FuNGI

A0A0L1IN02

Protein Details

Accession

A0A0L1IN02

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
708-740	KTITKEERRAESKEKRKQKRRRLAIARAREEEG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
92-120	RGGHSHRGDRGDRGGRGGRGRGRGRGRAG
704-734	QGPRKTITKEERRAESKEKRKQKRRRLAIAR

Subcellular Location(s)

cysk 14, cyto 6, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034101 Lsm4 IPR010920 LSM_dom_sf IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0043229 C:intracellular organelle GO:0003723 F:RNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM PF13812 PPR_3
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR PS52002 SM
CDD	cd01723 LSm4

Amino Acid Sequences

MLPLGLLTAAQGHPMLVELKNGETLNGHLANCDNWMNLILKEVVQTSPEGDRFFRLPEVYIRGNNIKYLRIPEEIIEMVKEQQQNQPSNRNRGGHSHRGDRGDRGGRGGRGRGRGRGRAGPVSTSRKCLSSASLQKVGGIDPPKEDGSLGDGYNESVNQHPTPDQLDVNHKLGQDAGTSLKEEISGAENTRKRPPGVPKTLEHKPTSFLEQKLQELTTSAPRVLSTSQILRILIRDRHVRPEVRHYRALLRANSDAERGSPEVVRKLLAEMEASGFTLDSGTLHTALQAIAVHPDYLLRQEIVRTLRDRWLPLSPDGWHYVVAGLVREHQFELALDHIAHMERKDMPVEGWLHSMLVYYLCEFEEFDEVVRLMRSRVDQGYDMTTDLWLYVLDVASAAVHHESTRFVWDQMVELRYLYPSYGVCSNVLTVASRTGDTELAASVARFLTEADVPLSLEDYEKITEAHVISGNLYAGFEVLCEMHKAKIALESSSTAAILTYMIQSRTNPREAWSLLKKLKALKYEIPLRCALVVLEMCEHEAINDPFVVDDGLALYKQLYALCSEKADVSVYNSLISMCRRAKNTDAGMFVVKEMATLGVVPNATTFEHLIIMCLDAGNFESAYMYFQDLLARDASPSEEARAEIRDLCTGSSDQYAVQLRYHPQIRDALVGRQADNFDPTQVRAGLIKKVPSDSPPEYANRFRQGPRKTITKEERRAESKEKRKQKRRRLAIARAREEEGWEDYVPGGLIPEDQVKADANSPSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.13
3	0.1
4	0.13
5	0.14
6	0.15
7	0.2
8	0.2
9	0.19
10	0.17
11	0.18
12	0.22
13	0.24
14	0.23
15	0.19
16	0.2
17	0.21
18	0.22
19	0.22
20	0.15
21	0.12
22	0.15
23	0.16
24	0.14
25	0.17
26	0.15
27	0.14
28	0.16
29	0.17
30	0.15
31	0.14
32	0.15
33	0.14
34	0.19
35	0.22
36	0.22
37	0.22
38	0.25
39	0.25
40	0.27
41	0.28
42	0.23
43	0.23
44	0.26
45	0.32
46	0.33
47	0.34
48	0.37
49	0.39
50	0.39
51	0.42
52	0.39
53	0.36
54	0.34
55	0.38
56	0.37
57	0.33
58	0.33
59	0.29
60	0.31
61	0.29
62	0.26
63	0.21
64	0.18
65	0.18
66	0.22
67	0.23
68	0.21
69	0.26
70	0.33
71	0.39
72	0.44
73	0.52
74	0.55
75	0.62
76	0.67
77	0.65
78	0.6
79	0.62
80	0.65
81	0.65
82	0.64
83	0.63
84	0.62
85	0.64
86	0.64
87	0.58
88	0.58
89	0.56
90	0.5
91	0.47
92	0.47
93	0.45
94	0.47
95	0.5
96	0.47
97	0.48
98	0.51
99	0.54
100	0.56
101	0.58
102	0.6
103	0.6
104	0.59
105	0.57
106	0.55
107	0.52
108	0.53
109	0.55
110	0.51
111	0.5
112	0.46
113	0.4
114	0.4
115	0.36
116	0.33
117	0.34
118	0.41
119	0.42
120	0.46
121	0.45
122	0.44
123	0.43
124	0.39
125	0.34
126	0.29
127	0.23
128	0.19
129	0.22
130	0.22
131	0.21
132	0.2
133	0.15
134	0.16
135	0.17
136	0.15
137	0.13
138	0.13
139	0.13
140	0.14
141	0.14
142	0.11
143	0.11
144	0.14
145	0.14
146	0.15
147	0.15
148	0.17
149	0.19
150	0.2
151	0.19
152	0.19
153	0.26
154	0.29
155	0.31
156	0.33
157	0.3
158	0.27
159	0.27
160	0.24
161	0.17
162	0.15
163	0.14
164	0.12
165	0.13
166	0.13
167	0.12
168	0.11
169	0.11
170	0.1
171	0.11
172	0.12
173	0.13
174	0.21
175	0.24
176	0.27
177	0.34
178	0.37
179	0.36
180	0.41
181	0.5
182	0.52
183	0.59
184	0.61
185	0.59
186	0.62
187	0.68
188	0.67
189	0.59
190	0.49
191	0.43
192	0.4
193	0.42
194	0.41
195	0.35
196	0.36
197	0.35
198	0.36
199	0.35
200	0.33
201	0.26
202	0.21
203	0.21
204	0.21
205	0.2
206	0.18
207	0.16
208	0.16
209	0.18
210	0.17
211	0.18
212	0.15
213	0.16
214	0.18
215	0.19
216	0.19
217	0.18
218	0.2
219	0.23
220	0.22
221	0.24
222	0.29
223	0.3
224	0.37
225	0.43
226	0.45
227	0.43
228	0.51
229	0.56
230	0.54
231	0.56
232	0.5
233	0.5
234	0.52
235	0.55
236	0.46
237	0.41
238	0.37
239	0.36
240	0.35
241	0.3
242	0.24
243	0.18
244	0.18
245	0.15
246	0.14
247	0.13
248	0.14
249	0.16
250	0.16
251	0.16
252	0.14
253	0.14
254	0.14
255	0.12
256	0.11
257	0.09
258	0.1
259	0.09
260	0.09
261	0.08
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.03
267	0.05
268	0.05
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.07
282	0.06
283	0.08
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.08
288	0.12
289	0.14
290	0.17
291	0.18
292	0.19
293	0.24
294	0.26
295	0.27
296	0.25
297	0.28
298	0.27
299	0.26
300	0.27
301	0.22
302	0.23
303	0.24
304	0.22
305	0.17
306	0.15
307	0.13
308	0.12
309	0.11
310	0.09
311	0.06
312	0.09
313	0.1
314	0.1
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.07
328	0.08
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.12
335	0.14
336	0.13
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.11
341	0.11
342	0.07
343	0.06
344	0.05
345	0.04
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.08
358	0.07
359	0.05
360	0.07
361	0.08
362	0.1
363	0.11
364	0.12
365	0.12
366	0.13
367	0.15
368	0.14
369	0.13
370	0.1
371	0.1
372	0.08
373	0.07
374	0.06
375	0.04
376	0.03
377	0.04
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.04
389	0.05
390	0.06
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.13
398	0.14
399	0.11
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.08
405	0.06
406	0.06
407	0.07
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.06
417	0.07
418	0.08
419	0.07
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.05
434	0.05
435	0.06
436	0.07
437	0.06
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.09
451	0.09
452	0.1
453	0.1
454	0.1
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.08
459	0.08
460	0.06
461	0.05
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.09
471	0.1
472	0.1
473	0.14
474	0.15
475	0.14
476	0.15
477	0.15
478	0.14
479	0.14
480	0.14
481	0.09
482	0.07
483	0.07
484	0.06
485	0.05
486	0.06
487	0.07
488	0.08
489	0.09
490	0.1
491	0.18
492	0.22
493	0.24
494	0.23
495	0.24
496	0.28
497	0.29
498	0.35
499	0.34
500	0.38
501	0.38
502	0.4
503	0.4
504	0.42
505	0.45
506	0.42
507	0.42
508	0.39
509	0.43
510	0.51
511	0.5
512	0.47
513	0.43
514	0.39
515	0.34
516	0.29
517	0.21
518	0.15
519	0.13
520	0.11
521	0.11
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.1
526	0.07
527	0.12
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.1
533	0.11
534	0.11
535	0.05
536	0.05
537	0.04
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.06
546	0.09
547	0.11
548	0.12
549	0.12
550	0.13
551	0.12
552	0.13
553	0.13
554	0.11
555	0.13
556	0.15
557	0.15
558	0.14
559	0.14
560	0.13
561	0.14
562	0.15
563	0.19
564	0.2
565	0.25
566	0.27
567	0.31
568	0.34
569	0.4
570	0.45
571	0.42
572	0.39
573	0.37
574	0.36
575	0.32
576	0.28
577	0.21
578	0.15
579	0.11
580	0.09
581	0.07
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.08
590	0.08
591	0.09
592	0.1
593	0.08
594	0.11
595	0.1
596	0.11
597	0.1
598	0.1
599	0.09
600	0.08
601	0.07
602	0.06
603	0.07
604	0.07
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.08
610	0.09
611	0.09
612	0.08
613	0.09
614	0.11
615	0.11
616	0.12
617	0.12
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.12
622	0.12
623	0.13
624	0.13
625	0.13
626	0.14
627	0.15
628	0.17
629	0.17
630	0.18
631	0.18
632	0.19
633	0.19
634	0.18
635	0.19
636	0.18
637	0.18
638	0.16
639	0.15
640	0.12
641	0.18
642	0.22
643	0.2
644	0.21
645	0.24
646	0.25
647	0.32
648	0.38
649	0.33
650	0.31
651	0.36
652	0.36
653	0.39
654	0.38
655	0.35
656	0.35
657	0.36
658	0.34
659	0.31
660	0.32
661	0.26
662	0.27
663	0.23
664	0.21
665	0.21
666	0.21
667	0.22
668	0.21
669	0.21
670	0.21
671	0.23
672	0.27
673	0.29
674	0.33
675	0.31
676	0.34
677	0.35
678	0.34
679	0.4
680	0.36
681	0.35
682	0.35
683	0.38
684	0.4
685	0.46
686	0.49
687	0.48
688	0.5
689	0.53
690	0.58
691	0.59
692	0.62
693	0.6
694	0.63
695	0.61
696	0.66
697	0.71
698	0.73
699	0.76
700	0.75
701	0.79
702	0.74
703	0.77
704	0.76
705	0.76
706	0.76
707	0.77
708	0.8
709	0.82
710	0.88
711	0.92
712	0.93
713	0.93
714	0.93
715	0.94
716	0.94
717	0.94
718	0.94
719	0.93
720	0.9
721	0.83
722	0.75
723	0.65
724	0.56
725	0.49
726	0.42
727	0.34
728	0.27
729	0.23
730	0.2
731	0.2
732	0.17
733	0.13
734	0.1
735	0.07
736	0.08
737	0.09
738	0.13
739	0.13
740	0.13
741	0.15
742	0.16
743	0.17
744	0.21

A0A0L1IN02

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer