Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061HKU5

Protein Details
Accession A0A061HKU5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-282FLQVRIKRHRWHKKILKTNDPLHydrophilic
575-609NAEKREEREKREKQEYWSKEGKKRKPESGPDGGAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
554-612NSKRQAAKEAHRAVYRKKLAENAEKREEREKREKQEYWSKEGKKRKPESGPDGGAKRRR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 8.5, cyto_mito 7.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039761  Bms1/Tsr1  
IPR007034  BMS1_TSR1_C  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:2000232  P:regulation of rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04950  RIBIOP_C  
Amino Acid Sequences MSSVQRYHAKKRLLCSKDLSKLIYNESLSPSEVSRRWRGEFEEEKESNSDLPEQDDEDVFFSKAELKSLDTNEDRAIPIISYEELEAKWSDATNLDALRRRFTATDLLQHEQSNGESDDEGDGEFHDLEADGEGKHDNLDVEREKNARRKEELKLRFEAEDEEGLNNDNAISRRNGVEDEEFGEDDWYDAQKAQIQKQLSINKAEFEILDDSQRVNIEGFRAGQYAKIIIGGVASELVTMFDPKTPLIVGGLSATEDRFGFLQVRIKRHRWHKKILKTNDPLIFSLGWRRFQTLPVYSISDSRVRNRMLKYTPEHMHCFGTFYGPLIAPNTGFCCFQSFSSKSPGFRISASGTVLHVDEVSEIVKKLKLTGTPYKIFKNTAFIKDMFTSSVEIAKFEGAAIKTVSGVRGQIKKALSKPEGHFRATFEDKILMSDIVFLRTWYPVKPHRYFNPVTNLIGWNGMRLTGQIRKDEGLPTPQLRDSQYKPIERVKRVFNPLRVPKTLAAELPYKSQIVQMQKQRRETYMQKRAVVLGGEEKSARDLMQKLMTLRQEKNSKRQAAKEAHRAVYRKKLAENAEKREEREKREKQEYWSKEGKKRKPESGPDGGAKRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.68
4 0.67
5 0.67
6 0.62
7 0.57
8 0.56
9 0.55
10 0.53
11 0.45
12 0.39
13 0.39
14 0.36
15 0.31
16 0.3
17 0.26
18 0.27
19 0.29
20 0.33
21 0.37
22 0.41
23 0.43
24 0.46
25 0.49
26 0.52
27 0.57
28 0.56
29 0.57
30 0.52
31 0.51
32 0.49
33 0.45
34 0.37
35 0.29
36 0.28
37 0.19
38 0.22
39 0.21
40 0.2
41 0.21
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.18
46 0.15
47 0.13
48 0.12
49 0.17
50 0.17
51 0.18
52 0.17
53 0.19
54 0.25
55 0.27
56 0.34
57 0.29
58 0.31
59 0.3
60 0.31
61 0.28
62 0.23
63 0.22
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.13
80 0.14
81 0.16
82 0.2
83 0.25
84 0.26
85 0.29
86 0.29
87 0.3
88 0.27
89 0.27
90 0.31
91 0.28
92 0.35
93 0.36
94 0.38
95 0.38
96 0.38
97 0.36
98 0.28
99 0.26
100 0.21
101 0.16
102 0.14
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.14
127 0.16
128 0.18
129 0.22
130 0.25
131 0.31
132 0.38
133 0.44
134 0.44
135 0.47
136 0.5
137 0.55
138 0.62
139 0.66
140 0.63
141 0.61
142 0.57
143 0.52
144 0.47
145 0.4
146 0.32
147 0.25
148 0.21
149 0.17
150 0.14
151 0.15
152 0.14
153 0.11
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.15
170 0.14
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.11
179 0.14
180 0.18
181 0.22
182 0.23
183 0.26
184 0.33
185 0.38
186 0.37
187 0.39
188 0.35
189 0.31
190 0.31
191 0.28
192 0.21
193 0.17
194 0.17
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.16
250 0.19
251 0.27
252 0.32
253 0.36
254 0.42
255 0.52
256 0.61
257 0.6
258 0.68
259 0.7
260 0.74
261 0.8
262 0.81
263 0.8
264 0.74
265 0.74
266 0.68
267 0.6
268 0.5
269 0.42
270 0.34
271 0.24
272 0.27
273 0.22
274 0.21
275 0.2
276 0.23
277 0.22
278 0.24
279 0.28
280 0.22
281 0.22
282 0.2
283 0.22
284 0.19
285 0.2
286 0.2
287 0.21
288 0.2
289 0.21
290 0.25
291 0.24
292 0.29
293 0.29
294 0.34
295 0.31
296 0.36
297 0.36
298 0.38
299 0.41
300 0.4
301 0.41
302 0.36
303 0.35
304 0.29
305 0.28
306 0.2
307 0.18
308 0.14
309 0.11
310 0.11
311 0.09
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.19
325 0.19
326 0.2
327 0.28
328 0.3
329 0.28
330 0.3
331 0.31
332 0.25
333 0.24
334 0.25
335 0.19
336 0.19
337 0.19
338 0.16
339 0.14
340 0.13
341 0.13
342 0.1
343 0.08
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.08
352 0.08
353 0.1
354 0.12
355 0.14
356 0.2
357 0.29
358 0.34
359 0.38
360 0.41
361 0.43
362 0.42
363 0.42
364 0.36
365 0.36
366 0.34
367 0.33
368 0.33
369 0.3
370 0.31
371 0.3
372 0.3
373 0.22
374 0.18
375 0.16
376 0.13
377 0.16
378 0.13
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.09
384 0.12
385 0.08
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.08
393 0.1
394 0.15
395 0.19
396 0.2
397 0.24
398 0.26
399 0.3
400 0.34
401 0.4
402 0.38
403 0.4
404 0.43
405 0.48
406 0.5
407 0.47
408 0.44
409 0.38
410 0.42
411 0.38
412 0.36
413 0.27
414 0.26
415 0.23
416 0.23
417 0.22
418 0.15
419 0.11
420 0.15
421 0.14
422 0.13
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.15
427 0.16
428 0.13
429 0.19
430 0.25
431 0.34
432 0.38
433 0.44
434 0.48
435 0.54
436 0.55
437 0.55
438 0.57
439 0.51
440 0.47
441 0.43
442 0.38
443 0.31
444 0.32
445 0.26
446 0.17
447 0.15
448 0.14
449 0.11
450 0.11
451 0.14
452 0.16
453 0.2
454 0.21
455 0.23
456 0.24
457 0.26
458 0.28
459 0.26
460 0.26
461 0.28
462 0.27
463 0.29
464 0.29
465 0.3
466 0.31
467 0.35
468 0.34
469 0.39
470 0.44
471 0.45
472 0.48
473 0.54
474 0.6
475 0.6
476 0.61
477 0.6
478 0.61
479 0.67
480 0.7
481 0.67
482 0.69
483 0.72
484 0.73
485 0.67
486 0.62
487 0.56
488 0.54
489 0.49
490 0.4
491 0.34
492 0.32
493 0.3
494 0.3
495 0.29
496 0.23
497 0.21
498 0.23
499 0.25
500 0.29
501 0.36
502 0.42
503 0.51
504 0.57
505 0.65
506 0.65
507 0.62
508 0.62
509 0.64
510 0.65
511 0.66
512 0.66
513 0.6
514 0.59
515 0.57
516 0.51
517 0.42
518 0.33
519 0.3
520 0.24
521 0.23
522 0.22
523 0.2
524 0.2
525 0.2
526 0.18
527 0.15
528 0.16
529 0.19
530 0.24
531 0.27
532 0.27
533 0.33
534 0.39
535 0.41
536 0.43
537 0.47
538 0.52
539 0.56
540 0.64
541 0.68
542 0.7
543 0.7
544 0.74
545 0.74
546 0.75
547 0.78
548 0.78
549 0.76
550 0.73
551 0.73
552 0.7
553 0.67
554 0.67
555 0.66
556 0.6
557 0.56
558 0.57
559 0.59
560 0.66
561 0.68
562 0.66
563 0.69
564 0.68
565 0.68
566 0.71
567 0.69
568 0.67
569 0.69
570 0.7
571 0.7
572 0.77
573 0.78
574 0.77
575 0.8
576 0.77
577 0.74
578 0.75
579 0.74
580 0.73
581 0.78
582 0.79
583 0.79
584 0.81
585 0.83
586 0.83
587 0.85
588 0.84
589 0.84
590 0.82
591 0.79
592 0.78