Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SHD6

Protein Details
Accession R7SHD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-279ASSFGIKDKTRRRRPQHREKHLDEEYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-269KTRRRRPQ
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 8, cysk 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008906  HATC_C_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG cput:CONPUDRAFT_36856  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05699  Dimer_Tnp_hAT  
Amino Acid Sequences MREEIVNAFQEYFIQLKLELDVGWFTMDNASNNVTAMQELQSLLQAREIEFDANQHRIMCFPHIVNICVNHIVKSFSDLRMVDAHAWDQAIPDEGTRTAFVGAVLSDPIAEARGIVRDWEVLGVFEHVLQIPHVAQQRMSSESLPRLGRAAAYLELLIYGWDHVGQVDPRAKPFADLGSNKAYEYYRRTDNSDAYVISMFLDPAFKLDWMEECWSSEAQESAEELIKKTICQYRECMPAPVRDSRHGAVRSTLASSFGIKDKTRRRRPQHREKHLDEEYQAYTSEPLAHEGLDPLKYWEGKRDTFPTLFAMAMDFMPIQASSVPSERVFSSAAETNTKKRNRLSSTMLEITQILKFGLKKERLSFVEGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.11
4 0.12
5 0.12
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.13
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.18
18 0.17
19 0.17
20 0.17
21 0.13
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.18
35 0.18
36 0.16
37 0.14
38 0.18
39 0.19
40 0.21
41 0.22
42 0.2
43 0.19
44 0.19
45 0.21
46 0.21
47 0.21
48 0.19
49 0.25
50 0.25
51 0.27
52 0.28
53 0.27
54 0.26
55 0.27
56 0.27
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.19
61 0.22
62 0.23
63 0.18
64 0.23
65 0.22
66 0.23
67 0.23
68 0.25
69 0.21
70 0.19
71 0.19
72 0.14
73 0.15
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.06
119 0.1
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.16
124 0.18
125 0.2
126 0.21
127 0.17
128 0.16
129 0.18
130 0.23
131 0.21
132 0.19
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.13
137 0.13
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.05
152 0.05
153 0.09
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.19
165 0.22
166 0.22
167 0.21
168 0.22
169 0.19
170 0.16
171 0.19
172 0.2
173 0.21
174 0.22
175 0.25
176 0.26
177 0.27
178 0.27
179 0.25
180 0.21
181 0.17
182 0.16
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.07
187 0.05
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.09
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.17
216 0.2
217 0.2
218 0.22
219 0.25
220 0.27
221 0.35
222 0.37
223 0.37
224 0.35
225 0.38
226 0.39
227 0.43
228 0.4
229 0.35
230 0.38
231 0.34
232 0.4
233 0.36
234 0.33
235 0.28
236 0.27
237 0.25
238 0.22
239 0.21
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.16
245 0.19
246 0.18
247 0.26
248 0.35
249 0.46
250 0.56
251 0.64
252 0.72
253 0.79
254 0.89
255 0.92
256 0.93
257 0.93
258 0.92
259 0.87
260 0.86
261 0.8
262 0.72
263 0.62
264 0.55
265 0.45
266 0.36
267 0.3
268 0.21
269 0.17
270 0.14
271 0.15
272 0.11
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.14
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.16
283 0.18
284 0.19
285 0.26
286 0.29
287 0.31
288 0.36
289 0.39
290 0.41
291 0.39
292 0.4
293 0.34
294 0.3
295 0.27
296 0.22
297 0.18
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.09
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.09
308 0.1
309 0.12
310 0.15
311 0.15
312 0.17
313 0.17
314 0.18
315 0.18
316 0.16
317 0.18
318 0.21
319 0.22
320 0.28
321 0.3
322 0.35
323 0.44
324 0.49
325 0.5
326 0.51
327 0.59
328 0.59
329 0.64
330 0.65
331 0.64
332 0.67
333 0.65
334 0.59
335 0.5
336 0.43
337 0.38
338 0.31
339 0.23
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.21
344 0.3
345 0.34
346 0.39
347 0.44
348 0.52
349 0.51