Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M3M9M6

Protein Details
Accession A0A5M3M9M6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
858-888EATQRRPKASASKPRSKKPRRTHEDEIENFQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
862-878RRPKASASKPRSKKPRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR035935  TFB5-like_sf  
IPR009400  TFIIH_TTDA/Tfb5  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG cput:CONPUDRAFT_76986  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PF06331  Tfb5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
Amino Acid Sequences MNEKQPFIIEDLDDYHLIIKADEEYRVRRELEAEAKTVLPIGVTFQRIDIPCHAKSSLYALQINALRSKRKVLCVRLPFADSRWKPPSPNHVNNTRVALRVPLFKSNLCKAALVMMPPDATSTKRDVPELLASAATTDFSVFGFTISFRYRCWVAWLTKARTYSGHTYFPRFHQKRCQSVEDNSASRGGDALKLGEDFTKSPSGAQSAQFQPSQPTRFVFLCIYKHILMNTTHTPLPSTIDHHNTQHILSLRRSQTPGYSSEDIRKQFSDKCKERTGFTPHPWQLDCAEAFYLGLDCTVIAGTGSGKTLCFAMPAMLRTDKITLVLSPLNILEDDQARRFEHMGLRATVVNGETFTPKLRHILEKPVPEFQVVFTSPEMVLSPGPFNSMLTSATFQEHLAGAVVDEAHCIEEWGPEFRPAYDELGAIRSIIPLHLPVYATSATMPPHVLATVRSVLHINPRRSYHVNLGNDRPNITQEIRTIDGSKDYAALDYLFTGCQQPEDLPHAIIFVNRRKDAEEIFDRLIKSPWFPVHLHDSVDFLTAKRGKQTKKRVMERFAKGEIRVLISTSAGSMGVDIPDITLVIQFGVPSSLMEWLQRAGRAGRSCAIQAVAILFVEKSVLAKQKVKSRRRENDMSDGEEQQVYRKKVEPALRQWIETTGCRRDVADEYFDNPSGRLSPTGDCCDNCRSRAIHEQRAVMPGSINDMLMGSETENPQDATAANALDGGNSDSSDEDGENDEDNSEGDDVEDEPGQKPNSHGKRPTSSHPAIRRTRDRLRIVRDGLRSWRVAMRRRDYPGCSMPGEALLPDKPLKKISGDRQLTTLEDLHGAVGSAWAFVEEYGLELLAEVQRLDQVADEATQRRPKASASKPRSKKPRRTHEDEIENFQSATPGTSCFSIATTGGFVTPIQVAQTSQQSSFNVHFYVPPHTQAPSVIRSQPLSPSKRQSTSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.17
4 0.17
5 0.15
6 0.12
7 0.14
8 0.16
9 0.2
10 0.23
11 0.26
12 0.3
13 0.35
14 0.35
15 0.31
16 0.32
17 0.35
18 0.39
19 0.38
20 0.35
21 0.33
22 0.32
23 0.31
24 0.29
25 0.22
26 0.14
27 0.1
28 0.13
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.24
34 0.25
35 0.28
36 0.32
37 0.33
38 0.33
39 0.36
40 0.36
41 0.3
42 0.3
43 0.34
44 0.32
45 0.3
46 0.31
47 0.27
48 0.32
49 0.35
50 0.37
51 0.36
52 0.34
53 0.35
54 0.35
55 0.44
56 0.44
57 0.5
58 0.57
59 0.59
60 0.66
61 0.69
62 0.73
63 0.67
64 0.66
65 0.58
66 0.52
67 0.54
68 0.46
69 0.46
70 0.47
71 0.46
72 0.46
73 0.51
74 0.59
75 0.59
76 0.66
77 0.65
78 0.67
79 0.68
80 0.67
81 0.67
82 0.58
83 0.49
84 0.4
85 0.38
86 0.32
87 0.37
88 0.36
89 0.36
90 0.36
91 0.38
92 0.44
93 0.44
94 0.46
95 0.39
96 0.36
97 0.29
98 0.33
99 0.31
100 0.26
101 0.22
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.19
106 0.14
107 0.14
108 0.16
109 0.2
110 0.25
111 0.27
112 0.28
113 0.27
114 0.3
115 0.34
116 0.33
117 0.28
118 0.22
119 0.2
120 0.19
121 0.18
122 0.14
123 0.09
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.11
133 0.15
134 0.16
135 0.15
136 0.2
137 0.21
138 0.21
139 0.27
140 0.29
141 0.28
142 0.37
143 0.46
144 0.47
145 0.5
146 0.51
147 0.46
148 0.41
149 0.44
150 0.43
151 0.38
152 0.42
153 0.4
154 0.44
155 0.46
156 0.51
157 0.57
158 0.51
159 0.52
160 0.55
161 0.61
162 0.65
163 0.69
164 0.7
165 0.64
166 0.66
167 0.69
168 0.65
169 0.57
170 0.48
171 0.44
172 0.35
173 0.3
174 0.26
175 0.17
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.14
186 0.17
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.2
191 0.21
192 0.22
193 0.26
194 0.26
195 0.29
196 0.29
197 0.28
198 0.3
199 0.34
200 0.35
201 0.3
202 0.28
203 0.29
204 0.29
205 0.31
206 0.29
207 0.27
208 0.27
209 0.28
210 0.31
211 0.28
212 0.29
213 0.26
214 0.26
215 0.22
216 0.25
217 0.25
218 0.24
219 0.24
220 0.23
221 0.24
222 0.21
223 0.23
224 0.19
225 0.2
226 0.22
227 0.26
228 0.29
229 0.29
230 0.32
231 0.29
232 0.28
233 0.28
234 0.28
235 0.26
236 0.26
237 0.33
238 0.32
239 0.35
240 0.37
241 0.33
242 0.33
243 0.32
244 0.32
245 0.31
246 0.31
247 0.28
248 0.34
249 0.39
250 0.36
251 0.36
252 0.35
253 0.31
254 0.34
255 0.42
256 0.46
257 0.47
258 0.52
259 0.58
260 0.58
261 0.58
262 0.59
263 0.59
264 0.56
265 0.54
266 0.58
267 0.52
268 0.55
269 0.52
270 0.46
271 0.38
272 0.34
273 0.29
274 0.2
275 0.18
276 0.13
277 0.12
278 0.11
279 0.1
280 0.06
281 0.06
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.08
300 0.1
301 0.11
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.14
308 0.13
309 0.13
310 0.1
311 0.12
312 0.13
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.1
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.15
325 0.16
326 0.17
327 0.18
328 0.19
329 0.22
330 0.23
331 0.22
332 0.23
333 0.22
334 0.21
335 0.19
336 0.16
337 0.11
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.15
346 0.17
347 0.22
348 0.23
349 0.33
350 0.37
351 0.42
352 0.43
353 0.43
354 0.42
355 0.36
356 0.34
357 0.24
358 0.23
359 0.17
360 0.16
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.07
400 0.09
401 0.09
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.13
406 0.12
407 0.14
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.12
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.06
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.08
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.2
444 0.27
445 0.27
446 0.28
447 0.3
448 0.35
449 0.37
450 0.39
451 0.37
452 0.37
453 0.4
454 0.39
455 0.42
456 0.42
457 0.4
458 0.38
459 0.31
460 0.24
461 0.23
462 0.21
463 0.18
464 0.14
465 0.17
466 0.17
467 0.17
468 0.17
469 0.15
470 0.15
471 0.13
472 0.12
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.12
490 0.12
491 0.11
492 0.11
493 0.12
494 0.12
495 0.13
496 0.15
497 0.16
498 0.21
499 0.21
500 0.21
501 0.22
502 0.23
503 0.23
504 0.25
505 0.23
506 0.22
507 0.22
508 0.24
509 0.23
510 0.23
511 0.24
512 0.18
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.17
517 0.16
518 0.18
519 0.23
520 0.24
521 0.24
522 0.21
523 0.21
524 0.18
525 0.19
526 0.17
527 0.1
528 0.15
529 0.16
530 0.16
531 0.22
532 0.27
533 0.32
534 0.42
535 0.53
536 0.56
537 0.64
538 0.73
539 0.74
540 0.76
541 0.8
542 0.75
543 0.69
544 0.64
545 0.56
546 0.47
547 0.43
548 0.35
549 0.29
550 0.23
551 0.19
552 0.14
553 0.12
554 0.12
555 0.08
556 0.08
557 0.05
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.05
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.15
588 0.17
589 0.18
590 0.18
591 0.19
592 0.18
593 0.18
594 0.17
595 0.11
596 0.1
597 0.09
598 0.07
599 0.06
600 0.06
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.07
607 0.13
608 0.16
609 0.21
610 0.25
611 0.35
612 0.45
613 0.52
614 0.6
615 0.66
616 0.72
617 0.75
618 0.8
619 0.76
620 0.76
621 0.71
622 0.65
623 0.57
624 0.48
625 0.41
626 0.34
627 0.28
628 0.23
629 0.27
630 0.24
631 0.24
632 0.26
633 0.28
634 0.34
635 0.43
636 0.45
637 0.46
638 0.55
639 0.54
640 0.5
641 0.48
642 0.45
643 0.39
644 0.34
645 0.32
646 0.26
647 0.26
648 0.26
649 0.25
650 0.25
651 0.27
652 0.26
653 0.26
654 0.22
655 0.23
656 0.25
657 0.26
658 0.23
659 0.19
660 0.17
661 0.14
662 0.14
663 0.13
664 0.13
665 0.15
666 0.19
667 0.24
668 0.26
669 0.24
670 0.27
671 0.34
672 0.34
673 0.32
674 0.32
675 0.28
676 0.31
677 0.41
678 0.45
679 0.46
680 0.47
681 0.5
682 0.47
683 0.5
684 0.46
685 0.35
686 0.28
687 0.19
688 0.2
689 0.16
690 0.14
691 0.11
692 0.1
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.06
697 0.08
698 0.09
699 0.09
700 0.1
701 0.1
702 0.1
703 0.1
704 0.09
705 0.09
706 0.1
707 0.09
708 0.08
709 0.09
710 0.09
711 0.08
712 0.09
713 0.08
714 0.07
715 0.07
716 0.08
717 0.06
718 0.07
719 0.08
720 0.07
721 0.07
722 0.09
723 0.1
724 0.11
725 0.11
726 0.1
727 0.09
728 0.1
729 0.1
730 0.07
731 0.06
732 0.06
733 0.06
734 0.07
735 0.08
736 0.09
737 0.09
738 0.1
739 0.15
740 0.16
741 0.16
742 0.19
743 0.28
744 0.36
745 0.43
746 0.49
747 0.51
748 0.59
749 0.63
750 0.67
751 0.67
752 0.64
753 0.65
754 0.66
755 0.69
756 0.68
757 0.73
758 0.74
759 0.73
760 0.76
761 0.77
762 0.77
763 0.76
764 0.76
765 0.75
766 0.72
767 0.71
768 0.66
769 0.61
770 0.58
771 0.54
772 0.47
773 0.41
774 0.41
775 0.41
776 0.45
777 0.5
778 0.5
779 0.53
780 0.6
781 0.63
782 0.61
783 0.62
784 0.59
785 0.54
786 0.48
787 0.41
788 0.35
789 0.3
790 0.27
791 0.2
792 0.16
793 0.13
794 0.15
795 0.18
796 0.2
797 0.21
798 0.24
799 0.25
800 0.28
801 0.36
802 0.43
803 0.49
804 0.52
805 0.51
806 0.51
807 0.5
808 0.46
809 0.4
810 0.32
811 0.22
812 0.18
813 0.17
814 0.14
815 0.12
816 0.11
817 0.08
818 0.08
819 0.07
820 0.06
821 0.06
822 0.06
823 0.06
824 0.05
825 0.06
826 0.05
827 0.06
828 0.06
829 0.06
830 0.05
831 0.05
832 0.07
833 0.07
834 0.08
835 0.07
836 0.07
837 0.08
838 0.09
839 0.09
840 0.08
841 0.08
842 0.09
843 0.1
844 0.13
845 0.15
846 0.22
847 0.28
848 0.29
849 0.3
850 0.3
851 0.34
852 0.41
853 0.48
854 0.53
855 0.56
856 0.66
857 0.73
858 0.82
859 0.88
860 0.88
861 0.89
862 0.89
863 0.91
864 0.89
865 0.9
866 0.9
867 0.89
868 0.89
869 0.82
870 0.79
871 0.71
872 0.63
873 0.54
874 0.43
875 0.34
876 0.24
877 0.22
878 0.14
879 0.13
880 0.13
881 0.13
882 0.14
883 0.13
884 0.14
885 0.13
886 0.12
887 0.12
888 0.12
889 0.11
890 0.11
891 0.11
892 0.1
893 0.1
894 0.1
895 0.1
896 0.1
897 0.1
898 0.11
899 0.14
900 0.21
901 0.22
902 0.23
903 0.26
904 0.26
905 0.3
906 0.31
907 0.3
908 0.25
909 0.23
910 0.24
911 0.22
912 0.29
913 0.27
914 0.28
915 0.27
916 0.27
917 0.28
918 0.29
919 0.32
920 0.3
921 0.32
922 0.33
923 0.35
924 0.36
925 0.37
926 0.42
927 0.46
928 0.48
929 0.51
930 0.57
931 0.62