Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M3MIM9

Protein Details
Accession A0A5M3MIM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-405LTSMVVKKKKKAPANASPPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-414KKKKKAPANASPPAAEGEASGKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, nucl 11.5, cyto 11.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG cput:CONPUDRAFT_91410  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MEPKTEQATEQPTTVEGALEQARRAFALRRYEQAVEHYAMALEIATKKHGEDAPEMADLYFSYGKALLENAIVQSQVLGKDEPQNEEAEEKGANGAFLSFSGDAEEEGDPAVDLFANAAKAEEEEEEEDGEGEGEEEGGDGEPEDDFNAAWEVLELARAIYDRGKEDDGVTLKLADTYIALGDVSLETEKFDQAITDYEEGLKIKLELLPVSSRQIAEAHYKLTLALDLTPGRLSDAIVHAEKALDSVEHRLAELRTGIAGQLPPPSAPIEESSNASGSGKGKGKGRAAPVLADDAVQKMSKEQMEKEIKEVEGLREDLAMKVEELKTSPNDASAESAPAMAARALDAELNAGKGKGGGAGLDFSAILGAGSATASAQPAVVNDLTSMVVKKKKKAPANASPPAAEGEASGKRKAEDGEGTESKKAKLEGEESSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.18
3 0.11
4 0.14
5 0.18
6 0.19
7 0.2
8 0.19
9 0.19
10 0.2
11 0.22
12 0.23
13 0.25
14 0.33
15 0.36
16 0.39
17 0.43
18 0.45
19 0.44
20 0.44
21 0.42
22 0.34
23 0.31
24 0.26
25 0.22
26 0.19
27 0.17
28 0.12
29 0.09
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.19
36 0.21
37 0.22
38 0.23
39 0.26
40 0.27
41 0.27
42 0.28
43 0.21
44 0.2
45 0.16
46 0.17
47 0.15
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.14
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.2
68 0.23
69 0.25
70 0.24
71 0.25
72 0.24
73 0.24
74 0.23
75 0.16
76 0.14
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.06
84 0.06
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.04
100 0.03
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.09
149 0.1
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.18
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.1
212 0.06
213 0.05
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.08
231 0.07
232 0.04
233 0.05
234 0.08
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.11
266 0.16
267 0.18
268 0.2
269 0.24
270 0.29
271 0.33
272 0.35
273 0.38
274 0.37
275 0.35
276 0.33
277 0.3
278 0.27
279 0.23
280 0.19
281 0.15
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.12
288 0.14
289 0.16
290 0.17
291 0.26
292 0.33
293 0.34
294 0.36
295 0.36
296 0.33
297 0.33
298 0.33
299 0.26
300 0.21
301 0.21
302 0.18
303 0.16
304 0.17
305 0.14
306 0.14
307 0.13
308 0.09
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.15
314 0.16
315 0.19
316 0.19
317 0.17
318 0.17
319 0.17
320 0.2
321 0.17
322 0.17
323 0.14
324 0.14
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.08
329 0.07
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.04
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.12
374 0.13
375 0.16
376 0.23
377 0.28
378 0.36
379 0.43
380 0.52
381 0.6
382 0.69
383 0.73
384 0.76
385 0.82
386 0.82
387 0.77
388 0.68
389 0.61
390 0.52
391 0.42
392 0.31
393 0.22
394 0.19
395 0.24
396 0.26
397 0.27
398 0.26
399 0.26
400 0.29
401 0.3
402 0.3
403 0.29
404 0.3
405 0.37
406 0.42
407 0.44
408 0.46
409 0.47
410 0.42
411 0.4
412 0.37
413 0.32
414 0.32
415 0.33