.46
415	0.47
416	0.42
417	0.42
418	0.43
419	0.38
420	0.36
421	0.26
422	0.21
423	0.22
424	0.2
425	0.18
426	0.18
427	0.16
428	0.1
429	0.13
430	0.13
431	0.1
432	0.1
433	0.1
434	0.08
435	0.08
436	0.08
437	0.06
438	0.06
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.15
443	0.23
444	0.27
445	0.29
446	0.35
447	0.35
448	0.39
449	0.42
450	0.38
451	0.33
452	0.32
453	0.3
454	0.27
455	0.25
456	0.21
457	0.18
458	0.16
459	0.12
460	0.11
461	0.1
462	0.07
463	0.07
464	0.08
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.1
473	0.1
474	0.13
475	0.14
476	0.13
477	0.13
478	0.13
479	0.11
480	0.11
481	0.09
482	0.06
483	0.06
484	0.11
485	0.1
486	0.1
487	0.12
488	0.12
489	0.12
490	0.13
491	0.13
492	0.07
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.08
498	0.09
499	0.09
500	0.13
501	0.16
502	0.17
503	0.18
504	0.19
505	0.2
506	0.2
507	0.25
508	0.25
509	0.24
510	0.26
511	0.27
512	0.27
513	0.27
514	0.25
515	0.21
516	0.18
517	0.16
518	0.16
519	0.17
520	0.18
521	0.19
522	0.19
523	0.18
524	0.18
525	0.16
526	0.12
527	0.1
528	0.09
529	0.1
530	0.14
531	0.15
532	0.14
533	0.14
534	0.14
535	0.13
536	0.12
537	0.1
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.06
544	0.06
545	0.05
546	0.05
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.05
552	0.04
553	0.04
554	0.06
555	0.06
556	0.07
557	0.07
558	0.12
559	0.13
560	0.21
561	0.21
562	0.22
563	0.26
564	0.3
565	0.34
566	0.38
567	0.44
568	0.39
569	0.43
570	0.44
571	0.41
572	0.35
573	0.31
574	0.23
575	0.15
576	0.13
577	0.09
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.03
583	0.03
584	0.03
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.05
590	0.07
591	0.08
592	0.08
593	0.09
594	0.17
595	0.18
596	0.19
597	0.25
598	0.26
599	0.28
600	0.34
601	0.39
602	0.41
603	0.49
604	0.51
605	0.48
606	0.51
607	0.52
608	0.49
609	0.49
610	0.49
611	0.44
612	0.5
613	0.49
614	0.46
615	0.46
616	0.45
617	0.46
618	0.36
619	0.33
620	0.27
621	0.3
622	0.29
623	0.28
624	0.28
625	0.24
626	0.25
627	0.24
628	0.22
629	0.17
630	0.18
631	0.2
632	0.19
633	0.17
634	0.16
635	0.15
636	0.15
637	0.16
638	0.12
639	0.1
640	0.09
641	0.13
642	0.13
643	0.14
644	0.15
645	0.15
646	0.15
647	0.17
648	0.16
649	0.1
650	0.11
651	0.13
652	0.12
653	0.14
654	0.14
655	0.11
656	0.11
657	0.16
658	0.18
659	0.17
660	0.22
661	0.22
662	0.27
663	0.32
664	0.37
665	0.4
666	0.41
667	0.43
668	0.43
669	0.46
670	0.42
671	0.39
672	0.34
673	0.26
674	0.24
675	0.21
676	0.17
677	0.16
678	0.15
679	0.15
680	0.17
681	0.17
682	0.17
683	0.17
684	0.15
685	0.12
686	0.13
687	0.13
688	0.14
689	0.18
690	0.18
691	0.18
692	0.18
693	0.17
694	0.15
695	0.14
696	0.1
697	0.06
698	0.04
699	0.04
700	0.04
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.06
705	0.07
706	0.09
707	0.13
708	0.15
709	0.18
710	0.22
711	0.22
712	0.21
713	0.21
714	0.21
715	0.2
716	0.24
717	0.28
718	0.32
719	0.34
720	0.38
721	0.4
722	0.38
723	0.36
724	0.35
725	0.37
726	0.38
727	0.43
728	0.46
729	0.5
730	0.53
731	0.55
732	0.49
733	0.45
734	0.4
735	0.34
736	0.31
737	0.28
738	0.25
739	0.27
740	0.26
741	0.23
742	0.2
743	0.18
744	0.16
745	0.14
746	0.14
747	0.13
748	0.15
749	0.15
750	0.14
751	0.15
752	0.14
753	0.15
754	0.17
755	0.19
756	0.21
757	0.23
758	0.25
759	0.27
760	0.28
761	0.31
762	0.37
763	0.37
764	0.37
765	0.36
766	0.38
767	0.36
768	0.36
769	0.32
770	0.25
771	0.22
772	0.22
773	0.21
774	0.25
775	0.27
776	0.3
777	0.33
778	0.36
779	0.33
780	0.3
781	0.28
782	0.21
783	0.18
784	0.15
785	0.12
786	0.09
787	0.08
788	0.08
789	0.09
790	0.14
791	0.14
792	0.13
793	0.13
794	0.15
795	0.15
796	0.16
797	0.17
798	0.13
799	0.14
800	0.19
801	0.22
802	0.29
803	0.36
804	0.4
805	0.45
806	0.5
807	0.54
808	0.54
809	0.56
810	0.52
811	0.53
812	0.53
813	0.49
814	0.48
815	0.41
816	0.38
817	0.35
818	0.3
819	0.23
820	0.24
821	0.25
822	0.28
823	0.34
824	0.38
825	0.41
826	0.42
827	0.42
828	0.37
829	0.37
830	0.33
831	0.3
832	0.28
833	0.24
834	0.24
835	0.23
836	0.22
837	0.2
838	0.2
839	0.17
840	0.16
841	0.19
842	0.18
843	0.2
844	0.23
845	0.24
846	0.21
847	0.22
848	0.19
849	0.16
850	0.16
851	0.12
852	0.1
853	0.09
854	0.08
855	0.08
856	0.09
857	0.08
858	0.08
859	0.08
860	0.08
861	0.07
862	0.09
863	0.1
864	0.14
865	0.16
866	0.17
867	0.19
868	0.21
869	0.22
870	0.22
871	0.22
872	0.23
873	0.24
874	0.22
875	0.21
876	0.19
877	0.18
878	0.18
879	0.17
880	0.11
881	0.08
882	0.09
883	0.08
884	0.07
885	0.07
886	0.06
887	0.07
888	0.07
889	0.09
890	0.11
891	0.11
892	0.12
893	0.12
894	0.13
895	0.12
896	0.13
897	0.16
898	0.19
899	0.21
900	0.21
901	0.21
902	0.22
903	0.24
904	0.25
905	0.21
906	0.18
907	0.17
908	0.17
909	0.19
910	0.15
911	0.15
912	0.16
913	0.15
914	0.13
915	0.14
916	0.13
917	0.15
918	0.17
919	0.19
920	0.18
921	0.28
922	0.38
923	0.43
924	0.47
925	0.49
926	0.49
927	0.48
928	0.54
929	0.46
930	0.42
931	0.38
932	0.37
933	0.34
934	0.32
935	0.3
936	0.22
937	0.2
938	0.13
939	0.12
940	0.09
941	0.06
942	0.06
943	0.06
944	0.06
945	0.06
946	0.06
947	0.08
948	0.08
949	0.08
950	0.08
951	0.08
952	0.09
953	0.09
954	0.09
955	0.07
956	0.08
957	0.1
958	0.14
959	0.23
960	0.25
961	0.36
962	0.45
963	0.48
964	0.5
965	0.55
966	0.57
967	0.57
968	0.58
969	0.55
970	0.57
971	0.58
972	0.57
973	0.51
974	0.44
975	0.35
976	0.31
977	0.27
978	0.22
979	0.17
980	0.18
981	0.2
982	0.25
983	0.28
984	0.33
985	0.38
986	0.38
987	0.46
988	0.47
989	0.54
990	0.53
991	0.56
992	0.59
993	0.53
994	0.51
995	0.44
996	0.42
997	0.34
998	0.35
999	0.37
1000	0.32
1001	0.32
1002	0.33
1003	0.38
1004	0.43
1005	0.46
1006	0.44
1007	0.42
1008	0.44
1009	0.48
1010	0.5
1011	0.52
1012	0.56
1013	0.59
1014	0.57
1015	0.52
1016	0.5
1017	0.43
1018	0.37
1019	0.34
1020	0.27
1021	0.24
1022	0.25
1023	0.25
1024	0.23
1025	0.23
1026	0.24
1027	0.18
1028	0.15
1029	0.13
1030	0.1
1031	0.08
1032	0.09
1033	0.08
1034	0.09
1035	0.09
1036	0.09
1037	0.07
1038	0.07
1039	0.07
1040	0.1
1041	0.1
1042	0.12
1043	0.12
1044	0.11
1045	0.13
1046	0.14
1047	0.13
1048	0.11
1049	0.11
1050	0.1
1051	0.13
1052	0.14
1053	0.13
1054	0.15
1055	0.21
1056	0.26
1057	0.32
1058	0.39
1059	0.41
1060	0.5
1061	0.51
1062	0.55
1063	0.57
1064	0.62
1065	0.6
1066	0.52
1067	0.46
1068	0.42
1069	0.42
1070	0.38
1071	0.33
1072	0.25
1073	0.21
1074	0.22
1075	0.22
1076	0.2
1077	0.22
1078	0.22
1079	0.21
1080	0.19
1081	0.18
1082	0.18
1083	0.18
1084	0.18
1085	0.17
1086	0.14
1087	0.19
1088	0.22
1089	0.21
1090	0.21
1091	0.21
1092	0.25
1093	0.22
1094	0.23
1095	0.19
1096	0.18
1097	0.2
1098	0.2
1099	0.19
1100	0.14
1101	0.14
1102	0.14
1103	0.13
1104	0.11
1105	0.1
1106	0.11
1107	0.12
1108	0.13
1109	0.15
1110	0.16
1111	0.17
1112	0.2
1113	0.21
1114	0.23
1115	0.29
1116	0.33
1117	0.34
1118	0.38
1119	0.39
1120	0.47
1121	0.47
1122	0.43
1123	0.42
1124	0.36
1125	0.42
1126	0.47
1127	0.51
1128	0.46
1129	0.49
1130	0.52
1131	0.47
1132	0.47
1133	0.38
1134	0.3
1135	0.22
1136	0.16
1137	0.12
1138	0.08
1139	0.08
1140	0.07
1141	0.07
1142	0.05
1143	0.06
1144	0.07
1145	0.07
1146	0.07
1147	0.07
1148	0.09
1149	0.1
1150	0.14
1151	0.15
1152	0.17
1153	0.17
1154	0.23
1155	0.23
1156	0.27
1157	0.35
1158	0.33
1159	0.37
1160	0.37
1161	0.39
1162	0.38
1163	0.42
1164	0.44
1165	0.44
1166	0.49
1167	0.51
1168	0.54
1169	0.55
1170	0.53
1171	0.5
1172	0.5
1173	0.47
1174	0.49
1175	0.5
1176	0.52
1177	0.56
1178	0.58
1179	0.65
1180	0.65
1181	0.65
1182	0.62
1183	0.65
1184	0.63
1185	0.64
1186	0.68
1187	0.63
1188	0.59
1189	0.56
1190	0.59
1191	0.57
1192	0.56
1193	0.55
1194	0.52
1195	0.57
1196	0.63
1197	0.64
1198	0.6
1199	0.56
1200	0.56
1201	0.55
1202	0.57
1203	0.58
1204	0.52
1205	0.52
1206	0.52
1207	0.56
1208	0.53
1209	0.48
1210	0.45
1211	0.39
1212	0.46
1213	0.46
1214	0.44
1215	0.41
1216	0.48
1217	0.51
1218	0.5
1219	0.46
1220	0.4
1221	0.43
1222	0.44
1223	0.39
1224	0.35
1225	0.31
1226	0.32
1227	0.4
1228	0.37
1229	0.31
1230	0.34
1231	0.42
1232	0.38
1233	0.42
1234	0.45
1235	0.42
1236	0.45
1237	0.47
1238	0.5
1239	0.46
1240	0.47

B2VRT0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer