Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061HPJ8

Protein Details
Accession A0A061HPJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-198MKITTSRNPHEKKKQKIIDLNVHydrophilic
575-596DKQFQDRRRMSRSRNRPKHALFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 3, pero 3, cysk 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026847  VPS13  
IPR031645  VPS13_DH-like  
IPR009543  VPS13_VAB  
Gene Ontology GO:0010008  C:endosome membrane  
GO:0005798  C:Golgi-associated vesicle  
GO:0005741  C:mitochondrial outer membrane  
GO:0071561  C:nucleus-vacuole junction  
GO:0005777  C:peroxisome  
GO:0005628  C:prospore membrane  
GO:0005774  C:vacuolar membrane  
GO:1990816  C:vacuole-mitochondrion membrane contact site  
GO:0005543  F:phospholipid binding  
GO:0120014  F:phospholipid transfer activity  
GO:0032120  P:ascospore-type prospore membrane formation  
GO:0048193  P:Golgi vesicle transport  
GO:0045324  P:late endosome to vacuole transport  
GO:0007005  P:mitochondrion organization  
GO:0045053  P:protein retention in Golgi apparatus  
GO:0006623  P:protein targeting to vacuole  
GO:0090083  P:regulation of inclusion body assembly  
GO:0061709  P:reticulophagy  
Pfam View protein in Pfam  
PF06650  SHR-BD  
PF16909  VPS13_C  
Amino Acid Sequences MMEEINFREPGSAQLMSLGPEALLPLHFLQKGTTKQLSLCYPGLNNQWSSPFNISDLGTTHVKLAKTGERQRLIRVEILMENATIFLHISLELKHWPFSIRNESDTEFLFYQANPNINEEDSDDRSSWHPIRYRLPPRSIMPYAWDYPAAKDKKLIFNADGKERHIRLTEIGNLIPMKITTSRNPHEKKKQKIIDLNVAADGPTQTLILSNFKASKSLYKQNPRSESTTSAAGGFEVKGQNTFVSFHAQLKLAGVGISLINAQLKELAYITMRDISLKYSESLLYQTITGSIKWIQVDNQLYGGIFPMIFYPSVVPKNNRETEPLPSVHIMVTRVKDDSYGVLYIKYATVLLQQMTLEIDEDFVYALLEFSKAPGAEWSEPSNVVLCDESLDIPEPTQDQSGNQIYFELLNIQPMQLDLSFVRTDRVNVEDKTSSRNPLMFFLNVLTMAIGNINDAPVRLNALIIENGRVSASVLVQRMSNHYSQEVLYQVHKILGSADFLGNPVGLFNNLSSGVADIFYEPYYGFIMADRPEDLGIGIAKGATSFLKKSVFGVSDSVSKFTGSIAKGLAEATMDKQFQDRRRMSRSRNRPKHALFGVTAGANSFVSSLASGVGGLARKPLEGAEQEGFAGFFKGVGKGALGFVTKPAIGIFDLASNVSEGIRNTTTVFDAEGLERVRLTRFIGSDGIVRPYSQREALGQFWLKQLDSGKYFNEQYIAHLELPREDVVVMLTYSRIMLIKSKKLTSEWDIPLKDIQTISKERTGLSLILRGELNGPFVPVTEESSRNFLYSKVGVAVEEFNQKYKAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.2
4 0.2
5 0.17
6 0.11
7 0.11
8 0.11
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.15
14 0.17
15 0.17
16 0.19
17 0.26
18 0.31
19 0.36
20 0.38
21 0.35
22 0.36
23 0.42
24 0.43
25 0.41
26 0.38
27 0.34
28 0.32
29 0.35
30 0.4
31 0.38
32 0.35
33 0.32
34 0.36
35 0.33
36 0.36
37 0.35
38 0.29
39 0.26
40 0.27
41 0.25
42 0.21
43 0.22
44 0.21
45 0.19
46 0.19
47 0.21
48 0.22
49 0.22
50 0.22
51 0.25
52 0.29
53 0.37
54 0.46
55 0.52
56 0.56
57 0.58
58 0.63
59 0.64
60 0.59
61 0.53
62 0.45
63 0.39
64 0.33
65 0.34
66 0.28
67 0.22
68 0.18
69 0.15
70 0.13
71 0.1
72 0.09
73 0.06
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.11
79 0.16
80 0.17
81 0.19
82 0.19
83 0.22
84 0.24
85 0.3
86 0.38
87 0.36
88 0.37
89 0.4
90 0.4
91 0.39
92 0.37
93 0.35
94 0.25
95 0.23
96 0.21
97 0.17
98 0.21
99 0.23
100 0.25
101 0.21
102 0.23
103 0.24
104 0.23
105 0.24
106 0.21
107 0.23
108 0.23
109 0.25
110 0.22
111 0.22
112 0.24
113 0.3
114 0.3
115 0.31
116 0.33
117 0.36
118 0.43
119 0.51
120 0.6
121 0.61
122 0.64
123 0.63
124 0.62
125 0.65
126 0.6
127 0.51
128 0.46
129 0.43
130 0.4
131 0.35
132 0.34
133 0.26
134 0.27
135 0.35
136 0.33
137 0.28
138 0.31
139 0.35
140 0.41
141 0.45
142 0.45
143 0.39
144 0.44
145 0.48
146 0.5
147 0.47
148 0.42
149 0.45
150 0.42
151 0.42
152 0.37
153 0.33
154 0.27
155 0.3
156 0.32
157 0.27
158 0.26
159 0.25
160 0.24
161 0.22
162 0.2
163 0.16
164 0.13
165 0.14
166 0.17
167 0.21
168 0.29
169 0.35
170 0.45
171 0.51
172 0.59
173 0.66
174 0.72
175 0.76
176 0.78
177 0.8
178 0.79
179 0.81
180 0.78
181 0.77
182 0.7
183 0.62
184 0.51
185 0.44
186 0.34
187 0.27
188 0.2
189 0.1
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.07
194 0.08
195 0.11
196 0.11
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.18
201 0.18
202 0.24
203 0.28
204 0.37
205 0.44
206 0.52
207 0.6
208 0.67
209 0.72
210 0.68
211 0.66
212 0.6
213 0.55
214 0.47
215 0.41
216 0.32
217 0.26
218 0.22
219 0.18
220 0.15
221 0.11
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.11
231 0.15
232 0.16
233 0.17
234 0.19
235 0.19
236 0.18
237 0.18
238 0.17
239 0.12
240 0.1
241 0.08
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.17
284 0.19
285 0.18
286 0.17
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.08
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.1
300 0.15
301 0.17
302 0.19
303 0.24
304 0.32
305 0.36
306 0.36
307 0.37
308 0.35
309 0.37
310 0.39
311 0.35
312 0.28
313 0.25
314 0.24
315 0.2
316 0.19
317 0.16
318 0.14
319 0.15
320 0.14
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.06
335 0.05
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.06
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.1
363 0.11
364 0.13
365 0.15
366 0.14
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.11
371 0.1
372 0.08
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.11
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.09
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.05
404 0.06
405 0.05
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.1
410 0.09
411 0.1
412 0.1
413 0.13
414 0.14
415 0.14
416 0.18
417 0.19
418 0.2
419 0.25
420 0.26
421 0.25
422 0.22
423 0.24
424 0.21
425 0.21
426 0.23
427 0.17
428 0.15
429 0.14
430 0.13
431 0.11
432 0.1
433 0.07
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.03
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.09
451 0.08
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.07
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.14
466 0.16
467 0.16
468 0.14
469 0.14
470 0.15
471 0.14
472 0.15
473 0.14
474 0.12
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.04
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.06
514 0.08
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.05
530 0.05
531 0.07
532 0.07
533 0.1
534 0.13
535 0.13
536 0.15
537 0.18
538 0.19
539 0.18
540 0.19
541 0.18
542 0.22
543 0.22
544 0.22
545 0.18
546 0.17
547 0.16
548 0.15
549 0.18
550 0.13
551 0.14
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.12
557 0.08
558 0.08
559 0.09
560 0.12
561 0.12
562 0.12
563 0.16
564 0.22
565 0.28
566 0.38
567 0.42
568 0.45
569 0.54
570 0.62
571 0.68
572 0.72
573 0.77
574 0.79
575 0.83
576 0.83
577 0.84
578 0.79
579 0.78
580 0.71
581 0.64
582 0.53
583 0.44
584 0.39
585 0.29
586 0.26
587 0.17
588 0.14
589 0.1
590 0.09
591 0.07
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.04
599 0.04
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.1
608 0.11
609 0.12
610 0.16
611 0.15
612 0.15
613 0.15
614 0.15
615 0.15
616 0.11
617 0.11
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.1
628 0.1
629 0.09
630 0.1
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.09
635 0.09
636 0.08
637 0.09
638 0.09
639 0.08
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.08
644 0.08
645 0.08
646 0.09
647 0.08
648 0.12
649 0.13
650 0.13
651 0.14
652 0.15
653 0.16
654 0.14
655 0.15
656 0.11
657 0.12
658 0.12
659 0.15
660 0.15
661 0.14
662 0.14
663 0.14
664 0.15
665 0.15
666 0.16
667 0.16
668 0.16
669 0.18
670 0.19
671 0.2
672 0.23
673 0.23
674 0.25
675 0.21
676 0.21
677 0.2
678 0.23
679 0.26
680 0.23
681 0.22
682 0.22
683 0.26
684 0.27
685 0.33
686 0.31
687 0.29
688 0.31
689 0.31
690 0.28
691 0.26
692 0.28
693 0.27
694 0.28
695 0.29
696 0.27
697 0.3
698 0.32
699 0.3
700 0.29
701 0.23
702 0.22
703 0.25
704 0.26
705 0.23
706 0.25
707 0.24
708 0.23
709 0.26
710 0.23
711 0.19
712 0.15
713 0.13
714 0.12
715 0.13
716 0.11
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.08
723 0.08
724 0.16
725 0.23
726 0.31
727 0.36
728 0.4
729 0.41
730 0.43
731 0.49
732 0.48
733 0.5
734 0.49
735 0.52
736 0.49
737 0.49
738 0.5
739 0.44
740 0.4
741 0.32
742 0.28
743 0.27
744 0.31
745 0.34
746 0.35
747 0.35
748 0.33
749 0.35
750 0.34
751 0.3
752 0.27
753 0.28
754 0.23
755 0.25
756 0.25
757 0.22
758 0.22
759 0.2
760 0.21
761 0.15
762 0.16
763 0.14
764 0.14
765 0.17
766 0.15
767 0.19
768 0.21
769 0.23
770 0.24
771 0.3
772 0.3
773 0.28
774 0.28
775 0.23
776 0.24
777 0.22
778 0.23
779 0.2
780 0.2
781 0.19
782 0.21
783 0.23
784 0.2
785 0.27
786 0.26
787 0.26