FuNGI

A7F390

Protein Details

Accession

A7F390

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MPKENKHARGRRDTLKRKREEDLER	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-18	KHARGRRDTLKRK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR040000 NOP9 IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0003723 F:RNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
KEGG	ssl:SS1G_11736 -
PROSITE	View protein in PROSITE PS50302 PUM

Amino Acid Sequences

MPKENKHARGRRDTLKRKREEDLEREENHDNLTQDLKRRRSSQDEAVSFIALDNDKTFPSFSAGTGTNAIEVADRPYYGLLEDEEQEYFKRADELLELNNFPSEEERSLFLANVYREARGKELKIACSQSCSRLMERLILLSTAQQKKKLFTQFAGNFPHLVSHRFASHCCEMLFIQSASIVTEELTGAEKKEQKKEAEAKDEEDGEGKEDEITESMESLFLATLDELEGQLSSLLTDRFASHTLRVLLIILSGRPLEKSSTKSLLQSKKKEKIGINGLDTAPTEFSLNKRTVPESFLWAIEKIISDTIASMDRAFIQVLVGHPTGNPCLQLLLELELTNPSSKKGGNSEQKTLISTLLPDDITVEGSQSAIFVNGIVYDQIGSRVLETIMSHAPGKLFKQIYRAIFKDRIAGLARNEIASYVVIRVLNRLSKEDLEEAITEISPQIEGLVTRNRTNIIKVLLERCQARRASTEPLTNSIAAAYGSDKNQLILKMADISLETLTAATAPPPVAIDDDKPAPVTVLPKPSPSQLHGSLLAQAMLKIPGSPSQLIQNSLLSLPTSTILALSLYPTTTHIIQASLLPISA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.88
3	0.88
4	0.82
5	0.81
6	0.8
7	0.79
8	0.76
9	0.75
10	0.73
11	0.67
12	0.67
13	0.62
14	0.53
15	0.46
16	0.41
17	0.32
18	0.25
19	0.3
20	0.28
21	0.35
22	0.43
23	0.47
24	0.51
25	0.56
26	0.61
27	0.63
28	0.67
29	0.68
30	0.69
31	0.64
32	0.61
33	0.56
34	0.49
35	0.4
36	0.33
37	0.26
38	0.16
39	0.15
40	0.13
41	0.13
42	0.13
43	0.14
44	0.15
45	0.12
46	0.16
47	0.16
48	0.14
49	0.18
50	0.19
51	0.2
52	0.22
53	0.21
54	0.17
55	0.16
56	0.16
57	0.12
58	0.11
59	0.12
60	0.11
61	0.11
62	0.11
63	0.11
64	0.12
65	0.11
66	0.11
67	0.1
68	0.11
69	0.12
70	0.13
71	0.13
72	0.14
73	0.14
74	0.16
75	0.14
76	0.13
77	0.13
78	0.12
79	0.13
80	0.15
81	0.17
82	0.19
83	0.22
84	0.22
85	0.21
86	0.21
87	0.2
88	0.17
89	0.17
90	0.16
91	0.14
92	0.15
93	0.17
94	0.17
95	0.18
96	0.18
97	0.17
98	0.19
99	0.17
100	0.22
101	0.21
102	0.21
103	0.22
104	0.23
105	0.27
106	0.27
107	0.28
108	0.31
109	0.35
110	0.37
111	0.4
112	0.44
113	0.39
114	0.4
115	0.41
116	0.37
117	0.38
118	0.37
119	0.33
120	0.33
121	0.33
122	0.31
123	0.3
124	0.27
125	0.22
126	0.19
127	0.18
128	0.17
129	0.25
130	0.29
131	0.31
132	0.35
133	0.36
134	0.39
135	0.46
136	0.5
137	0.45
138	0.39
139	0.47
140	0.46
141	0.51
142	0.53
143	0.46
144	0.38
145	0.35
146	0.37
147	0.27
148	0.25
149	0.2
150	0.17
151	0.2
152	0.21
153	0.22
154	0.24
155	0.25
156	0.25
157	0.23
158	0.23
159	0.19
160	0.2
161	0.22
162	0.16
163	0.13
164	0.11
165	0.11
166	0.1
167	0.1
168	0.08
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.13
177	0.18
178	0.21
179	0.29
180	0.34
181	0.33
182	0.42
183	0.5
184	0.52
185	0.56
186	0.53
187	0.48
188	0.45
189	0.44
190	0.36
191	0.28
192	0.22
193	0.15
194	0.13
195	0.11
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.07
200	0.08
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.08
227	0.1
228	0.11
229	0.11
230	0.14
231	0.15
232	0.14
233	0.14
234	0.12
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.09
245	0.11
246	0.15
247	0.19
248	0.22
249	0.23
250	0.28
251	0.35
252	0.42
253	0.48
254	0.53
255	0.58
256	0.62
257	0.64
258	0.66
259	0.6
260	0.58
261	0.58
262	0.53
263	0.46
264	0.41
265	0.37
266	0.32
267	0.29
268	0.22
269	0.14
270	0.1
271	0.09
272	0.06
273	0.08
274	0.11
275	0.12
276	0.13
277	0.14
278	0.16
279	0.16
280	0.18
281	0.18
282	0.18
283	0.18
284	0.17
285	0.16
286	0.15
287	0.14
288	0.12
289	0.11
290	0.07
291	0.06
292	0.06
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.1
312	0.11
313	0.1
314	0.1
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.09
331	0.11
332	0.15
333	0.24
334	0.32
335	0.36
336	0.4
337	0.43
338	0.43
339	0.42
340	0.37
341	0.29
342	0.2
343	0.16
344	0.13
345	0.1
346	0.09
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.09
351	0.08
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.13
383	0.14
384	0.18
385	0.19
386	0.2
387	0.25
388	0.3
389	0.34
390	0.39
391	0.4
392	0.39
393	0.41
394	0.4
395	0.4
396	0.35
397	0.33
398	0.3
399	0.31
400	0.26
401	0.27
402	0.27
403	0.21
404	0.21
405	0.17
406	0.15
407	0.13
408	0.12
409	0.07
410	0.09
411	0.09
412	0.1
413	0.11
414	0.14
415	0.17
416	0.17
417	0.19
418	0.2
419	0.2
420	0.23
421	0.23
422	0.21
423	0.19
424	0.18
425	0.16
426	0.15
427	0.13
428	0.11
429	0.09
430	0.08
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.08
437	0.16
438	0.18
439	0.2
440	0.21
441	0.24
442	0.24
443	0.26
444	0.27
445	0.23
446	0.24
447	0.27
448	0.3
449	0.32
450	0.35
451	0.37
452	0.35
453	0.39
454	0.36
455	0.35
456	0.34
457	0.33
458	0.37
459	0.38
460	0.42
461	0.37
462	0.4
463	0.4
464	0.36
465	0.33
466	0.25
467	0.2
468	0.13
469	0.12
470	0.11
471	0.11
472	0.12
473	0.15
474	0.15
475	0.15
476	0.18
477	0.18
478	0.18
479	0.16
480	0.16
481	0.16
482	0.16
483	0.15
484	0.13
485	0.13
486	0.11
487	0.11
488	0.09
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.05
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.09
499	0.11
500	0.13
501	0.14
502	0.17
503	0.19
504	0.19
505	0.2
506	0.19
507	0.17
508	0.17
509	0.2
510	0.21
511	0.28
512	0.29
513	0.32
514	0.34
515	0.39
516	0.42
517	0.41
518	0.42
519	0.37
520	0.4
521	0.38
522	0.37
523	0.35
524	0.31
525	0.29
526	0.22
527	0.18
528	0.15
529	0.14
530	0.14
531	0.11
532	0.11
533	0.15
534	0.19
535	0.2
536	0.2
537	0.27
538	0.3
539	0.32
540	0.32
541	0.29
542	0.26
543	0.25
544	0.25
545	0.17
546	0.15
547	0.13
548	0.12
549	0.11
550	0.09
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.1
559	0.12
560	0.15
561	0.15
562	0.17
563	0.16
564	0.16
565	0.16
566	0.18
567	0.18

A7F390

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer