Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EFB5

Protein Details
Accession A7EFB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-279PTYKYAPRKPSEKKRRASKKTLTKPTTNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-271KEAHKKAYPTYKYAPRKPSEKKRRASKK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 11.333, cyto_nucl 9.333, mito 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0009653  P:anatomical structure morphogenesis  
GO:0030154  P:cell differentiation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ssl:SS1G_04006  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MSLSTLRLGKWVPHRGTILETPLADVPYPAVDITPVEAYGIPGLSKEIYDAMRTFFNELDLYNALDINPWCELKDSQYLGIGTPERQILLHFYEQHTDRKGVFVRDAYVSRIFLAPLDEFEDKQMLAVAGFTNLCLEPLNVEHRRMMNGSWDENCTILPTNVGVTLCSGSGKKHLSPSLPAALKPKIPRPANEWILYRADNHIPIKKAYPGITNNEISSIIAGMWAAETPERRLKYKIRADLLKEAHKKAYPTYKYAPRKPSEKKRRASKKTLTKPTTNQLSHNINTTTSSISFPIANNNSIDNSDLNTFGLNIHINHSNITEQQLQSENSRLTYNDQSIGMNFTSTESWQMVQQQDLYDFFSPRQITLGATESDNVQICQGSSSDMCWKRTDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.5
4 0.48
5 0.43
6 0.36
7 0.33
8 0.3
9 0.3
10 0.29
11 0.23
12 0.19
13 0.15
14 0.12
15 0.13
16 0.1
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.11
21 0.11
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.08
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.12
36 0.15
37 0.15
38 0.16
39 0.19
40 0.2
41 0.21
42 0.18
43 0.18
44 0.16
45 0.15
46 0.17
47 0.15
48 0.15
49 0.13
50 0.13
51 0.11
52 0.14
53 0.14
54 0.12
55 0.14
56 0.13
57 0.13
58 0.15
59 0.16
60 0.17
61 0.24
62 0.24
63 0.23
64 0.26
65 0.26
66 0.24
67 0.27
68 0.24
69 0.18
70 0.18
71 0.17
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.17
77 0.2
78 0.21
79 0.22
80 0.27
81 0.29
82 0.33
83 0.33
84 0.3
85 0.26
86 0.29
87 0.31
88 0.28
89 0.29
90 0.26
91 0.25
92 0.27
93 0.28
94 0.26
95 0.24
96 0.22
97 0.2
98 0.19
99 0.16
100 0.13
101 0.14
102 0.11
103 0.1
104 0.14
105 0.14
106 0.13
107 0.14
108 0.15
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.07
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.08
126 0.16
127 0.17
128 0.18
129 0.2
130 0.21
131 0.23
132 0.23
133 0.21
134 0.21
135 0.22
136 0.23
137 0.22
138 0.22
139 0.21
140 0.2
141 0.2
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.12
158 0.14
159 0.15
160 0.18
161 0.21
162 0.21
163 0.24
164 0.26
165 0.28
166 0.27
167 0.26
168 0.26
169 0.25
170 0.28
171 0.28
172 0.3
173 0.32
174 0.33
175 0.34
176 0.36
177 0.43
178 0.43
179 0.44
180 0.39
181 0.33
182 0.33
183 0.32
184 0.27
185 0.21
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.2
190 0.19
191 0.2
192 0.21
193 0.21
194 0.22
195 0.2
196 0.23
197 0.22
198 0.26
199 0.29
200 0.28
201 0.25
202 0.24
203 0.23
204 0.17
205 0.14
206 0.1
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.05
216 0.08
217 0.14
218 0.16
219 0.18
220 0.23
221 0.28
222 0.37
223 0.45
224 0.48
225 0.49
226 0.52
227 0.54
228 0.58
229 0.57
230 0.56
231 0.53
232 0.48
233 0.45
234 0.42
235 0.4
236 0.36
237 0.42
238 0.35
239 0.37
240 0.42
241 0.49
242 0.56
243 0.63
244 0.67
245 0.61
246 0.68
247 0.72
248 0.76
249 0.78
250 0.78
251 0.79
252 0.82
253 0.88
254 0.88
255 0.88
256 0.87
257 0.86
258 0.87
259 0.89
260 0.84
261 0.8
262 0.76
263 0.74
264 0.74
265 0.65
266 0.57
267 0.53
268 0.54
269 0.47
270 0.47
271 0.39
272 0.29
273 0.29
274 0.27
275 0.22
276 0.17
277 0.17
278 0.13
279 0.14
280 0.15
281 0.13
282 0.21
283 0.21
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.21
288 0.2
289 0.22
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.12
302 0.16
303 0.16
304 0.17
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.21
309 0.23
310 0.19
311 0.22
312 0.25
313 0.26
314 0.26
315 0.3
316 0.27
317 0.23
318 0.24
319 0.22
320 0.23
321 0.28
322 0.28
323 0.26
324 0.26
325 0.25
326 0.25
327 0.27
328 0.22
329 0.16
330 0.14
331 0.12
332 0.13
333 0.12
334 0.15
335 0.13
336 0.13
337 0.15
338 0.21
339 0.21
340 0.22
341 0.23
342 0.22
343 0.23
344 0.23
345 0.25
346 0.22
347 0.22
348 0.2
349 0.25
350 0.23
351 0.22
352 0.23
353 0.2
354 0.18
355 0.2
356 0.23
357 0.18
358 0.18
359 0.18
360 0.17
361 0.2
362 0.21
363 0.18
364 0.15
365 0.14
366 0.13
367 0.14
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.15
372 0.25
373 0.3
374 0.32