FuNGI

A0A0L1IKH6

Protein Details

Accession

A0A0L1IKH6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-37	MTARNRTTSTSLPRKRRRPAKSCEQCRERKVRCDLQL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-19	RKRRRP

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000690 Matrin/U1-C_Znf_C2H2 IPR003604 Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2 IPR007219 Transcription_factor_dom_fun IPR013085 U1-CZ_Znf_C2H2 IPR017340 U1_snRNP-C IPR036864 Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf IPR001138 Zn2Cys6_DnaBD IPR036236 Znf_C2H2_sf
Gene Ontology	GO:0000243 C:commitment complex GO:0005685 C:U1 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003677 F:DNA binding GO:0000981 F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific GO:0003729 F:mRNA binding GO:0030619 F:U1 snRNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0000395 P:mRNA 5'-splice site recognition GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04082 Fungal_trans PF06220 zf-U1 PF00172 Zn_clus
PROSITE	View protein in PROSITE PS50171 ZF_MATRIN PS00463 ZN2_CY6_FUNGAL_1 PS50048 ZN2_CY6_FUNGAL_2
CDD	cd12148 fungal_TF_MHR cd00067 GAL4

Amino Acid Sequences

MTARNRTTSTSLPRKRRRPAKSCEQCRERKVRCDLQLPCRACRHARDPLTCTYRESSRPRPSQTDARTAPKSPDIPASTPTERGQPQQQFHGLRNIPSTQLDQHDVANTGTGTSGSSLQDLENRLRKAEQQLSELSRTLQPGAVSGDLAIPAIMPRLRNTAEKTKLFGPSHWMYTAEKIAGGQIDSKDMDFSMVDMKADIAEMAKECRNLRKAAKSQRTLQLNDPVPDLFSTFPDRQICDELASAYIRTLEQIYRVVHIPSFWKEYYQFWEAPHASSTSFLIKLGLIFSIGTTFYPILEESERLRHLAQTWVYAAQWWLVGPSEKLTRNLDGIQVFCLLLVSRKTNTIGPSPWLSTGSLLRMAMTMGLHRDPRVFPGLAPFQAEMRSRLWTTILELVVHESIDSSSMPLMISPQDFDSHIPNNINDADLWPDTKEFPTVKPLQQFTKSSIQLLMRQSLPIRMEAAKLINSSDSEQSYSAVLQLATDLQKACRDLATYFQLHWPQYSGETDLHRKFLDMQIRRYILLLHRPYMLQAQQDPRFYLSRKICGESAMIIASYAESIQLPSQHLDDLSRLMAMSTGPFCGSLHLDIITVLGLEVISQLKETTTVSSETGHLIVDPLGEMSKVQREPMIRILEHINDQMLQIVAQGIARFKRYIFLSVVLCQIRALESGTRDIRPLMIKAVQESVKNCYMASQSSQSDSTPQGSIETLICTEAPLGLDFDLMDPDLDFSAFFAHFSGGGGDGDYCDVYLTHDSMSVRKAHNAGRNHLRNVLEYYQQIGQEKAQSVIDSITSSYAAEGQAVPNPAMAPPGAFPPPFPFPGRPGQLPPPPFGFPPPGGPNGAPGMPPRT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.87
3	0.9
4	0.9
5	0.89
6	0.89
7	0.89
8	0.9
9	0.91
10	0.91
11	0.91
12	0.89
13	0.89
14	0.9
15	0.87
16	0.85
17	0.84
18	0.83
19	0.8
20	0.8
21	0.79
22	0.78
23	0.79
24	0.74
25	0.7
26	0.67
27	0.65
28	0.61
29	0.6
30	0.58
31	0.58
32	0.64
33	0.65
34	0.63
35	0.67
36	0.68
37	0.61
38	0.58
39	0.52
40	0.49
41	0.5
42	0.54
43	0.54
44	0.59
45	0.66
46	0.69
47	0.71
48	0.72
49	0.74
50	0.72
51	0.72
52	0.67
53	0.67
54	0.65
55	0.6
56	0.57
57	0.54
58	0.5
59	0.42
60	0.45
61	0.42
62	0.4
63	0.41
64	0.44
65	0.39
66	0.41
67	0.4
68	0.38
69	0.36
70	0.38
71	0.44
72	0.45
73	0.46
74	0.49
75	0.56
76	0.51
77	0.52
78	0.57
79	0.5
80	0.44
81	0.45
82	0.4
83	0.34
84	0.33
85	0.34
86	0.28
87	0.3
88	0.31
89	0.27
90	0.27
91	0.27
92	0.26
93	0.23
94	0.21
95	0.16
96	0.13
97	0.12
98	0.1
99	0.08
100	0.08
101	0.11
102	0.09
103	0.1
104	0.11
105	0.11
106	0.15
107	0.18
108	0.24
109	0.29
110	0.29
111	0.3
112	0.31
113	0.35
114	0.4
115	0.45
116	0.42
117	0.38
118	0.44
119	0.46
120	0.47
121	0.43
122	0.37
123	0.31
124	0.29
125	0.26
126	0.22
127	0.17
128	0.17
129	0.18
130	0.16
131	0.14
132	0.13
133	0.12
134	0.1
135	0.1
136	0.08
137	0.05
138	0.05
139	0.08
140	0.09
141	0.09
142	0.11
143	0.17
144	0.19
145	0.24
146	0.3
147	0.37
148	0.44
149	0.45
150	0.47
151	0.46
152	0.53
153	0.49
154	0.44
155	0.42
156	0.37
157	0.38
158	0.36
159	0.33
160	0.26
161	0.28
162	0.29
163	0.22
164	0.18
165	0.15
166	0.15
167	0.14
168	0.14
169	0.13
170	0.11
171	0.13
172	0.14
173	0.14
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.09
178	0.09
179	0.11
180	0.11
181	0.1
182	0.1
183	0.1
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.05
188	0.06
189	0.07
190	0.1
191	0.12
192	0.15
193	0.17
194	0.25
195	0.28
196	0.32
197	0.38
198	0.45
199	0.52
200	0.6
201	0.68
202	0.66
203	0.69
204	0.72
205	0.72
206	0.65
207	0.6
208	0.58
209	0.53
210	0.49
211	0.43
212	0.35
213	0.3
214	0.26
215	0.23
216	0.14
217	0.11
218	0.17
219	0.16
220	0.21
221	0.23
222	0.24
223	0.25
224	0.28
225	0.26
226	0.21
227	0.21
228	0.17
229	0.16
230	0.15
231	0.13
232	0.1
233	0.1
234	0.08
235	0.08
236	0.1
237	0.08
238	0.1
239	0.14
240	0.14
241	0.15
242	0.17
243	0.17
244	0.15
245	0.16
246	0.18
247	0.17
248	0.22
249	0.2
250	0.21
251	0.21
252	0.24
253	0.28
254	0.29
255	0.27
256	0.22
257	0.3
258	0.29
259	0.29
260	0.27
261	0.23
262	0.18
263	0.17
264	0.18
265	0.13
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.08
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.09
286	0.11
287	0.11
288	0.16
289	0.16
290	0.17
291	0.17
292	0.16
293	0.17
294	0.21
295	0.2
296	0.17
297	0.18
298	0.17
299	0.17
300	0.16
301	0.15
302	0.09
303	0.09
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.09
310	0.14
311	0.15
312	0.18
313	0.2
314	0.21
315	0.22
316	0.22
317	0.23
318	0.19
319	0.18
320	0.16
321	0.14
322	0.13
323	0.11
324	0.1
325	0.07
326	0.08
327	0.09
328	0.11
329	0.1
330	0.12
331	0.14
332	0.16
333	0.18
334	0.19
335	0.19
336	0.19
337	0.21
338	0.21
339	0.2
340	0.19
341	0.17
342	0.14
343	0.14
344	0.13
345	0.12
346	0.11
347	0.1
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.11
358	0.11
359	0.13
360	0.17
361	0.15
362	0.13
363	0.19
364	0.21
365	0.19
366	0.2
367	0.18
368	0.15
369	0.18
370	0.19
371	0.15
372	0.14
373	0.16
374	0.15
375	0.15
376	0.15
377	0.12
378	0.13
379	0.15
380	0.14
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.11
385	0.11
386	0.09
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.07
402	0.08
403	0.09
404	0.11
405	0.12
406	0.13
407	0.13
408	0.13
409	0.14
410	0.14
411	0.13
412	0.1
413	0.09
414	0.1
415	0.09
416	0.09
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.12
422	0.1
423	0.11
424	0.17
425	0.21
426	0.23
427	0.27
428	0.29
429	0.3
430	0.33
431	0.34
432	0.32
433	0.36
434	0.33
435	0.29
436	0.3
437	0.28
438	0.28
439	0.29
440	0.26
441	0.19
442	0.19
443	0.19
444	0.19
445	0.18
446	0.14
447	0.14
448	0.12
449	0.13
450	0.13
451	0.14
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.1
456	0.1
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.1
465	0.09
466	0.08
467	0.07
468	0.05
469	0.06
470	0.07
471	0.07
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.1
476	0.1
477	0.11
478	0.1
479	0.11
480	0.1
481	0.14
482	0.18
483	0.17
484	0.17
485	0.2
486	0.23
487	0.22
488	0.21
489	0.18
490	0.15
491	0.15
492	0.16
493	0.14
494	0.13
495	0.16
496	0.23
497	0.23
498	0.24
499	0.22
500	0.22
501	0.21
502	0.24
503	0.3
504	0.28
505	0.31
506	0.36
507	0.37
508	0.36
509	0.35
510	0.32
511	0.26
512	0.3
513	0.28
514	0.23
515	0.23
516	0.23
517	0.24
518	0.25
519	0.24
520	0.17
521	0.19
522	0.26
523	0.29
524	0.3
525	0.3
526	0.29
527	0.3
528	0.29
529	0.33
530	0.29
531	0.33
532	0.34
533	0.35
534	0.33
535	0.31
536	0.31
537	0.23
538	0.2
539	0.13
540	0.11
541	0.08
542	0.08
543	0.06
544	0.06
545	0.04
546	0.04
547	0.03
548	0.04
549	0.05
550	0.07
551	0.08
552	0.09
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.11
557	0.11
558	0.1
559	0.09
560	0.08
561	0.08
562	0.07
563	0.07
564	0.06
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.09
572	0.1
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.09
579	0.07
580	0.06
581	0.04
582	0.04
583	0.03
584	0.03
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.06
592	0.07
593	0.08
594	0.09
595	0.1
596	0.11
597	0.12
598	0.13
599	0.13
600	0.13
601	0.11
602	0.09
603	0.08
604	0.08
605	0.07
606	0.06
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.06
612	0.13
613	0.13
614	0.14
615	0.16
616	0.18
617	0.22
618	0.29
619	0.32
620	0.26
621	0.27
622	0.3
623	0.29
624	0.29
625	0.26
626	0.2
627	0.15
628	0.15
629	0.14
630	0.11
631	0.09
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.07
636	0.08
637	0.09
638	0.11
639	0.13
640	0.13
641	0.13
642	0.18
643	0.18
644	0.21
645	0.21
646	0.23
647	0.24
648	0.25
649	0.31
650	0.26
651	0.24
652	0.21
653	0.19
654	0.16
655	0.14
656	0.14
657	0.11
658	0.12
659	0.19
660	0.22
661	0.22
662	0.22
663	0.21
664	0.23
665	0.22
666	0.22
667	0.2
668	0.21
669	0.21
670	0.22
671	0.27
672	0.27
673	0.27
674	0.28
675	0.29
676	0.29
677	0.28
678	0.26
679	0.24
680	0.23
681	0.22
682	0.25
683	0.24
684	0.22
685	0.25
686	0.26
687	0.23
688	0.25
689	0.24
690	0.23
691	0.18
692	0.17
693	0.16
694	0.15
695	0.16
696	0.14
697	0.13
698	0.11
699	0.11
700	0.11
701	0.1
702	0.09
703	0.09
704	0.09
705	0.08
706	0.09
707	0.08
708	0.08
709	0.08
710	0.08
711	0.08
712	0.07
713	0.07
714	0.06
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.06
719	0.06
720	0.08
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.08
725	0.08
726	0.09
727	0.1
728	0.08
729	0.08
730	0.08
731	0.08
732	0.08
733	0.08
734	0.08
735	0.07
736	0.06
737	0.06
738	0.08
739	0.1
740	0.11
741	0.1
742	0.14
743	0.15
744	0.17
745	0.2
746	0.23
747	0.23
748	0.26
749	0.3
750	0.34
751	0.41
752	0.45
753	0.5
754	0.55
755	0.61
756	0.59
757	0.61
758	0.55
759	0.51
760	0.51
761	0.46
762	0.39
763	0.33
764	0.33
765	0.31
766	0.32
767	0.3
768	0.26
769	0.25
770	0.26
771	0.27
772	0.26
773	0.23
774	0.21
775	0.21
776	0.2
777	0.19
778	0.14
779	0.13
780	0.12
781	0.11
782	0.1
783	0.1
784	0.1
785	0.1
786	0.1
787	0.1
788	0.11
789	0.15
790	0.17
791	0.16
792	0.15
793	0.16
794	0.15
795	0.15
796	0.14
797	0.11
798	0.1
799	0.14
800	0.17
801	0.17
802	0.18
803	0.23
804	0.28
805	0.3
806	0.34
807	0.33
808	0.34
809	0.43
810	0.48
811	0.46
812	0.48
813	0.53
814	0.56
815	0.56
816	0.55
817	0.5
818	0.47
819	0.44
820	0.43
821	0.4
822	0.34
823	0.39
824	0.4
825	0.38
826	0.39
827	0.38
828	0.37
829	0.34
830	0.33
831	0.27

A0A0L1IKH6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer