Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SDW2

Protein Details
Accession R7SDW2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MDRPSEKRGKHVDVKHKHHLEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8, cyto_nucl 7.5, mito 7, pero 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR037316  Yen1_H3TH  
Gene Ontology GO:0008821  F:crossover junction DNA endonuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG cput:CONPUDRAFT_133032  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09906  H3TH_YEN1  
Amino Acid Sequences MDRPSEKRGKHVDVKHKHHLEEGFRDFIQVYGFNQHTAPGEAEAELAAMSCHNLLDGVLTTDSDVILFGAKHVIRELPESDGNKRSHQVEIFTEESIRKSGWDCHRLLLVALLSGADYDMSGVQGCGIKVASQLAKGDLGEKLVHAFTGCPAPQFLRFCVEWRKDLRDMLRENAKGALARKHGNIADNVPNTFPSLSVLGNYLCPVTSHSLSLDTPRDIGGLRSPQSLQPDVTKLTSLFIHYFNWTPAKVQKYIHDNIWAGIYMRAIFRVRHNIVFRIWDSQERC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.8
4 0.72
5 0.69
6 0.65
7 0.61
8 0.6
9 0.56
10 0.5
11 0.44
12 0.44
13 0.38
14 0.32
15 0.27
16 0.19
17 0.16
18 0.18
19 0.19
20 0.19
21 0.19
22 0.2
23 0.19
24 0.2
25 0.19
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.13
30 0.11
31 0.1
32 0.07
33 0.06
34 0.05
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.05
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.04
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.14
61 0.13
62 0.17
63 0.18
64 0.17
65 0.21
66 0.23
67 0.26
68 0.32
69 0.33
70 0.32
71 0.34
72 0.31
73 0.3
74 0.29
75 0.28
76 0.24
77 0.27
78 0.26
79 0.24
80 0.23
81 0.2
82 0.2
83 0.18
84 0.15
85 0.11
86 0.11
87 0.19
88 0.26
89 0.31
90 0.31
91 0.31
92 0.32
93 0.32
94 0.3
95 0.23
96 0.15
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.03
104 0.02
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.07
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.16
145 0.18
146 0.26
147 0.27
148 0.28
149 0.3
150 0.35
151 0.33
152 0.36
153 0.37
154 0.36
155 0.36
156 0.36
157 0.4
158 0.34
159 0.33
160 0.31
161 0.28
162 0.23
163 0.23
164 0.24
165 0.2
166 0.22
167 0.22
168 0.25
169 0.25
170 0.25
171 0.25
172 0.23
173 0.27
174 0.26
175 0.26
176 0.23
177 0.22
178 0.21
179 0.19
180 0.15
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.16
198 0.16
199 0.2
200 0.21
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.15
207 0.16
208 0.19
209 0.2
210 0.22
211 0.23
212 0.25
213 0.3
214 0.31
215 0.27
216 0.25
217 0.27
218 0.27
219 0.26
220 0.25
221 0.2
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.2
230 0.21
231 0.23
232 0.21
233 0.22
234 0.26
235 0.29
236 0.31
237 0.32
238 0.36
239 0.4
240 0.44
241 0.44
242 0.44
243 0.4
244 0.37
245 0.36
246 0.3
247 0.23
248 0.21
249 0.19
250 0.13
251 0.13
252 0.16
253 0.16
254 0.18
255 0.23
256 0.32
257 0.35
258 0.42
259 0.45
260 0.45
261 0.46
262 0.5
263 0.45
264 0.42
265 0.41