Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L1JCT8

Protein Details
Accession A0A0L1JCT8    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-52AEESKARISKRRRTQNQTDESDQSHydrophilic
58-79EDLKLSKSKGKAKKPQQSEDDDHydrophilic
98-123EQETKPSKRKPLDKGKPPKKNKTGVVBasic
264-285LDGMQRKNEEKKKRKMEAGDAGBasic
289-311TTELKVRRTFKQNEVKRGRHTIQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-119KPSKRKPLDKGKPPKKNK
165-171RRRSNKR
273-278EKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MTTRKRNEFLDLAPSDDEDNDRGYDSEAAEESKARISKRRRTQNQTDESDQSDNDSDEDLKLSKSKGKAKKPQQSEDDDNDDDEQEETTGAQYLDVTEQETKPSKRKPLDKGKPPKKNKTGVVYLSSLPPYLKPFALKSMLEARSFGPITKVFLSPSVRPASAPRRRSNKRKTYTDGWVEFASKKTAKLCAETLNASIVGGRKGGWYHDDVWNMKYLKGFKWGDLMEQVQRERQEREAKQRIEDSRARKEDKVFLQGVETGKVLDGMQRKNEEKKKRKMEAGDAGGQQTTELKVRRTFKQNEVKRGRHTIQDGAAALEDDTKRVLGKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.28
3 0.25
4 0.24
5 0.15
6 0.16
7 0.14
8 0.15
9 0.14
10 0.15
11 0.16
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.19
20 0.22
21 0.22
22 0.3
23 0.38
24 0.48
25 0.57
26 0.67
27 0.72
28 0.78
29 0.87
30 0.89
31 0.89
32 0.86
33 0.8
34 0.72
35 0.66
36 0.58
37 0.47
38 0.39
39 0.31
40 0.24
41 0.19
42 0.18
43 0.15
44 0.13
45 0.15
46 0.13
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.19
51 0.25
52 0.35
53 0.42
54 0.52
55 0.61
56 0.7
57 0.78
58 0.81
59 0.83
60 0.8
61 0.79
62 0.76
63 0.71
64 0.67
65 0.58
66 0.5
67 0.42
68 0.36
69 0.27
70 0.21
71 0.15
72 0.08
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.15
87 0.21
88 0.23
89 0.29
90 0.35
91 0.42
92 0.48
93 0.56
94 0.62
95 0.68
96 0.75
97 0.79
98 0.84
99 0.86
100 0.89
101 0.89
102 0.9
103 0.87
104 0.84
105 0.8
106 0.76
107 0.72
108 0.65
109 0.59
110 0.51
111 0.43
112 0.37
113 0.31
114 0.24
115 0.17
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.17
123 0.21
124 0.19
125 0.19
126 0.26
127 0.28
128 0.26
129 0.26
130 0.23
131 0.23
132 0.24
133 0.21
134 0.15
135 0.13
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.13
140 0.16
141 0.19
142 0.17
143 0.21
144 0.21
145 0.19
146 0.19
147 0.24
148 0.3
149 0.35
150 0.4
151 0.43
152 0.51
153 0.58
154 0.68
155 0.74
156 0.74
157 0.75
158 0.76
159 0.75
160 0.71
161 0.71
162 0.69
163 0.59
164 0.51
165 0.43
166 0.38
167 0.32
168 0.27
169 0.24
170 0.17
171 0.17
172 0.16
173 0.21
174 0.2
175 0.22
176 0.23
177 0.23
178 0.25
179 0.24
180 0.23
181 0.19
182 0.17
183 0.14
184 0.14
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.14
195 0.18
196 0.22
197 0.23
198 0.23
199 0.28
200 0.27
201 0.26
202 0.26
203 0.24
204 0.21
205 0.28
206 0.28
207 0.23
208 0.28
209 0.28
210 0.26
211 0.26
212 0.27
213 0.22
214 0.24
215 0.25
216 0.22
217 0.25
218 0.26
219 0.26
220 0.3
221 0.36
222 0.38
223 0.48
224 0.55
225 0.54
226 0.55
227 0.6
228 0.56
229 0.54
230 0.55
231 0.52
232 0.52
233 0.58
234 0.58
235 0.54
236 0.55
237 0.56
238 0.54
239 0.53
240 0.44
241 0.37
242 0.35
243 0.35
244 0.33
245 0.26
246 0.21
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.13
252 0.18
253 0.2
254 0.25
255 0.31
256 0.35
257 0.44
258 0.54
259 0.6
260 0.64
261 0.72
262 0.77
263 0.79
264 0.83
265 0.8
266 0.8
267 0.79
268 0.75
269 0.7
270 0.61
271 0.54
272 0.46
273 0.39
274 0.3
275 0.22
276 0.17
277 0.16
278 0.17
279 0.21
280 0.28
281 0.33
282 0.41
283 0.49
284 0.54
285 0.59
286 0.67
287 0.72
288 0.76
289 0.81
290 0.8
291 0.78
292 0.8
293 0.73
294 0.7
295 0.66
296 0.61
297 0.54
298 0.53
299 0.46
300 0.37
301 0.35
302 0.27
303 0.23
304 0.22
305 0.19
306 0.14
307 0.15
308 0.14
309 0.14