Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M3MSF6

Protein Details
Accession A0A5M3MSF6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-335CEYLGGKKRSRISQRRPRLDVFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
KEGG cput:CONPUDRAFT_81645  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
CDD cd18727  PIN_Swt1-like  
Amino Acid Sequences MSFDSLQALCYDRPPAAGEIHLHDTLRRIDEIANKDVEMQAPLSENLSIVVLDTNILLEYLDVVRKFVEEVESQNIPVLLIIPGAVIYELDGQKNRDGLSWFARRASTWLLKKVKERKCVKGQALDETCKPSRNWKKREIGESSWDERRNDSLILDCCQYFSRIRHKRTVLCSKDKLLAVEAESEGIQNIYPTGQFCSRAIAHALYGPEAGLFRFSGHRPNYKNSSIELTQVHVEQEDDGMDIDDDASTTETLQPSHALDLLHLQVIEHFGQLLVELVMRVGGPELQECGEGVSRHAPRHKLVPFSQWGPRECCEYLGGKKRSRISQRRPRLDVFLTKPYADRGARRGQDWSRRDWEVAMQSLGDLGEEWQEGTIQESIPSVQIHMERVFSMPMRPTGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.2
4 0.22
5 0.22
6 0.25
7 0.29
8 0.29
9 0.27
10 0.25
11 0.27
12 0.29
13 0.29
14 0.24
15 0.21
16 0.23
17 0.31
18 0.36
19 0.36
20 0.34
21 0.31
22 0.32
23 0.31
24 0.28
25 0.22
26 0.17
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.06
44 0.05
45 0.04
46 0.06
47 0.07
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.12
55 0.14
56 0.12
57 0.15
58 0.2
59 0.21
60 0.21
61 0.21
62 0.2
63 0.16
64 0.14
65 0.12
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.03
74 0.04
75 0.1
76 0.11
77 0.13
78 0.15
79 0.17
80 0.19
81 0.21
82 0.2
83 0.18
84 0.19
85 0.2
86 0.26
87 0.31
88 0.3
89 0.31
90 0.31
91 0.28
92 0.29
93 0.33
94 0.34
95 0.32
96 0.41
97 0.45
98 0.48
99 0.56
100 0.64
101 0.65
102 0.66
103 0.68
104 0.68
105 0.72
106 0.78
107 0.74
108 0.72
109 0.65
110 0.65
111 0.64
112 0.57
113 0.49
114 0.46
115 0.42
116 0.37
117 0.36
118 0.37
119 0.43
120 0.5
121 0.56
122 0.59
123 0.67
124 0.7
125 0.78
126 0.74
127 0.67
128 0.64
129 0.62
130 0.57
131 0.54
132 0.51
133 0.43
134 0.37
135 0.35
136 0.3
137 0.24
138 0.21
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.19
143 0.17
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.15
148 0.18
149 0.27
150 0.35
151 0.39
152 0.46
153 0.51
154 0.56
155 0.61
156 0.68
157 0.64
158 0.63
159 0.62
160 0.57
161 0.56
162 0.5
163 0.42
164 0.32
165 0.26
166 0.18
167 0.17
168 0.14
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.03
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.08
202 0.08
203 0.16
204 0.19
205 0.26
206 0.29
207 0.34
208 0.39
209 0.4
210 0.41
211 0.34
212 0.36
213 0.3
214 0.3
215 0.25
216 0.2
217 0.18
218 0.18
219 0.16
220 0.11
221 0.11
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.12
245 0.09
246 0.09
247 0.11
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.09
277 0.11
278 0.1
279 0.11
280 0.18
281 0.21
282 0.25
283 0.3
284 0.31
285 0.31
286 0.4
287 0.42
288 0.41
289 0.41
290 0.45
291 0.45
292 0.46
293 0.5
294 0.47
295 0.47
296 0.45
297 0.43
298 0.41
299 0.37
300 0.34
301 0.3
302 0.3
303 0.35
304 0.4
305 0.47
306 0.46
307 0.51
308 0.56
309 0.62
310 0.69
311 0.71
312 0.72
313 0.76
314 0.82
315 0.86
316 0.86
317 0.8
318 0.76
319 0.71
320 0.69
321 0.64
322 0.62
323 0.54
324 0.49
325 0.46
326 0.42
327 0.43
328 0.37
329 0.36
330 0.33
331 0.4
332 0.42
333 0.43
334 0.49
335 0.5
336 0.57
337 0.55
338 0.57
339 0.53
340 0.53
341 0.53
342 0.46
343 0.44
344 0.4
345 0.39
346 0.32
347 0.26
348 0.23
349 0.23
350 0.21
351 0.14
352 0.09
353 0.06
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.11
361 0.12
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.14
370 0.16
371 0.2
372 0.2
373 0.21
374 0.19
375 0.21
376 0.23
377 0.21
378 0.23
379 0.23