Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EKD0

Protein Details
Accession A7EKD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MVKPLSFKGDKKTKKRKRVDTAEKFGDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-18GDKKTKKRKR
209-228RFKPKLKASKEEKASQKISR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6.5, cyto_mito 6, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008999  Actin-crosslinking  
IPR010414  FRG1  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0051015  F:actin filament binding  
KEGG ssl:SS1G_05777  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06229  FRG1  
Amino Acid Sequences MVKPLSFKGDKKTKKRKRVDTAEKFGDSEASTSQAIAKPQEEEAAQDDDTWVTAEAAGDVVGPVVFVLPSDPPSCIACDTNGKVFASRLENMIENNPTTAEPHDVRQVWVANKVAGTETYSFKGHHGKYLSCDKFGILSANTEAVSPLESFLSIPTADTPGTFQIQTLRDTFLTIKPLATAKENALPEIRGDADSINFNTTIRIRMQARFKPKLKASKEEKASQKISRKELEDAVGRRLDDDEVRKLKRARREGDYHEALLLIKVKNKHDKYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.92
3 0.92
4 0.93
5 0.94
6 0.94
7 0.94
8 0.93
9 0.89
10 0.8
11 0.7
12 0.59
13 0.5
14 0.39
15 0.3
16 0.21
17 0.16
18 0.14
19 0.13
20 0.16
21 0.16
22 0.18
23 0.19
24 0.19
25 0.18
26 0.19
27 0.21
28 0.18
29 0.17
30 0.18
31 0.19
32 0.18
33 0.16
34 0.16
35 0.14
36 0.14
37 0.12
38 0.09
39 0.06
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.05
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.03
50 0.03
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.04
55 0.05
56 0.07
57 0.09
58 0.09
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.19
66 0.21
67 0.22
68 0.24
69 0.23
70 0.22
71 0.22
72 0.23
73 0.21
74 0.2
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.2
80 0.18
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.19
91 0.19
92 0.2
93 0.21
94 0.23
95 0.2
96 0.23
97 0.22
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.14
102 0.11
103 0.12
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.15
110 0.22
111 0.2
112 0.22
113 0.23
114 0.22
115 0.25
116 0.35
117 0.35
118 0.28
119 0.28
120 0.23
121 0.22
122 0.22
123 0.19
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.13
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.15
157 0.17
158 0.19
159 0.15
160 0.18
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.16
168 0.14
169 0.2
170 0.2
171 0.2
172 0.2
173 0.19
174 0.16
175 0.17
176 0.16
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.13
190 0.18
191 0.2
192 0.26
193 0.34
194 0.39
195 0.48
196 0.55
197 0.57
198 0.6
199 0.65
200 0.69
201 0.66
202 0.69
203 0.68
204 0.68
205 0.71
206 0.7
207 0.71
208 0.68
209 0.69
210 0.67
211 0.68
212 0.65
213 0.65
214 0.62
215 0.58
216 0.54
217 0.51
218 0.48
219 0.47
220 0.42
221 0.41
222 0.38
223 0.34
224 0.31
225 0.29
226 0.26
227 0.24
228 0.26
229 0.31
230 0.36
231 0.39
232 0.45
233 0.5
234 0.54
235 0.59
236 0.64
237 0.61
238 0.62
239 0.68
240 0.69
241 0.73
242 0.72
243 0.62
244 0.53
245 0.47
246 0.38
247 0.32
248 0.29
249 0.21
250 0.22
251 0.26
252 0.33
253 0.43