Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L1JB50

Protein Details
Accession A0A0L1JB50    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-56SVPSTGPPPKPLRKNRAGQTRQGMTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1171-1213PPPSKPKEKQGAFLQAAGPIKRPQQPGSRGGRRGGLGVKRAVP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MDINSLLSPQESNSQSGRSSPSAAPTSVSNTSVPSTGPPPKPLRKNRAGQTRQGMTSSPLAQHVFAPPHVSEPSPPAISPTVGPNTALDPWNGHARRLGFHAASPTPALECPASQKHRIVRVSTLSLDDVSPRQFGRPQYTDATIVIRYSHVGWPQGGRPQKLYGYIVGSECTAAGNRAFCSNSRKPSVLRRACNFVRLLHAGFVNHVYPPNNPELHGDPRKYDLLKDMRTAREEMDKLFAMGEDLWAEWIQDESMLAQTVDERIAVMELCQRSVEEEYGSTKLWSIYGEWVLYLYNSAHGEGGQHQWTEEDRMIGREVFSWQSVLDVWQRGAEATRWRTPDSHLVWDRLLDLQMQDITRNPSQEKIGHVRNLFDIRLQTPHATWDQTFQTFSGFVSTYYNANYENIMADTAGRYATACKEQYSAREEFEIRLRNAAESGDLTQEWTIFTEYIEWEVNSNHRNRHSNFELVNAVYQRAVLRFPTDANMWEDFVMFLIDESMHGNANTTTISTLERATRHCPCSGTLWSQYLLSSEREGQSFSKIADIKHKATSTGLLDVAGMEEVLKVHTAWCSYLRRRAFMSDSTDEDLDVAEVGIRSAIESVQELGEKKYGRSYQGDPLFRLERIYIRYLSESGSWDSARETFKGLMGRRGNSYDKFVQGEATVDAARRTPNPSFATAVLKQAIKRTDLDWPEKIMQTYIAHCEDYEDSDELQLAILETRKAMRAITARRERDATELAAQQAQQPASTEQAAHPEKRKREEEEANVNGLPTKKARGEEEASAAEAEPAALQRDRENATVVVKNLPHQITEHKVRQFFRHCGTINSVKMFSGDGNSEVAVIEFNSKDEALVAQTRDQKSLDDSTIEVQIGTCSTLFVTNFPPEADENYIRGLFREYGEIIDVRFPSLKYNTHRRFCYVQFKTSEAAHRATRLDGTTVGKGLMLTAKISDPSRKQDRHGPIYEGREIHVSNVDFKASEPDLKELFSKYGTVELVRLPRKVDGGSKGFGYVVFSTKEEATAALAMDGQEYRLRTLHVKISAPQSTKRSATTIVSHVGKSQSPAAEVNGSKASADADTPSSERAARSLGLMNIPDTVNDARIRALVEPYGKLIKIVLRPDHQGAIVEFADVNHAGRASLELEGQEIAPGRKLHVGTVPEMLKQSAENKDGRIPPPSKPKEKQGAFLQAAGPIKRPQQPGSRGGRRGGLGVKRAVPRGEHNGEKTMTTTTMMTTDSAPSVEGGKTKKSNDDFRAMIQRGREE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.3
4 0.34
5 0.28
6 0.32
7 0.3
8 0.35
9 0.36
10 0.36
11 0.33
12 0.29
13 0.33
14 0.31
15 0.31
16 0.24
17 0.22
18 0.23
19 0.23
20 0.21
21 0.19
22 0.23
23 0.3
24 0.34
25 0.4
26 0.48
27 0.57
28 0.67
29 0.74
30 0.78
31 0.78
32 0.84
33 0.86
34 0.88
35 0.84
36 0.82
37 0.81
38 0.78
39 0.7
40 0.62
41 0.53
42 0.45
43 0.45
44 0.39
45 0.31
46 0.29
47 0.28
48 0.27
49 0.27
50 0.3
51 0.27
52 0.25
53 0.27
54 0.23
55 0.26
56 0.27
57 0.26
58 0.22
59 0.24
60 0.29
61 0.26
62 0.26
63 0.26
64 0.26
65 0.26
66 0.25
67 0.27
68 0.26
69 0.25
70 0.26
71 0.23
72 0.24
73 0.26
74 0.26
75 0.2
76 0.18
77 0.2
78 0.3
79 0.3
80 0.28
81 0.28
82 0.29
83 0.3
84 0.33
85 0.37
86 0.27
87 0.29
88 0.34
89 0.3
90 0.3
91 0.29
92 0.25
93 0.2
94 0.2
95 0.2
96 0.15
97 0.15
98 0.2
99 0.28
100 0.33
101 0.36
102 0.42
103 0.46
104 0.54
105 0.58
106 0.55
107 0.52
108 0.53
109 0.53
110 0.48
111 0.44
112 0.36
113 0.32
114 0.29
115 0.25
116 0.21
117 0.19
118 0.19
119 0.18
120 0.2
121 0.23
122 0.28
123 0.35
124 0.36
125 0.38
126 0.4
127 0.42
128 0.41
129 0.37
130 0.35
131 0.27
132 0.24
133 0.2
134 0.16
135 0.14
136 0.15
137 0.18
138 0.19
139 0.2
140 0.21
141 0.24
142 0.27
143 0.34
144 0.38
145 0.36
146 0.36
147 0.38
148 0.39
149 0.4
150 0.38
151 0.33
152 0.3
153 0.3
154 0.27
155 0.24
156 0.21
157 0.17
158 0.15
159 0.13
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.15
166 0.16
167 0.18
168 0.27
169 0.33
170 0.39
171 0.43
172 0.45
173 0.46
174 0.55
175 0.64
176 0.64
177 0.65
178 0.62
179 0.66
180 0.64
181 0.66
182 0.57
183 0.47
184 0.44
185 0.39
186 0.36
187 0.29
188 0.29
189 0.24
190 0.23
191 0.24
192 0.18
193 0.16
194 0.17
195 0.16
196 0.16
197 0.2
198 0.24
199 0.23
200 0.23
201 0.26
202 0.28
203 0.37
204 0.43
205 0.4
206 0.36
207 0.4
208 0.44
209 0.4
210 0.37
211 0.36
212 0.38
213 0.39
214 0.43
215 0.46
216 0.45
217 0.47
218 0.47
219 0.4
220 0.4
221 0.38
222 0.33
223 0.31
224 0.27
225 0.24
226 0.23
227 0.2
228 0.14
229 0.12
230 0.11
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.14
261 0.16
262 0.17
263 0.12
264 0.13
265 0.15
266 0.17
267 0.17
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.11
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.11
289 0.12
290 0.16
291 0.15
292 0.15
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.19
297 0.17
298 0.16
299 0.14
300 0.16
301 0.18
302 0.17
303 0.16
304 0.13
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.14
318 0.13
319 0.15
320 0.16
321 0.2
322 0.24
323 0.29
324 0.31
325 0.32
326 0.33
327 0.35
328 0.41
329 0.37
330 0.41
331 0.39
332 0.39
333 0.38
334 0.37
335 0.34
336 0.26
337 0.23
338 0.14
339 0.11
340 0.1
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.17
346 0.18
347 0.21
348 0.2
349 0.2
350 0.24
351 0.25
352 0.29
353 0.3
354 0.35
355 0.38
356 0.37
357 0.36
358 0.37
359 0.38
360 0.32
361 0.27
362 0.23
363 0.19
364 0.21
365 0.22
366 0.19
367 0.16
368 0.19
369 0.19
370 0.19
371 0.18
372 0.19
373 0.21
374 0.21
375 0.21
376 0.17
377 0.17
378 0.15
379 0.15
380 0.13
381 0.1
382 0.1
383 0.12
384 0.13
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.11
389 0.12
390 0.11
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.09
404 0.13
405 0.14
406 0.14
407 0.17
408 0.18
409 0.22
410 0.26
411 0.25
412 0.21
413 0.24
414 0.24
415 0.23
416 0.28
417 0.3
418 0.25
419 0.26
420 0.25
421 0.22
422 0.22
423 0.21
424 0.15
425 0.1
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.13
445 0.16
446 0.19
447 0.21
448 0.26
449 0.33
450 0.34
451 0.41
452 0.41
453 0.43
454 0.4
455 0.39
456 0.36
457 0.29
458 0.3
459 0.22
460 0.19
461 0.13
462 0.13
463 0.11
464 0.09
465 0.1
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.12
471 0.12
472 0.13
473 0.15
474 0.15
475 0.14
476 0.14
477 0.13
478 0.11
479 0.1
480 0.08
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.11
501 0.12
502 0.15
503 0.2
504 0.25
505 0.26
506 0.27
507 0.27
508 0.25
509 0.29
510 0.3
511 0.29
512 0.26
513 0.25
514 0.24
515 0.23
516 0.22
517 0.18
518 0.16
519 0.13
520 0.11
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.14
525 0.13
526 0.14
527 0.14
528 0.13
529 0.16
530 0.16
531 0.17
532 0.24
533 0.28
534 0.28
535 0.31
536 0.31
537 0.27
538 0.26
539 0.28
540 0.2
541 0.18
542 0.15
543 0.11
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.06
548 0.05
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.04
554 0.03
555 0.04
556 0.05
557 0.06
558 0.07
559 0.11
560 0.17
561 0.2
562 0.27
563 0.28
564 0.29
565 0.3
566 0.32
567 0.3
568 0.28
569 0.32
570 0.26
571 0.27
572 0.27
573 0.25
574 0.22
575 0.19
576 0.15
577 0.09
578 0.07
579 0.04
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.06
593 0.07
594 0.07
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.16
599 0.17
600 0.18
601 0.21
602 0.24
603 0.28
604 0.35
605 0.36
606 0.32
607 0.34
608 0.33
609 0.29
610 0.27
611 0.19
612 0.15
613 0.16
614 0.18
615 0.15
616 0.15
617 0.16
618 0.15
619 0.16
620 0.14
621 0.13
622 0.11
623 0.12
624 0.11
625 0.1
626 0.11
627 0.13
628 0.13
629 0.12
630 0.12
631 0.11
632 0.13
633 0.18
634 0.18
635 0.23
636 0.25
637 0.25
638 0.25
639 0.29
640 0.29
641 0.25
642 0.3
643 0.24
644 0.23
645 0.23
646 0.21
647 0.18
648 0.15
649 0.15
650 0.11
651 0.1
652 0.08
653 0.07
654 0.08
655 0.08
656 0.09
657 0.09
658 0.12
659 0.12
660 0.18
661 0.2
662 0.21
663 0.22
664 0.22
665 0.26
666 0.23
667 0.25
668 0.21
669 0.2
670 0.19
671 0.21
672 0.21
673 0.18
674 0.18
675 0.17
676 0.22
677 0.25
678 0.29
679 0.26
680 0.28
681 0.29
682 0.29
683 0.28
684 0.21
685 0.19
686 0.15
687 0.16
688 0.16
689 0.15
690 0.14
691 0.13
692 0.15
693 0.13
694 0.13
695 0.14
696 0.11
697 0.1
698 0.1
699 0.1
700 0.08
701 0.08
702 0.06
703 0.04
704 0.04
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.06
709 0.07
710 0.08
711 0.07
712 0.1
713 0.16
714 0.21
715 0.31
716 0.39
717 0.39
718 0.41
719 0.42
720 0.4
721 0.37
722 0.34
723 0.26
724 0.2
725 0.2
726 0.19
727 0.18
728 0.18
729 0.16
730 0.17
731 0.15
732 0.12
733 0.12
734 0.12
735 0.13
736 0.13
737 0.12
738 0.09
739 0.18
740 0.2
741 0.21
742 0.28
743 0.33
744 0.37
745 0.44
746 0.47
747 0.44
748 0.5
749 0.54
750 0.54
751 0.56
752 0.54
753 0.49
754 0.45
755 0.39
756 0.33
757 0.27
758 0.21
759 0.13
760 0.14
761 0.15
762 0.17
763 0.19
764 0.22
765 0.25
766 0.25
767 0.27
768 0.25
769 0.22
770 0.21
771 0.19
772 0.13
773 0.09
774 0.08
775 0.05
776 0.04
777 0.06
778 0.06
779 0.07
780 0.08
781 0.12
782 0.15
783 0.15
784 0.17
785 0.16
786 0.19
787 0.2
788 0.2
789 0.2
790 0.18
791 0.19
792 0.22
793 0.22
794 0.19
795 0.18
796 0.21
797 0.24
798 0.31
799 0.35
800 0.35
801 0.39
802 0.4
803 0.47
804 0.49
805 0.48
806 0.44
807 0.45
808 0.42
809 0.39
810 0.44
811 0.43
812 0.39
813 0.37
814 0.34
815 0.26
816 0.26
817 0.24
818 0.18
819 0.12
820 0.11
821 0.09
822 0.09
823 0.09
824 0.09
825 0.08
826 0.08
827 0.06
828 0.05
829 0.07
830 0.06
831 0.06
832 0.07
833 0.07
834 0.07
835 0.07
836 0.07
837 0.08
838 0.11
839 0.11
840 0.15
841 0.22
842 0.24
843 0.25
844 0.25
845 0.23
846 0.24
847 0.26
848 0.22
849 0.17
850 0.16
851 0.16
852 0.17
853 0.17
854 0.13
855 0.09
856 0.09
857 0.08
858 0.08
859 0.06
860 0.05
861 0.05
862 0.07
863 0.08
864 0.09
865 0.12
866 0.13
867 0.14
868 0.14
869 0.15
870 0.14
871 0.16
872 0.19
873 0.18
874 0.17
875 0.18
876 0.19
877 0.18
878 0.17
879 0.17
880 0.14
881 0.13
882 0.15
883 0.13
884 0.13
885 0.14
886 0.14
887 0.12
888 0.14
889 0.13
890 0.12
891 0.13
892 0.13
893 0.16
894 0.19
895 0.25
896 0.28
897 0.39
898 0.47
899 0.53
900 0.54
901 0.55
902 0.57
903 0.57
904 0.62
905 0.55
906 0.52
907 0.48
908 0.48
909 0.45
910 0.43
911 0.43
912 0.35
913 0.34
914 0.29
915 0.29
916 0.28
917 0.27
918 0.26
919 0.2
920 0.18
921 0.18
922 0.19
923 0.18
924 0.17
925 0.16
926 0.14
927 0.13
928 0.12
929 0.12
930 0.09
931 0.08
932 0.09
933 0.1
934 0.12
935 0.14
936 0.19
937 0.21
938 0.29
939 0.39
940 0.4
941 0.43
942 0.5
943 0.58
944 0.6
945 0.6
946 0.57
947 0.53
948 0.56
949 0.57
950 0.48
951 0.4
952 0.34
953 0.31
954 0.26
955 0.26
956 0.21
957 0.2
958 0.2
959 0.2
960 0.16
961 0.17
962 0.21
963 0.17
964 0.2
965 0.18
966 0.21
967 0.22
968 0.23
969 0.24
970 0.2
971 0.2
972 0.17
973 0.16
974 0.13
975 0.16
976 0.16
977 0.15
978 0.14
979 0.17
980 0.24
981 0.27
982 0.27
983 0.25
984 0.26
985 0.27
986 0.28
987 0.3
988 0.29
989 0.3
990 0.3
991 0.29
992 0.28
993 0.26
994 0.24
995 0.22
996 0.16
997 0.15
998 0.15
999 0.15
1000 0.16
1001 0.16
1002 0.17
1003 0.13
1004 0.12
1005 0.11
1006 0.1
1007 0.1
1008 0.08
1009 0.08
1010 0.07
1011 0.08
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.1
1015 0.1
1016 0.12
1017 0.12
1018 0.14
1019 0.16
1020 0.2
1021 0.26
1022 0.28
1023 0.3
1024 0.32
1025 0.39
1026 0.44
1027 0.44
1028 0.46
1029 0.44
1030 0.44
1031 0.44
1032 0.42
1033 0.37
1034 0.34
1035 0.34
1036 0.33
1037 0.32
1038 0.33
1039 0.33
1040 0.32
1041 0.31
1042 0.31
1043 0.28
1044 0.26
1045 0.27
1046 0.21
1047 0.21
1048 0.22
1049 0.21
1050 0.25
1051 0.24
1052 0.25
1053 0.23
1054 0.22
1055 0.19
1056 0.18
1057 0.17
1058 0.12
1059 0.12
1060 0.11
1061 0.11
1062 0.13
1063 0.14
1064 0.14
1065 0.15
1066 0.16
1067 0.15
1068 0.15
1069 0.15
1070 0.13
1071 0.15
1072 0.18
1073 0.18
1074 0.2
1075 0.2
1076 0.19
1077 0.19
1078 0.19
1079 0.16
1080 0.16
1081 0.15
1082 0.16
1083 0.16
1084 0.16
1085 0.15
1086 0.16
1087 0.17
1088 0.15
1089 0.17
1090 0.17
1091 0.19
1092 0.19
1093 0.22
1094 0.24
1095 0.23
1096 0.21
1097 0.21
1098 0.23
1099 0.26
1100 0.32
1101 0.35
1102 0.35
1103 0.4
1104 0.42
1105 0.42
1106 0.37
1107 0.34
1108 0.27
1109 0.26
1110 0.22
1111 0.18
1112 0.15
1113 0.13
1114 0.15
1115 0.13
1116 0.14
1117 0.1
1118 0.1
1119 0.09
1120 0.09
1121 0.11
1122 0.09
1123 0.1
1124 0.1
1125 0.09
1126 0.1
1127 0.11
1128 0.11
1129 0.11
1130 0.12
1131 0.12
1132 0.15
1133 0.16
1134 0.17
1135 0.22
1136 0.22
1137 0.23
1138 0.26
1139 0.28
1140 0.26
1141 0.32
1142 0.32
1143 0.29
1144 0.3
1145 0.28
1146 0.22
1147 0.22
1148 0.26
1149 0.25
1150 0.29
1151 0.29
1152 0.31
1153 0.38
1154 0.44
1155 0.44
1156 0.47
1157 0.43
1158 0.47
1159 0.56
1160 0.62
1161 0.65
1162 0.64
1163 0.72
1164 0.74
1165 0.74
1166 0.74
1167 0.72
1168 0.73
1169 0.64
1170 0.61
1171 0.52
1172 0.46
1173 0.47
1174 0.41
1175 0.35
1176 0.29
1177 0.33
1178 0.38
1179 0.42
1180 0.43
1181 0.49
1182 0.55
1183 0.6
1184 0.67
1185 0.7
1186 0.67
1187 0.66
1188 0.64
1189 0.55
1190 0.53
1191 0.51
1192 0.47
1193 0.43
1194 0.44
1195 0.48
1196 0.47
1197 0.5
1198 0.48
1199 0.44
1200 0.44
1201 0.48
1202 0.5
1203 0.5
1204 0.49
1205 0.51
1206 0.5
1207 0.47
1208 0.42
1209 0.35
1210 0.29
1211 0.24
1212 0.21
1213 0.15
1214 0.16
1215 0.16
1216 0.16
1217 0.14
1218 0.16
1219 0.15
1220 0.14
1221 0.14
1222 0.12
1223 0.14
1224 0.15
1225 0.18
1226 0.19
1227 0.27
1228 0.32
1229 0.35
1230 0.44
1231 0.49
1232 0.57
1233 0.58
1234 0.63
1235 0.57
1236 0.57
1237 0.65
1238 0.58
1239 0.54