Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EKD6

Protein Details
Accession A7EKD6    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-51VASFVRTRDTKERKKRQHDPNAPKRPLTHydrophilic
184-205TPAPKTPKAKGRKSKGKSEVAEHydrophilic
216-242VPPQKEASPARKRKRSGKKGDEPVATTHydrophilic
247-267ATIETPKSAPKSRKKKTKTDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-39RKKR
186-201APKTPKAKGRKSKGKS
220-235KEASPARKRKRSGKKG
254-264SAPKSRKKKTK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG ssl:SS1G_05783  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARPKKVDDKPKEAADGATLQIDVASFVRTRDTKERKKRQHDPNAPKRPLTPFFLYMQTARPIIAKDLGDVPKGEVSSEGTKRWTDMAPKDKALWQDAYKDNLRLYNARMHSYRRGNLSAKEMSDDAAAAYADENNIGADASADAQLVGEASAGVTATVEEEEDAEGEPEPEAEAEAEVEKSPTPAPKTPKAKGRKSKGKSEVAEEIPAPSSASIVPPQKEASPARKRKRSGKKGDEPVATTEQEEATIETPKSAPKSRKKKTKTDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.44
3 0.37
4 0.29
5 0.22
6 0.18
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.1
11 0.08
12 0.09
13 0.08
14 0.09
15 0.15
16 0.16
17 0.22
18 0.32
19 0.42
20 0.51
21 0.62
22 0.73
23 0.78
24 0.87
25 0.92
26 0.92
27 0.93
28 0.93
29 0.93
30 0.93
31 0.93
32 0.86
33 0.78
34 0.71
35 0.67
36 0.6
37 0.56
38 0.5
39 0.41
40 0.41
41 0.42
42 0.39
43 0.33
44 0.32
45 0.28
46 0.23
47 0.2
48 0.19
49 0.16
50 0.17
51 0.2
52 0.16
53 0.15
54 0.22
55 0.23
56 0.23
57 0.22
58 0.21
59 0.19
60 0.19
61 0.18
62 0.11
63 0.14
64 0.19
65 0.21
66 0.21
67 0.21
68 0.21
69 0.22
70 0.23
71 0.22
72 0.21
73 0.27
74 0.34
75 0.36
76 0.37
77 0.38
78 0.39
79 0.38
80 0.35
81 0.31
82 0.24
83 0.27
84 0.29
85 0.32
86 0.31
87 0.3
88 0.28
89 0.26
90 0.27
91 0.21
92 0.21
93 0.23
94 0.23
95 0.25
96 0.26
97 0.28
98 0.33
99 0.37
100 0.38
101 0.34
102 0.37
103 0.36
104 0.37
105 0.38
106 0.33
107 0.27
108 0.26
109 0.22
110 0.18
111 0.15
112 0.13
113 0.08
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.12
171 0.16
172 0.21
173 0.27
174 0.36
175 0.44
176 0.49
177 0.57
178 0.62
179 0.68
180 0.73
181 0.78
182 0.79
183 0.77
184 0.82
185 0.82
186 0.81
187 0.73
188 0.69
189 0.65
190 0.56
191 0.53
192 0.42
193 0.35
194 0.27
195 0.25
196 0.19
197 0.12
198 0.1
199 0.08
200 0.1
201 0.14
202 0.19
203 0.19
204 0.21
205 0.23
206 0.23
207 0.29
208 0.32
209 0.37
210 0.43
211 0.53
212 0.61
213 0.68
214 0.74
215 0.79
216 0.85
217 0.86
218 0.86
219 0.86
220 0.87
221 0.88
222 0.9
223 0.84
224 0.75
225 0.7
226 0.63
227 0.53
228 0.43
229 0.34
230 0.25
231 0.21
232 0.19
233 0.15
234 0.12
235 0.16
236 0.15
237 0.15
238 0.16
239 0.2
240 0.26
241 0.33
242 0.41
243 0.47
244 0.59
245 0.68
246 0.78
247 0.82