Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L1JHT5

Protein Details
Accession A0A0L1JHT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-107KLLSRFREQNGKKKKPVERRKLEKHYLEFIKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-98KLLSRFREQNGKKKKPVERRKL
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR019458  Est1-like_N  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF10374  EST1  
PF10373  EST1_DNA_bind  
Amino Acid Sequences MASAFQNTWQIALDIERELLKSLAEKEPTFAEISHYLSELRAACQNAILQDFDAARSIDVESRLWDAHLKINNRFRKLLSRFREQNGKKKKPVERRKLEKHYLEFIKTSQRFYRGYIQQLSSHFGGIPELENVARKFNFDNLSAEDSTVQPVGDLRKRILQSCHATLIRLGDLSRYRETELVGKDRNWGPAIGYYDLATVIYPASGASHNQLAVIALADGNHLRATYHLYRALAAQEPHPSAKGNLEIEFRKVRNLWAKRELIRPEDAGIPGRALAPWFVYLHAQCYKGTDFPEHEELENEVLNQLAVDLKERSLEGTLQKFCLVNISAEDFSRTRSNEESVSNARLFFQRINLKTFFTLLQILLAEVERFAVEESNYKDGKNGPDKITAVARRVLPALRNYSSWLLTVNYQLVAHKEEKDTPLSVQITEFWKIYANTLTLLASTFDVVLLPEIDYLLEEDEETLCFVPLNTEATSRRYLDTSGRQKPRMNDLGVERNHPNMEMLYRIREFVIDGLDMVVSNKIPIALVDDGDKKTFIYKEEGLPSQFFASPSGHHHTVSSASIEREDIPRTTQDPTYATDSKSVFGGSQSASMSASMHRIVEGVERLVESDCYENTPALPEHLVFPQNNEQPSSSHIFNPSTDSIFREESIPARQTPIAPPGLGHSMANSAALARVPSSQAYAPRPSLPGIPSIWNMGLSPDVGDASSPRTPPGLGQHPIQHSGHLIPGSIGSPSHHLSQDSAMNDLILRQSLMHQSQMQNPLNGSSSISSWIPSSNPTSHHRLSGLGWDNRGLLDAASSPPPLGAPSQPISSGLANASWANDAFLANTLSSGAGYPSSGFGGSRKSATQYGAIGQTPPCGHGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.15
7 0.13
8 0.15
9 0.18
10 0.24
11 0.27
12 0.27
13 0.28
14 0.3
15 0.31
16 0.29
17 0.25
18 0.23
19 0.21
20 0.24
21 0.23
22 0.22
23 0.2
24 0.19
25 0.23
26 0.19
27 0.19
28 0.2
29 0.21
30 0.2
31 0.22
32 0.24
33 0.22
34 0.22
35 0.21
36 0.16
37 0.18
38 0.18
39 0.17
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.14
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.2
53 0.18
54 0.24
55 0.3
56 0.34
57 0.39
58 0.49
59 0.56
60 0.58
61 0.59
62 0.55
63 0.59
64 0.62
65 0.64
66 0.61
67 0.63
68 0.65
69 0.68
70 0.76
71 0.72
72 0.74
73 0.75
74 0.78
75 0.76
76 0.78
77 0.82
78 0.82
79 0.87
80 0.88
81 0.88
82 0.89
83 0.92
84 0.93
85 0.92
86 0.9
87 0.84
88 0.83
89 0.77
90 0.7
91 0.61
92 0.53
93 0.54
94 0.47
95 0.47
96 0.42
97 0.42
98 0.4
99 0.43
100 0.5
101 0.45
102 0.5
103 0.51
104 0.49
105 0.48
106 0.49
107 0.49
108 0.39
109 0.34
110 0.27
111 0.21
112 0.19
113 0.15
114 0.14
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.15
119 0.15
120 0.2
121 0.19
122 0.2
123 0.2
124 0.25
125 0.28
126 0.25
127 0.28
128 0.26
129 0.32
130 0.3
131 0.29
132 0.24
133 0.21
134 0.21
135 0.18
136 0.14
137 0.09
138 0.11
139 0.17
140 0.21
141 0.23
142 0.23
143 0.3
144 0.32
145 0.37
146 0.39
147 0.41
148 0.42
149 0.44
150 0.49
151 0.42
152 0.41
153 0.38
154 0.36
155 0.28
156 0.22
157 0.18
158 0.16
159 0.2
160 0.24
161 0.26
162 0.25
163 0.25
164 0.26
165 0.27
166 0.28
167 0.29
168 0.32
169 0.32
170 0.31
171 0.36
172 0.37
173 0.4
174 0.34
175 0.29
176 0.24
177 0.25
178 0.28
179 0.23
180 0.21
181 0.18
182 0.17
183 0.16
184 0.15
185 0.1
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.13
213 0.16
214 0.19
215 0.22
216 0.22
217 0.22
218 0.23
219 0.25
220 0.22
221 0.2
222 0.18
223 0.2
224 0.22
225 0.23
226 0.22
227 0.21
228 0.18
229 0.19
230 0.22
231 0.19
232 0.19
233 0.23
234 0.23
235 0.27
236 0.32
237 0.29
238 0.28
239 0.27
240 0.31
241 0.37
242 0.42
243 0.44
244 0.47
245 0.52
246 0.53
247 0.59
248 0.57
249 0.51
250 0.48
251 0.41
252 0.35
253 0.32
254 0.29
255 0.24
256 0.2
257 0.16
258 0.14
259 0.13
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.15
270 0.18
271 0.18
272 0.16
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.21
277 0.2
278 0.19
279 0.22
280 0.27
281 0.25
282 0.24
283 0.22
284 0.21
285 0.2
286 0.18
287 0.13
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.14
304 0.19
305 0.2
306 0.2
307 0.21
308 0.2
309 0.19
310 0.2
311 0.17
312 0.12
313 0.12
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.16
318 0.12
319 0.14
320 0.17
321 0.17
322 0.16
323 0.17
324 0.19
325 0.2
326 0.2
327 0.23
328 0.22
329 0.24
330 0.23
331 0.21
332 0.2
333 0.19
334 0.19
335 0.15
336 0.19
337 0.23
338 0.25
339 0.29
340 0.29
341 0.29
342 0.28
343 0.28
344 0.22
345 0.16
346 0.15
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.06
354 0.04
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.08
362 0.11
363 0.16
364 0.16
365 0.16
366 0.17
367 0.19
368 0.25
369 0.29
370 0.31
371 0.28
372 0.32
373 0.33
374 0.33
375 0.36
376 0.32
377 0.26
378 0.25
379 0.23
380 0.2
381 0.21
382 0.2
383 0.17
384 0.19
385 0.22
386 0.2
387 0.2
388 0.21
389 0.22
390 0.21
391 0.19
392 0.16
393 0.12
394 0.11
395 0.12
396 0.1
397 0.09
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.11
402 0.12
403 0.13
404 0.13
405 0.15
406 0.17
407 0.18
408 0.18
409 0.15
410 0.19
411 0.17
412 0.16
413 0.14
414 0.15
415 0.15
416 0.16
417 0.15
418 0.11
419 0.12
420 0.12
421 0.13
422 0.12
423 0.1
424 0.09
425 0.1
426 0.09
427 0.07
428 0.08
429 0.07
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.08
458 0.08
459 0.1
460 0.11
461 0.15
462 0.17
463 0.17
464 0.17
465 0.16
466 0.17
467 0.19
468 0.28
469 0.34
470 0.41
471 0.45
472 0.48
473 0.51
474 0.53
475 0.56
476 0.52
477 0.44
478 0.38
479 0.37
480 0.42
481 0.39
482 0.4
483 0.32
484 0.28
485 0.27
486 0.24
487 0.2
488 0.12
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.14
493 0.14
494 0.14
495 0.14
496 0.13
497 0.13
498 0.1
499 0.11
500 0.07
501 0.07
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.1
517 0.14
518 0.14
519 0.15
520 0.15
521 0.11
522 0.14
523 0.15
524 0.14
525 0.16
526 0.17
527 0.21
528 0.25
529 0.27
530 0.26
531 0.25
532 0.24
533 0.21
534 0.2
535 0.16
536 0.14
537 0.13
538 0.13
539 0.17
540 0.23
541 0.22
542 0.21
543 0.21
544 0.2
545 0.21
546 0.2
547 0.18
548 0.13
549 0.12
550 0.13
551 0.13
552 0.14
553 0.14
554 0.15
555 0.13
556 0.14
557 0.15
558 0.17
559 0.19
560 0.18
561 0.18
562 0.18
563 0.2
564 0.25
565 0.25
566 0.24
567 0.26
568 0.26
569 0.24
570 0.23
571 0.2
572 0.14
573 0.12
574 0.13
575 0.09
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.11
582 0.09
583 0.11
584 0.09
585 0.09
586 0.08
587 0.08
588 0.09
589 0.11
590 0.11
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.11
596 0.11
597 0.09
598 0.09
599 0.09
600 0.11
601 0.11
602 0.11
603 0.1
604 0.13
605 0.12
606 0.12
607 0.13
608 0.11
609 0.12
610 0.15
611 0.18
612 0.15
613 0.2
614 0.26
615 0.29
616 0.3
617 0.3
618 0.27
619 0.25
620 0.29
621 0.29
622 0.22
623 0.21
624 0.23
625 0.23
626 0.23
627 0.27
628 0.25
629 0.23
630 0.22
631 0.22
632 0.22
633 0.21
634 0.21
635 0.18
636 0.17
637 0.17
638 0.22
639 0.23
640 0.2
641 0.22
642 0.22
643 0.23
644 0.25
645 0.28
646 0.24
647 0.21
648 0.21
649 0.21
650 0.23
651 0.21
652 0.18
653 0.13
654 0.13
655 0.13
656 0.13
657 0.1
658 0.07
659 0.07
660 0.08
661 0.07
662 0.06
663 0.08
664 0.09
665 0.09
666 0.11
667 0.13
668 0.18
669 0.23
670 0.26
671 0.27
672 0.29
673 0.3
674 0.29
675 0.3
676 0.26
677 0.25
678 0.23
679 0.24
680 0.22
681 0.23
682 0.22
683 0.19
684 0.18
685 0.15
686 0.13
687 0.1
688 0.1
689 0.08
690 0.07
691 0.07
692 0.07
693 0.07
694 0.11
695 0.14
696 0.14
697 0.15
698 0.15
699 0.16
700 0.18
701 0.26
702 0.29
703 0.28
704 0.31
705 0.38
706 0.4
707 0.44
708 0.42
709 0.35
710 0.29
711 0.27
712 0.27
713 0.2
714 0.17
715 0.13
716 0.14
717 0.13
718 0.12
719 0.11
720 0.09
721 0.12
722 0.14
723 0.17
724 0.18
725 0.18
726 0.19
727 0.22
728 0.26
729 0.23
730 0.23
731 0.19
732 0.18
733 0.17
734 0.17
735 0.14
736 0.1
737 0.09
738 0.08
739 0.11
740 0.17
741 0.19
742 0.22
743 0.25
744 0.28
745 0.35
746 0.45
747 0.44
748 0.39
749 0.38
750 0.37
751 0.34
752 0.31
753 0.26
754 0.17
755 0.15
756 0.16
757 0.16
758 0.14
759 0.13
760 0.14
761 0.13
762 0.16
763 0.2
764 0.21
765 0.25
766 0.3
767 0.37
768 0.38
769 0.4
770 0.38
771 0.35
772 0.33
773 0.38
774 0.41
775 0.37
776 0.36
777 0.34
778 0.33
779 0.31
780 0.31
781 0.21
782 0.12
783 0.1
784 0.11
785 0.12
786 0.14
787 0.14
788 0.13
789 0.12
790 0.13
791 0.13
792 0.14
793 0.14
794 0.18
795 0.2
796 0.22
797 0.22
798 0.23
799 0.25
800 0.23
801 0.22
802 0.17
803 0.15
804 0.14
805 0.14
806 0.14
807 0.13
808 0.12
809 0.11
810 0.11
811 0.11
812 0.1
813 0.12
814 0.12
815 0.1
816 0.1
817 0.1
818 0.09
819 0.09
820 0.09
821 0.08
822 0.07
823 0.08
824 0.08
825 0.09
826 0.1
827 0.1
828 0.1
829 0.11
830 0.17
831 0.19
832 0.21
833 0.22
834 0.25
835 0.28
836 0.3
837 0.31
838 0.27
839 0.29
840 0.31
841 0.3
842 0.28
843 0.26
844 0.29
845 0.26