Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L1IR17

Protein Details
Accession A0A0L1IR17    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-150TGPKQTSEKSEPKRRRKSRAEAATETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-143GRPEKPQRGKRKSMTGPKQTSEKSEPKRRRKSR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MPLDNRIAPVENPSDDESTGESIPYNDAKEDHDSDAENQEDNDDEEDEEDEEGVYVVEKILGHDFAKNGTLLLQVKWKGYDDPADETMEPEENLLEGAKDLVEEYYRVHGGRPEKPQRGKRKSMTGPKQTSEKSEPKRRRKSRAEAATETPDEDDADLPPWVPRTGSWENEVQNVDTILRDAETSTLIAYLQWKNGKKSKVSLETCYDRCPRKMLKFYEEHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.24
3 0.25
4 0.22
5 0.2
6 0.19
7 0.16
8 0.13
9 0.12
10 0.15
11 0.16
12 0.15
13 0.13
14 0.14
15 0.17
16 0.22
17 0.25
18 0.24
19 0.23
20 0.24
21 0.25
22 0.29
23 0.27
24 0.21
25 0.18
26 0.17
27 0.16
28 0.15
29 0.14
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.05
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.06
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.12
58 0.11
59 0.12
60 0.16
61 0.17
62 0.18
63 0.19
64 0.19
65 0.17
66 0.17
67 0.21
68 0.18
69 0.2
70 0.21
71 0.22
72 0.21
73 0.2
74 0.2
75 0.16
76 0.13
77 0.09
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.04
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.11
97 0.15
98 0.21
99 0.29
100 0.36
101 0.43
102 0.51
103 0.59
104 0.67
105 0.71
106 0.73
107 0.68
108 0.7
109 0.71
110 0.74
111 0.75
112 0.74
113 0.7
114 0.64
115 0.65
116 0.56
117 0.53
118 0.5
119 0.5
120 0.49
121 0.55
122 0.63
123 0.68
124 0.79
125 0.81
126 0.85
127 0.85
128 0.86
129 0.86
130 0.86
131 0.82
132 0.76
133 0.71
134 0.66
135 0.57
136 0.48
137 0.37
138 0.27
139 0.2
140 0.16
141 0.12
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.16
152 0.21
153 0.23
154 0.25
155 0.28
156 0.29
157 0.33
158 0.34
159 0.26
160 0.22
161 0.2
162 0.18
163 0.13
164 0.12
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.12
177 0.13
178 0.18
179 0.25
180 0.29
181 0.36
182 0.43
183 0.48
184 0.48
185 0.53
186 0.57
187 0.61
188 0.61
189 0.61
190 0.62
191 0.65
192 0.63
193 0.63
194 0.6
195 0.55
196 0.53
197 0.55
198 0.56
199 0.58
200 0.65
201 0.65
202 0.67