FuNGI

A7EFX0

Protein Details

Accession

A7EFX0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-56	APQFTRKPKAADPLRPRKKPVRRPNVPSKPPGAN	Hydrophilic
536-561	ESSGNESSRKKHKKKHVGSSQPTGQP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-52	RKPKAADPLRPRKKPVRRPNVPSKP
483-535	KKKDEEAKAKLKAEAKTPGTSSKGNNTPSGRPKHTDPLKKTKSLKRAGSPNLS
537-551	SSGNESSRKKHKKKH
609-611	KKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	ssl:SS1G_04211 -

Amino Acid Sequences

MSASPSGMSNGRTPTPTPNSGGAPQFTRKPKAADPLRPRKKPVRRPNVPSKPPGANLNGLTPARPNGPTSLNNFSGPRAPGPRGPVPINGNVAPRQTYGGWTHPPKGEVTDFPLFTTRRALRDGLRYHAMRFAGKKEVDPTNQDEFTRPISLHRRDPRQPPPGKAFKDEDTVMEDVVDSKERERQEILKAEKEAQKAADRAQIAPTSNNANASAAKKAQAFRNEKTTQVHRLDKTAEQKKESDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYESALSEVNVMFFTEGSSFRMIPVEKWYKFTSKNKFNTLTIDEAEALLSKKTKESRWAMKTQEKNEAQRATQENIQGLNRLYTVKAESQSFRGSSRNETRDIDELDFDADDLFQDDDELPTVEPDRDEDTKDAQERIKQDQRGANLFGEADEEAVEKDFMKEEQELEAQKKLGKGVRKALTKREKNFIYDSDSSNPYASSDSEDDTSDEEKQKEIDKKKDEEAKAKLKAEAKTPGTSSKGNNTPSGRPKHTDPLKKTKSLKRAGSPNLSESSGNESSRKKHKKKHVGSSQPTGQPQRKSSIVKMSVNASELSRISSSPPNPQGATSDGEATGGEMSDGAGGKKKKITLRMGGSPTASRPASPAPGKSSSSRAGSPAQGTEHAGSSSSGPITPKEIIAALPSAGISIGQLLGHFRGRVGDSDGQTTKKEFMAMIKTNSKYGADKLLRPKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.43
4	0.42
5	0.42
6	0.43
7	0.46
8	0.48
9	0.42
10	0.39
11	0.4
12	0.44
13	0.48
14	0.49
15	0.48
16	0.5
17	0.52
18	0.58
19	0.63
20	0.65
21	0.69
22	0.75
23	0.81
24	0.82
25	0.84
26	0.84
27	0.85
28	0.86
29	0.86
30	0.86
31	0.86
32	0.89
33	0.93
34	0.93
35	0.9
36	0.85
37	0.81
38	0.76
39	0.69
40	0.65
41	0.58
42	0.52
43	0.46
44	0.43
45	0.43
46	0.37
47	0.34
48	0.3
49	0.28
50	0.26
51	0.26
52	0.24
53	0.22
54	0.27
55	0.31
56	0.34
57	0.39
58	0.38
59	0.39
60	0.38
61	0.36
62	0.36
63	0.34
64	0.34
65	0.32
66	0.33
67	0.34
68	0.4
69	0.45
70	0.44
71	0.45
72	0.45
73	0.44
74	0.46
75	0.46
76	0.42
77	0.39
78	0.37
79	0.37
80	0.32
81	0.28
82	0.26
83	0.22
84	0.24
85	0.24
86	0.27
87	0.33
88	0.35
89	0.4
90	0.4
91	0.41
92	0.38
93	0.38
94	0.36
95	0.3
96	0.33
97	0.33
98	0.31
99	0.3
100	0.35
101	0.31
102	0.29
103	0.35
104	0.32
105	0.29
106	0.32
107	0.33
108	0.33
109	0.42
110	0.44
111	0.41
112	0.45
113	0.43
114	0.41
115	0.43
116	0.39
117	0.34
118	0.33
119	0.31
120	0.33
121	0.32
122	0.33
123	0.34
124	0.39
125	0.39
126	0.4
127	0.42
128	0.4
129	0.42
130	0.4
131	0.37
132	0.32
133	0.32
134	0.3
135	0.24
136	0.25
137	0.32
138	0.37
139	0.45
140	0.51
141	0.56
142	0.61
143	0.7
144	0.73
145	0.74
146	0.75
147	0.72
148	0.73
149	0.74
150	0.7
151	0.67
152	0.61
153	0.53
154	0.52
155	0.46
156	0.38
157	0.32
158	0.29
159	0.23
160	0.19
161	0.16
162	0.12
163	0.12
164	0.13
165	0.1
166	0.11
167	0.16
168	0.17
169	0.19
170	0.21
171	0.24
172	0.28
173	0.36
174	0.4
175	0.4
176	0.41
177	0.45
178	0.47
179	0.45
180	0.39
181	0.34
182	0.34
183	0.3
184	0.3
185	0.29
186	0.25
187	0.25
188	0.26
189	0.26
190	0.23
191	0.22
192	0.22
193	0.21
194	0.2
195	0.21
196	0.18
197	0.16
198	0.17
199	0.18
200	0.2
201	0.16
202	0.18
203	0.2
204	0.22
205	0.27
206	0.34
207	0.38
208	0.37
209	0.46
210	0.45
211	0.45
212	0.47
213	0.47
214	0.46
215	0.46
216	0.51
217	0.42
218	0.44
219	0.44
220	0.45
221	0.5
222	0.5
223	0.47
224	0.43
225	0.43
226	0.45
227	0.49
228	0.45
229	0.41
230	0.34
231	0.33
232	0.33
233	0.33
234	0.29
235	0.24
236	0.24
237	0.19
238	0.17
239	0.15
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.16
244	0.19
245	0.19
246	0.18
247	0.19
248	0.19
249	0.18
250	0.18
251	0.14
252	0.11
253	0.11
254	0.12
255	0.11
256	0.12
257	0.12
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.08
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.2
277	0.26
278	0.26
279	0.29
280	0.31
281	0.33
282	0.4
283	0.48
284	0.49
285	0.51
286	0.56
287	0.59
288	0.6
289	0.56
290	0.53
291	0.48
292	0.4
293	0.31
294	0.26
295	0.2
296	0.16
297	0.15
298	0.12
299	0.09
300	0.07
301	0.08
302	0.07
303	0.1
304	0.14
305	0.16
306	0.23
307	0.29
308	0.38
309	0.43
310	0.49
311	0.52
312	0.56
313	0.61
314	0.56
315	0.59
316	0.53
317	0.51
318	0.51
319	0.47
320	0.39
321	0.39
322	0.39
323	0.31
324	0.31
325	0.28
326	0.23
327	0.23
328	0.23
329	0.18
330	0.15
331	0.13
332	0.11
333	0.1
334	0.09
335	0.08
336	0.1
337	0.11
338	0.12
339	0.13
340	0.14
341	0.16
342	0.17
343	0.17
344	0.17
345	0.18
346	0.17
347	0.22
348	0.29
349	0.3
350	0.3
351	0.31
352	0.32
353	0.32
354	0.33
355	0.27
356	0.19
357	0.16
358	0.14
359	0.13
360	0.1
361	0.07
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.11
379	0.11
380	0.13
381	0.14
382	0.16
383	0.19
384	0.21
385	0.22
386	0.19
387	0.22
388	0.23
389	0.3
390	0.34
391	0.32
392	0.35
393	0.36
394	0.38
395	0.38
396	0.36
397	0.29
398	0.22
399	0.21
400	0.16
401	0.14
402	0.1
403	0.07
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.1
417	0.13
418	0.14
419	0.16
420	0.17
421	0.16
422	0.17
423	0.17
424	0.18
425	0.2
426	0.24
427	0.26
428	0.33
429	0.4
430	0.46
431	0.48
432	0.55
433	0.62
434	0.65
435	0.64
436	0.64
437	0.59
438	0.55
439	0.55
440	0.47
441	0.44
442	0.38
443	0.37
444	0.33
445	0.32
446	0.29
447	0.26
448	0.24
449	0.17
450	0.16
451	0.13
452	0.13
453	0.12
454	0.13
455	0.13
456	0.14
457	0.14
458	0.14
459	0.15
460	0.15
461	0.17
462	0.16
463	0.16
464	0.17
465	0.23
466	0.3
467	0.36
468	0.42
469	0.45
470	0.48
471	0.55
472	0.62
473	0.6
474	0.59
475	0.6
476	0.6
477	0.59
478	0.57
479	0.55
480	0.51
481	0.49
482	0.46
483	0.46
484	0.41
485	0.37
486	0.37
487	0.37
488	0.35
489	0.36
490	0.33
491	0.33
492	0.36
493	0.36
494	0.4
495	0.4
496	0.44
497	0.5
498	0.55
499	0.51
500	0.48
501	0.5
502	0.55
503	0.6
504	0.63
505	0.62
506	0.65
507	0.67
508	0.72
509	0.76
510	0.74
511	0.75
512	0.74
513	0.74
514	0.7
515	0.73
516	0.73
517	0.72
518	0.66
519	0.6
520	0.54
521	0.48
522	0.4
523	0.31
524	0.32
525	0.27
526	0.26
527	0.26
528	0.27
529	0.32
530	0.43
531	0.53
532	0.53
533	0.59
534	0.7
535	0.77
536	0.84
537	0.89
538	0.89
539	0.89
540	0.88
541	0.86
542	0.83
543	0.77
544	0.72
545	0.69
546	0.64
547	0.59
548	0.56
549	0.52
550	0.51
551	0.5
552	0.49
553	0.52
554	0.52
555	0.49
556	0.48
557	0.47
558	0.42
559	0.39
560	0.35
561	0.25
562	0.21
563	0.18
564	0.18
565	0.15
566	0.14
567	0.16
568	0.22
569	0.24
570	0.3
571	0.35
572	0.36
573	0.36
574	0.36
575	0.35
576	0.31
577	0.31
578	0.23
579	0.21
580	0.17
581	0.16
582	0.15
583	0.13
584	0.11
585	0.08
586	0.06
587	0.04
588	0.05
589	0.06
590	0.07
591	0.07
592	0.13
593	0.14
594	0.18
595	0.22
596	0.27
597	0.31
598	0.39
599	0.47
600	0.5
601	0.56
602	0.62
603	0.62
604	0.59
605	0.56
606	0.49
607	0.43
608	0.4
609	0.33
610	0.24
611	0.23
612	0.24
613	0.3
614	0.32
615	0.34
616	0.34
617	0.39
618	0.42
619	0.41
620	0.43
621	0.4
622	0.41
623	0.38
624	0.36
625	0.34
626	0.35
627	0.35
628	0.32
629	0.3
630	0.27
631	0.29
632	0.27
633	0.25
634	0.21
635	0.19
636	0.16
637	0.15
638	0.16
639	0.14
640	0.14
641	0.14
642	0.15
643	0.19
644	0.19
645	0.18
646	0.17
647	0.17
648	0.16
649	0.17
650	0.17
651	0.12
652	0.11
653	0.11
654	0.09
655	0.09
656	0.08
657	0.06
658	0.05
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.08
663	0.11
664	0.14
665	0.14
666	0.13
667	0.17
668	0.18
669	0.2
670	0.25
671	0.29
672	0.28
673	0.35
674	0.38
675	0.37
676	0.37
677	0.37
678	0.33
679	0.27
680	0.27
681	0.21
682	0.24
683	0.32
684	0.36
685	0.41
686	0.46
687	0.47
688	0.47
689	0.48
690	0.44
691	0.37
692	0.35
693	0.38
694	0.35
695	0.42

A7EFX0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer