Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5M3N6N9

Protein Details
Accession A0A5M3N6N9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
210-243LPTTRSKRLTQSPQRSHLRPAKRNQRAKKTTAVKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-238RPAKRNQRAKK
519-547RVGARGAAARGGQRGGGPNRGGGGGRGGP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, cyto 13, nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG cput:CONPUDRAFT_46591  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MGLREDLIEQIVHPDPQNSDKLLHDLNLAGLPSREQVLKDIEEKLLLPPTKLPDHWLSTYQIHWQHETSIPSLLSFQPSPPPTSLAFVRSGIQGRVTGYTEIPNPRTNLTAITSTSLDRAPGPSSSFVRGKSGHVPFWPGGLDDVLLTAEPGQAQDPTKGLRTVAPGLSRGLRLPGEEVDDDLFDLVPENEELNGAIPSTREATDIDELLPTTRSKRLTQSPQRSHLRPAKRNQRAKKTTAVKRDWAHVVDINKPMTNFHELVPEMAHKYPFELDTFQKEAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAEKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKQTFSSSSVGILTGDVQINPEASCLVMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAEVPPFACTLSSPFIHHLQRGVVWEEVIIMLPDHVNIILLSATVPNTKEFADWVGRTKKKDIYVISTAQRPVPLEHYLYAGRDTFKIVDASRKFLSQGYKEAGEALRRKQDKEREAAGLAPVQRVGARGAAARGGQRGGGPNRGGGGGRGGPPRTINTGMDKNLYVHLLSHLQKKALLPVVVFTLSKKRCEENASTLTNANLCNAVERSEVHVAIEKAISRLKGTDKKLPQIARMRDLLSRGIGVHHGGLLPIVKEVRSMSFLPLLWVVEILFARGLVKILFATETFAMGVNMPAKCVVFSGIRKHDGKSFRDILPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVIIVTQNELPEQTALQHMMLGVPAKLSSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENASQRLLPDQQKKVVEHEKTLSAMPTLDCDICLTDIEEFYDTSEAVISYNQAMLLFAASSPTNANLFASGRVIILRDSKYRTNNAALLLKPDLTQPTSSGRMFFALVLVNGSHTGPTKVKDELPVPPLWPPTPNSVAVENATYELTSVSITSIALLTQRIIKANGVEPLEIIDRHRISHMKEAINQLRELVDGWIRAGSIPEVDWNRLRALDFQESMRTRNDLASRCKDTECTCKGCPQFAEHYHILHAQKVLKANIAMLKMAISDQNLELIPDYEQRIEVLKELQFIDENSTVLLKGRVACEINSVNELVLTELILENTLAAYEPEEVVALLSCFVFQEKTDSEPVIPPKLAEGRDAIIAISDRVGRVQDRNKVAAEEFRSNLKFGLMEVVYEWAKGMPFEQITSLTDVAEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDADLFKKMEEAQLKIKRDIVFAASLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.26
4 0.3
5 0.27
6 0.27
7 0.27
8 0.31
9 0.3
10 0.28
11 0.25
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.19
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.15
21 0.15
22 0.14
23 0.17
24 0.22
25 0.25
26 0.27
27 0.29
28 0.27
29 0.27
30 0.27
31 0.26
32 0.3
33 0.27
34 0.25
35 0.26
36 0.32
37 0.36
38 0.35
39 0.38
40 0.37
41 0.42
42 0.44
43 0.43
44 0.41
45 0.38
46 0.4
47 0.42
48 0.41
49 0.38
50 0.38
51 0.36
52 0.35
53 0.38
54 0.39
55 0.32
56 0.3
57 0.27
58 0.24
59 0.26
60 0.23
61 0.23
62 0.21
63 0.22
64 0.26
65 0.28
66 0.32
67 0.31
68 0.32
69 0.28
70 0.32
71 0.33
72 0.27
73 0.28
74 0.25
75 0.26
76 0.27
77 0.28
78 0.25
79 0.24
80 0.23
81 0.21
82 0.23
83 0.24
84 0.21
85 0.19
86 0.22
87 0.26
88 0.31
89 0.33
90 0.34
91 0.34
92 0.34
93 0.35
94 0.32
95 0.29
96 0.26
97 0.26
98 0.22
99 0.23
100 0.23
101 0.21
102 0.23
103 0.2
104 0.18
105 0.15
106 0.17
107 0.16
108 0.17
109 0.19
110 0.22
111 0.24
112 0.29
113 0.32
114 0.31
115 0.34
116 0.33
117 0.35
118 0.39
119 0.41
120 0.39
121 0.38
122 0.42
123 0.36
124 0.37
125 0.33
126 0.24
127 0.2
128 0.17
129 0.15
130 0.09
131 0.1
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.1
141 0.12
142 0.13
143 0.15
144 0.17
145 0.2
146 0.2
147 0.2
148 0.21
149 0.24
150 0.27
151 0.29
152 0.29
153 0.27
154 0.29
155 0.31
156 0.29
157 0.25
158 0.24
159 0.2
160 0.19
161 0.2
162 0.19
163 0.2
164 0.19
165 0.2
166 0.17
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.11
171 0.07
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.08
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.15
191 0.17
192 0.18
193 0.17
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.16
198 0.13
199 0.14
200 0.18
201 0.21
202 0.23
203 0.31
204 0.39
205 0.49
206 0.59
207 0.67
208 0.71
209 0.77
210 0.82
211 0.77
212 0.77
213 0.75
214 0.75
215 0.72
216 0.74
217 0.76
218 0.78
219 0.86
220 0.86
221 0.88
222 0.85
223 0.81
224 0.81
225 0.8
226 0.78
227 0.79
228 0.74
229 0.71
230 0.66
231 0.67
232 0.62
233 0.53
234 0.47
235 0.41
236 0.37
237 0.35
238 0.37
239 0.33
240 0.3
241 0.28
242 0.26
243 0.25
244 0.29
245 0.24
246 0.2
247 0.24
248 0.23
249 0.23
250 0.24
251 0.23
252 0.2
253 0.21
254 0.21
255 0.15
256 0.17
257 0.18
258 0.17
259 0.17
260 0.18
261 0.19
262 0.24
263 0.26
264 0.25
265 0.24
266 0.23
267 0.22
268 0.22
269 0.21
270 0.16
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.08
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.13
306 0.14
307 0.18
308 0.2
309 0.21
310 0.21
311 0.23
312 0.23
313 0.26
314 0.35
315 0.36
316 0.44
317 0.45
318 0.51
319 0.55
320 0.56
321 0.62
322 0.53
323 0.47
324 0.47
325 0.48
326 0.42
327 0.41
328 0.41
329 0.3
330 0.29
331 0.26
332 0.17
333 0.13
334 0.11
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.15
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.11
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.07
374 0.06
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.07
381 0.1
382 0.1
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.07
390 0.07
391 0.09
392 0.12
393 0.12
394 0.13
395 0.15
396 0.21
397 0.23
398 0.23
399 0.22
400 0.2
401 0.2
402 0.21
403 0.21
404 0.15
405 0.13
406 0.13
407 0.11
408 0.11
409 0.09
410 0.07
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.11
433 0.15
434 0.15
435 0.21
436 0.29
437 0.32
438 0.35
439 0.38
440 0.4
441 0.39
442 0.44
443 0.4
444 0.37
445 0.39
446 0.41
447 0.4
448 0.39
449 0.36
450 0.31
451 0.3
452 0.24
453 0.21
454 0.2
455 0.19
456 0.17
457 0.16
458 0.18
459 0.17
460 0.17
461 0.17
462 0.14
463 0.13
464 0.12
465 0.13
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.2
471 0.2
472 0.24
473 0.24
474 0.23
475 0.23
476 0.24
477 0.28
478 0.22
479 0.25
480 0.23
481 0.23
482 0.22
483 0.24
484 0.22
485 0.23
486 0.24
487 0.23
488 0.28
489 0.29
490 0.32
491 0.37
492 0.44
493 0.43
494 0.46
495 0.46
496 0.4
497 0.39
498 0.38
499 0.31
500 0.26
501 0.21
502 0.16
503 0.13
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.1
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.14
520 0.15
521 0.18
522 0.17
523 0.17
524 0.17
525 0.17
526 0.17
527 0.11
528 0.12
529 0.1
530 0.13
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.16
535 0.18
536 0.19
537 0.19
538 0.17
539 0.19
540 0.23
541 0.23
542 0.23
543 0.22
544 0.2
545 0.18
546 0.18
547 0.12
548 0.09
549 0.1
550 0.14
551 0.15
552 0.21
553 0.21
554 0.21
555 0.22
556 0.22
557 0.24
558 0.22
559 0.21
560 0.14
561 0.14
562 0.15
563 0.14
564 0.14
565 0.11
566 0.16
567 0.17
568 0.2
569 0.21
570 0.22
571 0.24
572 0.29
573 0.32
574 0.3
575 0.35
576 0.33
577 0.33
578 0.31
579 0.29
580 0.25
581 0.22
582 0.14
583 0.09
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.09
588 0.08
589 0.09
590 0.12
591 0.13
592 0.13
593 0.12
594 0.15
595 0.13
596 0.13
597 0.14
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.11
602 0.08
603 0.1
604 0.15
605 0.22
606 0.25
607 0.32
608 0.34
609 0.38
610 0.43
611 0.42
612 0.43
613 0.44
614 0.44
615 0.39
616 0.38
617 0.35
618 0.31
619 0.31
620 0.25
621 0.17
622 0.14
623 0.11
624 0.1
625 0.09
626 0.08
627 0.07
628 0.06
629 0.06
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.06
639 0.07
640 0.09
641 0.1
642 0.1
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.13
647 0.12
648 0.09
649 0.08
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.05
664 0.05
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.07
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.09
681 0.09
682 0.12
683 0.19
684 0.23
685 0.28
686 0.29
687 0.3
688 0.34
689 0.37
690 0.37
691 0.37
692 0.37
693 0.33
694 0.36
695 0.35
696 0.31
697 0.29
698 0.27
699 0.21
700 0.17
701 0.17
702 0.12
703 0.13
704 0.11
705 0.08
706 0.09
707 0.1
708 0.1
709 0.11
710 0.12
711 0.13
712 0.14
713 0.14
714 0.13
715 0.12
716 0.13
717 0.11
718 0.1
719 0.09
720 0.09
721 0.08
722 0.09
723 0.08
724 0.07
725 0.07
726 0.08
727 0.08
728 0.07
729 0.06
730 0.06
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.06
737 0.07
738 0.07
739 0.05
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.08
744 0.09
745 0.1
746 0.12
747 0.14
748 0.15
749 0.2
750 0.21
751 0.22
752 0.23
753 0.22
754 0.2
755 0.19
756 0.18
757 0.13
758 0.12
759 0.09
760 0.07
761 0.06
762 0.05
763 0.06
764 0.06
765 0.06
766 0.08
767 0.1
768 0.13
769 0.14
770 0.14
771 0.14
772 0.15
773 0.17
774 0.17
775 0.22
776 0.25
777 0.28
778 0.31
779 0.3
780 0.29
781 0.3
782 0.34
783 0.33
784 0.36
785 0.35
786 0.38
787 0.41
788 0.42
789 0.45
790 0.48
791 0.43
792 0.38
793 0.37
794 0.33
795 0.31
796 0.3
797 0.24
798 0.16
799 0.15
800 0.12
801 0.11
802 0.11
803 0.1
804 0.09
805 0.09
806 0.09
807 0.08
808 0.09
809 0.08
810 0.07
811 0.07
812 0.08
813 0.08
814 0.07
815 0.07
816 0.08
817 0.07
818 0.06
819 0.07
820 0.06
821 0.05
822 0.06
823 0.06
824 0.05
825 0.06
826 0.06
827 0.05
828 0.05
829 0.05
830 0.05
831 0.05
832 0.04
833 0.05
834 0.05
835 0.06
836 0.06
837 0.07
838 0.07
839 0.07
840 0.08
841 0.08
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.09
846 0.08
847 0.09
848 0.09
849 0.09
850 0.13
851 0.15
852 0.17
853 0.21
854 0.27
855 0.31
856 0.34
857 0.37
858 0.36
859 0.35
860 0.35
861 0.36
862 0.31
863 0.3
864 0.27
865 0.24
866 0.21
867 0.2
868 0.18
869 0.15
870 0.16
871 0.14
872 0.18
873 0.21
874 0.21
875 0.21
876 0.19
877 0.18
878 0.18
879 0.17
880 0.13
881 0.1
882 0.09
883 0.09
884 0.08
885 0.08
886 0.08
887 0.08
888 0.08
889 0.08
890 0.1
891 0.11
892 0.14
893 0.16
894 0.17
895 0.19
896 0.22
897 0.24
898 0.26
899 0.29
900 0.28
901 0.26
902 0.27
903 0.28
904 0.25
905 0.25
906 0.22
907 0.24
908 0.26
909 0.27
910 0.26
911 0.24
912 0.25
913 0.23
914 0.22
915 0.16
916 0.14
917 0.12
918 0.1
919 0.08
920 0.07
921 0.06
922 0.06
923 0.05
924 0.05
925 0.05
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.05
930 0.06
931 0.06
932 0.07
933 0.1
934 0.11
935 0.13
936 0.14
937 0.15
938 0.16
939 0.18
940 0.22
941 0.2
942 0.19
943 0.17
944 0.18
945 0.19
946 0.17
947 0.16
948 0.18
949 0.17
950 0.18
951 0.22
952 0.23
953 0.24
954 0.33
955 0.38
956 0.35
957 0.39
958 0.47
959 0.51
960 0.5
961 0.47
962 0.39
963 0.32
964 0.29
965 0.25
966 0.18
967 0.13
968 0.11
969 0.11
970 0.11
971 0.11
972 0.1
973 0.1
974 0.09
975 0.07
976 0.07
977 0.13
978 0.15
979 0.18
980 0.2
981 0.2
982 0.21
983 0.21
984 0.22
985 0.21
986 0.24
987 0.27
988 0.26
989 0.26
990 0.33
991 0.33
992 0.35
993 0.33
994 0.29
995 0.24
996 0.28
997 0.33
998 0.32
999 0.39
1000 0.45
1001 0.49
1002 0.49
1003 0.5
1004 0.48
1005 0.46
1006 0.49
1007 0.47
1008 0.45
1009 0.41
1010 0.46
1011 0.47
1012 0.48
1013 0.46
1014 0.41
1015 0.43
1016 0.41
1017 0.47
1018 0.4
1019 0.39
1020 0.36
1021 0.4
1022 0.36
1023 0.3
1024 0.3
1025 0.25
1026 0.27
1027 0.31
1028 0.3
1029 0.27
1030 0.26
1031 0.27
1032 0.27
1033 0.25
1034 0.22
1035 0.17
1036 0.16
1037 0.14
1038 0.14
1039 0.13
1040 0.09
1041 0.1
1042 0.1
1043 0.12
1044 0.12
1045 0.12
1046 0.12
1047 0.11
1048 0.12
1049 0.13
1050 0.15
1051 0.14
1052 0.14
1053 0.14
1054 0.16
1055 0.16
1056 0.16
1057 0.18
1058 0.17
1059 0.19
1060 0.2
1061 0.2
1062 0.19
1063 0.19
1064 0.23
1065 0.19
1066 0.18
1067 0.15
1068 0.15
1069 0.14
1070 0.14
1071 0.15
1072 0.11
1073 0.13
1074 0.14
1075 0.18
1076 0.19
1077 0.19
1078 0.23
1079 0.25
1080 0.25
1081 0.24
1082 0.23
1083 0.18
1084 0.17
1085 0.17
1086 0.12
1087 0.09
1088 0.07
1089 0.07
1090 0.07
1091 0.07
1092 0.07
1093 0.06
1094 0.05
1095 0.05
1096 0.05
1097 0.05
1098 0.05
1099 0.06
1100 0.07
1101 0.07
1102 0.07
1103 0.07
1104 0.07
1105 0.07
1106 0.08
1107 0.07
1108 0.06
1109 0.06
1110 0.06
1111 0.06
1112 0.07
1113 0.07
1114 0.07
1115 0.13
1116 0.14
1117 0.18
1118 0.21
1119 0.22
1120 0.23
1121 0.28
1122 0.33
1123 0.32
1124 0.3
1125 0.27
1126 0.29
1127 0.34
1128 0.33
1129 0.29
1130 0.27
1131 0.23
1132 0.25
1133 0.25
1134 0.19
1135 0.15
1136 0.15
1137 0.13
1138 0.12
1139 0.12
1140 0.11
1141 0.12
1142 0.14
1143 0.15
1144 0.23
1145 0.3
1146 0.37
1147 0.41
1148 0.44
1149 0.45
1150 0.45
1151 0.45
1152 0.44
1153 0.42
1154 0.4
1155 0.36
1156 0.4
1157 0.4
1158 0.38
1159 0.36
1160 0.3
1161 0.24
1162 0.18
1163 0.24
1164 0.17
1165 0.16
1166 0.15
1167 0.19
1168 0.18
1169 0.17
1170 0.17
1171 0.11
1172 0.11
1173 0.11
1174 0.11
1175 0.13
1176 0.14
1177 0.15
1178 0.16
1179 0.17
1180 0.19
1181 0.23
1182 0.22
1183 0.16
1184 0.16
1185 0.15
1186 0.13
1187 0.13
1188 0.1
1189 0.07
1190 0.09
1191 0.09
1192 0.09
1193 0.1
1194 0.1
1195 0.11
1196 0.16
1197 0.17
1198 0.19
1199 0.24
1200 0.3
1201 0.34
1202 0.36
1203 0.37
1204 0.35
1205 0.34
1206 0.38
1207 0.37
1208 0.33
1209 0.3
1210 0.28
1211 0.26
1212 0.25
1213 0.24
1214 0.18
1215 0.16
1216 0.17
1217 0.16
1218 0.15
1219 0.16
1220 0.15
1221 0.21
1222 0.24
1223 0.27
1224 0.34
1225 0.43
1226 0.48
1227 0.49
1228 0.54
1229 0.48
1230 0.45
1231 0.44
1232 0.37
1233 0.32