Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M3MKE3

Protein Details
Accession A0A5M3MKE3    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MSGSTPKKQQAQPRPPPKEPRSPKQKQPNGSGGGHydrophilic
459-485GKEKEKEKTPRAGEKRRGPSEKEKEKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-27PRPPPKEPRSPKQKQ
235-236KK
269-335KKAKKAAAAAAAAAKEKEKEKEKEKGQDKDTAAKGQPAAASSSGAPANKAGTKSPARPPRPSKAANK
435-487SKRRERAEKEKAAAQDKEGKDGGEGKEKEKEKTPRAGEKRRGPSEKEKEKERE
531-553RGGARGGRRGRGGGRGRGGHRGS
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG cput:CONPUDRAFT_144892  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSGSTPKKQQAQPRPPPKEPRSPKQKQPNGSGGGGGNTSGGGGGGGERMKAVVRRLPANLPEDIFWQSVQAWVTPETVAWRKFYAGKIHKRPNKESMPSRAYIAFKSDDLVATFSREYDGHVFRDKAGNESQAVVEFAPFQKVPAEKKKADPRAGTIEKDEDFISFLKTLEAADKAEPMTLEALIAQAQPPPQPTTTPLLDALKAEKSAQKDKEAILRNHAHYKDQAPSKKEEAKKKAAAAAAVQKQASQQQAQAQAQAQQQEGQPMSKKAKKAAAAAAAAAKEKEKEKEKEKGQDKDTAAKGQPAAASSSGAPANKAGTKSPARPPRPSKAANKAAAAAAAAAHQNTPTVPQIQQRTKSPAAPAHAALASASGVAAAAAGGVGGTSDPASSASASASANAGAHAQSAPGSGRRGRPVIGLGRQFEAALSGAGVSKRRERAEKEKAAAQDKEGKDGGEGKEKEKEKTPRAGEKRRGPSEKEKEKEREEKSVPSILQRAATATSPNPPVPGILPAVPAPDGAAAAVGEGGERGGARGGRRGRGGGRGRGGHRGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.9
4 0.88
5 0.87
6 0.86
7 0.86
8 0.86
9 0.85
10 0.87
11 0.87
12 0.88
13 0.85
14 0.84
15 0.82
16 0.77
17 0.69
18 0.61
19 0.51
20 0.44
21 0.35
22 0.27
23 0.17
24 0.12
25 0.11
26 0.07
27 0.06
28 0.04
29 0.04
30 0.04
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.11
37 0.14
38 0.18
39 0.2
40 0.24
41 0.28
42 0.32
43 0.37
44 0.4
45 0.4
46 0.39
47 0.36
48 0.32
49 0.31
50 0.3
51 0.25
52 0.2
53 0.17
54 0.15
55 0.16
56 0.16
57 0.15
58 0.14
59 0.14
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.18
64 0.24
65 0.24
66 0.24
67 0.24
68 0.25
69 0.3
70 0.34
71 0.38
72 0.42
73 0.51
74 0.6
75 0.69
76 0.73
77 0.77
78 0.79
79 0.78
80 0.77
81 0.76
82 0.74
83 0.73
84 0.72
85 0.65
86 0.61
87 0.56
88 0.48
89 0.4
90 0.36
91 0.28
92 0.22
93 0.23
94 0.21
95 0.17
96 0.16
97 0.17
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.15
105 0.19
106 0.21
107 0.22
108 0.26
109 0.27
110 0.27
111 0.33
112 0.3
113 0.28
114 0.28
115 0.27
116 0.23
117 0.24
118 0.23
119 0.17
120 0.18
121 0.14
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.15
129 0.18
130 0.25
131 0.34
132 0.41
133 0.4
134 0.5
135 0.6
136 0.64
137 0.68
138 0.63
139 0.58
140 0.6
141 0.61
142 0.53
143 0.46
144 0.41
145 0.34
146 0.33
147 0.28
148 0.18
149 0.16
150 0.15
151 0.14
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.09
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.17
182 0.2
183 0.2
184 0.21
185 0.21
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.15
194 0.18
195 0.25
196 0.27
197 0.28
198 0.29
199 0.3
200 0.37
201 0.41
202 0.38
203 0.37
204 0.4
205 0.4
206 0.45
207 0.45
208 0.38
209 0.33
210 0.35
211 0.34
212 0.36
213 0.39
214 0.34
215 0.38
216 0.42
217 0.47
218 0.51
219 0.54
220 0.54
221 0.57
222 0.58
223 0.56
224 0.54
225 0.47
226 0.41
227 0.34
228 0.34
229 0.3
230 0.28
231 0.26
232 0.22
233 0.22
234 0.24
235 0.24
236 0.17
237 0.15
238 0.17
239 0.24
240 0.24
241 0.25
242 0.22
243 0.25
244 0.26
245 0.26
246 0.21
247 0.17
248 0.17
249 0.19
250 0.18
251 0.15
252 0.15
253 0.17
254 0.22
255 0.24
256 0.25
257 0.25
258 0.3
259 0.31
260 0.32
261 0.33
262 0.31
263 0.27
264 0.26
265 0.24
266 0.2
267 0.17
268 0.14
269 0.11
270 0.08
271 0.1
272 0.14
273 0.19
274 0.24
275 0.29
276 0.37
277 0.42
278 0.5
279 0.56
280 0.59
281 0.54
282 0.58
283 0.54
284 0.53
285 0.49
286 0.44
287 0.37
288 0.32
289 0.29
290 0.23
291 0.22
292 0.16
293 0.15
294 0.11
295 0.11
296 0.09
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.11
306 0.16
307 0.2
308 0.25
309 0.33
310 0.41
311 0.44
312 0.51
313 0.57
314 0.59
315 0.64
316 0.65
317 0.64
318 0.65
319 0.69
320 0.63
321 0.58
322 0.5
323 0.42
324 0.36
325 0.28
326 0.18
327 0.09
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.07
336 0.08
337 0.1
338 0.12
339 0.17
340 0.26
341 0.32
342 0.36
343 0.38
344 0.44
345 0.44
346 0.44
347 0.43
348 0.39
349 0.37
350 0.35
351 0.31
352 0.26
353 0.24
354 0.22
355 0.17
356 0.13
357 0.09
358 0.07
359 0.06
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.02
373 0.02
374 0.02
375 0.03
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.06
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.1
397 0.13
398 0.16
399 0.21
400 0.25
401 0.27
402 0.26
403 0.27
404 0.3
405 0.34
406 0.37
407 0.37
408 0.34
409 0.34
410 0.33
411 0.31
412 0.25
413 0.2
414 0.13
415 0.09
416 0.07
417 0.06
418 0.07
419 0.09
420 0.12
421 0.14
422 0.19
423 0.25
424 0.3
425 0.36
426 0.42
427 0.51
428 0.59
429 0.65
430 0.63
431 0.63
432 0.64
433 0.64
434 0.57
435 0.51
436 0.5
437 0.42
438 0.43
439 0.38
440 0.32
441 0.27
442 0.32
443 0.31
444 0.31
445 0.32
446 0.3
447 0.38
448 0.4
449 0.41
450 0.45
451 0.51
452 0.48
453 0.56
454 0.61
455 0.64
456 0.72
457 0.79
458 0.8
459 0.81
460 0.84
461 0.85
462 0.83
463 0.79
464 0.8
465 0.81
466 0.81
467 0.77
468 0.76
469 0.74
470 0.77
471 0.79
472 0.73
473 0.72
474 0.65
475 0.66
476 0.62
477 0.61
478 0.53
479 0.49
480 0.48
481 0.4
482 0.38
483 0.32
484 0.29
485 0.24
486 0.24
487 0.22
488 0.19
489 0.23
490 0.25
491 0.26
492 0.25
493 0.23
494 0.23
495 0.21
496 0.23
497 0.2
498 0.17
499 0.19
500 0.18
501 0.2
502 0.18
503 0.17
504 0.14
505 0.11
506 0.1
507 0.08
508 0.08
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.05
519 0.08
520 0.11
521 0.13
522 0.21
523 0.27
524 0.32
525 0.35
526 0.39
527 0.39
528 0.47
529 0.53
530 0.54
531 0.56
532 0.59
533 0.59