Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061HDJ3

Protein Details
Accession A0A061HDJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-28HSSGRIESRPFKRKRPSTDQELSKRVRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030692  C:Noc4p-Nop14p complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Amino Acid Sequences MHSSGRIESRPFKRKRPSTDQELSKRVRSDSSEIQTEDEQDRILLLERDILASKKNYNSIATLIQIFGSTERDLDSALLAAVSLCRIFTRLLVTGSMSKQQKISEKATVVVKWLKDQYLKYKKILTHLLSDDELSSTALNICMKLLKTEGQNSSTSTDYEFPTPSLHAVVRVLVNTGEFNNVRNEFAQNYVDVYDDIRFYTFEAIEKILKGEPEQLHSKIVVENCLEILTSVQSVPESNEELKSFYISKPPNATHALYSLTQHKKRSQATWLALMRLGVDKNQRKIILKLMADSIAPWFNKPELLMDFLTDCYDAGGSTSLLALSGVFYLIQQKNLDYPFIDQIFFGFLTLFWDQLIYLHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.83
3 0.84
4 0.82
5 0.82
6 0.86
7 0.86
8 0.84
9 0.84
10 0.79
11 0.74
12 0.68
13 0.6
14 0.55
15 0.5
16 0.48
17 0.48
18 0.49
19 0.49
20 0.46
21 0.47
22 0.43
23 0.42
24 0.36
25 0.28
26 0.22
27 0.15
28 0.15
29 0.13
30 0.14
31 0.12
32 0.1
33 0.13
34 0.14
35 0.15
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.2
40 0.25
41 0.25
42 0.29
43 0.29
44 0.29
45 0.3
46 0.3
47 0.29
48 0.26
49 0.23
50 0.19
51 0.16
52 0.15
53 0.13
54 0.11
55 0.12
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.06
74 0.06
75 0.08
76 0.11
77 0.13
78 0.14
79 0.15
80 0.16
81 0.19
82 0.2
83 0.26
84 0.24
85 0.23
86 0.24
87 0.27
88 0.32
89 0.34
90 0.37
91 0.35
92 0.35
93 0.37
94 0.39
95 0.36
96 0.33
97 0.31
98 0.27
99 0.25
100 0.26
101 0.26
102 0.26
103 0.29
104 0.36
105 0.42
106 0.45
107 0.44
108 0.47
109 0.46
110 0.48
111 0.52
112 0.44
113 0.39
114 0.38
115 0.38
116 0.32
117 0.31
118 0.25
119 0.18
120 0.16
121 0.1
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.12
134 0.14
135 0.2
136 0.22
137 0.22
138 0.23
139 0.23
140 0.24
141 0.22
142 0.2
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.12
173 0.14
174 0.13
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.16
199 0.15
200 0.19
201 0.22
202 0.22
203 0.22
204 0.22
205 0.22
206 0.18
207 0.18
208 0.17
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.08
215 0.08
216 0.05
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.15
231 0.15
232 0.13
233 0.21
234 0.21
235 0.24
236 0.29
237 0.29
238 0.32
239 0.34
240 0.35
241 0.27
242 0.27
243 0.26
244 0.21
245 0.22
246 0.27
247 0.32
248 0.35
249 0.38
250 0.42
251 0.47
252 0.51
253 0.53
254 0.51
255 0.51
256 0.5
257 0.55
258 0.52
259 0.45
260 0.41
261 0.37
262 0.3
263 0.24
264 0.21
265 0.16
266 0.24
267 0.29
268 0.33
269 0.38
270 0.41
271 0.41
272 0.43
273 0.47
274 0.45
275 0.39
276 0.37
277 0.34
278 0.31
279 0.28
280 0.26
281 0.21
282 0.18
283 0.17
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.17
288 0.18
289 0.19
290 0.16
291 0.2
292 0.19
293 0.18
294 0.19
295 0.18
296 0.18
297 0.14
298 0.12
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.14
317 0.16
318 0.19
319 0.2
320 0.21
321 0.26
322 0.27
323 0.29
324 0.21
325 0.24
326 0.27
327 0.28
328 0.27
329 0.21
330 0.21
331 0.22
332 0.21
333 0.17
334 0.1
335 0.09
336 0.13
337 0.14
338 0.14
339 0.1
340 0.11
341 0.1