FuNGI

A0A0L1ITV3

Protein Details

Accession

A0A0L1ITV3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
151-182	ALYESMKREAKKKERKKKWEPYVRKTVPKQTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
157-170	KREAKKKERKKKWE
435-446	YRGRPYGRGRGA

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040450 TFIIF_beta_HTH IPR040504 TFIIF_beta_N IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf IPR000571 Znf_CCCH IPR036855 Znf_CCCH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF02270 TFIIF_beta PF17683 TFIIF_beta_N PF00642 zf-CCCH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50103 ZF_C3H1
CDD	cd07980 TFIIF_beta

Amino Acid Sequences

MVPQIKPDPDAASPYIKPDPDSKDAILDDIDDEDLYEDAGDLDFTNAAQSVWLSRIPRTLWEHWSNLDDDEEIQIGTVRIEGPLNDIKRVSLRINEREENHDIPKDYLLQRQTVNTEHVSSHSTQNTYLFTEKDIPGHENRMITFGEARSALYESMKREAKKKERKKKWEPYVRKTVPKQTALVGSVSEEFNCLPVENEEFRLLSEQKVLQSLKPKRETVFIDKVPGKLLQARNVLPGEKGAFVQATKVAKLKPQENKTTRMPQNELLDLIYQCFREYRYWPFKALKARLRQPEAYLKQTLEMIGHLVKSGDFAMTWELKPEAKESSYANALSYGDAKEEMAPGADYNFDDASEEEATPGMFTDNDDIQFENPYSLVTMTEDQDLMAKISQLAGQINRHKTQNPQTSTPYGSDYQSGHYVARHVPSRGRPGWAPYRGRPYGRGRGAAPHRHRTLVLNNTATPGTPGGATPSTNSGMDVDSESRSTTPNGWVAKRDRHMQLINSAIYDQEAQARAKAMEESRKAKEQKKADIERAKVLRYAQGVGRQYPGPAAPQVAPGPSAEYQVYLNDIPFRVSRGGSKLIRVSGAAFSAAILTKRAGSPLIDDPNTINNTPKRVTIAGVTFVRSKNGNLHRLGAVTSKRKPNATKKDELCRRFTTTGTCYKGPSCLYVHDPDKVALCKDFLQTGDCAAGISCDLSHEPSPHRSPTCMHFLRGRCSNPECRYAHIRLTPGAPVCRDFANLGYCEKGANCDQRHVHECPDYANTGVCNKKRCRLPHVDRAGQIRKNTGANKVDATNDDDSDASSEDEEYDEIDSDDVDSDDLDEDEPELIIKTDGSNDLSQQQDFISF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.37
3	0.34
4	0.34
5	0.36
6	0.41
7	0.4
8	0.44
9	0.39
10	0.39
11	0.39
12	0.38
13	0.31
14	0.24
15	0.2
16	0.16
17	0.16
18	0.1
19	0.1
20	0.09
21	0.09
22	0.08
23	0.07
24	0.06
25	0.05
26	0.06
27	0.06
28	0.05
29	0.06
30	0.06
31	0.06
32	0.07
33	0.07
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.08
38	0.1
39	0.14
40	0.15
41	0.17
42	0.22
43	0.23
44	0.3
45	0.36
46	0.39
47	0.44
48	0.48
49	0.49
50	0.46
51	0.48
52	0.42
53	0.36
54	0.31
55	0.23
56	0.18
57	0.17
58	0.15
59	0.11
60	0.1
61	0.1
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.07
66	0.08
67	0.09
68	0.09
69	0.13
70	0.21
71	0.22
72	0.24
73	0.24
74	0.24
75	0.27
76	0.31
77	0.29
78	0.29
79	0.36
80	0.42
81	0.49
82	0.54
83	0.53
84	0.56
85	0.58
86	0.55
87	0.51
88	0.47
89	0.41
90	0.37
91	0.36
92	0.36
93	0.33
94	0.35
95	0.33
96	0.33
97	0.33
98	0.34
99	0.35
100	0.32
101	0.33
102	0.29
103	0.28
104	0.25
105	0.25
106	0.25
107	0.24
108	0.28
109	0.28
110	0.27
111	0.25
112	0.27
113	0.27
114	0.27
115	0.27
116	0.21
117	0.2
118	0.25
119	0.25
120	0.25
121	0.26
122	0.26
123	0.27
124	0.32
125	0.32
126	0.27
127	0.27
128	0.27
129	0.24
130	0.22
131	0.22
132	0.17
133	0.17
134	0.16
135	0.15
136	0.14
137	0.15
138	0.15
139	0.15
140	0.18
141	0.18
142	0.25
143	0.3
144	0.3
145	0.36
146	0.46
147	0.54
148	0.62
149	0.71
150	0.75
151	0.8
152	0.9
153	0.94
154	0.94
155	0.94
156	0.95
157	0.94
158	0.92
159	0.92
160	0.89
161	0.87
162	0.83
163	0.82
164	0.78
165	0.72
166	0.64
167	0.56
168	0.53
169	0.45
170	0.39
171	0.29
172	0.22
173	0.2
174	0.19
175	0.15
176	0.11
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.09
181	0.08
182	0.09
183	0.14
184	0.15
185	0.17
186	0.17
187	0.17
188	0.17
189	0.21
190	0.2
191	0.16
192	0.18
193	0.18
194	0.18
195	0.23
196	0.24
197	0.23
198	0.32
199	0.38
200	0.44
201	0.48
202	0.5
203	0.46
204	0.51
205	0.54
206	0.53
207	0.54
208	0.46
209	0.48
210	0.47
211	0.46
212	0.42
213	0.37
214	0.3
215	0.28
216	0.3
217	0.29
218	0.32
219	0.32
220	0.35
221	0.35
222	0.34
223	0.27
224	0.26
225	0.2
226	0.16
227	0.15
228	0.12
229	0.11
230	0.1
231	0.11
232	0.14
233	0.14
234	0.14
235	0.17
236	0.17
237	0.2
238	0.25
239	0.32
240	0.37
241	0.42
242	0.52
243	0.53
244	0.58
245	0.61
246	0.67
247	0.64
248	0.61
249	0.58
250	0.52
251	0.52
252	0.48
253	0.41
254	0.32
255	0.29
256	0.22
257	0.2
258	0.16
259	0.12
260	0.11
261	0.11
262	0.12
263	0.14
264	0.16
265	0.25
266	0.33
267	0.35
268	0.39
269	0.42
270	0.45
271	0.51
272	0.56
273	0.54
274	0.53
275	0.59
276	0.62
277	0.65
278	0.61
279	0.56
280	0.58
281	0.55
282	0.51
283	0.45
284	0.37
285	0.32
286	0.31
287	0.27
288	0.17
289	0.13
290	0.1
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.08
302	0.1
303	0.1
304	0.11
305	0.12
306	0.12
307	0.13
308	0.14
309	0.13
310	0.12
311	0.14
312	0.14
313	0.15
314	0.17
315	0.17
316	0.15
317	0.14
318	0.13
319	0.12
320	0.13
321	0.1
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.08
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.09
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.05
348	0.04
349	0.04
350	0.06
351	0.07
352	0.08
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.08
359	0.07
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.08
367	0.09
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.07
374	0.06
375	0.05
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.09
381	0.14
382	0.2
383	0.24
384	0.26
385	0.26
386	0.27
387	0.31
388	0.39
389	0.44
390	0.41
391	0.41
392	0.43
393	0.44
394	0.44
395	0.39
396	0.32
397	0.24
398	0.21
399	0.19
400	0.16
401	0.15
402	0.15
403	0.15
404	0.12
405	0.11
406	0.13
407	0.12
408	0.14
409	0.15
410	0.14
411	0.17
412	0.21
413	0.28
414	0.27
415	0.28
416	0.26
417	0.29
418	0.36
419	0.4
420	0.4
421	0.36
422	0.43
423	0.43
424	0.44
425	0.45
426	0.44
427	0.46
428	0.44
429	0.43
430	0.35
431	0.41
432	0.46
433	0.49
434	0.48
435	0.47
436	0.46
437	0.45
438	0.45
439	0.4
440	0.4
441	0.37
442	0.36
443	0.3
444	0.29
445	0.29
446	0.28
447	0.25
448	0.19
449	0.12
450	0.08
451	0.06
452	0.06
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.1
462	0.09
463	0.09
464	0.1
465	0.09
466	0.08
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.1
473	0.11
474	0.16
475	0.19
476	0.19
477	0.24
478	0.28
479	0.33
480	0.35
481	0.38
482	0.35
483	0.38
484	0.39
485	0.35
486	0.35
487	0.32
488	0.29
489	0.24
490	0.22
491	0.16
492	0.14
493	0.13
494	0.09
495	0.09
496	0.11
497	0.11
498	0.11
499	0.13
500	0.12
501	0.12
502	0.14
503	0.14
504	0.19
505	0.23
506	0.28
507	0.3
508	0.37
509	0.42
510	0.46
511	0.51
512	0.5
513	0.54
514	0.59
515	0.62
516	0.63
517	0.66
518	0.62
519	0.62
520	0.58
521	0.5
522	0.42
523	0.37
524	0.31
525	0.25
526	0.25
527	0.2
528	0.24
529	0.25
530	0.24
531	0.25
532	0.22
533	0.21
534	0.2
535	0.18
536	0.13
537	0.12
538	0.13
539	0.11
540	0.13
541	0.14
542	0.13
543	0.13
544	0.11
545	0.14
546	0.12
547	0.14
548	0.11
549	0.11
550	0.11
551	0.11
552	0.13
553	0.1
554	0.1
555	0.11
556	0.11
557	0.12
558	0.12
559	0.14
560	0.13
561	0.14
562	0.16
563	0.18
564	0.25
565	0.24
566	0.27
567	0.28
568	0.27
569	0.27
570	0.24
571	0.22
572	0.16
573	0.15
574	0.12
575	0.09
576	0.08
577	0.08
578	0.09
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.09
583	0.09
584	0.1
585	0.1
586	0.09
587	0.13
588	0.18
589	0.24
590	0.23
591	0.23
592	0.23
593	0.28
594	0.3
595	0.27
596	0.27
597	0.23
598	0.28
599	0.28
600	0.28
601	0.26
602	0.24
603	0.25
604	0.23
605	0.23
606	0.24
607	0.24
608	0.25
609	0.25
610	0.24
611	0.25
612	0.22
613	0.21
614	0.25
615	0.31
616	0.36
617	0.34
618	0.36
619	0.35
620	0.35
621	0.35
622	0.31
623	0.3
624	0.31
625	0.36
626	0.41
627	0.43
628	0.49
629	0.56
630	0.61
631	0.66
632	0.67
633	0.7
634	0.68
635	0.76
636	0.8
637	0.76
638	0.72
639	0.65
640	0.65
641	0.57
642	0.52
643	0.48
644	0.44
645	0.48
646	0.47
647	0.43
648	0.38
649	0.37
650	0.4
651	0.34
652	0.32
653	0.25
654	0.23
655	0.26
656	0.31
657	0.33
658	0.31
659	0.32
660	0.29
661	0.31
662	0.3
663	0.27
664	0.21
665	0.21
666	0.2
667	0.2
668	0.21
669	0.18
670	0.18
671	0.17
672	0.17
673	0.16
674	0.13
675	0.12
676	0.09
677	0.09
678	0.07
679	0.07
680	0.05
681	0.06
682	0.07
683	0.1
684	0.13
685	0.16
686	0.2
687	0.26
688	0.31
689	0.36
690	0.38
691	0.36
692	0.37
693	0.39
694	0.46
695	0.41
696	0.4
697	0.41
698	0.43
699	0.49
700	0.53
701	0.51
702	0.47
703	0.51
704	0.58
705	0.54
706	0.59
707	0.53
708	0.51
709	0.55
710	0.53
711	0.54
712	0.48
713	0.47
714	0.4
715	0.41
716	0.4
717	0.37
718	0.37
719	0.31
720	0.28
721	0.27
722	0.26
723	0.26
724	0.22
725	0.21
726	0.22
727	0.21
728	0.21
729	0.21
730	0.2
731	0.19
732	0.19
733	0.2
734	0.21
735	0.29
736	0.3
737	0.36
738	0.39
739	0.45
740	0.51
741	0.49
742	0.48
743	0.44
744	0.43
745	0.38
746	0.39
747	0.33
748	0.28
749	0.27
750	0.23
751	0.25
752	0.33
753	0.34
754	0.39
755	0.43
756	0.5
757	0.57
758	0.62
759	0.64
760	0.67
761	0.72
762	0.74
763	0.79
764	0.78
765	0.74
766	0.77
767	0.76
768	0.7
769	0.64
770	0.58
771	0.52
772	0.52
773	0.51
774	0.5
775	0.46
776	0.44
777	0.44
778	0.42
779	0.41
780	0.36
781	0.38
782	0.32
783	0.27
784	0.25
785	0.22
786	0.2
787	0.19
788	0.18
789	0.13
790	0.11
791	0.11
792	0.1
793	0.11
794	0.1
795	0.09
796	0.09
797	0.09
798	0.09
799	0.09
800	0.08
801	0.08
802	0.09
803	0.08
804	0.07
805	0.07
806	0.07
807	0.08
808	0.09
809	0.08
810	0.08
811	0.08
812	0.09
813	0.08
814	0.08
815	0.08
816	0.08
817	0.08
818	0.08
819	0.08
820	0.11
821	0.14
822	0.18
823	0.18
824	0.2
825	0.25
826	0.27
827	0.26
828	0.24

A0A0L1ITV3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer