Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C1E305

Protein Details
Accession A0A0C1E305    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
399-420LDSPPYFERKKNQYANKPVDDFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, cyto_nucl 7.5, nucl 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024535  Pectate_lyase_SF_prot  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
IPR039279  QRT3-like  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12708  Pectate_lyase_3  
Amino Acid Sequences MTKLNKDRLENYSRRSNAGAKLAKQRRESSISPLLNITSVISHAAALVAEADMATSLADCSITLSRRADGNFWTEGIRRQGTVPWGSDANYKVFRNVVTDYHADPTGASDSTAAIQAAINDGQRCGERCNGSTLKSAIVYFPPGTYLVSSTIRANNWPTIRAASSFVGLGVLSTNEYVGGTGPDGGDAEYYVNTARFYSQIRNLRIDIISTDPNAYVCAIHYQVAQATSLQDMELIATTGTTQQGIFSENGSGGIMSDVTFRGGNFGFCEIQLLTIICSKHTFTNSFGWMVAISNLVGYPDYLGLGMGLSLRIQGGDVGICLVNPDGNGNIGSVSFVDSQITGVTTAIIVSPISSSPGSGTTGLILDNTRIGGPIVDTAGSSVPYSREQSLLGGRVDGLDSPPYFERKKNQYANKPVDDFVQLKTLGARGDGVSDDTAAIQRAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.56
3 0.54
4 0.5
5 0.54
6 0.54
7 0.5
8 0.59
9 0.64
10 0.67
11 0.68
12 0.67
13 0.64
14 0.65
15 0.61
16 0.58
17 0.6
18 0.54
19 0.49
20 0.45
21 0.38
22 0.31
23 0.29
24 0.21
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.05
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.03
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.07
48 0.11
49 0.13
50 0.17
51 0.19
52 0.2
53 0.24
54 0.25
55 0.25
56 0.23
57 0.26
58 0.23
59 0.22
60 0.23
61 0.21
62 0.25
63 0.29
64 0.27
65 0.24
66 0.24
67 0.27
68 0.3
69 0.32
70 0.29
71 0.25
72 0.25
73 0.25
74 0.28
75 0.26
76 0.26
77 0.28
78 0.27
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.25
83 0.25
84 0.22
85 0.2
86 0.22
87 0.23
88 0.24
89 0.23
90 0.2
91 0.17
92 0.17
93 0.15
94 0.13
95 0.11
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.11
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.14
112 0.15
113 0.19
114 0.2
115 0.21
116 0.29
117 0.3
118 0.31
119 0.33
120 0.31
121 0.27
122 0.25
123 0.24
124 0.18
125 0.17
126 0.17
127 0.14
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.14
137 0.15
138 0.17
139 0.18
140 0.19
141 0.21
142 0.23
143 0.23
144 0.23
145 0.22
146 0.2
147 0.21
148 0.2
149 0.2
150 0.15
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.1
155 0.09
156 0.07
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.09
185 0.13
186 0.2
187 0.27
188 0.3
189 0.32
190 0.32
191 0.33
192 0.31
193 0.27
194 0.21
195 0.16
196 0.15
197 0.12
198 0.12
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.07
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.17
269 0.18
270 0.17
271 0.23
272 0.24
273 0.23
274 0.22
275 0.19
276 0.17
277 0.15
278 0.13
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.11
371 0.14
372 0.18
373 0.18
374 0.18
375 0.18
376 0.22
377 0.25
378 0.27
379 0.24
380 0.22
381 0.2
382 0.2
383 0.2
384 0.17
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.17
389 0.2
390 0.25
391 0.27
392 0.31
393 0.39
394 0.44
395 0.54
396 0.6
397 0.68
398 0.73
399 0.81
400 0.86
401 0.84
402 0.78
403 0.69
404 0.62
405 0.56
406 0.47
407 0.39
408 0.35
409 0.27
410 0.24
411 0.25
412 0.24
413 0.19
414 0.18
415 0.18
416 0.12
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.14
421 0.14
422 0.13
423 0.12
424 0.13