Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SDU0

Protein Details
Accession R7SDU0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-320SGPSSGMPKKGKKKGKRGGKKKVIPSVYNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-46RAEQRRLKAQERREKSDKLR
298-313MPKKGKKKGKRGGKKK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 10.5, mito 8, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG cput:CONPUDRAFT_170333  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSDHKPSGSSTLKPAHEPVIAQKLKDRAEQRRLKAQERREKSDKLREKGNESFRIGHYECAADFYKKAQKVHGERRQPIILSNLAAALLKLGEWEGAHFAAEGALTTDATNLKARFRRGVARKELEQYEAAMIDFKVILDQDPNNAEVKAHYEAAKKLFDAGKGVPAEFDDDMPQYDPTGSMFESESESGSSDAEHEGNSIPCRFYNHDGCKRGHACAYSHKNDDLSVRDGLGKNVCIYFLLGKCKFGAEKCIYSHTKAYLPDGWWNHPEYREAFEIALPMKLELIAASSGSGPSSGMPKKGKKKGKRGGKKKVIPSVYNSDDDDLHDGGVLGFSASDVEELAMQGIKPWDDEAADALAVLNGYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.41
3 0.38
4 0.36
5 0.36
6 0.39
7 0.38
8 0.35
9 0.38
10 0.4
11 0.42
12 0.48
13 0.49
14 0.48
15 0.58
16 0.67
17 0.67
18 0.71
19 0.74
20 0.76
21 0.76
22 0.77
23 0.77
24 0.76
25 0.79
26 0.75
27 0.78
28 0.77
29 0.8
30 0.79
31 0.73
32 0.74
33 0.7
34 0.7
35 0.71
36 0.71
37 0.67
38 0.61
39 0.61
40 0.53
41 0.56
42 0.5
43 0.43
44 0.35
45 0.29
46 0.25
47 0.24
48 0.25
49 0.18
50 0.18
51 0.22
52 0.29
53 0.31
54 0.33
55 0.34
56 0.41
57 0.5
58 0.61
59 0.64
60 0.66
61 0.66
62 0.71
63 0.69
64 0.59
65 0.52
66 0.45
67 0.37
68 0.28
69 0.24
70 0.18
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.08
75 0.06
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.07
95 0.07
96 0.09
97 0.13
98 0.13
99 0.18
100 0.22
101 0.25
102 0.28
103 0.3
104 0.38
105 0.42
106 0.51
107 0.54
108 0.55
109 0.55
110 0.57
111 0.55
112 0.48
113 0.4
114 0.32
115 0.24
116 0.19
117 0.16
118 0.11
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.09
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.16
140 0.18
141 0.21
142 0.21
143 0.18
144 0.19
145 0.2
146 0.18
147 0.18
148 0.16
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.14
153 0.13
154 0.15
155 0.12
156 0.12
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.13
191 0.15
192 0.19
193 0.28
194 0.36
195 0.43
196 0.48
197 0.48
198 0.53
199 0.51
200 0.48
201 0.41
202 0.34
203 0.27
204 0.32
205 0.39
206 0.36
207 0.37
208 0.36
209 0.34
210 0.33
211 0.33
212 0.27
213 0.22
214 0.18
215 0.16
216 0.19
217 0.19
218 0.2
219 0.19
220 0.16
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.1
225 0.1
226 0.13
227 0.14
228 0.22
229 0.21
230 0.22
231 0.22
232 0.23
233 0.24
234 0.21
235 0.26
236 0.23
237 0.26
238 0.27
239 0.34
240 0.35
241 0.36
242 0.38
243 0.32
244 0.31
245 0.28
246 0.31
247 0.28
248 0.27
249 0.32
250 0.32
251 0.33
252 0.32
253 0.34
254 0.33
255 0.29
256 0.31
257 0.26
258 0.27
259 0.25
260 0.24
261 0.21
262 0.19
263 0.2
264 0.17
265 0.17
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.05
281 0.06
282 0.13
283 0.15
284 0.21
285 0.28
286 0.37
287 0.47
288 0.57
289 0.67
290 0.7
291 0.79
292 0.83
293 0.87
294 0.9
295 0.9
296 0.92
297 0.93
298 0.92
299 0.9
300 0.89
301 0.85
302 0.77
303 0.73
304 0.71
305 0.64
306 0.58
307 0.49
308 0.41
309 0.34
310 0.33
311 0.3
312 0.21
313 0.17
314 0.14
315 0.13
316 0.11
317 0.1
318 0.08
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.1
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.09