Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L1J7J8

Protein Details
Accession A0A0L1J7J8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-365MEISRSLRKKKGNLQSARKFRLPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
350-353KKKG
Subcellular Location(s) extr 13, golg 5, plas 4, E.R. 2, cyto 1, pero 1, vacu 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008949  Isoprenoid_synthase_dom_sf  
IPR002060  Squ/phyt_synthse  
IPR019845  Squalene/phytoene_synthase_CS  
IPR044843  Trans_IPPS_bact-type  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0004311  F:farnesyltranstransferase activity  
GO:0016117  P:carotenoid biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00494  SQS_PSY  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01045  SQUALEN_PHYTOEN_SYN_2  
Amino Acid Sequences MLKCILYYREVVFFAITNALVVFGLVTCDVALAIDQYDYLTSGTSSTKGTSLKSAFTTVTVRRVEFNNQILDALCEATNCLHLKSPSMYLGSALFEGQLRIDLIFLYSFCRLIDDLVDEAQNKDQAFLWIERCSALLDARFLSQDVEKSISLKGLCSEVDQRLVAAIKQIPAPRLSKQPLLDLLRGLKTDLEFNHKQGIFPIQTEADLDMYASLVAGTVGELTLSLIYHHHFQNKPIHPPDHLQQITAAGREMGRALQYVNIARDIHRDAVIGRVYIPTAWLQKAGVSPLDVIDYPSHPKVYTMQAMLLDKAEYCYQNSRAAIDKLPLEIQGPVNATIESYMEISRSLRKKKGNLQSARKFRLPLWRRLLVAWKAMNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.15
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.05
11 0.06
12 0.05
13 0.06
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.07
27 0.06
28 0.06
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.12
34 0.15
35 0.16
36 0.18
37 0.24
38 0.25
39 0.26
40 0.27
41 0.29
42 0.25
43 0.26
44 0.3
45 0.25
46 0.31
47 0.3
48 0.29
49 0.3
50 0.32
51 0.36
52 0.36
53 0.38
54 0.34
55 0.31
56 0.31
57 0.29
58 0.27
59 0.21
60 0.16
61 0.12
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.16
69 0.16
70 0.19
71 0.21
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.21
76 0.18
77 0.18
78 0.16
79 0.14
80 0.11
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.15
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.14
145 0.13
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.17
159 0.19
160 0.19
161 0.25
162 0.27
163 0.28
164 0.27
165 0.28
166 0.32
167 0.33
168 0.31
169 0.25
170 0.25
171 0.22
172 0.21
173 0.19
174 0.13
175 0.1
176 0.12
177 0.12
178 0.18
179 0.17
180 0.18
181 0.25
182 0.24
183 0.24
184 0.22
185 0.26
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.12
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.05
215 0.08
216 0.1
217 0.17
218 0.17
219 0.22
220 0.32
221 0.36
222 0.43
223 0.45
224 0.45
225 0.41
226 0.43
227 0.42
228 0.43
229 0.38
230 0.31
231 0.26
232 0.28
233 0.27
234 0.24
235 0.21
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.11
246 0.13
247 0.13
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.19
252 0.19
253 0.19
254 0.17
255 0.17
256 0.14
257 0.19
258 0.2
259 0.16
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.13
265 0.11
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.15
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.13
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.16
283 0.18
284 0.19
285 0.17
286 0.18
287 0.2
288 0.24
289 0.27
290 0.24
291 0.24
292 0.26
293 0.28
294 0.27
295 0.25
296 0.19
297 0.14
298 0.15
299 0.17
300 0.14
301 0.16
302 0.21
303 0.23
304 0.28
305 0.28
306 0.28
307 0.31
308 0.33
309 0.32
310 0.29
311 0.28
312 0.24
313 0.25
314 0.23
315 0.19
316 0.19
317 0.18
318 0.18
319 0.19
320 0.18
321 0.18
322 0.18
323 0.17
324 0.14
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.12
332 0.2
333 0.28
334 0.35
335 0.41
336 0.49
337 0.57
338 0.67
339 0.75
340 0.77
341 0.79
342 0.83
343 0.86
344 0.88
345 0.86
346 0.8
347 0.72
348 0.66
349 0.67
350 0.63
351 0.62
352 0.6
353 0.59
354 0.56
355 0.58
356 0.63
357 0.56
358 0.57