Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L1IST9

Protein Details
Accession A0A0L1IST9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-69VAEGAPKKKKIIRKKRRPARPQVDPATVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-60APKKKKIIRKKRRPAR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences WPIPPQSTEPTTLPEATSAPDEQVASEENALAVTQPAESAVAEGAPKKKKIIRKKRRPARPQVDPATVKSEPPPQTGTVFNIWYNKWSGGDREDSYLSKQHAPSRCNISKDSGYTRADKVIGSYFCLFFARGVCHLGSECQYLHRLPTIHDLFSPNVDCFGRDKFSDYRDDMGGVGSFMRQNRTLYVGRIHVTDDIEEVVARHFAEWGEIERIRVLRRGVWLSLRILLLRRRSLRRRLWHINVTLDNNEILNVRWATVDPNPLAQKREARRLEEQAAEAVRRALPADFVAELEGRDPEARKRKKIEGSFGLQGYEPPDEVWYSRTKQLEGAGQGDQGQLEAPNQPLMLENSSSASAPPQESESSGIFSSSTVAALRGLAGGNVTTQAAPQASGGPLVGYGSDDESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.24
3 0.21
4 0.23
5 0.19
6 0.16
7 0.17
8 0.17
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.09
19 0.08
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.13
31 0.2
32 0.25
33 0.27
34 0.32
35 0.38
36 0.47
37 0.57
38 0.65
39 0.69
40 0.74
41 0.85
42 0.89
43 0.94
44 0.95
45 0.95
46 0.94
47 0.93
48 0.92
49 0.88
50 0.86
51 0.78
52 0.7
53 0.66
54 0.56
55 0.46
56 0.4
57 0.41
58 0.35
59 0.36
60 0.36
61 0.3
62 0.33
63 0.33
64 0.34
65 0.28
66 0.27
67 0.26
68 0.27
69 0.25
70 0.25
71 0.26
72 0.23
73 0.21
74 0.21
75 0.22
76 0.21
77 0.26
78 0.25
79 0.26
80 0.27
81 0.27
82 0.28
83 0.3
84 0.29
85 0.29
86 0.31
87 0.35
88 0.39
89 0.4
90 0.44
91 0.49
92 0.51
93 0.49
94 0.47
95 0.46
96 0.43
97 0.45
98 0.44
99 0.41
100 0.39
101 0.39
102 0.38
103 0.35
104 0.32
105 0.28
106 0.24
107 0.24
108 0.21
109 0.21
110 0.22
111 0.19
112 0.19
113 0.2
114 0.18
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.24
135 0.24
136 0.23
137 0.24
138 0.25
139 0.23
140 0.24
141 0.24
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.15
148 0.15
149 0.13
150 0.18
151 0.18
152 0.2
153 0.25
154 0.25
155 0.24
156 0.23
157 0.23
158 0.19
159 0.17
160 0.14
161 0.09
162 0.08
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.19
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.1
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.07
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.13
200 0.13
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.16
205 0.18
206 0.18
207 0.19
208 0.2
209 0.18
210 0.2
211 0.18
212 0.15
213 0.16
214 0.19
215 0.21
216 0.25
217 0.3
218 0.36
219 0.43
220 0.52
221 0.58
222 0.62
223 0.68
224 0.71
225 0.72
226 0.71
227 0.67
228 0.62
229 0.56
230 0.5
231 0.41
232 0.33
233 0.26
234 0.19
235 0.17
236 0.12
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.17
246 0.14
247 0.18
248 0.22
249 0.23
250 0.26
251 0.26
252 0.32
253 0.33
254 0.43
255 0.42
256 0.43
257 0.47
258 0.51
259 0.52
260 0.46
261 0.42
262 0.35
263 0.33
264 0.28
265 0.23
266 0.18
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.18
285 0.28
286 0.35
287 0.41
288 0.47
289 0.55
290 0.63
291 0.68
292 0.69
293 0.66
294 0.65
295 0.63
296 0.57
297 0.5
298 0.4
299 0.34
300 0.28
301 0.21
302 0.15
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.16
309 0.19
310 0.24
311 0.26
312 0.26
313 0.27
314 0.3
315 0.33
316 0.31
317 0.3
318 0.26
319 0.24
320 0.24
321 0.22
322 0.18
323 0.12
324 0.1
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.15
334 0.16
335 0.15
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.14
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.15
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.21
349 0.19
350 0.19
351 0.18
352 0.17
353 0.14
354 0.13
355 0.14
356 0.11
357 0.11
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.07
372 0.08
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.13
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.11
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.07
386 0.08